MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_012029	ACC	2	6	2006716	2006721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480423
56003	NC_012029	CG	3	6	2006726	2006731	0 %	0 %	50 %	50 %	222480423
56004	NC_012029	CGG	2	6	2006753	2006758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480423
56005	NC_012029	CCG	2	6	2006816	2006821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480424
56006	NC_012029	CGTCAC	2	12	2006835	2006846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222480424
56007	NC_012029	CCT	2	6	2006847	2006852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222480424
56008	NC_012029	GCGG	2	8	2006942	2006949	0 %	0 %	75 %	25 %	222480424
56009	NC_012029	CGG	2	6	2007053	2007058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480424
56010	NC_012029	CTT	2	6	2007078	2007083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480424
56011	NC_012029	CG	3	6	2007102	2007107	0 %	0 %	50 %	50 %	222480424
56012	NC_012029	GAC	2	6	2007154	2007159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56013	NC_012029	CGC	2	6	2007172	2007177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56014	NC_012029	CGA	2	6	2007269	2007274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480425
56015	NC_012029	CGG	2	6	2007290	2007295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480425
56016	NC_012029	ACCG	2	8	2007342	2007349	25 %	0 %	25 %	50 %	222480425
56017	NC_012029	TCT	2	6	2007371	2007376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222480425
56018	NC_012029	TGT	2	6	2007389	2007394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222480425
56019	NC_012029	TCG	2	6	2007457	2007462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480425
56020	NC_012029	CAG	2	6	2007480	2007485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480425
56021	NC_012029	CGG	2	6	2007500	2007505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480425
56022	NC_012029	GAC	2	6	2007513	2007518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480425
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56031	NC_012029	GAT	2	6	2007999	2008004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480425
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56033	NC_012029	GC	3	6	2008028	2008033	0 %	0 %	50 %	50 %	222480425
56034	NC_012029	GGCTC	2	10	2008040	2008049	0 %	20 %	40 %	40 %	222480425
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56036	NC_012029	GC	3	6	2008078	2008083	0 %	0 %	50 %	50 %	222480425
56037	NC_012029	GC	3	6	2008087	2008092	0 %	0 %	50 %	50 %	222480425
56038	NC_012029	AGT	2	6	2008097	2008102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222480425
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56042	NC_012029	CGG	2	6	2008307	2008312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56043	NC_012029	CGA	2	6	2008354	2008359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56044	NC_012029	CG	3	6	2008415	2008420	0 %	0 %	50 %	50 %	222480426
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56051	NC_012029	CGT	2	6	2008546	2008551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480426
56052	NC_012029	TCGGC	2	10	2008557	2008566	0 %	20 %	40 %	40 %	222480426
56053	NC_012029	CGAC	2	8	2008618	2008625	25 %	0 %	25 %	50 %	222480426
56054	NC_012029	GC	4	8	2008636	2008643	0 %	0 %	50 %	50 %	222480426
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56088	NC_012029	TCGACG	2	12	2009651	2009662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222480427
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56117	NC_012029	GTG	2	6	2010834	2010839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56233	NC_012029	CGA	2	6	2014607	2014612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480430
56234	NC_012029	GC	3	6	2014613	2014618	0 %	0 %	50 %	50 %	222480430
56235	NC_012029	GC	3	6	2014658	2014663	0 %	0 %	50 %	50 %	222480430
56236	NC_012029	CAG	2	6	2014793	2014798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480430
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56239	NC_012029	GC	4	8	2014943	2014950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56240	NC_012029	CGA	2	6	2015019	2015024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480431
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56245	NC_012029	CGG	2	6	2015108	2015113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480431
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56247	NC_012029	TCG	2	6	2015309	2015314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480431
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56298	NC_012029	C	7	7	2017074	2017080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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56301	NC_012029	CG	3	6	2017186	2017191	0 %	0 %	50 %	50 %	222480435
56302	NC_012029	A	6	6	2017252	2017257	100 %	0 %	0 %	0 %	222480435
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56332	NC_012029	GCCG	2	8	2018372	2018379	0 %	0 %	50 %	50 %	222480435
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56334	NC_012029	GAC	2	6	2018432	2018437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480435
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56338	NC_012029	CGA	2	6	2018542	2018547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480435
56339	NC_012029	CG	3	6	2018569	2018574	0 %	0 %	50 %	50 %	222480435
56340	NC_012029	GCC	2	6	2018609	2018614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56341	NC_012029	GAC	2	6	2018615	2018620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56343	NC_012029	CGGT	2	8	2018724	2018731	0 %	25 %	50 %	25 %	222480436
56344	NC_012029	CGG	2	6	2018735	2018740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480436
56345	NC_012029	CGC	4	12	2018744	2018755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480436
56346	NC_012029	TCG	2	6	2018785	2018790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480436
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56379	NC_012029	GCGCG	2	10	2019775	2019784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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56463	NC_012029	GTCGAC	2	12	2022529	2022540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222480440
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56465	NC_012029	CGA	2	6	2022655	2022660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56466	NC_012029	TCG	2	6	2022699	2022704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56467	NC_012029	ACC	2	6	2022713	2022718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222480441
56468	NC_012029	ACG	2	6	2022735	2022740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56469	NC_012029	CGG	2	6	2022757	2022762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480441
56470	NC_012029	CGA	2	6	2022796	2022801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56471	NC_012029	TCG	2	6	2022849	2022854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56472	NC_012029	GCT	2	6	2022855	2022860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480441
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56479	NC_012029	GCC	2	6	2023022	2023027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480441
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56483	NC_012029	CG	3	6	2023110	2023115	0 %	0 %	50 %	50 %	222480441
56484	NC_012029	CGACGC	2	12	2023156	2023167	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222480441
56485	NC_012029	GAG	2	6	2023223	2023228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480441
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56488	NC_012029	GCGCG	2	10	2023306	2023315	0 %	0 %	60 %	40 %	222480441
56489	NC_012029	CGA	2	6	2023318	2023323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56490	NC_012029	AGG	2	6	2023350	2023355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222480441
56491	NC_012029	CGA	2	6	2023366	2023371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56492	NC_012029	CCG	2	6	2023377	2023382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480441
56493	NC_012029	GCC	2	6	2023433	2023438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480441
56494	NC_012029	TCG	3	9	2023464	2023472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56495	NC_012029	AGGGCG	2	12	2023497	2023508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222480441
56496	NC_012029	TCGA	2	8	2023514	2023521	25 %	25 %	25 %	25 %	222480441
56497	NC_012029	CAG	2	6	2023550	2023555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56498	NC_012029	GGC	2	6	2023556	2023561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222480441
56499	NC_012029	GTC	2	6	2023568	2023573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222480441
56500	NC_012029	CGC	2	6	2023624	2023629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222480441

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