MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_011852	TGA	2	6	25102	25107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870296
503	NC_011852	ATA	2	6	25224	25229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870296
504	NC_011852	TA	3	6	25228	25233	50 %	50 %	0 %	0 %	219870296
505	NC_011852	TGA	2	6	25273	25278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011852	TTTCT	2	10	25293	25302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
507	NC_011852	T	6	6	25328	25333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011852	ACCG	2	8	25340	25347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_011852	T	6	6	25357	25362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011852	A	6	6	25423	25428	100 %	0 %	0 %	0 %	219870297
511	NC_011852	CAA	2	6	25434	25439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870297
512	NC_011852	CTT	2	6	25513	25518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870297
513	NC_011852	TGCC	2	8	25528	25535	0 %	25 %	25 %	50 %	219870297
514	NC_011852	A	6	6	25683	25688	100 %	0 %	0 %	0 %	219870297
515	NC_011852	TGA	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870297
516	NC_011852	GGT	2	6	25854	25859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870297
517	NC_011852	TGG	2	6	25993	25998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011852	ACCC	2	8	26005	26012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
519	NC_011852	A	6	6	26030	26035	100 %	0 %	0 %	0 %	219870298
520	NC_011852	CAA	2	6	26095	26100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
521	NC_011852	T	6	6	26159	26164	0 %	100 %	0 %	0 %	219870298
522	NC_011852	GAA	2	6	26281	26286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870298
523	NC_011852	AACC	2	8	26375	26382	50 %	0 %	0 %	50 %	219870298
524	NC_011852	TTGA	2	8	26404	26411	25 %	50 %	25 %	0 %	219870298
525	NC_011852	TTA	2	6	26449	26454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870298
526	NC_011852	GAA	2	6	26464	26469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870298
527	NC_011852	TTCT	2	8	26531	26538	0 %	75 %	0 %	25 %	219870298
528	NC_011852	TGCG	2	8	26558	26565	0 %	25 %	50 %	25 %	219870298
529	NC_011852	ATC	2	6	26771	26776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870298
530	NC_011852	CAA	2	6	26869	26874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
531	NC_011852	GTT	2	6	26922	26927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870298
532	NC_011852	TCA	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870298
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534	NC_011852	T	6	6	26961	26966	0 %	100 %	0 %	0 %	219870298
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536	NC_011852	AGA	2	6	26985	26990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870298
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539	NC_011852	CAA	2	6	27137	27142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
540	NC_011852	ACA	2	6	27229	27234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
541	NC_011852	AAC	2	6	27251	27256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
542	NC_011852	A	6	6	27264	27269	100 %	0 %	0 %	0 %	219870298
543	NC_011852	TC	4	8	27270	27277	0 %	50 %	0 %	50 %	219870298
544	NC_011852	AACC	2	8	27278	27285	50 %	0 %	0 %	50 %	219870298
545	NC_011852	GCCT	2	8	27321	27328	0 %	25 %	25 %	50 %	219870298
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547	NC_011852	A	10	10	27383	27392	100 %	0 %	0 %	0 %	219870298
548	NC_011852	ACC	2	6	27414	27419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870298
549	NC_011852	CAA	2	6	27487	27492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
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552	NC_011852	ATG	2	6	27530	27535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870298
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554	NC_011852	A	7	7	27646	27652	100 %	0 %	0 %	0 %	219870298
555	NC_011852	AAC	2	6	27760	27765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
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558	NC_011852	CAA	2	6	27850	27855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
559	NC_011852	TAG	2	6	27861	27866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870298
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562	NC_011852	ACA	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870298
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598	NC_011852	TTAT	2	8	29658	29665	25 %	75 %	0 %	0 %	219870300
599	NC_011852	GA	3	6	29700	29705	50 %	0 %	50 %	0 %	219870300
600	NC_011852	GGGTT	2	10	29707	29716	0 %	40 %	60 %	0 %	219870300
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602	NC_011852	AAT	2	6	29750	29755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011852	TGT	2	6	29757	29762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011852	TCT	2	6	29766	29771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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606	NC_011852	AG	3	6	29806	29811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011852	A	7	7	29824	29830	100 %	0 %	0 %	0 %	219870301
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609	NC_011852	GCAATT	2	12	29933	29944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219870301
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613	NC_011852	A	6	6	30057	30062	100 %	0 %	0 %	0 %	219870301
614	NC_011852	TTA	2	6	30086	30091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870301
615	NC_011852	CAG	2	6	30122	30127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870302
616	NC_011852	AAAG	2	8	30184	30191	75 %	0 %	25 %	0 %	219870302
617	NC_011852	TGAT	2	8	30290	30297	25 %	50 %	25 %	0 %	219870302
618	NC_011852	ACG	2	6	30344	30349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870302
619	NC_011852	A	7	7	30398	30404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011852	A	7	7	30414	30420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011852	A	6	6	30521	30526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011852	A	7	7	30530	30536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011852	TAAT	2	8	30553	30560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011852	ACC	2	6	30597	30602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_011852	T	6	6	30603	30608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011852	TTACGA	2	12	30611	30622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
627	NC_011852	CAA	2	6	30726	30731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011852	AGA	2	6	30734	30739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011852	CAA	2	6	30798	30803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870303
630	NC_011852	ACCTGA	2	12	30809	30820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219870303
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632	NC_011852	AAC	2	6	30879	30884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870303
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