MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012029	GTT	2	6	18837	18842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478458
502	NC_012029	GTCGCG	2	12	18890	18901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478458
503	NC_012029	CGC	2	6	18929	18934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478458
504	NC_012029	CG	3	6	18971	18976	0 %	0 %	50 %	50 %	222478458
505	NC_012029	GCCG	2	8	18999	19006	0 %	0 %	50 %	50 %	222478458
506	NC_012029	GT	3	6	19131	19136	0 %	50 %	50 %	0 %	222478458
507	NC_012029	CACG	2	8	19217	19224	25 %	0 %	25 %	50 %	222478458
508	NC_012029	CCG	2	6	19234	19239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_012029	CCG	2	6	19241	19246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_012029	CGAA	2	8	19405	19412	50 %	0 %	25 %	25 %	222478459
511	NC_012029	TCG	2	6	19417	19422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478459
512	NC_012029	TCG	2	6	19492	19497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478459
513	NC_012029	CTT	2	6	19521	19526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478459
514	NC_012029	GTT	2	6	19582	19587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012029	CCGA	2	8	19641	19648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_012029	TCC	2	6	19678	19683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_012029	CGAC	2	8	19690	19697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_012029	AT	3	6	19748	19753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012029	AT	3	6	19786	19791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012029	TTA	2	6	19792	19797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012029	TG	3	6	19803	19808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012029	GGA	2	6	19821	19826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012029	GAGT	2	8	19892	19899	25 %	25 %	50 %	0 %	222478460
524	NC_012029	GCCC	2	8	19952	19959	0 %	0 %	25 %	75 %	222478460
525	NC_012029	GGA	2	6	19964	19969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478460
526	NC_012029	CTCCGC	2	12	19989	20000	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222478460
527	NC_012029	CGA	2	6	20066	20071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478460
528	NC_012029	CGC	2	6	20072	20077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478460
529	NC_012029	CGA	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478460
530	NC_012029	CGA	2	6	20102	20107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478460
531	NC_012029	CGA	3	9	20150	20158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478460
532	NC_012029	T	6	6	20181	20186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012029	GAA	2	6	20302	20307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012029	CCGGT	2	10	20335	20344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
535	NC_012029	AAT	2	6	20852	20857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012029	GCA	2	6	20925	20930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012029	GCC	2	6	21054	21059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_012029	GGAC	2	8	21243	21250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
539	NC_012029	GGA	2	6	21480	21485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012029	TAA	2	6	21536	21541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012029	TGA	2	6	21554	21559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012029	AG	3	6	21575	21580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012029	GCC	2	6	21591	21596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_012029	CGAG	2	8	21636	21643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_012029	CAG	2	6	21662	21667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012029	CCG	2	6	21699	21704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_012029	GGA	2	6	21715	21720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012029	GTA	2	6	21885	21890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012029	GC	3	6	21905	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_012029	CA	3	6	21934	21939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_012029	CATG	2	8	22128	22135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_012029	CCG	2	6	22152	22157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_012029	CGA	2	6	22168	22173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012029	CA	3	6	22186	22191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_012029	CCT	2	6	22249	22254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_012029	AGG	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012029	GAC	3	9	22353	22361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012029	CCTG	2	8	22413	22420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_012029	GAC	2	6	22434	22439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012029	AC	3	6	22565	22570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_012029	GGCTC	2	10	22598	22607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
562	NC_012029	GAA	2	6	22665	22670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012029	GGAA	2	8	22750	22757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012029	GTC	2	6	22775	22780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012029	CAAT	2	8	22849	22856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_012029	CTC	2	6	23009	23014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_012029	GAG	2	6	23141	23146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012029	TCC	2	6	23150	23155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_012029	AG	3	6	23163	23168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012029	CGT	2	6	23178	23183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012029	GCA	2	6	23275	23280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_012029	CAGG	2	8	23355	23362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_012029	GAG	2	6	23555	23560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012029	AAC	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012029	GGT	2	6	23700	23705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012029	AGC	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012029	ACC	2	6	23818	23823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_012029	AGC	2	6	23938	23943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012029	AGCG	2	8	24171	24178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_012029	GAA	2	6	24336	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012029	TAA	2	6	24396	24401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012029	CGG	2	6	24504	24509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012029	GTA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012029	GCA	2	6	24714	24719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012029	TAGG	2	8	24720	24727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012029	ACA	2	6	24766	24771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012029	TAC	2	6	24778	24783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012029	GAG	2	6	24812	24817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012029	GC	3	6	24873	24878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_012029	ATC	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012029	TGACGC	2	12	24961	24972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012029	GTC	2	6	25052	25057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012029	GTT	2	6	25146	25151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012029	AGG	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012029	CGT	2	6	25187	25192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_012029	GCT	2	6	25204	25209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012029	TG	3	6	25294	25299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012029	AAG	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012029	AGA	2	6	25398	25403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012029	GAA	2	6	25551	25556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012029	TC	4	8	25572	25579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_012029	GA	3	6	25592	25597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012029	GGC	2	6	25629	25634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012029	CCA	2	6	25684	25689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_012029	CGC	2	6	25737	25742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_012029	T	6	6	25807	25812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012029	AG	3	6	25820	25825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012029	CGG	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_012029	GCC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_012029	GCTC	2	8	25989	25996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_012029	GGT	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012029	CTT	2	6	26015	26020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012029	TCG	2	6	26073	26078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478462
614	NC_012029	CG	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	222478462
615	NC_012029	GT	3	6	26091	26096	0 %	50 %	50 %	0 %	222478462
616	NC_012029	TAG	2	6	26123	26128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478462
617	NC_012029	CCGC	2	8	26200	26207	0 %	0 %	25 %	75 %	222478462
618	NC_012029	GCG	2	6	26208	26213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478462
619	NC_012029	CGGCGA	2	12	26233	26244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478462
620	NC_012029	CGGG	2	8	26258	26265	0 %	0 %	75 %	25 %	222478462
621	NC_012029	CGGTGA	2	12	26401	26412	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478462
622	NC_012029	CCG	2	6	26413	26418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478462
623	NC_012029	GGA	2	6	26446	26451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478462
624	NC_012029	GTC	2	6	26495	26500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478462
625	NC_012029	ATCGCG	2	12	26502	26513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478462
626	NC_012029	CGTCGA	2	12	26515	26526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478462
627	NC_012029	CCTT	2	8	26604	26611	0 %	50 %	0 %	50 %	222478462
628	NC_012029	CCTT	2	8	26634	26641	0 %	50 %	0 %	50 %	222478462
629	NC_012029	GCG	2	6	26748	26753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478462
630	NC_012029	TGG	2	6	26807	26812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478462
631	NC_012029	GCG	2	6	26849	26854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012029	AG	3	6	26875	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012029	GC	3	6	26890	26895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_012029	CGA	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012029	TGC	2	6	26977	26982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_012029	GCC	2	6	27003	27008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_012029	GGCG	2	8	27024	27031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
638	NC_012029	CGCTT	2	10	27058	27067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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