MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012029	CTG	2	6	167007	167012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4502	NC_012029	GCC	2	6	167042	167047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478594
4503	NC_012029	GACG	2	8	167048	167055	25 %	0 %	50 %	25 %	222478594
4504	NC_012029	CGC	2	6	167056	167061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478594
4505	NC_012029	GCG	2	6	167182	167187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478594
4506	NC_012029	CAC	2	6	167208	167213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478594
4507	NC_012029	GAC	2	6	167277	167282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4508	NC_012029	CGA	2	6	167312	167317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4509	NC_012029	CCG	2	6	167319	167324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478594
4510	NC_012029	GTC	3	9	167352	167360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4511	NC_012029	GCA	2	6	167363	167368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4512	NC_012029	TCA	2	6	167377	167382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478594
4513	NC_012029	CCG	2	6	167383	167388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478594
4514	NC_012029	GAG	2	6	167439	167444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478594
4515	NC_012029	AGA	2	6	167452	167457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478594
4516	NC_012029	GAG	2	6	167484	167489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478594
4517	NC_012029	TCA	2	6	167500	167505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478594
4518	NC_012029	CGC	2	6	167516	167521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478594
4519	NC_012029	GTC	2	6	167523	167528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478594
4520	NC_012029	CGGC	2	8	167623	167630	0 %	0 %	50 %	50 %	222478594
4521	NC_012029	GCA	2	6	167663	167668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478595
4522	NC_012029	CGA	2	6	167708	167713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478595
4523	NC_012029	CGA	2	6	167782	167787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478595
4524	NC_012029	ATCGAC	2	12	167877	167888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478595
4525	NC_012029	CGA	2	6	167891	167896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478595
4526	NC_012029	CG	3	6	167898	167903	0 %	0 %	50 %	50 %	222478595
4527	NC_012029	ACG	2	6	167935	167940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478595
4528	NC_012029	CGCT	2	8	168012	168019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_012029	GCCGTC	2	12	168023	168034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_012029	TCG	2	6	168037	168042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_012029	CG	3	6	168101	168106	0 %	0 %	50 %	50 %	222478596
4532	NC_012029	GTC	2	6	168171	168176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4533	NC_012029	AGC	2	6	168191	168196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4534	NC_012029	ACG	2	6	168261	168266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4535	NC_012029	GAG	2	6	168275	168280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478596
4536	NC_012029	CGG	2	6	168322	168327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478596
4537	NC_012029	CCG	2	6	168345	168350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478596
4538	NC_012029	GGT	2	6	168416	168421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478596
4539	NC_012029	CGA	2	6	168430	168435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4540	NC_012029	CGA	2	6	168442	168447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4541	NC_012029	AGC	2	6	168450	168455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4542	NC_012029	AC	3	6	168499	168504	50 %	0 %	0 %	50 %	222478596
4543	NC_012029	GAC	2	6	168509	168514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4544	NC_012029	GCG	2	6	168535	168540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478596
4545	NC_012029	CGC	2	6	168557	168562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478596
4546	NC_012029	CGA	2	6	168568	168573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478596
4547	NC_012029	GCC	3	9	168718	168726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478597
4548	NC_012029	CT	3	6	168753	168758	0 %	50 %	0 %	50 %	222478597
4549	NC_012029	GTG	2	6	168814	168819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478597
4550	NC_012029	AGG	2	6	168836	168841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478597
4551	NC_012029	TCG	3	9	168913	168921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478597
4552	NC_012029	CGA	2	6	168935	168940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478597
4553	NC_012029	GGCGTC	2	12	168960	168971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478597
4554	NC_012029	GGC	2	6	169193	169198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478598
4555	NC_012029	GTC	2	6	169247	169252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4556	NC_012029	CGT	4	12	169279	169290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4557	NC_012029	CGACGC	2	12	169303	169314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478598
4558	NC_012029	GGC	2	6	169321	169326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478598
4559	NC_012029	TCG	3	9	169353	169361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4560	NC_012029	GCC	2	6	169431	169436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478598
4561	NC_012029	CCGGA	2	10	169441	169450	20 %	0 %	40 %	40 %	222478598
4562	NC_012029	CG	3	6	169501	169506	0 %	0 %	50 %	50 %	222478598
4563	NC_012029	CG	3	6	169523	169528	0 %	0 %	50 %	50 %	222478598
4564	NC_012029	CTCG	2	8	169576	169583	0 %	25 %	25 %	50 %	222478598
4565	NC_012029	GC	3	6	169591	169596	0 %	0 %	50 %	50 %	222478598
4566	NC_012029	TCC	2	6	169644	169649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478598
4567	NC_012029	CGGT	2	8	169657	169664	0 %	25 %	50 %	25 %	222478598
4568	NC_012029	TCGG	2	8	169682	169689	0 %	25 %	50 %	25 %	222478598
4569	NC_012029	CGCGGC	2	12	169714	169725	0 %	0 %	50 %	50 %	222478598
4570	NC_012029	CGC	2	6	169732	169737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478598
4571	NC_012029	CGC	2	6	169741	169746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478598
4572	NC_012029	CGG	2	6	169787	169792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478598
4573	NC_012029	TC	3	6	169831	169836	0 %	50 %	0 %	50 %	222478598
4574	NC_012029	CGT	2	6	169852	169857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4575	NC_012029	TCG	2	6	169868	169873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
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4577	NC_012029	CGT	2	6	169930	169935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4578	NC_012029	CGACGC	2	12	170007	170018	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478598
4579	NC_012029	TCG	3	9	170022	170030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478598
4580	NC_012029	GGC	2	6	170104	170109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478598
4581	NC_012029	TTG	2	6	170121	170126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478598
4582	NC_012029	CGG	2	6	170163	170168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478598
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4584	NC_012029	CGGC	2	8	170250	170257	0 %	0 %	50 %	50 %	222478598
4585	NC_012029	GA	3	6	170322	170327	50 %	0 %	50 %	0 %	222478598
4586	NC_012029	GAA	2	6	170388	170393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478599
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4588	NC_012029	TG	3	6	170424	170429	0 %	50 %	50 %	0 %	222478599
4589	NC_012029	TC	3	6	170503	170508	0 %	50 %	0 %	50 %	222478599
4590	NC_012029	CGA	2	6	170549	170554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4591	NC_012029	CGA	2	6	170570	170575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4592	NC_012029	CGT	2	6	170657	170662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4593	NC_012029	CTG	2	6	170697	170702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4594	NC_012029	CGA	2	6	170714	170719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
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4599	NC_012029	CGA	2	6	170873	170878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4600	NC_012029	CG	3	6	170893	170898	0 %	0 %	50 %	50 %	222478599
4601	NC_012029	GTCGAG	2	12	170943	170954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478599
4602	NC_012029	GTC	2	6	170964	170969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4603	NC_012029	GAC	2	6	171059	171064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4604	NC_012029	CGA	2	6	171068	171073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4605	NC_012029	TCG	2	6	171088	171093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4606	NC_012029	CCGC	2	8	171094	171101	0 %	0 %	25 %	75 %	222478599
4607	NC_012029	CCG	2	6	171140	171145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478599
4608	NC_012029	GAC	2	6	171180	171185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4609	NC_012029	CGA	2	6	171209	171214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
4610	NC_012029	GCG	2	6	171223	171228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478599
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4612	NC_012029	TG	3	6	171286	171291	0 %	50 %	50 %	0 %	222478599
4613	NC_012029	ACA	2	6	171295	171300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478599
4614	NC_012029	GCC	2	6	171303	171308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478599
4615	NC_012029	CGA	2	6	171320	171325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478599
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4865	NC_012029	CGC	2	6	179248	179253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478605
4866	NC_012029	GCT	2	6	179254	179259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478605
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4868	NC_012029	GCT	2	6	179269	179274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478605
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4873	NC_012029	CGG	2	6	179418	179423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478605
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4879	NC_012029	CTCGGT	2	12	179524	179535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478605
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4886	NC_012029	CGT	2	6	179749	179754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478605
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4897	NC_012029	GTC	2	6	180035	180040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478605
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4902	NC_012029	GACG	2	8	180155	180162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4903	NC_012029	TCG	2	6	180277	180282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478606
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4935	NC_012029	TTG	2	6	181183	181188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4937	NC_012029	CGG	2	6	181234	181239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4943	NC_012029	CGC	2	6	181482	181487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4948	NC_012029	ACGG	2	8	181623	181630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4949	NC_012029	CTCGC	2	10	181680	181689	0 %	20 %	20 %	60 %	222478607
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4951	NC_012029	CGCC	2	8	181722	181729	0 %	0 %	25 %	75 %	222478607
4952	NC_012029	CGA	2	6	181730	181735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
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4954	NC_012029	CGC	2	6	181795	181800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478607
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4961	NC_012029	GTCG	2	8	182025	182032	0 %	25 %	50 %	25 %	222478607
4962	NC_012029	CG	4	8	182031	182038	0 %	0 %	50 %	50 %	222478607
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4970	NC_012029	TAC	2	6	182226	182231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478607
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4978	NC_012029	CGCC	2	8	182396	182403	0 %	0 %	25 %	75 %	222478607
4979	NC_012029	CGA	2	6	182417	182422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
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4983	NC_012029	CGA	2	6	182534	182539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
4984	NC_012029	CGA	2	6	182576	182581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
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4986	NC_012029	CAC	2	6	182613	182618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478607
4987	NC_012029	CG	3	6	182643	182648	0 %	0 %	50 %	50 %	222478607
4988	NC_012029	CGG	2	6	182787	182792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478607
4989	NC_012029	CGA	2	6	182810	182815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
4990	NC_012029	CGA	2	6	182822	182827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
4991	NC_012029	GAC	2	6	182868	182873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
4992	NC_012029	CGA	3	9	182882	182890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478607
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4994	NC_012029	GGA	2	6	182996	183001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478607
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4996	NC_012029	GGC	2	6	183077	183082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478607
4997	NC_012029	CGG	2	6	183112	183117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478607
4998	NC_012029	GTC	2	6	183129	183134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478607
4999	NC_012029	TCGACG	2	12	183148	183159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478607
5000	NC_012029	GC	3	6	183183	183188	0 %	0 %	50 %	50 %	222478607

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