MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012028	TGG	2	6	74110	74115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475745
1502	NC_012028	CGT	2	6	74145	74150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475745
1503	NC_012028	AC	3	6	74193	74198	50 %	0 %	0 %	50 %	222475745
1504	NC_012028	CGG	2	6	74240	74245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475745
1505	NC_012028	GTA	2	6	74278	74283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475745
1506	NC_012028	AGTC	2	8	74298	74305	25 %	25 %	25 %	25 %	222475745
1507	NC_012028	CTG	2	6	74323	74328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475745
1508	NC_012028	GCC	2	6	74412	74417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1509	NC_012028	GCC	2	6	74457	74462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1510	NC_012028	GCC	2	6	74500	74505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1511	NC_012028	GCAG	2	8	74538	74545	25 %	0 %	50 %	25 %	222475746
1512	NC_012028	GC	3	6	74570	74575	0 %	0 %	50 %	50 %	222475746
1513	NC_012028	GCC	2	6	74682	74687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1514	NC_012028	CGT	2	6	74744	74749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1515	NC_012028	GCC	2	6	74805	74810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1516	NC_012028	CTCG	2	8	74879	74886	0 %	25 %	25 %	50 %	222475746
1517	NC_012028	CG	3	6	74895	74900	0 %	0 %	50 %	50 %	222475746
1518	NC_012028	TCC	2	6	74916	74921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475746
1519	NC_012028	ACC	2	6	74942	74947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475746
1520	NC_012028	CGT	2	6	74951	74956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1521	NC_012028	GTC	2	6	74973	74978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1522	NC_012028	GCC	2	6	74979	74984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1523	NC_012028	CCG	2	6	75052	75057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1524	NC_012028	CAG	2	6	75065	75070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1525	NC_012028	TGC	2	6	75071	75076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1526	NC_012028	GCC	2	6	75135	75140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475746
1527	NC_012028	CGT	2	6	75172	75177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1528	NC_012028	CCA	2	6	75190	75195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475746
1529	NC_012028	CGT	2	6	75217	75222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475746
1530	NC_012028	CGT	2	6	75305	75310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_012028	CGC	2	6	75336	75341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_012028	CGA	2	6	75375	75380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012028	CGG	2	6	75415	75420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_012028	CAT	2	6	75499	75504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475747
1535	NC_012028	CGG	2	6	75535	75540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475747
1536	NC_012028	GTC	2	6	75596	75601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1537	NC_012028	TCG	2	6	75619	75624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1538	NC_012028	GC	3	6	75631	75636	0 %	0 %	50 %	50 %	222475747
1539	NC_012028	GAC	2	6	75680	75685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1540	NC_012028	CGA	2	6	75694	75699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1541	NC_012028	GCC	2	6	75722	75727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475747
1542	NC_012028	CGA	2	6	75778	75783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1543	NC_012028	ACG	2	6	75849	75854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1544	NC_012028	GCCT	2	8	75864	75871	0 %	25 %	25 %	50 %	222475747
1545	NC_012028	CTGT	2	8	75923	75930	0 %	50 %	25 %	25 %	222475747
1546	NC_012028	CGGC	2	8	75992	75999	0 %	0 %	50 %	50 %	222475747
1547	NC_012028	CG	3	6	76013	76018	0 %	0 %	50 %	50 %	222475747
1548	NC_012028	GTC	2	6	76061	76066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1549	NC_012028	TCA	2	6	76074	76079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475747
1550	NC_012028	CGT	2	6	76132	76137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1551	NC_012028	GTCGGC	2	12	76148	76159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222475747
1552	NC_012028	CGCC	2	8	76183	76190	0 %	0 %	25 %	75 %	222475747
1553	NC_012028	CAC	2	6	76196	76201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475747
1554	NC_012028	CAGC	2	8	76220	76227	25 %	0 %	25 %	50 %	222475747
1555	NC_012028	GTC	2	6	76274	76279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475747
1556	NC_012028	ATG	2	6	76304	76309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475747
1557	NC_012028	ATC	2	6	76430	76435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475747
1558	NC_012028	GCC	2	6	76489	76494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475748
1559	NC_012028	TCA	2	6	76529	76534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475748
1560	NC_012028	GCA	2	6	76634	76639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475748
1561	NC_012028	CG	3	6	76655	76660	0 %	0 %	50 %	50 %	222475748
1562	NC_012028	CCG	2	6	76713	76718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475748
1563	NC_012028	GC	3	6	76727	76732	0 %	0 %	50 %	50 %	222475748
1564	NC_012028	ACG	2	6	76758	76763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475748
1565	NC_012028	GGCC	2	8	76900	76907	0 %	0 %	50 %	50 %	222475748
1566	NC_012028	ACG	2	6	76919	76924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475748
1567	NC_012028	TTCT	2	8	76992	76999	0 %	75 %	0 %	25 %	222475748
1568	NC_012028	AT	3	6	77005	77010	50 %	50 %	0 %	0 %	222475748
1569	NC_012028	TTC	2	6	77011	77016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475748
1570	NC_012028	CTT	2	6	77037	77042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475748
1571	NC_012028	CCCG	2	8	77095	77102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1572	NC_012028	AGGT	2	8	77243	77250	25 %	25 %	50 %	0 %	222475749
1573	NC_012028	AGTT	2	8	77385	77392	25 %	50 %	25 %	0 %	222475749
1574	NC_012028	GGAG	2	8	77430	77437	25 %	0 %	75 %	0 %	222475749
1575	NC_012028	ACTT	2	8	77445	77452	25 %	50 %	0 %	25 %	222475749
1576	NC_012028	TTC	2	6	77490	77495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475749
1577	NC_012028	TTCTG	2	10	77515	77524	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1578	NC_012028	TGG	2	6	77531	77536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012028	CGT	2	6	77553	77558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475750
1580	NC_012028	GAA	2	6	77614	77619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475750
1581	NC_012028	GAA	2	6	77683	77688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475750
1582	NC_012028	CAT	2	6	77724	77729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475750
1583	NC_012028	CGA	2	6	77923	77928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_012028	GA	3	6	77927	77932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012028	ACGG	2	8	77936	77943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_012028	GCTGTC	2	12	77955	77966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_012028	GGC	2	6	77967	77972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_012028	GCC	2	6	77978	77983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_012028	CACT	2	8	78000	78007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_012028	TCGG	2	8	78020	78027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_012028	GTC	2	6	78046	78051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1592	NC_012028	TCG	2	6	78106	78111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1593	NC_012028	CCA	3	9	78139	78147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475751
1594	NC_012028	CGCC	2	8	78155	78162	0 %	0 %	25 %	75 %	222475751
1595	NC_012028	CGG	2	6	78164	78169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475751
1596	NC_012028	CAC	3	9	78226	78234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475751
1597	NC_012028	CAG	2	6	78238	78243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1598	NC_012028	GTTGTC	2	12	78263	78274	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222475751
1599	NC_012028	AGT	2	6	78327	78332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475751
1600	NC_012028	GTG	2	6	78348	78353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475751
1601	NC_012028	GCG	2	6	78374	78379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475751
1602	NC_012028	GTAC	2	8	78424	78431	25 %	25 %	25 %	25 %	222475751
1603	NC_012028	GAT	2	6	78553	78558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475751
1604	NC_012028	AGC	2	6	78590	78595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1605	NC_012028	GAA	2	6	78673	78678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475751
1606	NC_012028	ACT	2	6	78691	78696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475751
1607	NC_012028	TTC	2	6	78746	78751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475751
1608	NC_012028	CG	3	6	78755	78760	0 %	0 %	50 %	50 %	222475751
1609	NC_012028	GTC	2	6	78829	78834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1610	NC_012028	GTA	2	6	78844	78849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475751
1611	NC_012028	CGA	2	6	79053	79058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1612	NC_012028	CAG	2	6	79077	79082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475751
1613	NC_012028	AAG	2	6	79147	79152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475751
1614	NC_012028	AC	3	6	79194	79199	50 %	0 %	0 %	50 %	222475751
1615	NC_012028	AGCA	2	8	79204	79211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_012028	CTAA	2	8	79218	79225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_012028	GTT	2	6	79364	79369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475752
1618	NC_012028	TTG	2	6	79375	79380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475752
1619	NC_012028	CAT	2	6	79424	79429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475752
1620	NC_012028	GCT	2	6	79470	79475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475752
1621	NC_012028	CGA	2	6	79493	79498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475752
1622	NC_012028	GTT	2	6	79518	79523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475752
1623	NC_012028	GTC	2	6	79540	79545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475752
1624	NC_012028	GAC	2	6	79636	79641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475752
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1626	NC_012028	GAT	2	6	79707	79712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475752
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