MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 62516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011899	A	8	8	170723	170730	100 %	0 %	0 %	0 %	220931013
4003	NC_011899	ATGG	2	8	170772	170779	25 %	25 %	50 %	0 %	220931013
4004	NC_011899	ATA	2	6	170826	170831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931013
4005	NC_011899	TTA	2	6	170833	170838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931013
4006	NC_011899	ATT	2	6	170851	170856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931013
4007	NC_011899	AGA	2	6	170945	170950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931013
4008	NC_011899	TAAA	2	8	171004	171011	75 %	25 %	0 %	0 %	220931013
4009	NC_011899	A	6	6	171009	171014	100 %	0 %	0 %	0 %	220931013
4010	NC_011899	GAT	2	6	171033	171038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931013
4011	NC_011899	GAA	3	9	171087	171095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931013
4012	NC_011899	T	7	7	171146	171152	0 %	100 %	0 %	0 %	220931013
4013	NC_011899	TAA	2	6	171172	171177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931013
4014	NC_011899	GGT	2	6	171204	171209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931013
4015	NC_011899	GTT	2	6	171222	171227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931013
4016	NC_011899	A	6	6	171244	171249	100 %	0 %	0 %	0 %	220931013
4017	NC_011899	AAT	2	6	171310	171315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011899	CTT	2	6	171327	171332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_011899	TA	3	6	171333	171338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011899	GAT	2	6	171347	171352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011899	TAA	2	6	171353	171358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011899	TAA	2	6	171378	171383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011899	GTTAA	2	10	171385	171394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011899	TAT	2	6	171395	171400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011899	AGG	2	6	171405	171410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011899	A	8	8	171450	171457	100 %	0 %	0 %	0 %	220931014
4027	NC_011899	GCAG	2	8	171464	171471	25 %	0 %	50 %	25 %	220931014
4028	NC_011899	A	6	6	171482	171487	100 %	0 %	0 %	0 %	220931014
4029	NC_011899	GAG	2	6	171501	171506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931014
4030	NC_011899	GTT	2	6	171510	171515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931014
4031	NC_011899	A	6	6	171526	171531	100 %	0 %	0 %	0 %	220931014
4032	NC_011899	A	6	6	171547	171552	100 %	0 %	0 %	0 %	220931014
4033	NC_011899	GAAG	2	8	171668	171675	50 %	0 %	50 %	0 %	220931014
4034	NC_011899	GAATTG	2	12	171780	171791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931015
4035	NC_011899	TTG	2	6	171795	171800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931015
4036	NC_011899	TGG	2	6	171822	171827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931015
4037	NC_011899	TA	3	6	171858	171863	50 %	50 %	0 %	0 %	220931015
4038	NC_011899	ATT	2	6	171879	171884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931015
4039	NC_011899	TGC	2	6	171928	171933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931015
4040	NC_011899	GTTC	2	8	171998	172005	0 %	50 %	25 %	25 %	220931015
4041	NC_011899	TGA	2	6	172006	172011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931015
4042	NC_011899	GAG	2	6	172136	172141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931015
4043	NC_011899	GGGA	2	8	172240	172247	25 %	0 %	75 %	0 %	220931016
4044	NC_011899	CTG	2	6	172250	172255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931016
4045	NC_011899	TTA	2	6	172270	172275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220931016
4046	NC_011899	GTA	2	6	172291	172296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931016
4047	NC_011899	TAA	2	6	172314	172319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931016
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4052	NC_011899	ATGCT	2	10	172526	172535	20 %	40 %	20 %	20 %	220931016
4053	NC_011899	G	6	6	172562	172567	0 %	0 %	100 %	0 %	220931016
4054	NC_011899	GAT	2	6	172587	172592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931016
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4057	NC_011899	AAT	2	6	172788	172793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220931016
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4059	NC_011899	GTG	2	6	172925	172930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220931016
4060	NC_011899	CCCT	2	8	172933	172940	0 %	25 %	0 %	75 %	220931016
4061	NC_011899	GGA	2	6	172942	172947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220931016
4062	NC_011899	CTGGT	2	10	172970	172979	0 %	40 %	40 %	20 %	220931016
4063	NC_011899	AAG	2	6	173101	173106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220931016
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4065	NC_011899	A	6	6	173197	173202	100 %	0 %	0 %	0 %	220931016
4066	NC_011899	TGAA	2	8	173228	173235	50 %	25 %	25 %	0 %	220931016
4067	NC_011899	CTG	2	6	173311	173316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220931016
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4082	NC_011899	A	6	6	174167	174172	100 %	0 %	0 %	0 %	220931017
4083	NC_011899	TGA	2	6	174229	174234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931017
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4095	NC_011899	G	6	6	174848	174853	0 %	0 %	100 %	0 %	220931017
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4103	NC_011899	TGA	2	6	175304	175309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220931019
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4108	NC_011899	AT	3	6	175418	175423	50 %	50 %	0 %	0 %	220931019
4109	NC_011899	CCT	2	6	175431	175436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220931019
4110	NC_011899	TTG	2	6	175450	175455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220931019
4111	NC_011899	GTTT	2	8	175483	175490	0 %	75 %	25 %	0 %	220931019
4112	NC_011899	GCTG	2	8	175500	175507	0 %	25 %	50 %	25 %	220931019
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4114	NC_011899	A	6	6	175665	175670	100 %	0 %	0 %	0 %	220931019
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4120	NC_011899	A	6	6	175870	175875	100 %	0 %	0 %	0 %	220931020
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