MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_012029	CGC	2	6	2023671	2023676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56502	NC_012029	CTG	2	6	2023771	2023776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480442
56503	NC_012029	GAGTG	2	10	2023835	2023844	20 %	20 %	60 %	0 %	222480442
56504	NC_012029	CGG	2	6	2024035	2024040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480442
56505	NC_012029	AG	3	6	2024051	2024056	50 %	0 %	50 %	0 %	222480442
56506	NC_012029	AAG	2	6	2024059	2024064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222480442
56507	NC_012029	TCATT	2	10	2024151	2024160	20 %	60 %	0 %	20 %	222480442
56508	NC_012029	AGT	2	6	2024164	2024169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56509	NC_012029	TCC	2	6	2024170	2024175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56510	NC_012029	AAC	2	6	2024203	2024208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56511	NC_012029	TAT	2	6	2024219	2024224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56512	NC_012029	GC	3	6	2024295	2024300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56513	NC_012029	TCG	3	9	2024329	2024337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56514	NC_012029	GCC	2	6	2024401	2024406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56515	NC_012029	AGT	2	6	2024419	2024424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56516	NC_012029	CTCG	2	8	2024443	2024450	0 %	25 %	25 %	50 %	222480443
56517	NC_012029	CCCG	2	8	2024475	2024482	0 %	0 %	25 %	75 %	222480443
56518	NC_012029	CCCG	2	8	2024539	2024546	0 %	0 %	25 %	75 %	222480443
56519	NC_012029	TCG	3	9	2024564	2024572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56520	NC_012029	CGA	2	6	2024598	2024603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56521	NC_012029	CGG	2	6	2024616	2024621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480443
56522	NC_012029	TCG	2	6	2024633	2024638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56523	NC_012029	CGC	2	6	2024656	2024661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480443
56524	NC_012029	GCC	2	6	2024684	2024689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480443
56525	NC_012029	ACGT	2	8	2024708	2024715	25 %	25 %	25 %	25 %	222480443
56526	NC_012029	CG	3	6	2024720	2024725	0 %	0 %	50 %	50 %	222480443
56527	NC_012029	GGC	2	6	2024735	2024740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480443
56528	NC_012029	TTC	3	9	2024747	2024755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480443
56529	NC_012029	CGT	2	6	2024805	2024810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56530	NC_012029	GCTC	2	8	2024820	2024827	0 %	25 %	25 %	50 %	222480443
56531	NC_012029	GTC	2	6	2024831	2024836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56532	NC_012029	CAC	2	6	2024845	2024850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480443
56533	NC_012029	CTCG	2	8	2024869	2024876	0 %	25 %	25 %	50 %	222480443
56534	NC_012029	CCG	2	6	2024886	2024891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480443
56535	NC_012029	GTC	2	6	2024911	2024916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56536	NC_012029	CTC	2	6	2024920	2024925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480443
56537	NC_012029	CGGTCG	2	12	2024988	2024999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222480443
56538	NC_012029	GC	3	6	2025021	2025026	0 %	0 %	50 %	50 %	222480443
56539	NC_012029	GCGA	2	8	2025061	2025068	25 %	0 %	50 %	25 %	222480443
56540	NC_012029	ACCGCG	2	12	2025077	2025088	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222480443
56541	NC_012029	GCA	2	6	2025092	2025097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56542	NC_012029	AAC	2	6	2025164	2025169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222480443
56543	NC_012029	CGG	2	6	2025204	2025209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480443
56544	NC_012029	GGT	2	6	2025259	2025264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480443
56545	NC_012029	CGG	2	6	2025274	2025279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480443
56546	NC_012029	GC	3	6	2025315	2025320	0 %	0 %	50 %	50 %	222480443
56547	NC_012029	GTC	2	6	2025382	2025387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480443
56548	NC_012029	GGA	2	6	2025481	2025486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56549	NC_012029	ACCGGA	2	12	2025516	2025527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480444
56550	NC_012029	GC	4	8	2025534	2025541	0 %	0 %	50 %	50 %	222480444
56551	NC_012029	GCC	2	6	2025544	2025549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480444
56552	NC_012029	CCG	2	6	2025579	2025584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480444
56553	NC_012029	GCG	2	6	2025596	2025601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480444
56554	NC_012029	CGA	2	6	2025636	2025641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480444
56555	NC_012029	CGA	2	6	2025679	2025684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480444
56556	NC_012029	GCCG	2	8	2025703	2025710	0 %	0 %	50 %	50 %	222480444
56557	NC_012029	CGA	2	6	2025732	2025737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480444
56558	NC_012029	ACG	2	6	2025909	2025914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480444
56559	NC_012029	C	7	7	2025941	2025947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56560	NC_012029	GTAC	2	8	2025953	2025960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56561	NC_012029	CGGC	2	8	2025984	2025991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56562	NC_012029	CGA	2	6	2025994	2025999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56563	NC_012029	CCG	2	6	2026011	2026016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56564	NC_012029	GCA	2	6	2026020	2026025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56565	NC_012029	ACTC	2	8	2026027	2026034	25 %	25 %	0 %	50 %	222480445
56566	NC_012029	TCG	2	6	2026048	2026053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56567	NC_012029	CGA	2	6	2026061	2026066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56568	NC_012029	CGT	2	6	2026091	2026096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56569	NC_012029	CGA	2	6	2026112	2026117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56570	NC_012029	CCT	2	6	2026139	2026144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480445
56571	NC_012029	GTG	2	6	2026171	2026176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480445
56572	NC_012029	CGG	2	6	2026181	2026186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480445
56573	NC_012029	CGC	2	6	2026289	2026294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480445
56574	NC_012029	GGT	2	6	2026337	2026342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480445
56575	NC_012029	GCC	2	6	2026350	2026355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480445
56576	NC_012029	TCG	2	6	2026432	2026437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56577	NC_012029	CCT	2	6	2026454	2026459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480445
56578	NC_012029	TGT	2	6	2026484	2026489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222480445
56579	NC_012029	GCCC	2	8	2026499	2026506	0 %	0 %	25 %	75 %	222480445
56580	NC_012029	CCG	2	6	2026510	2026515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480445
56581	NC_012029	GTC	2	6	2026536	2026541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480445
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56583	NC_012029	CGC	2	6	2026571	2026576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480445
56584	NC_012029	CGA	2	6	2026655	2026660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56585	NC_012029	GGT	2	6	2026688	2026693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222480445
56586	NC_012029	CGG	2	6	2026709	2026714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480445
56587	NC_012029	TCC	2	6	2026726	2026731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480445
56588	NC_012029	GAC	2	6	2026767	2026772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480445
56589	NC_012029	CTC	2	6	2026788	2026793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480445
56590	NC_012029	GGC	2	6	2026794	2026799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480445
56591	NC_012029	GCC	2	6	2026908	2026913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480445
56592	NC_012029	CGAG	2	8	2026925	2026932	25 %	0 %	50 %	25 %	222480445
56593	NC_012029	GTA	2	6	2026962	2026967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480445
56594	NC_012029	CG	3	6	2027037	2027042	0 %	0 %	50 %	50 %	222480445
56595	NC_012029	ATCG	2	8	2027043	2027050	25 %	25 %	25 %	25 %	222480445
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56598	NC_012029	ATC	2	6	2027185	2027190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222480445
56599	NC_012029	CCTG	2	8	2027204	2027211	0 %	25 %	25 %	50 %	222480445
56600	NC_012029	GGT	2	6	2027321	2027326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56601	NC_012029	CGA	2	6	2027344	2027349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56602	NC_012029	GTT	2	6	2027403	2027408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56603	NC_012029	GA	3	6	2027457	2027462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56604	NC_012029	TCG	3	9	2027542	2027550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480446
56605	NC_012029	GGC	2	6	2027585	2027590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480446
56606	NC_012029	ATCG	2	8	2027592	2027599	25 %	25 %	25 %	25 %	222480446
56607	NC_012029	CGA	2	6	2027600	2027605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480446
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56617	NC_012029	GAC	3	9	2027817	2027825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480446
56618	NC_012029	TCG	2	6	2027830	2027835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480446
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56735	NC_012029	CGC	2	6	2031816	2031821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480449
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56737	NC_012029	CGA	2	6	2031861	2031866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480449
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56839	NC_012029	CGAT	2	8	2035263	2035270	25 %	25 %	25 %	25 %	222480455
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56846	NC_012029	CGC	2	6	2035504	2035509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480455
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56968	NC_012029	CT	3	6	2039957	2039962	0 %	50 %	0 %	50 %	222480460
56969	NC_012029	CGC	2	6	2039965	2039970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480460
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56971	NC_012029	CTG	2	6	2039981	2039986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480460
56972	NC_012029	TCG	2	6	2039988	2039993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480460
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56975	NC_012029	GCC	2	6	2040068	2040073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480460
56976	NC_012029	CGG	2	6	2040079	2040084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480460
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56978	NC_012029	TCG	2	6	2040144	2040149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480460
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56982	NC_012029	GC	3	6	2040384	2040389	0 %	0 %	50 %	50 %	222480460
56983	NC_012029	CGG	2	6	2040414	2040419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480460
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56985	NC_012029	CGT	2	6	2040487	2040492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480460
56986	NC_012029	GTA	2	6	2040497	2040502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480460
56987	NC_012029	TCG	2	6	2040573	2040578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480460
56988	NC_012029	CGA	2	6	2040613	2040618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480460
56989	NC_012029	TC	3	6	2040631	2040636	0 %	50 %	0 %	50 %	222480460
56990	NC_012029	CGG	2	6	2040643	2040648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480460
56991	NC_012029	GCG	2	6	2040676	2040681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56992	NC_012029	GTC	2	6	2040705	2040710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480461
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56994	NC_012029	AC	3	6	2040800	2040805	50 %	0 %	0 %	50 %	222480461
56995	NC_012029	AGC	2	6	2040883	2040888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480461
56996	NC_012029	CTC	2	6	2040906	2040911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480461
56997	NC_012029	GTC	2	6	2040939	2040944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480461
56998	NC_012029	CGA	2	6	2040953	2040958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480461
56999	NC_012029	TCG	2	6	2040991	2040996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480461
57000	NC_012029	GAC	2	6	2041053	2041058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480461

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