MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011852	AAG	2	6	144597	144602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870403
3002	NC_011852	TCA	2	6	144607	144612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870403
3003	NC_011852	ACCG	2	8	144632	144639	25 %	0 %	25 %	50 %	219870403
3004	NC_011852	AACG	2	8	144746	144753	50 %	0 %	25 %	25 %	219870403
3005	NC_011852	A	7	7	144803	144809	100 %	0 %	0 %	0 %	219870403
3006	NC_011852	AGA	2	6	144831	144836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870403
3007	NC_011852	ATA	2	6	144885	144890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870403
3008	NC_011852	AAG	2	6	144952	144957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870403
3009	NC_011852	AAT	2	6	144975	144980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870403
3010	NC_011852	AG	3	6	145018	145023	50 %	0 %	50 %	0 %	219870404
3011	NC_011852	T	6	6	145050	145055	0 %	100 %	0 %	0 %	219870404
3012	NC_011852	GAC	2	6	145100	145105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870404
3013	NC_011852	TTC	2	6	145127	145132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870404
3014	NC_011852	ATT	2	6	145305	145310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870404
3015	NC_011852	AGCC	2	8	145345	145352	25 %	0 %	25 %	50 %	219870404
3016	NC_011852	GCA	2	6	145435	145440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870404
3017	NC_011852	TTA	2	6	145507	145512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870404
3018	NC_011852	TTA	2	6	145543	145548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870404
3019	NC_011852	AGAA	2	8	145574	145581	75 %	0 %	25 %	0 %	219870404
3020	NC_011852	AG	3	6	145654	145659	50 %	0 %	50 %	0 %	219870404
3021	NC_011852	TAAA	2	8	145747	145754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011852	ACT	2	6	145802	145807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870405
3023	NC_011852	TGA	2	6	145858	145863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870405
3024	NC_011852	TGA	2	6	145902	145907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870405
3025	NC_011852	TCT	2	6	145963	145968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870405
3026	NC_011852	T	6	6	145972	145977	0 %	100 %	0 %	0 %	219870405
3027	NC_011852	GTT	2	6	145997	146002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870405
3028	NC_011852	TTG	2	6	146035	146040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870405
3029	NC_011852	T	6	6	146042	146047	0 %	100 %	0 %	0 %	219870405
3030	NC_011852	TGT	2	6	146200	146205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870405
3031	NC_011852	GCG	2	6	146262	146267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870405
3032	NC_011852	TTCTT	2	10	146410	146419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3033	NC_011852	ATC	2	6	146421	146426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011852	GGT	2	6	146440	146445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011852	TTCTT	2	10	146470	146479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_011852	ATC	2	6	146481	146486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_011852	TTCTT	2	10	146531	146540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3038	NC_011852	ATC	2	6	146542	146547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011852	GGT	2	6	146562	146567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011852	ATC	2	6	146603	146608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870406
3041	NC_011852	A	6	6	146614	146619	100 %	0 %	0 %	0 %	219870406
3042	NC_011852	GTT	2	6	146703	146708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870406
3043	NC_011852	CTT	2	6	146793	146798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870406
3044	NC_011852	GTAA	2	8	146853	146860	50 %	25 %	25 %	0 %	219870406
3045	NC_011852	ATA	2	6	147058	147063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870406
3046	NC_011852	GTT	2	6	147070	147075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870406
3047	NC_011852	GAA	2	6	147149	147154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870406
3048	NC_011852	AATC	2	8	147189	147196	50 %	25 %	0 %	25 %	219870406
3049	NC_011852	CCA	2	6	147218	147223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870406
3050	NC_011852	CCAC	2	8	147230	147237	25 %	0 %	0 %	75 %	219870406
3051	NC_011852	A	6	6	147409	147414	100 %	0 %	0 %	0 %	219870406
3052	NC_011852	CCA	2	6	147460	147465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870406
3053	NC_011852	ATA	2	6	147487	147492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870406
3054	NC_011852	ACAGC	2	10	147525	147534	40 %	0 %	20 %	40 %	219870406
3055	NC_011852	T	6	6	147540	147545	0 %	100 %	0 %	0 %	219870406
3056	NC_011852	AAGC	2	8	147606	147613	50 %	0 %	25 %	25 %	219870406
3057	NC_011852	ATC	2	6	147625	147630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870406
3058	NC_011852	CTG	2	6	147643	147648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870406
3059	NC_011852	A	6	6	147666	147671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011852	A	6	6	147676	147681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011852	ATTA	2	8	147780	147787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011852	CAG	2	6	147863	147868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011852	ATCA	2	8	147891	147898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_011852	T	7	7	147900	147906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011852	TAAA	2	8	147938	147945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011852	CCCA	2	8	147979	147986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3067	NC_011852	ATC	2	6	148050	148055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_011852	CTG	2	6	148104	148109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_011852	ACC	2	6	148170	148175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_011852	TTG	2	6	148193	148198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011852	TCG	2	6	148239	148244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011852	T	9	9	148245	148253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011852	T	6	6	148298	148303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011852	CAT	2	6	148304	148309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_011852	CAC	2	6	148371	148376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_011852	T	6	6	148397	148402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011852	AAT	2	6	148407	148412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011852	AAT	2	6	148480	148485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011852	GGA	2	6	148509	148514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_011852	CCA	2	6	148678	148683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_011852	CAG	2	6	148739	148744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_011852	GTG	2	6	148758	148763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011852	ATC	2	6	148803	148808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_011852	TTTAC	2	10	148888	148897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3085	NC_011852	ACT	2	6	148905	148910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_011852	CTT	2	6	148913	148918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_011852	TAA	2	6	149015	149020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011852	CAA	2	6	149060	149065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_011852	TGG	2	6	149148	149153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011852	T	6	6	149226	149231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011852	AAATA	2	10	149244	149253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011852	CAG	2	6	149262	149267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_011852	A	7	7	149295	149301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011852	T	7	7	149494	149500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011852	GTG	2	6	149566	149571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870407
3096	NC_011852	GAA	2	6	149586	149591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870407
3097	NC_011852	ATCT	2	8	149609	149616	25 %	50 %	0 %	25 %	219870407
3098	NC_011852	TAGA	2	8	149617	149624	50 %	25 %	25 %	0 %	219870407
3099	NC_011852	TTGC	2	8	149646	149653	0 %	50 %	25 %	25 %	219870407
3100	NC_011852	GTG	2	6	149701	149706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870407
3101	NC_011852	CAG	2	6	149920	149925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870407
3102	NC_011852	ACA	2	6	149946	149951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870407
3103	NC_011852	ATTGAA	2	12	149976	149987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219870407
3104	NC_011852	TGT	2	6	149993	149998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870407
3105	NC_011852	ATA	2	6	150148	150153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870407
3106	NC_011852	ACG	2	6	150225	150230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870407
3107	NC_011852	TTAA	2	8	150236	150243	50 %	50 %	0 %	0 %	219870407
3108	NC_011852	TATT	2	8	150273	150280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011852	T	6	6	150290	150295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011852	CAT	2	6	150328	150333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870408
3111	NC_011852	TCC	2	6	150430	150435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219870408
3112	NC_011852	AAT	2	6	150454	150459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870408
3113	NC_011852	TAA	2	6	150495	150500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870408
3114	NC_011852	CCA	2	6	150719	150724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870408
3115	NC_011852	GCT	2	6	150779	150784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870408
3116	NC_011852	TAA	2	6	150816	150821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870408
3117	NC_011852	TTG	2	6	150835	150840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870408
3118	NC_011852	CTT	2	6	150843	150848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870408
3119	NC_011852	TGT	2	6	150866	150871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870408
3120	NC_011852	TGA	2	6	150895	150900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011852	TCAA	2	8	150990	150997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_011852	AAGA	2	8	151024	151031	75 %	0 %	25 %	0 %	219870409
3123	NC_011852	A	6	6	151049	151054	100 %	0 %	0 %	0 %	219870409
3124	NC_011852	TTA	2	6	151114	151119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870409
3125	NC_011852	TGT	2	6	151176	151181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870409
3126	NC_011852	AGA	2	6	151185	151190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870409
3127	NC_011852	TCGT	2	8	151221	151228	0 %	50 %	25 %	25 %	219870409
3128	NC_011852	CTT	2	6	151280	151285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870409
3129	NC_011852	ACT	2	6	151294	151299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870409
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3132	NC_011852	CGT	2	6	151333	151338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870409
3133	NC_011852	TTAA	2	8	151345	151352	50 %	50 %	0 %	0 %	219870409
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3140	NC_011852	TGT	2	6	151628	151633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_011852	TA	3	6	151670	151675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_011852	T	6	6	156187	156192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_011852	ACCA	2	8	156615	156622	50 %	0 %	0 %	50 %	219870414
3249	NC_011852	ACCG	2	8	156626	156633	25 %	0 %	25 %	50 %	219870414
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