MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012029	ACG	2	6	39485	39490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1002	NC_012029	TCGTC	2	10	39495	39504	0 %	40 %	20 %	40 %	222478473
1003	NC_012029	CGG	2	6	39569	39574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478473
1004	NC_012029	GC	3	6	39579	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	222478473
1005	NC_012029	GAC	2	6	39607	39612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1006	NC_012029	GAG	2	6	39613	39618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478473
1007	NC_012029	GGC	2	6	39619	39624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478473
1008	NC_012029	ATCG	2	8	39631	39638	25 %	25 %	25 %	25 %	222478473
1009	NC_012029	GTCG	2	8	39685	39692	0 %	25 %	50 %	25 %	222478473
1010	NC_012029	GTC	3	9	39727	39735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1011	NC_012029	GAC	2	6	39736	39741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1012	NC_012029	TCG	2	6	39785	39790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1013	NC_012029	CGA	2	6	39810	39815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1014	NC_012029	CGT	2	6	39942	39947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478473
1015	NC_012029	GAT	2	6	39948	39953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478473
1016	NC_012029	AGGCG	2	10	40021	40030	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_012029	CG	3	6	40051	40056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_012029	CGC	2	6	40089	40094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_012029	CGTT	2	8	40101	40108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_012029	ACA	2	6	40146	40151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012029	CGCT	2	8	40161	40168	0 %	25 %	25 %	50 %	222478474
1022	NC_012029	TCG	2	6	40190	40195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478474
1023	NC_012029	GTG	2	6	40201	40206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478474
1024	NC_012029	TCGAC	2	10	40209	40218	20 %	20 %	20 %	40 %	222478474
1025	NC_012029	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	222478474
1026	NC_012029	CGA	2	6	40344	40349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478474
1027	NC_012029	GCC	2	6	40372	40377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478474
1028	NC_012029	ACGA	2	8	40382	40389	50 %	0 %	25 %	25 %	222478474
1029	NC_012029	TCG	4	12	40466	40477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478474
1030	NC_012029	AGA	2	6	40482	40487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478474
1031	NC_012029	CCG	2	6	40488	40493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478474
1032	NC_012029	CGA	2	6	40539	40544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478474
1033	NC_012029	GGT	2	6	40578	40583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478474
1034	NC_012029	TCG	2	6	40613	40618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478474
1035	NC_012029	GGTCGC	2	12	40702	40713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478475
1036	NC_012029	TGA	2	6	40732	40737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478475
1037	NC_012029	CGT	2	6	40762	40767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478475
1038	NC_012029	ACC	2	6	40820	40825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_012029	TCA	2	6	40856	40861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478476
1040	NC_012029	CGA	2	6	40862	40867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1041	NC_012029	TCG	3	9	40886	40894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1042	NC_012029	GCT	2	6	40908	40913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1043	NC_012029	CGT	2	6	40914	40919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1044	NC_012029	AGGGG	2	10	40937	40946	20 %	0 %	80 %	0 %	222478476
1045	NC_012029	ACG	2	6	40986	40991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1046	NC_012029	CGC	3	9	40992	41000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478476
1047	NC_012029	CGG	3	9	41043	41051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478476
1048	NC_012029	GGC	3	9	41053	41061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478476
1049	NC_012029	CGG	2	6	41076	41081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478476
1050	NC_012029	GGA	2	6	41103	41108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478476
1051	NC_012029	GCG	2	6	41113	41118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478476
1052	NC_012029	GGC	2	6	41119	41124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478476
1053	NC_012029	CAA	2	6	41208	41213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478476
1054	NC_012029	GT	3	6	41280	41285	0 %	50 %	50 %	0 %	222478476
1055	NC_012029	TCG	2	6	41327	41332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1056	NC_012029	CAG	2	6	41344	41349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478476
1057	NC_012029	GCC	2	6	41460	41465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_012029	CTC	2	6	41472	41477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012029	TCC	2	6	41484	41489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_012029	CCGC	2	8	41507	41514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1061	NC_012029	TCA	2	6	41561	41566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478477
1062	NC_012029	GCC	2	6	41584	41589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478477
1063	NC_012029	CGC	2	6	41598	41603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478477
1064	NC_012029	CGC	2	6	41660	41665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478477
1065	NC_012029	GCC	2	6	41674	41679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478477
1066	NC_012029	TCGTCA	2	12	41681	41692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222478477
1067	NC_012029	CTC	2	6	41719	41724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478477
1068	NC_012029	TGT	2	6	41777	41782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478477
1069	NC_012029	CCT	2	6	41784	41789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478477
1070	NC_012029	CGA	2	6	41796	41801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478477
1071	NC_012029	GAGT	2	8	41875	41882	25 %	25 %	50 %	0 %	222478477
1072	NC_012029	CCT	2	6	41894	41899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_012029	CTC	2	6	41905	41910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_012029	CCG	2	6	41911	41916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_012029	CGA	2	6	41920	41925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_012029	CGA	2	6	42007	42012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478478
1077	NC_012029	ATC	2	6	42059	42064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478478
1078	NC_012029	CGG	2	6	42073	42078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478478
1079	NC_012029	CGT	2	6	42085	42090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478478
1080	NC_012029	GTC	3	9	42119	42127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478478
1081	NC_012029	CGG	2	6	42133	42138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478478
1082	NC_012029	CCG	2	6	42171	42176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478478
1083	NC_012029	ACA	2	6	42177	42182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478478
1084	NC_012029	CCG	2	6	42184	42189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478478
1085	NC_012029	CGA	2	6	42208	42213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478478
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1087	NC_012029	CGG	2	6	42283	42288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478478
1088	NC_012029	CGT	2	6	42383	42388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012029	GCC	2	6	42466	42471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1090	NC_012029	TCG	4	12	42487	42498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1091	NC_012029	TCA	2	6	42527	42532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478479
1092	NC_012029	GCGG	2	8	42555	42562	0 %	0 %	75 %	25 %	222478479
1093	NC_012029	CGT	2	6	42636	42641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1094	NC_012029	ACC	2	6	42647	42652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478479
1095	NC_012029	CCT	2	6	42659	42664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478479
1096	NC_012029	CGT	2	6	42713	42718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1097	NC_012029	GCC	3	9	42723	42731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1098	NC_012029	CGACCG	2	12	42746	42757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478479
1099	NC_012029	TCGCC	2	10	42785	42794	0 %	20 %	20 %	60 %	222478479
1100	NC_012029	CGGC	2	8	42851	42858	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
1101	NC_012029	CGTC	2	8	42866	42873	0 %	25 %	25 %	50 %	222478479
1102	NC_012029	CCG	2	6	42950	42955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1103	NC_012029	GGT	2	6	42971	42976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478479
1104	NC_012029	TCG	2	6	42986	42991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1105	NC_012029	CGG	2	6	43006	43011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478479
1106	NC_012029	TCG	2	6	43012	43017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1107	NC_012029	CTC	2	6	43080	43085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478479
1108	NC_012029	CGC	2	6	43125	43130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1109	NC_012029	CGT	2	6	43139	43144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1110	NC_012029	CTC	2	6	43191	43196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478479
1111	NC_012029	GGC	2	6	43216	43221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478479
1112	NC_012029	GC	3	6	43231	43236	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
1113	NC_012029	CGG	2	6	43245	43250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478479
1114	NC_012029	CG	3	6	43288	43293	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
1115	NC_012029	CG	3	6	43306	43311	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
1116	NC_012029	CGC	2	6	43352	43357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1117	NC_012029	GCG	2	6	43386	43391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478479
1118	NC_012029	CCGGA	2	10	43428	43437	20 %	0 %	40 %	40 %	222478479
1119	NC_012029	GTC	2	6	43455	43460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478479
1120	NC_012029	GGT	2	6	43488	43493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478479
1121	NC_012029	CCG	2	6	43546	43551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478479
1122	NC_012029	CCGTC	2	10	43565	43574	0 %	20 %	20 %	60 %	222478479
1123	NC_012029	CGGG	2	8	43586	43593	0 %	0 %	75 %	25 %	222478479
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1125	NC_012029	GC	3	6	43676	43681	0 %	0 %	50 %	50 %	222478479
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1251	NC_012029	GTC	2	6	48119	48124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1252	NC_012029	CTC	2	6	48137	48142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478485
1253	NC_012029	CGT	2	6	48157	48162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1254	NC_012029	GC	3	6	48171	48176	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
1255	NC_012029	TCG	2	6	48180	48185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1256	NC_012029	CGT	2	6	48197	48202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
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1264	NC_012029	GTC	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
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1283	NC_012029	CGGG	2	8	49086	49093	0 %	0 %	75 %	25 %	222478486
1284	NC_012029	GAA	2	6	49173	49178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478486
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1287	NC_012029	TCG	2	6	49338	49343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1288	NC_012029	GCCA	2	8	49346	49353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1289	NC_012029	CGG	2	6	49361	49366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1292	NC_012029	TTG	2	6	49431	49436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1293	NC_012029	GACC	2	8	49469	49476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1294	NC_012029	ATCGG	2	10	49483	49492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1303	NC_012029	TAC	2	6	49770	49775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1367	NC_012029	TAA	2	6	52624	52629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_012029	ACCA	2	8	52689	52696	50 %	0 %	0 %	50 %	222478492
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