MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 34890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011126	ATA	2	6	181988	181993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952586
4002	NC_011126	TCC	2	6	182024	182029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952586
4003	NC_011126	TTC	2	6	182030	182035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4004	NC_011126	TCT	2	6	182040	182045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4005	NC_011126	TATAA	2	10	182060	182069	60 %	40 %	0 %	0 %	195952586
4006	NC_011126	ATCT	2	8	182096	182103	25 %	50 %	0 %	25 %	195952586
4007	NC_011126	TCT	2	6	182121	182126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4008	NC_011126	ATG	2	6	182191	182196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952586
4009	NC_011126	AT	3	6	182197	182202	50 %	50 %	0 %	0 %	195952586
4010	NC_011126	TA	3	6	182247	182252	50 %	50 %	0 %	0 %	195952586
4011	NC_011126	T	6	6	182292	182297	0 %	100 %	0 %	0 %	195952586
4012	NC_011126	AT	3	6	182342	182347	50 %	50 %	0 %	0 %	195952586
4013	NC_011126	ATGT	2	8	182400	182407	25 %	50 %	25 %	0 %	195952586
4014	NC_011126	TTC	2	6	182414	182419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4015	NC_011126	TCT	2	6	182505	182510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4016	NC_011126	GGTA	2	8	182535	182542	25 %	25 %	50 %	0 %	195952586
4017	NC_011126	TAA	2	6	182566	182571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952586
4018	NC_011126	AAG	2	6	182627	182632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952586
4019	NC_011126	CT	3	6	182658	182663	0 %	50 %	0 %	50 %	195952586
4020	NC_011126	TCTTT	2	10	182698	182707	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
4021	NC_011126	TAC	3	9	182993	183001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952586
4022	NC_011126	TTG	2	6	183002	183007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952586
4023	NC_011126	CTTTT	2	10	183062	183071	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
4024	NC_011126	TCTTT	2	10	183079	183088	0 %	80 %	0 %	20 %	195952586
4025	NC_011126	CCAATT	2	12	183194	183205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952586
4026	NC_011126	AAT	2	6	183228	183233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952586
4027	NC_011126	TTG	2	6	183237	183242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952586
4028	NC_011126	CTT	2	6	183253	183258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952586
4029	NC_011126	ATA	2	6	183311	183316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952586
4030	NC_011126	ACC	2	6	183365	183370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952586
4031	NC_011126	ATA	2	6	183417	183422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952586
4032	NC_011126	TAC	2	6	183464	183469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952587
4033	NC_011126	CTT	2	6	183592	183597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4034	NC_011126	CTT	2	6	183621	183626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4035	NC_011126	TCT	2	6	183651	183656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4036	NC_011126	ATG	2	6	183675	183680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952587
4037	NC_011126	CTC	2	6	183686	183691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952587
4038	NC_011126	CGT	2	6	183775	183780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952587
4039	NC_011126	A	6	6	183806	183811	100 %	0 %	0 %	0 %	195952587
4040	NC_011126	TGTCG	2	10	183844	183853	0 %	40 %	40 %	20 %	195952587
4041	NC_011126	TTC	2	6	183872	183877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4042	NC_011126	ATTT	2	8	183880	183887	25 %	75 %	0 %	0 %	195952587
4043	NC_011126	AAC	2	6	183942	183947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952587
4044	NC_011126	CAA	2	6	183979	183984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952587
4045	NC_011126	GTTT	2	8	184003	184010	0 %	75 %	25 %	0 %	195952587
4046	NC_011126	ATA	2	6	184092	184097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952587
4047	NC_011126	AAG	2	6	184205	184210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952587
4048	NC_011126	ATA	2	6	184223	184228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952587
4049	NC_011126	TG	3	6	184263	184268	0 %	50 %	50 %	0 %	195952587
4050	NC_011126	T	6	6	184310	184315	0 %	100 %	0 %	0 %	195952587
4051	NC_011126	CTATC	2	10	184345	184354	20 %	40 %	0 %	40 %	195952587
4052	NC_011126	CATATA	2	12	184410	184421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	195952587
4053	NC_011126	CAT	2	6	184504	184509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952587
4054	NC_011126	TGA	2	6	184564	184569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952587
4055	NC_011126	T	7	7	184638	184644	0 %	100 %	0 %	0 %	195952587
4056	NC_011126	ATAC	2	8	184656	184663	50 %	25 %	0 %	25 %	195952587
4057	NC_011126	A	6	6	184709	184714	100 %	0 %	0 %	0 %	195952587
4058	NC_011126	TC	3	6	184784	184789	0 %	50 %	0 %	50 %	195952587
4059	NC_011126	TAT	2	6	184808	184813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952587
4060	NC_011126	AGTA	2	8	184818	184825	50 %	25 %	25 %	0 %	195952587
4061	NC_011126	GCTTAA	2	12	184897	184908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195952587
4062	NC_011126	TTTGC	2	10	184929	184938	0 %	60 %	20 %	20 %	195952587
4063	NC_011126	TTC	2	6	184958	184963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4064	NC_011126	AGT	2	6	184994	184999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952587
4065	NC_011126	TCT	2	6	185004	185009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4066	NC_011126	AGC	2	6	185033	185038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952587
4067	NC_011126	TA	3	6	185196	185201	50 %	50 %	0 %	0 %	195952587
4068	NC_011126	T	6	6	185291	185296	0 %	100 %	0 %	0 %	195952587
4069	NC_011126	TCT	2	6	185301	185306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4070	NC_011126	AAG	2	6	185432	185437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952587
4071	NC_011126	AT	3	6	185446	185451	50 %	50 %	0 %	0 %	195952587
4072	NC_011126	T	6	6	185526	185531	0 %	100 %	0 %	0 %	195952587
4073	NC_011126	AAAG	2	8	185540	185547	75 %	0 %	25 %	0 %	195952587
4074	NC_011126	TCT	2	6	185568	185573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4075	NC_011126	AAG	2	6	185576	185581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952587
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4077	NC_011126	AT	3	6	185619	185624	50 %	50 %	0 %	0 %	195952587
4078	NC_011126	CTT	2	6	185668	185673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4079	NC_011126	TTC	2	6	185682	185687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952587
4080	NC_011126	AGC	2	6	185688	185693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952587
4081	NC_011126	T	7	7	185781	185787	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4082	NC_011126	TCC	2	6	185792	185797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952588
4083	NC_011126	AAAAT	2	10	185839	185848	80 %	20 %	0 %	0 %	195952588
4084	NC_011126	AAT	2	6	185856	185861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952588
4085	NC_011126	AT	3	6	186009	186014	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4086	NC_011126	TATC	2	8	186027	186034	25 %	50 %	0 %	25 %	195952588
4087	NC_011126	ATC	2	6	186079	186084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952588
4088	NC_011126	TGTT	2	8	186101	186108	0 %	75 %	25 %	0 %	195952588
4089	NC_011126	T	6	6	186152	186157	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4090	NC_011126	TTTC	2	8	186164	186171	0 %	75 %	0 %	25 %	195952588
4091	NC_011126	AGATAT	2	12	186280	186291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	195952588
4092	NC_011126	TCTTA	2	10	186316	186325	20 %	60 %	0 %	20 %	195952588
4093	NC_011126	TTC	2	6	186349	186354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4094	NC_011126	TACT	2	8	186368	186375	25 %	50 %	0 %	25 %	195952588
4095	NC_011126	CTA	2	6	186429	186434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952588
4096	NC_011126	TA	3	6	186550	186555	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4097	NC_011126	GTT	2	6	186643	186648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952588
4098	NC_011126	CTT	2	6	186654	186659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4099	NC_011126	ATA	2	6	186684	186689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952588
4100	NC_011126	TA	3	6	186765	186770	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4101	NC_011126	TGT	2	6	186933	186938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952588
4102	NC_011126	CGT	2	6	187128	187133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952588
4103	NC_011126	CAC	2	6	187138	187143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952588
4104	NC_011126	AT	3	6	187147	187152	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4105	NC_011126	TA	3	6	187166	187171	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4106	NC_011126	CATTTT	2	12	187173	187184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	195952588
4107	NC_011126	T	6	6	187181	187186	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4108	NC_011126	GTTT	2	8	187215	187222	0 %	75 %	25 %	0 %	195952588
4109	NC_011126	CTT	2	6	187308	187313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4110	NC_011126	T	6	6	187312	187317	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4111	NC_011126	TTGA	2	8	187342	187349	25 %	50 %	25 %	0 %	195952588
4112	NC_011126	AAG	2	6	187381	187386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952588
4113	NC_011126	CTTT	2	8	187427	187434	0 %	75 %	0 %	25 %	195952588
4114	NC_011126	TCT	2	6	187446	187451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
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4116	NC_011126	T	6	6	187504	187509	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4117	NC_011126	TTA	2	6	187539	187544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952588
4118	NC_011126	T	7	7	187562	187568	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4119	NC_011126	AT	4	8	187591	187598	50 %	50 %	0 %	0 %	195952588
4120	NC_011126	TCT	2	6	187718	187723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4121	NC_011126	CTT	2	6	187797	187802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4122	NC_011126	T	6	6	187801	187806	0 %	100 %	0 %	0 %	195952588
4123	NC_011126	TTTA	2	8	187834	187841	25 %	75 %	0 %	0 %	195952588
4124	NC_011126	CTT	2	6	187872	187877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952588
4125	NC_011126	CAG	2	6	187884	187889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952588
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4146	NC_011126	TAT	2	6	188653	188658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4154	NC_011126	TATCT	2	10	189290	189299	20 %	60 %	0 %	20 %	195952589
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4372	NC_011126	ATG	2	6	198937	198942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952598
4373	NC_011126	CTT	2	6	198971	198976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952598
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4376	NC_011126	A	6	6	199039	199044	100 %	0 %	0 %	0 %	195952598
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4403	NC_011126	TTTG	2	8	200399	200406	0 %	75 %	25 %	0 %	195952600
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4455	NC_011126	ATT	2	6	202988	202993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4485	NC_011126	A	6	6	204524	204529	100 %	0 %	0 %	0 %	195952604
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4490	NC_011126	ACTA	2	8	204701	204708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4491	NC_011126	GTA	2	6	204733	204738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_011126	TCT	2	6	204776	204781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952605
4494	NC_011126	A	6	6	204801	204806	100 %	0 %	0 %	0 %	195952605
4495	NC_011126	CAA	2	6	204814	204819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952605
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4497	NC_011126	TATGC	2	10	204961	204970	20 %	40 %	20 %	20 %	195952605
4498	NC_011126	TAT	2	6	204987	204992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_011126	GT	4	8	205000	205007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_011126	GT	4	8	205079	205086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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