MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori G27 plasmid pHPG27

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011334	ACA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011334	GGA	2	6	287	292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011334	TTA	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011334	TTA	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011334	TAT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011334	CAA	2	6	621	626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435471
7	NC_011334	ACC	2	6	638	643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208435471
8	NC_011334	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435471
9	NC_011334	ATT	2	6	871	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208435471
10	NC_011334	ACA	2	6	900	905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435471
11	NC_011334	CAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435471
12	NC_011334	CTT	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435471
13	NC_011334	CAA	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435471
14	NC_011334	GAA	2	6	1729	1734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208435471
15	NC_011334	TCC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	208435471
16	NC_011334	CAA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435471
17	NC_011334	TGA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435472
18	NC_011334	CAC	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208435472
19	NC_011334	CAA	2	6	2151	2156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435472
20	NC_011334	AAT	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435472
21	NC_011334	GAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208435472
22	NC_011334	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011334	ACC	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208435473
24	NC_011334	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435473
25	NC_011334	TGA	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435473
26	NC_011334	TGG	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208435473
27	NC_011334	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435473
28	NC_011334	CAT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435473
29	NC_011334	TCA	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435473
30	NC_011334	TAC	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435473
31	NC_011334	GTA	2	6	3596	3601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011334	ATA	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435474
33	NC_011334	AGT	2	6	4082	4087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435474
34	NC_011334	AAG	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208435474
35	NC_011334	TGT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435474
36	NC_011334	ATC	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435474
37	NC_011334	AAT	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435474
38	NC_011334	GTA	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435474
39	NC_011334	TCT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435474
40	NC_011334	AGT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011334	TAA	2	6	4798	4803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011334	TGT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435475
43	NC_011334	ATC	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435475
44	NC_011334	TAT	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208435475
45	NC_011334	ACA	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208435475
46	NC_011334	TTG	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435475
47	NC_011334	TTC	2	6	5309	5314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435475
48	NC_011334	ATC	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435475
49	NC_011334	CTA	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435475
50	NC_011334	AAT	2	6	5546	5551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435475
51	NC_011334	TAA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435475
52	NC_011334	TTC	2	6	5754	5759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435475
53	NC_011334	AAT	2	6	5837	5842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435475
54	NC_011334	AAT	2	6	5945	5950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011334	ATA	2	6	6042	6047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011334	AAT	2	6	6050	6055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011334	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011334	AAG	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208435476
59	NC_011334	TGT	2	6	6405	6410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435476
60	NC_011334	GTT	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435476
61	NC_011334	TTG	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435476
62	NC_011334	CTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435476
63	NC_011334	TAA	2	6	6654	6659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435476
64	NC_011334	TGT	2	6	6662	6667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435476
65	NC_011334	CTG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208435476
66	NC_011334	TAA	2	6	6780	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208435476
67	NC_011334	GTT	2	6	6972	6977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435477
68	NC_011334	CTT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208435477
69	NC_011334	ATG	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435477
70	NC_011334	ATG	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435477
71	NC_011334	ATG	2	6	7105	7110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435477
72	NC_011334	TGT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435477
73	NC_011334	TTG	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435477
74	NC_011334	TAG	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435477
75	NC_011334	GTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435477
76	NC_011334	GTA	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011334	TGA	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011334	GTT	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011334	TGT	2	6	7686	7691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011334	TGT	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011334	TCA	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011334	TGA	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435478
83	NC_011334	GTT	2	6	8203	8208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435478
84	NC_011334	TTA	2	6	8235	8240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208435478
85	NC_011334	TTA	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208435478
86	NC_011334	TTG	2	6	8338	8343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435478
87	NC_011334	TAT	2	6	8614	8619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011334	ATA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011334	ATG	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208435479
90	NC_011334	TTA	2	6	8888	8893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208435479
91	NC_011334	TAC	2	6	8911	8916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208435479
92	NC_011334	GAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208435479
93	NC_011334	GTT	2	6	9243	9248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208435480
94	NC_011334	TTC	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011334	ATC	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011334	ATT	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011334	AAC	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011334	GTT	2	6	9944	9949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.