MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012029	TCG	2	6	58340	58345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478495
1502	NC_012029	AGG	2	6	58379	58384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478495
1503	NC_012029	CAG	2	6	58417	58422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478495
1504	NC_012029	CTC	2	6	58423	58428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478495
1505	NC_012029	CTC	2	6	58435	58440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478495
1506	NC_012029	GGC	2	6	58441	58446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478495
1507	NC_012029	CGG	2	6	58490	58495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478495
1508	NC_012029	TCG	2	6	58517	58522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478495
1509	NC_012029	ACCG	2	8	58560	58567	25 %	0 %	25 %	50 %	222478495
1510	NC_012029	TTC	2	6	58649	58654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478495
1511	NC_012029	ATCCGA	2	12	58673	58684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478495
1512	NC_012029	CG	3	6	58690	58695	0 %	0 %	50 %	50 %	222478495
1513	NC_012029	GCC	2	6	58800	58805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478495
1514	NC_012029	GGA	2	6	58866	58871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478495
1515	NC_012029	CTG	2	6	58894	58899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478495
1516	NC_012029	CGAG	2	8	58920	58927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_012029	A	6	6	58985	58990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012029	GCC	2	6	58993	58998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_012029	AGC	2	6	59032	59037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478496
1520	NC_012029	CGC	2	6	59042	59047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478496
1521	NC_012029	CGG	2	6	59067	59072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478496
1522	NC_012029	TTG	2	6	59080	59085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478496
1523	NC_012029	CG	3	6	59088	59093	0 %	0 %	50 %	50 %	222478496
1524	NC_012029	CCT	2	6	59102	59107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478496
1525	NC_012029	ACG	2	6	59110	59115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478496
1526	NC_012029	GTC	2	6	59154	59159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478496
1527	NC_012029	TTG	2	6	59161	59166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478496
1528	NC_012029	CG	3	6	59170	59175	0 %	0 %	50 %	50 %	222478496
1529	NC_012029	TGA	2	6	59321	59326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478496
1530	NC_012029	CGAG	2	8	59357	59364	25 %	0 %	50 %	25 %	222478496
1531	NC_012029	CTC	2	6	59382	59387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478496
1532	NC_012029	GTC	2	6	59418	59423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478496
1533	NC_012029	TGT	2	6	59447	59452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478496
1534	NC_012029	CGG	2	6	59494	59499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478496
1535	NC_012029	ACG	2	6	59504	59509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478496
1536	NC_012029	TGC	2	6	59576	59581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_012029	CGT	2	6	59610	59615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_012029	CGG	2	6	59621	59626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012029	CGAT	2	8	59690	59697	25 %	25 %	25 %	25 %	222478497
1540	NC_012029	CTC	2	6	59700	59705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478497
1541	NC_012029	CGA	2	6	59783	59788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1542	NC_012029	GAC	2	6	59799	59804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1543	NC_012029	CTT	2	6	59819	59824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478497
1544	NC_012029	CCG	2	6	59892	59897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478497
1545	NC_012029	CGA	3	9	59909	59917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1546	NC_012029	CGA	2	6	60005	60010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1547	NC_012029	TCC	2	6	60043	60048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478497
1548	NC_012029	CGCC	2	8	60073	60080	0 %	0 %	25 %	75 %	222478497
1549	NC_012029	AG	3	6	60096	60101	50 %	0 %	50 %	0 %	222478497
1550	NC_012029	TGG	2	6	60103	60108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478497
1551	NC_012029	TCG	2	6	60136	60141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1552	NC_012029	GTG	2	6	60192	60197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478497
1553	NC_012029	CGG	2	6	60207	60212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478497
1554	NC_012029	TCG	2	6	60238	60243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1555	NC_012029	GCG	2	6	60256	60261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478497
1556	NC_012029	AGC	2	6	60280	60285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478497
1557	NC_012029	GGC	2	6	60309	60314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478497
1558	NC_012029	CGC	2	6	60362	60367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478497
1559	NC_012029	GCGAGG	2	12	60472	60483	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1560	NC_012029	GGTC	2	8	60495	60502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_012029	CGT	2	6	60506	60511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_012029	CGG	2	6	60518	60523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_012029	CA	3	6	60615	60620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_012029	ACCGCA	2	12	60621	60632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_012029	CGC	2	6	60657	60662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_012029	GCC	2	6	60664	60669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_012029	CGG	2	6	60672	60677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_012029	CG	3	6	60691	60696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_012029	GC	4	8	60727	60734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_012029	TCG	2	6	60814	60819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1571	NC_012029	CGT	2	6	60827	60832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1572	NC_012029	GTC	2	6	60882	60887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1573	NC_012029	CGT	2	6	60893	60898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1574	NC_012029	GAC	3	9	60942	60950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1575	NC_012029	CGAG	2	8	60995	61002	25 %	0 %	50 %	25 %	222478498
1576	NC_012029	GCC	2	6	61025	61030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478498
1577	NC_012029	TCG	2	6	61126	61131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1578	NC_012029	GTC	2	6	61228	61233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1579	NC_012029	TGA	2	6	61235	61240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478498
1580	NC_012029	CTT	2	6	61251	61256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478498
1581	NC_012029	CCA	2	6	61265	61270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478498
1582	NC_012029	GGA	2	6	61274	61279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478498
1583	NC_012029	TG	3	6	61295	61300	0 %	50 %	50 %	0 %	222478498
1584	NC_012029	CGA	3	9	61400	61408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1585	NC_012029	TCG	2	6	61433	61438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1586	NC_012029	CGA	2	6	61458	61463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1587	NC_012029	CCGTG	2	10	61469	61478	0 %	20 %	40 %	40 %	222478498
1588	NC_012029	CG	3	6	61557	61562	0 %	0 %	50 %	50 %	222478498
1589	NC_012029	GGT	2	6	61578	61583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478498
1590	NC_012029	GCC	2	6	61596	61601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478498
1591	NC_012029	ATG	2	6	61603	61608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478498
1592	NC_012029	CTC	2	6	61629	61634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478498
1593	NC_012029	CGT	2	6	61661	61666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1594	NC_012029	TGG	2	6	61676	61681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478498
1595	NC_012029	CGT	2	6	61709	61714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1596	NC_012029	CTC	2	6	61719	61724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478498
1597	NC_012029	GTC	2	6	61725	61730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1598	NC_012029	CGC	2	6	61733	61738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478498
1599	NC_012029	AGG	2	6	61748	61753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478498
1600	NC_012029	CGT	3	9	61787	61795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1601	NC_012029	GCC	2	6	61836	61841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478498
1602	NC_012029	CGA	2	6	61856	61861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1603	NC_012029	CATCGC	2	12	61887	61898	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478498
1604	NC_012029	GCT	2	6	61919	61924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478498
1605	NC_012029	CTC	2	6	61935	61940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478498
1606	NC_012029	CTC	2	6	61998	62003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478498
1607	NC_012029	GA	3	6	62023	62028	50 %	0 %	50 %	0 %	222478498
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1609	NC_012029	TCG	2	6	62239	62244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478499
1610	NC_012029	CTT	2	6	62264	62269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478499
1611	NC_012029	CGT	2	6	62294	62299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478499
1612	NC_012029	TCG	2	6	62320	62325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478499
1613	NC_012029	CGT	2	6	62327	62332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478499
1614	NC_012029	CGG	2	6	62355	62360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478499
1615	NC_012029	CGT	2	6	62372	62377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478499
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1625	NC_012029	GCCG	2	8	62733	62740	0 %	0 %	50 %	50 %	222478499
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