MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011852	TCAACA	2	12	48301	48312	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219870315
1002	NC_011852	CCA	2	6	48331	48336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870315
1003	NC_011852	GTTG	2	8	48378	48385	0 %	50 %	50 %	0 %	219870315
1004	NC_011852	CAA	2	6	48386	48391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870315
1005	NC_011852	GCC	2	6	48472	48477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870315
1006	NC_011852	ACC	2	6	48597	48602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_011852	AAAT	2	8	48604	48611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011852	TTC	2	6	48654	48659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011852	TTG	18	54	48735	48788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011852	CTG	2	6	48863	48868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870316
1011	NC_011852	TAT	2	6	48887	48892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870316
1012	NC_011852	ACT	2	6	48933	48938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870316
1013	NC_011852	ATT	2	6	49023	49028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870316
1014	NC_011852	ATGA	2	8	49168	49175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011852	ATT	2	6	49226	49231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011852	AAT	2	6	49275	49280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870317
1017	NC_011852	TCA	2	6	49362	49367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870317
1018	NC_011852	TG	3	6	49448	49453	0 %	50 %	50 %	0 %	219870317
1019	NC_011852	TC	3	6	49521	49526	0 %	50 %	0 %	50 %	219870317
1020	NC_011852	AG	3	6	49543	49548	50 %	0 %	50 %	0 %	219870317
1021	NC_011852	GAA	2	6	49612	49617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870317
1022	NC_011852	TGG	2	6	49673	49678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870317
1023	NC_011852	A	6	6	49838	49843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011852	A	6	6	49895	49900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011852	TTC	2	6	49924	49929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011852	A	6	6	49951	49956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011852	TTC	2	6	49980	49985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011852	A	6	6	50054	50059	100 %	0 %	0 %	0 %	219870318
1029	NC_011852	TTG	2	6	50118	50123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870318
1030	NC_011852	ATT	2	6	50186	50191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870318
1031	NC_011852	TCG	2	6	50251	50256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870318
1032	NC_011852	AAC	2	6	50314	50319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870318
1033	NC_011852	CCAA	2	8	50353	50360	50 %	0 %	0 %	50 %	219870318
1034	NC_011852	ATT	2	6	50404	50409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870318
1035	NC_011852	ACC	2	6	50457	50462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870318
1036	NC_011852	CTC	2	6	50532	50537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219870318
1037	NC_011852	TTA	2	6	50600	50605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870318
1038	NC_011852	A	7	7	50610	50616	100 %	0 %	0 %	0 %	219870318
1039	NC_011852	TGAAG	2	10	50629	50638	40 %	20 %	40 %	0 %	219870318
1040	NC_011852	TTTA	2	8	50640	50647	25 %	75 %	0 %	0 %	219870318
1041	NC_011852	TATTGA	2	12	50665	50676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219870318
1042	NC_011852	ACA	2	6	50678	50683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870318
1043	NC_011852	TTA	2	6	50725	50730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870318
1044	NC_011852	ATCT	2	8	50742	50749	25 %	50 %	0 %	25 %	219870319
1045	NC_011852	AGTT	2	8	50758	50765	25 %	50 %	25 %	0 %	219870319
1046	NC_011852	CTTTT	2	10	50779	50788	0 %	80 %	0 %	20 %	219870319
1047	NC_011852	CT	3	6	50835	50840	0 %	50 %	0 %	50 %	219870319
1048	NC_011852	TAT	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870319
1049	NC_011852	ATT	2	6	50861	50866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870319
1050	NC_011852	AAC	2	6	50951	50956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870319
1051	NC_011852	TTTA	2	8	51031	51038	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
1052	NC_011852	TAG	2	6	51067	51072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870319
1053	NC_011852	TGC	2	6	51239	51244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870319
1054	NC_011852	TTAT	2	8	51256	51263	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
1055	NC_011852	TCA	2	6	51353	51358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870319
1056	NC_011852	TTC	2	6	51366	51371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870319
1057	NC_011852	ATTT	2	8	51395	51402	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
1058	NC_011852	TTAT	2	8	51506	51513	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
1059	NC_011852	AT	3	6	51567	51572	50 %	50 %	0 %	0 %	219870319
1060	NC_011852	ATT	2	6	51575	51580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870319
1061	NC_011852	AAC	2	6	51622	51627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870319
1062	NC_011852	GTT	2	6	51638	51643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870319
1063	NC_011852	CAA	2	6	51694	51699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870319
1064	NC_011852	ATT	2	6	51705	51710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870319
1065	NC_011852	ATT	2	6	51730	51735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870319
1066	NC_011852	AAAAC	2	10	51750	51759	80 %	0 %	0 %	20 %	219870319
1067	NC_011852	ATTT	2	8	51792	51799	25 %	75 %	0 %	0 %	219870319
1068	NC_011852	TGG	2	6	51866	51871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870319
1069	NC_011852	T	6	6	51888	51893	0 %	100 %	0 %	0 %	219870319
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1071	NC_011852	ATT	2	6	51924	51929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1072	NC_011852	A	8	8	51973	51980	100 %	0 %	0 %	0 %	219870320
1073	NC_011852	T	6	6	51991	51996	0 %	100 %	0 %	0 %	219870320
1074	NC_011852	TAT	2	6	52038	52043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1075	NC_011852	AAG	2	6	52062	52067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870320
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1077	NC_011852	A	7	7	52082	52088	100 %	0 %	0 %	0 %	219870320
1078	NC_011852	TAA	2	6	52103	52108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870320
1079	NC_011852	TA	3	6	52123	52128	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
1080	NC_011852	AT	3	6	52146	52151	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
1081	NC_011852	T	6	6	52154	52159	0 %	100 %	0 %	0 %	219870320
1082	NC_011852	A	6	6	52167	52172	100 %	0 %	0 %	0 %	219870320
1083	NC_011852	TAA	2	6	52175	52180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870320
1084	NC_011852	TA	3	6	52185	52190	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
1085	NC_011852	GATTA	2	10	52211	52220	40 %	40 %	20 %	0 %	219870320
1086	NC_011852	TA	3	6	52249	52254	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
1087	NC_011852	TGA	2	6	52259	52264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870320
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1089	NC_011852	GATAAA	2	12	52425	52436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219870320
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1093	NC_011852	ATG	2	6	52558	52563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870320
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1095	NC_011852	ATT	2	6	52606	52611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1096	NC_011852	AG	4	8	52626	52633	50 %	0 %	50 %	0 %	219870320
1097	NC_011852	TAT	2	6	52637	52642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1098	NC_011852	TA	3	6	52656	52661	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
1099	NC_011852	ATT	2	6	52684	52689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1100	NC_011852	CTC	2	6	52747	52752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219870320
1101	NC_011852	TTA	2	6	52759	52764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1102	NC_011852	ATT	2	6	52782	52787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870320
1103	NC_011852	GAAAT	2	10	52810	52819	60 %	20 %	20 %	0 %	219870320
1104	NC_011852	TAT	2	6	52891	52896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870321
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1107	NC_011852	TAT	2	6	53025	53030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870321
1108	NC_011852	AT	3	6	53055	53060	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
1109	NC_011852	TA	3	6	53064	53069	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
1110	NC_011852	T	7	7	53099	53105	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
1111	NC_011852	T	6	6	53116	53121	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
1112	NC_011852	GA	3	6	53122	53127	50 %	0 %	50 %	0 %	219870321
1113	NC_011852	TTA	2	6	53166	53171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870321
1114	NC_011852	ATT	2	6	53204	53209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870321
1115	NC_011852	TGTACT	2	12	53218	53229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219870321
1116	NC_011852	T	8	8	53273	53280	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
1117	NC_011852	T	6	6	53282	53287	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
1118	NC_011852	T	7	7	53337	53343	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
1119	NC_011852	ATA	2	6	53421	53426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870321
1120	NC_011852	TTC	2	6	53439	53444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870321
1121	NC_011852	A	7	7	53461	53467	100 %	0 %	0 %	0 %	219870321
1122	NC_011852	TCTT	2	8	53478	53485	0 %	75 %	0 %	25 %	219870321
1123	NC_011852	TTA	3	9	53487	53495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870321
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1125	NC_011852	TTG	2	6	53514	53519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870321
1126	NC_011852	CAT	2	6	53568	53573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870321
1127	NC_011852	TGT	2	6	53596	53601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870321
1128	NC_011852	T	6	6	53603	53608	0 %	100 %	0 %	0 %	219870321
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