MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012029	CGG	3	9	217372	217380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_012029	GAC	3	9	217472	217480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6003	NC_012029	CCG	2	6	217500	217505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6004	NC_012029	GAC	2	6	217538	217543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6005	NC_012029	GTGA	2	8	217622	217629	25 %	25 %	50 %	0 %	222478640
6006	NC_012029	CGG	3	9	217681	217689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478640
6007	NC_012029	GCC	2	6	217787	217792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6008	NC_012029	CGA	3	9	217801	217809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6009	NC_012029	CGC	2	6	217825	217830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6010	NC_012029	CG	3	6	217846	217851	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6011	NC_012029	CCGG	2	8	217879	217886	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6012	NC_012029	GTC	2	6	217892	217897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6013	NC_012029	GCC	2	6	217917	217922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6014	NC_012029	CGC	2	6	217963	217968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6015	NC_012029	CGC	2	6	217995	218000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6016	NC_012029	GTC	2	6	218010	218015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6017	NC_012029	G	6	6	218017	218022	0 %	0 %	100 %	0 %	222478640
6018	NC_012029	GGGC	2	8	218038	218045	0 %	0 %	75 %	25 %	222478640
6019	NC_012029	CGA	2	6	218083	218088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6020	NC_012029	CG	3	6	218114	218119	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6021	NC_012029	CCG	2	6	218134	218139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6022	NC_012029	CGG	2	6	218151	218156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478640
6023	NC_012029	CCG	2	6	218248	218253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6024	NC_012029	CGT	2	6	218254	218259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6025	NC_012029	G	6	6	218271	218276	0 %	0 %	100 %	0 %	222478640
6026	NC_012029	GGGT	2	8	218284	218291	0 %	25 %	75 %	0 %	222478640
6027	NC_012029	CGC	2	6	218302	218307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6028	NC_012029	CCG	3	9	218326	218334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6029	NC_012029	CG	3	6	218333	218338	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6030	NC_012029	CGT	2	6	218389	218394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6031	NC_012029	CCG	2	6	218400	218405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478640
6032	NC_012029	TCG	2	6	218406	218411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6033	NC_012029	GC	4	8	218423	218430	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6034	NC_012029	CGA	2	6	218434	218439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6035	NC_012029	CAG	2	6	218478	218483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6036	NC_012029	CGT	2	6	218500	218505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6037	NC_012029	GTC	3	9	218570	218578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6038	NC_012029	CGA	2	6	218632	218637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6039	NC_012029	CG	3	6	218671	218676	0 %	0 %	50 %	50 %	222478640
6040	NC_012029	CGT	2	6	218683	218688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6041	NC_012029	CGT	2	6	218695	218700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478640
6042	NC_012029	CTGC	2	8	218730	218737	0 %	25 %	25 %	50 %	222478641
6043	NC_012029	CGA	2	6	218745	218750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6044	NC_012029	TCG	2	6	218765	218770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6045	NC_012029	TGA	2	6	218820	218825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478641
6046	NC_012029	CGCGGG	2	12	218850	218861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478641
6047	NC_012029	AGA	2	6	218874	218879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478641
6048	NC_012029	CTC	2	6	218932	218937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6049	NC_012029	GTCG	2	8	218950	218957	0 %	25 %	50 %	25 %	222478641
6050	NC_012029	GTC	2	6	218959	218964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6051	NC_012029	GGC	2	6	218971	218976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478641
6052	NC_012029	ACC	2	6	218987	218992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478641
6053	NC_012029	CGA	2	6	219012	219017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6054	NC_012029	GACGCG	2	12	219061	219072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478641
6055	NC_012029	CGC	2	6	219096	219101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6056	NC_012029	GTC	2	6	219154	219159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6057	NC_012029	TCG	2	6	219203	219208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6058	NC_012029	GTC	2	6	219209	219214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6059	NC_012029	GTC	2	6	219232	219237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6060	NC_012029	GCC	2	6	219245	219250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6061	NC_012029	GTC	2	6	219259	219264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6062	NC_012029	TCG	2	6	219281	219286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6063	NC_012029	GCA	2	6	219315	219320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6064	NC_012029	GCC	2	6	219330	219335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6065	NC_012029	GTCC	2	8	219406	219413	0 %	25 %	25 %	50 %	222478641
6066	NC_012029	TCG	2	6	219464	219469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6067	NC_012029	GC	4	8	219490	219497	0 %	0 %	50 %	50 %	222478641
6068	NC_012029	TCG	2	6	219521	219526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6069	NC_012029	GCC	2	6	219595	219600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6070	NC_012029	GAC	2	6	219661	219666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6071	NC_012029	GGA	2	6	219702	219707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478641
6072	NC_012029	TCG	2	6	219716	219721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6073	NC_012029	AGG	2	6	219737	219742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478641
6074	NC_012029	GAC	2	6	219769	219774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6075	NC_012029	GTC	3	9	219778	219786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6076	NC_012029	CTC	2	6	219823	219828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6077	NC_012029	CGT	2	6	219847	219852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6078	NC_012029	TCG	2	6	219866	219871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6079	NC_012029	AGCG	2	8	219899	219906	25 %	0 %	50 %	25 %	222478641
6080	NC_012029	CG	3	6	219973	219978	0 %	0 %	50 %	50 %	222478641
6081	NC_012029	TCG	3	9	220004	220012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6082	NC_012029	TCC	2	6	220058	220063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6083	NC_012029	CGGG	2	8	220065	220072	0 %	0 %	75 %	25 %	222478641
6084	NC_012029	CCT	2	6	220080	220085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6085	NC_012029	CGT	2	6	220107	220112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6086	NC_012029	GAT	2	6	220162	220167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478641
6087	NC_012029	TCG	3	9	220179	220187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6088	NC_012029	CG	3	6	220190	220195	0 %	0 %	50 %	50 %	222478641
6089	NC_012029	CCG	2	6	220198	220203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6090	NC_012029	GCC	2	6	220210	220215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6091	NC_012029	CTC	2	6	220243	220248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6092	NC_012029	CTC	2	6	220255	220260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478641
6093	NC_012029	GTC	2	6	220264	220269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6094	NC_012029	CGC	2	6	220284	220289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
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6097	NC_012029	GC	3	6	220406	220411	0 %	0 %	50 %	50 %	222478641
6098	NC_012029	GAC	2	6	220420	220425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6099	NC_012029	CGT	2	6	220452	220457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478641
6100	NC_012029	CCG	2	6	220511	220516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478641
6101	NC_012029	GTC	2	6	220616	220621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_012029	TCGCGC	2	12	220669	220680	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_012029	CG	3	6	220715	220720	0 %	0 %	50 %	50 %	222478642
6104	NC_012029	GTCG	2	8	220817	220824	0 %	25 %	50 %	25 %	222478642
6105	NC_012029	ACGA	2	8	220827	220834	50 %	0 %	25 %	25 %	222478642
6106	NC_012029	TAC	2	6	220878	220883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_012029	ATA	2	6	220884	220889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_012029	GCC	2	6	220892	220897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_012029	GAAA	2	8	220908	220915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_012029	CGT	3	9	220939	220947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478643
6111	NC_012029	TCG	2	6	221086	221091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478643
6112	NC_012029	CGT	3	9	221096	221104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478643
6113	NC_012029	ACT	2	6	221118	221123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478643
6114	NC_012029	CATG	2	8	221127	221134	25 %	25 %	25 %	25 %	222478643
6115	NC_012029	CT	3	6	221173	221178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_012029	ACAA	2	8	221197	221204	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_012029	GTGC	2	8	221241	221248	0 %	25 %	50 %	25 %	222478644
6118	NC_012029	TCG	3	9	221267	221275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478644
6119	NC_012029	CCG	2	6	221291	221296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478644
6120	NC_012029	CAA	2	6	221391	221396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478644
6121	NC_012029	CGT	2	6	221421	221426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478644
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6123	NC_012029	GC	3	6	221463	221468	0 %	0 %	50 %	50 %	222478644
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6142	NC_012029	A	6	6	222109	222114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_012029	GGT	3	9	222116	222124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6243	NC_012029	GC	3	6	225423	225428	0 %	0 %	50 %	50 %	222478648
6244	NC_012029	CTC	3	9	225487	225495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
6245	NC_012029	GTG	2	6	225496	225501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478648
6246	NC_012029	CCT	2	6	225594	225599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
6247	NC_012029	TCG	4	12	225623	225634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
6248	NC_012029	CGC	2	6	225639	225644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
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6250	NC_012029	TCC	2	6	225692	225697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
6251	NC_012029	CGA	2	6	225771	225776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
6252	NC_012029	CTC	2	6	225793	225798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
6253	NC_012029	CGT	2	6	225811	225816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
6254	NC_012029	TCGA	2	8	225824	225831	25 %	25 %	25 %	25 %	222478648
6255	NC_012029	GCG	2	6	225878	225883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
6256	NC_012029	TCG	2	6	225902	225907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
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6264	NC_012029	TCA	2	6	226320	226325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478648
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6271	NC_012029	TCG	2	6	226568	226573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
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6275	NC_012029	CGT	3	9	226773	226781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
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6289	NC_012029	GAC	2	6	227158	227163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
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6292	NC_012029	TCG	2	6	227189	227194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
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6303	NC_012029	TTA	2	6	227662	227667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6315	NC_012029	CA	3	6	228115	228120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6316	NC_012029	ATCG	2	8	228133	228140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6317	NC_012029	AT	3	6	228166	228171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6318	NC_012029	ACT	2	6	228175	228180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6323	NC_012029	ACG	2	6	228568	228573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6324	NC_012029	ATT	2	6	228576	228581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6325	NC_012029	ACGC	2	8	228740	228747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6326	NC_012029	GC	3	6	228810	228815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6327	NC_012029	GCC	2	6	228917	228922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478651
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6353	NC_012029	GC	5	10	229665	229674	0 %	0 %	50 %	50 %	222478651
6354	NC_012029	CAT	2	6	229753	229758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478651
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6359	NC_012029	GCG	2	6	229979	229984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6360	NC_012029	GGGC	2	8	229994	230001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6361	NC_012029	CGT	2	6	230117	230122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478652
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6365	NC_012029	CCG	2	6	230308	230313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6366	NC_012029	GTA	2	6	230346	230351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6367	NC_012029	CGC	2	6	230355	230360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6368	NC_012029	CGT	2	6	230367	230372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6369	NC_012029	TCG	2	6	230476	230481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6370	NC_012029	GTC	2	6	230514	230519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6371	NC_012029	GTC	2	6	230574	230579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6372	NC_012029	CGGCGT	2	12	230582	230593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6373	NC_012029	CCT	2	6	230620	230625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6374	NC_012029	ATG	2	6	230675	230680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6375	NC_012029	GAT	2	6	230684	230689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6376	NC_012029	CAT	2	6	230801	230806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478653
6377	NC_012029	TCG	2	6	230817	230822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478653
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6379	NC_012029	CGC	2	6	230926	230931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
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6382	NC_012029	GCG	2	6	231063	231068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478653
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6386	NC_012029	CTC	2	6	231170	231175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478653
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6388	NC_012029	GAT	2	6	231212	231217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478653
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6390	NC_012029	CGC	2	6	231250	231255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
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6392	NC_012029	TCG	3	9	231381	231389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478653
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6394	NC_012029	CGC	2	6	231457	231462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
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6399	NC_012029	TCG	2	6	231645	231650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478653
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6402	NC_012029	GC	3	6	231795	231800	0 %	0 %	50 %	50 %	222478653
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6404	NC_012029	CGC	2	6	231850	231855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6407	NC_012029	CGC	2	6	232055	232060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6410	NC_012029	ATCG	2	8	232251	232258	25 %	25 %	25 %	25 %	222478654
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6413	NC_012029	CGT	2	6	232336	232341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478654
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6424	NC_012029	GC	3	6	232890	232895	0 %	0 %	50 %	50 %	222478654
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6438	NC_012029	TCG	2	6	233701	233706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
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6444	NC_012029	GTC	2	6	233817	233822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
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6481	NC_012029	TCGACG	2	12	234913	234924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6482	NC_012029	CGA	2	6	234929	234934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6483	NC_012029	GGC	2	6	234975	234980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478655
6484	NC_012029	CT	3	6	235050	235055	0 %	50 %	0 %	50 %	222478655
6485	NC_012029	CTG	2	6	235071	235076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6486	NC_012029	GCT	2	6	235079	235084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6487	NC_012029	GTC	2	6	235101	235106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6488	NC_012029	CGA	2	6	235175	235180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6489	NC_012029	CCGG	2	8	235181	235188	0 %	0 %	50 %	50 %	222478655
6490	NC_012029	TCGA	2	8	235191	235198	25 %	25 %	25 %	25 %	222478655
6491	NC_012029	ACG	2	6	235248	235253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6492	NC_012029	CG	3	6	235252	235257	0 %	0 %	50 %	50 %	222478655
6493	NC_012029	ACT	2	6	235413	235418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478655
6494	NC_012029	CCT	2	6	235478	235483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478655
6495	NC_012029	TCG	2	6	235498	235503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6496	NC_012029	GCGG	2	8	235541	235548	0 %	0 %	75 %	25 %	222478655
6497	NC_012029	CGG	2	6	235625	235630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478655
6498	NC_012029	CGT	2	6	235637	235642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
6499	NC_012029	TAC	2	6	235665	235670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478655
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