MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 5971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011852	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	219870280
2	NC_011852	TATT	2	8	1741	1748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011852	AAGT	2	8	1790	1797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011852	ATTT	2	8	3907	3914	25 %	75 %	0 %	0 %	219870281
5	NC_011852	TGAA	2	8	4392	4399	50 %	25 %	25 %	0 %	219870281
6	NC_011852	GTAC	2	8	4478	4485	25 %	25 %	25 %	25 %	219870281
7	NC_011852	GAAA	2	8	4832	4839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011852	TTTC	2	8	4879	4886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011852	AAAC	2	8	4935	4942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011852	TTAA	2	8	7042	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011852	CGTT	2	8	7079	7086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011852	CCAC	2	8	7648	7655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_011852	ACTT	2	8	7997	8004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011852	ACTT	2	8	8379	8386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011852	TTTA	2	8	8866	8873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011852	ATTA	2	8	9468	9475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011852	TCAA	2	8	10061	10068	50 %	25 %	0 %	25 %	219870283
18	NC_011852	TTAC	2	8	10417	10424	25 %	50 %	0 %	25 %	219870283
19	NC_011852	ATCT	2	8	11185	11192	25 %	50 %	0 %	25 %	219870283
20	NC_011852	CAAA	2	8	11854	11861	75 %	0 %	0 %	25 %	219870284
21	NC_011852	AAAT	2	8	13508	13515	75 %	25 %	0 %	0 %	219870287
22	NC_011852	ATAA	2	8	13965	13972	75 %	25 %	0 %	0 %	219870287
23	NC_011852	ACCT	2	8	14797	14804	25 %	25 %	0 %	50 %	219870288
24	NC_011852	AATT	2	8	14949	14956	50 %	50 %	0 %	0 %	219870288
25	NC_011852	TGAG	2	8	16999	17006	25 %	25 %	50 %	0 %	219870289
26	NC_011852	ATGA	2	8	17511	17518	50 %	25 %	25 %	0 %	219870290
27	NC_011852	GCCA	2	8	19059	19066	25 %	0 %	25 %	50 %	219870291
28	NC_011852	ATAA	2	8	19239	19246	75 %	25 %	0 %	0 %	219870291
29	NC_011852	TTAA	2	8	20063	20070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011852	TTTC	2	8	20780	20787	0 %	75 %	0 %	25 %	219870293
31	NC_011852	AGTG	2	8	21112	21119	25 %	25 %	50 %	0 %	219870293
32	NC_011852	AAAT	2	8	21681	21688	75 %	25 %	0 %	0 %	219870294
33	NC_011852	AATC	2	8	21703	21710	50 %	25 %	0 %	25 %	219870294
34	NC_011852	ATAC	2	8	21853	21860	50 %	25 %	0 %	25 %	219870295
35	NC_011852	TAAA	2	8	22193	22200	75 %	25 %	0 %	0 %	219870295
36	NC_011852	TCTT	2	8	22693	22700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011852	TGAA	2	8	22887	22894	50 %	25 %	25 %	0 %	219870296
38	NC_011852	GTTG	2	8	23607	23614	0 %	50 %	50 %	0 %	219870296
39	NC_011852	TTGC	2	8	24383	24390	0 %	50 %	25 %	25 %	219870296
40	NC_011852	ATTT	2	8	24639	24646	25 %	75 %	0 %	0 %	219870296
41	NC_011852	TTGA	2	8	24944	24951	25 %	50 %	25 %	0 %	219870296
42	NC_011852	CTGT	2	8	25010	25017	0 %	50 %	25 %	25 %	219870296
43	NC_011852	ACCG	2	8	25340	25347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011852	TGCC	2	8	25528	25535	0 %	25 %	25 %	50 %	219870297
45	NC_011852	ACCC	2	8	26005	26012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011852	AACC	2	8	26375	26382	50 %	0 %	0 %	50 %	219870298
47	NC_011852	TTGA	2	8	26404	26411	25 %	50 %	25 %	0 %	219870298
48	NC_011852	TTCT	2	8	26531	26538	0 %	75 %	0 %	25 %	219870298
49	NC_011852	TGCG	2	8	26558	26565	0 %	25 %	50 %	25 %	219870298
50	NC_011852	AACC	2	8	27278	27285	50 %	0 %	0 %	50 %	219870298
51	NC_011852	GCCT	2	8	27321	27328	0 %	25 %	25 %	50 %	219870298
52	NC_011852	AAGC	2	8	27607	27614	50 %	0 %	25 %	25 %	219870298
53	NC_011852	TTAA	2	8	28344	28351	50 %	50 %	0 %	0 %	219870299
54	NC_011852	ACCG	2	8	28765	28772	25 %	0 %	25 %	50 %	219870299
55	NC_011852	GGCA	2	8	29285	29292	25 %	0 %	50 %	25 %	219870300
56	NC_011852	GATT	2	8	29425	29432	25 %	50 %	25 %	0 %	219870300
57	NC_011852	TTAT	2	8	29658	29665	25 %	75 %	0 %	0 %	219870300
58	NC_011852	AAAG	2	8	30184	30191	75 %	0 %	25 %	0 %	219870302
59	NC_011852	TGAT	2	8	30290	30297	25 %	50 %	25 %	0 %	219870302
60	NC_011852	TAAT	2	8	30553	30560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011852	CAAA	2	8	31163	31170	75 %	0 %	0 %	25 %	219870303
62	NC_011852	AACC	2	8	33485	33492	50 %	0 %	0 %	50 %	219870305
63	NC_011852	ACCC	2	8	33575	33582	25 %	0 %	0 %	75 %	219870305
64	NC_011852	ATTG	2	8	33637	33644	25 %	50 %	25 %	0 %	219870305
65	NC_011852	ATTG	2	8	34214	34221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011852	TATT	2	8	34240	34247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011852	GAAC	2	8	34300	34307	50 %	0 %	25 %	25 %	219870306
68	NC_011852	ATAA	2	8	34999	35006	75 %	25 %	0 %	0 %	219870307
69	NC_011852	ACAA	2	8	35134	35141	75 %	0 %	0 %	25 %	219870307
70	NC_011852	CCAC	2	8	35819	35826	25 %	0 %	0 %	75 %	219870307
71	NC_011852	ATTT	2	8	35949	35956	25 %	75 %	0 %	0 %	219870307
72	NC_011852	ACCA	2	8	36103	36110	50 %	0 %	0 %	50 %	219870307
73	NC_011852	TATT	2	8	36635	36642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011852	TTTG	2	8	36985	36992	0 %	75 %	25 %	0 %	219870308
75	NC_011852	TGCG	2	8	37140	37147	0 %	25 %	50 %	25 %	219870308
76	NC_011852	TTCT	2	8	37677	37684	0 %	75 %	0 %	25 %	219870308
77	NC_011852	TTTA	2	8	37870	37877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011852	ATTT	2	8	38001	38008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011852	AATA	2	8	38539	38546	75 %	25 %	0 %	0 %	219870309
80	NC_011852	CGCT	2	8	38947	38954	0 %	25 %	25 %	50 %	219870309
81	NC_011852	GAAC	2	8	39074	39081	50 %	0 %	25 %	25 %	219870309
82	NC_011852	ACCA	2	8	39344	39351	50 %	0 %	0 %	50 %	219870309
83	NC_011852	AAAT	2	8	39844	39851	75 %	25 %	0 %	0 %	219870309
84	NC_011852	AATC	2	8	40085	40092	50 %	25 %	0 %	25 %	219870309
85	NC_011852	CAAT	2	8	40150	40157	50 %	25 %	0 %	25 %	219870309
86	NC_011852	GATA	2	8	40360	40367	50 %	25 %	25 %	0 %	219870309
87	NC_011852	TTTG	2	8	40385	40392	0 %	75 %	25 %	0 %	219870309
88	NC_011852	CTGC	2	8	40611	40618	0 %	25 %	25 %	50 %	219870309
89	NC_011852	AGCC	2	8	40678	40685	25 %	0 %	25 %	50 %	219870309
90	NC_011852	ATAC	2	8	41547	41554	50 %	25 %	0 %	25 %	219870310
91	NC_011852	GATT	2	8	41694	41701	25 %	50 %	25 %	0 %	219870310
92	NC_011852	AGAT	2	8	42939	42946	50 %	25 %	25 %	0 %	219870311
93	NC_011852	CGTT	2	8	43108	43115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011852	TCAA	2	8	43417	43424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011852	GACG	2	8	43632	43639	25 %	0 %	50 %	25 %	219870312
96	NC_011852	CGTG	2	8	44534	44541	0 %	25 %	50 %	25 %	219870312
97	NC_011852	ACAA	2	8	44761	44768	75 %	0 %	0 %	25 %	219870312
98	NC_011852	AGCC	2	8	45474	45481	25 %	0 %	25 %	50 %	219870313
99	NC_011852	TGCT	2	8	46595	46602	0 %	50 %	25 %	25 %	219870314
100	NC_011852	GGGT	2	8	46956	46963	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011852	ACCC	2	8	47013	47020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_011852	GGGT	2	8	47115	47122	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011852	ACCC	2	8	47172	47179	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_011852	GATG	2	8	47488	47495	25 %	25 %	50 %	0 %	219870315
105	NC_011852	CCAA	2	8	47889	47896	50 %	0 %	0 %	50 %	219870315
106	NC_011852	GTTG	2	8	48378	48385	0 %	50 %	50 %	0 %	219870315
107	NC_011852	AAAT	2	8	48604	48611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011852	ATGA	2	8	49168	49175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011852	CCAA	2	8	50353	50360	50 %	0 %	0 %	50 %	219870318
110	NC_011852	TTTA	2	8	50640	50647	25 %	75 %	0 %	0 %	219870318
111	NC_011852	ATCT	2	8	50742	50749	25 %	50 %	0 %	25 %	219870319
112	NC_011852	AGTT	2	8	50758	50765	25 %	50 %	25 %	0 %	219870319
113	NC_011852	TTTA	2	8	51031	51038	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
114	NC_011852	TTAT	2	8	51256	51263	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
115	NC_011852	ATTT	2	8	51395	51402	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
116	NC_011852	TTAT	2	8	51506	51513	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
117	NC_011852	ATTT	2	8	51792	51799	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
118	NC_011852	AAAG	2	8	52500	52507	75 %	0 %	25 %	0 %	219870320
119	NC_011852	TCTT	2	8	53478	53485	0 %	75 %	0 %	25 %	219870321
120	NC_011852	GGTA	2	8	53743	53750	25 %	25 %	50 %	0 %	219870321
121	NC_011852	AAGA	2	8	54014	54021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011852	GAAT	2	8	54066	54073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011852	GGCA	2	8	54154	54161	25 %	0 %	50 %	25 %	219870322
124	NC_011852	ATAA	2	8	54333	54340	75 %	25 %	0 %	0 %	219870322
125	NC_011852	TTGG	2	8	54752	54759	0 %	50 %	50 %	0 %	219870322
126	NC_011852	GTTA	2	8	54803	54810	25 %	50 %	25 %	0 %	219870322
127	NC_011852	AAAT	2	8	54848	54855	75 %	25 %	0 %	0 %	219870322
128	NC_011852	TGTC	2	8	55161	55168	0 %	50 %	25 %	25 %	219870323
129	NC_011852	AGAT	2	8	55305	55312	50 %	25 %	25 %	0 %	219870323
130	NC_011852	TAAA	2	8	55485	55492	75 %	25 %	0 %	0 %	219870323
131	NC_011852	AATC	2	8	55493	55500	50 %	25 %	0 %	25 %	219870323
132	NC_011852	AAAT	2	8	55857	55864	75 %	25 %	0 %	0 %	219870323
133	NC_011852	AGGT	2	8	55967	55974	25 %	25 %	50 %	0 %	219870323
134	NC_011852	AATT	2	8	56317	56324	50 %	50 %	0 %	0 %	219870324
135	NC_011852	GAAG	2	8	56882	56889	50 %	0 %	50 %	0 %	219870324
136	NC_011852	TTTA	2	8	57062	57069	25 %	75 %	0 %	0 %	219870324
137	NC_011852	AAGA	2	8	57091	57098	75 %	0 %	25 %	0 %	219870324
138	NC_011852	TATT	2	8	57437	57444	25 %	75 %	0 %	0 %	219870325
139	NC_011852	CATA	2	8	58331	58338	50 %	25 %	0 %	25 %	219870326
140	NC_011852	ATTA	2	8	58379	58386	50 %	50 %	0 %	0 %	219870326
141	NC_011852	TTTG	2	8	58397	58404	0 %	75 %	25 %	0 %	219870326
142	NC_011852	AAAC	2	8	59090	59097	75 %	0 %	0 %	25 %	219870326
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144	NC_011852	TTTA	2	8	59522	59529	25 %	75 %	0 %	0 %	219870326
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