MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 1295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	TCAAA	2	10	178	187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011126	TGAAA	2	10	2160	2169	60 %	20 %	20 %	0 %	195952382
3	NC_011126	AAGTA	2	10	2282	2291	60 %	20 %	20 %	0 %	195952382
4	NC_011126	ATACC	2	10	2477	2486	40 %	20 %	0 %	40 %	195952383
5	NC_011126	CAAAA	2	10	3708	3717	80 %	0 %	0 %	20 %	195952384
6	NC_011126	TTGAT	2	10	3723	3732	20 %	60 %	20 %	0 %	195952384
7	NC_011126	GTTTA	2	10	8203	8212	20 %	60 %	20 %	0 %	195952388
8	NC_011126	AAAAC	2	10	9182	9191	80 %	0 %	0 %	20 %	195952389
9	NC_011126	TTACC	2	10	9261	9270	20 %	40 %	0 %	40 %	195952389
10	NC_011126	TGTAT	2	10	10442	10451	20 %	60 %	20 %	0 %	195952390
11	NC_011126	ATTCA	2	10	10675	10684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011126	GTTTG	2	10	13212	13221	0 %	60 %	40 %	0 %	195952393
13	NC_011126	AAAGA	2	10	13974	13983	80 %	0 %	20 %	0 %	195952393
14	NC_011126	ATCTC	2	10	15460	15469	20 %	40 %	0 %	40 %	195952395
15	NC_011126	CAAGA	2	10	16749	16758	60 %	0 %	20 %	20 %	195952396
16	NC_011126	ATATA	2	10	17401	17410	60 %	40 %	0 %	0 %	195952396
17	NC_011126	ATTTA	2	10	19646	19655	40 %	60 %	0 %	0 %	195952399
18	NC_011126	TACTC	2	10	21119	21128	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011126	TTTTC	2	10	21474	21483	0 %	80 %	0 %	20 %	195952402
20	NC_011126	AAAAG	2	10	22180	22189	80 %	0 %	20 %	0 %	195952403
21	NC_011126	GCTCT	2	10	23898	23907	0 %	40 %	20 %	40 %	195952406
22	NC_011126	AAAAT	2	10	25282	25291	80 %	20 %	0 %	0 %	195952407
23	NC_011126	ATATT	2	10	31005	31014	40 %	60 %	0 %	0 %	195952412
24	NC_011126	TTTAA	2	10	33774	33783	40 %	60 %	0 %	0 %	195952416
25	NC_011126	TTTCT	2	10	34255	34264	0 %	80 %	0 %	20 %	195952416
26	NC_011126	TATCT	2	10	34286	34295	20 %	60 %	0 %	20 %	195952416
27	NC_011126	AAAGA	2	10	35836	35845	80 %	0 %	20 %	0 %	195952420
28	NC_011126	TTTTC	2	10	36323	36332	0 %	80 %	0 %	20 %	195952421
29	NC_011126	CTCTT	2	10	38532	38541	0 %	60 %	0 %	40 %	195952423
30	NC_011126	TTCTA	2	10	38724	38733	20 %	60 %	0 %	20 %	195952423
31	NC_011126	CCTGT	2	10	39696	39705	0 %	40 %	20 %	40 %	195952424
32	NC_011126	TATTT	2	10	40334	40343	20 %	80 %	0 %	0 %	195952425
33	NC_011126	TTTAG	2	10	41603	41612	20 %	60 %	20 %	0 %	195952426
34	NC_011126	ACCAA	2	10	42388	42397	60 %	0 %	0 %	40 %	195952426
35	NC_011126	GCTTT	2	10	44081	44090	0 %	60 %	20 %	20 %	195952429
36	NC_011126	CTATC	2	10	44831	44840	20 %	40 %	0 %	40 %	195952429
37	NC_011126	GCTTG	2	10	46775	46784	0 %	40 %	40 %	20 %	195952433
38	NC_011126	ATCTT	2	10	47831	47840	20 %	60 %	0 %	20 %	195952433
39	NC_011126	TTGGC	2	10	48921	48930	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
40	NC_011126	CTTGG	2	10	49283	49292	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
41	NC_011126	AACAG	2	10	51403	51412	60 %	0 %	20 %	20 %	195952435
42	NC_011126	TAGAA	2	10	52585	52594	60 %	20 %	20 %	0 %	195952436
43	NC_011126	ATACG	2	10	53954	53963	40 %	20 %	20 %	20 %	195952438
44	NC_011126	CGCCT	2	10	54593	54602	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_011126	TTTTA	2	10	56592	56601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011126	CCCTT	2	10	58294	58303	0 %	40 %	0 %	60 %	195952441
47	NC_011126	TTTAT	2	10	60181	60190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011126	TAAAA	2	10	61325	61334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011126	TGCAA	2	10	65074	65083	40 %	20 %	20 %	20 %	195952450
50	NC_011126	TGTTT	2	10	65302	65311	0 %	80 %	20 %	0 %	195952451
51	NC_011126	AAACC	2	10	65377	65386	60 %	0 %	0 %	40 %	195952451
52	NC_011126	ATAAA	2	10	65512	65521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011126	GATGT	2	10	67031	67040	20 %	40 %	40 %	0 %	195952453
54	NC_011126	TATTT	2	10	67471	67480	20 %	80 %	0 %	0 %	195952453
55	NC_011126	TTTTA	2	10	68801	68810	20 %	80 %	0 %	0 %	195952456
56	NC_011126	CTGCA	2	10	70112	70121	20 %	20 %	20 %	40 %	195952457
57	NC_011126	TTTAT	2	10	71429	71438	20 %	80 %	0 %	0 %	195952458
58	NC_011126	CTTTG	2	10	73121	73130	0 %	60 %	20 %	20 %	195952460
59	NC_011126	TAGAA	2	10	73900	73909	60 %	20 %	20 %	0 %	195952461
60	NC_011126	AAGAG	2	10	74428	74437	60 %	0 %	40 %	0 %	195952461
61	NC_011126	TATAA	2	10	77332	77341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011126	TAAGA	2	10	81946	81955	60 %	20 %	20 %	0 %	195952468
63	NC_011126	ATTTA	2	10	81967	81976	40 %	60 %	0 %	0 %	195952468
64	NC_011126	TACAA	2	10	85452	85461	60 %	20 %	0 %	20 %	195952470
65	NC_011126	GGTAG	2	10	85934	85943	20 %	20 %	60 %	0 %	195952471
66	NC_011126	AGAAA	2	10	89116	89125	80 %	0 %	20 %	0 %	195952476
67	NC_011126	TAACT	2	10	89380	89389	40 %	40 %	0 %	20 %	195952476
68	NC_011126	AAAAC	2	10	90166	90175	80 %	0 %	0 %	20 %	195952476
69	NC_011126	TGACT	2	10	90322	90331	20 %	40 %	20 %	20 %	195952476
70	NC_011126	TGTTT	2	10	90449	90458	0 %	80 %	20 %	0 %	195952476
71	NC_011126	TTTTG	2	10	91301	91310	0 %	80 %	20 %	0 %	195952477
72	NC_011126	ACAAA	2	10	92055	92064	80 %	0 %	0 %	20 %	195952478
73	NC_011126	GATAA	2	10	93232	93241	60 %	20 %	20 %	0 %	195952478
74	NC_011126	GCTAA	2	10	95734	95743	40 %	20 %	20 %	20 %	195952482
75	NC_011126	GGATG	2	10	99852	99861	20 %	20 %	60 %	0 %	195952486
76	NC_011126	ACTAA	2	10	100235	100244	60 %	20 %	0 %	20 %	195952487
77	NC_011126	TATCA	2	10	100300	100309	40 %	40 %	0 %	20 %	195952487
78	NC_011126	AAAAT	2	10	100317	100326	80 %	20 %	0 %	0 %	195952487
79	NC_011126	TTAAA	2	10	101152	101161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011126	ACTAT	2	10	101637	101646	40 %	40 %	0 %	20 %	195952490
81	NC_011126	ATACA	2	10	103923	103932	60 %	20 %	0 %	20 %	195952492
82	NC_011126	AAAAC	2	10	104076	104085	80 %	0 %	0 %	20 %	195952492
83	NC_011126	TTACA	2	10	104154	104163	40 %	40 %	0 %	20 %	195952492
84	NC_011126	ATCTG	2	10	105645	105654	20 %	40 %	20 %	20 %	195952494
85	NC_011126	TCTTT	2	10	107066	107075	0 %	80 %	0 %	20 %	195952496
86	NC_011126	TTCTA	2	10	107373	107382	20 %	60 %	0 %	20 %	195952497
87	NC_011126	AAGCC	2	10	111328	111337	40 %	0 %	20 %	40 %	195952503
88	NC_011126	TTATA	2	10	112207	112216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011126	AAAGA	2	10	112756	112765	80 %	0 %	20 %	0 %	195952505
90	NC_011126	CTTTG	2	10	115375	115384	0 %	60 %	20 %	20 %	195952509
91	NC_011126	TATTT	2	10	116666	116675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011126	TATTT	2	10	116693	116702	20 %	80 %	0 %	0 %	195952510
93	NC_011126	TGGTA	2	10	118644	118653	20 %	40 %	40 %	0 %	195952511
94	NC_011126	TTGAT	2	10	120067	120076	20 %	60 %	20 %	0 %	195952513
95	NC_011126	ATATT	2	10	122015	122024	40 %	60 %	0 %	0 %	195952516
96	NC_011126	ATATT	2	10	123584	123593	40 %	60 %	0 %	0 %	195952518
97	NC_011126	AAAAT	2	10	124476	124485	80 %	20 %	0 %	0 %	195952519
98	NC_011126	AACAA	3	15	125263	125277	80 %	0 %	0 %	20 %	195952519
99	NC_011126	TTTAC	2	10	125979	125988	20 %	60 %	0 %	20 %	195952520
100	NC_011126	ATATA	2	10	126989	126998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011126	AAAAG	2	10	127296	127305	80 %	0 %	20 %	0 %	195952522
102	NC_011126	TTTTC	2	10	130699	130708	0 %	80 %	0 %	20 %	195952525
103	NC_011126	GTTTT	2	10	131416	131425	0 %	80 %	20 %	0 %	195952526
104	NC_011126	TCAAA	2	10	133869	133878	60 %	20 %	0 %	20 %	195952529
105	NC_011126	TCTTT	2	10	134041	134050	0 %	80 %	0 %	20 %	195952529
106	NC_011126	CATCT	2	10	134437	134446	20 %	40 %	0 %	40 %	195952529
107	NC_011126	TTGTT	2	10	135267	135276	0 %	80 %	20 %	0 %	195952530
108	NC_011126	CTTGG	2	10	137334	137343	0 %	40 %	40 %	20 %	195952532
109	NC_011126	AGTTT	2	10	137784	137793	20 %	60 %	20 %	0 %	195952532
110	NC_011126	CTTTT	2	10	145484	145493	0 %	80 %	0 %	20 %	195952540
111	NC_011126	TTTCT	2	10	146435	146444	0 %	80 %	0 %	20 %	195952541
112	NC_011126	TATCC	2	10	147066	147075	20 %	40 %	0 %	40 %	195952541
113	NC_011126	AAAGG	2	10	148129	148138	60 %	0 %	40 %	0 %	195952543
114	NC_011126	AAAGT	2	10	150736	150745	60 %	20 %	20 %	0 %	195952546
115	NC_011126	TTGTT	2	10	151627	151636	0 %	80 %	20 %	0 %	195952548
116	NC_011126	TGTTT	2	10	159956	159965	0 %	80 %	20 %	0 %	195952558
117	NC_011126	CTATC	2	10	165929	165938	20 %	40 %	0 %	40 %	195952566
118	NC_011126	TTCTT	2	10	166798	166807	0 %	80 %	0 %	20 %	195952568
119	NC_011126	TTTTG	2	10	169947	169956	0 %	80 %	20 %	0 %	195952573
120	NC_011126	AAGAC	2	10	170007	170016	60 %	0 %	20 %	20 %	195952573
121	NC_011126	CAAAG	2	10	171508	171517	60 %	0 %	20 %	20 %	195952574
122	NC_011126	AAGAT	2	10	171763	171772	60 %	20 %	20 %	0 %	195952574
123	NC_011126	TCTAA	2	10	172158	172167	40 %	40 %	0 %	20 %	195952575
124	NC_011126	ATAAA	2	10	173788	173797	80 %	20 %	0 %	0 %	195952577
125	NC_011126	TATCA	2	10	175355	175364	40 %	40 %	0 %	20 %	195952577
126	NC_011126	CTTTA	2	10	175825	175834	20 %	60 %	0 %	20 %	195952578
127	NC_011126	TTTTG	2	10	178959	178968	0 %	80 %	20 %	0 %	195952582
128	NC_011126	TTTTC	2	10	180358	180367	0 %	80 %	0 %	20 %	195952583
129	NC_011126	TATAA	2	10	182060	182069	60 %	40 %	0 %	0 %	195952586
130	NC_011126	TCTTT	2	10	182698	182707	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
131	NC_011126	CTTTT	2	10	183062	183071	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
132	NC_011126	TCTTT	2	10	183079	183088	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
133	NC_011126	TGTCG	2	10	183844	183853	0 %	40 %	40 %	20 %	195952587
134	NC_011126	CTATC	2	10	184345	184354	20 %	40 %	0 %	40 %	195952587
135	NC_011126	TTTGC	2	10	184929	184938	0 %	60 %	20 %	20 %	195952587
136	NC_011126	AAAAT	2	10	185839	185848	80 %	20 %	0 %	0 %	195952588
137	NC_011126	TCTTA	2	10	186316	186325	20 %	60 %	0 %	20 %	195952588
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