MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 34890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011126	GTT	2	6	226911	226916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952635
5002	NC_011126	AG	3	6	226917	226922	50 %	0 %	50 %	0 %	195952635
5003	NC_011126	AGA	2	6	227000	227005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952635
5004	NC_011126	AGA	2	6	227030	227035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952635
5005	NC_011126	TTA	2	6	227086	227091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011126	AAG	2	6	227093	227098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011126	T	6	6	227131	227136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011126	TAA	2	6	227155	227160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011126	GGT	2	6	227161	227166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011126	TTAAA	2	10	227177	227186	60 %	40 %	0 %	0 %	195952636
5011	NC_011126	T	6	6	227206	227211	0 %	100 %	0 %	0 %	195952636
5012	NC_011126	AGGA	2	8	227308	227315	50 %	0 %	50 %	0 %	195952636
5013	NC_011126	TA	3	6	227329	227334	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5014	NC_011126	AT	3	6	227385	227390	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5015	NC_011126	T	6	6	227448	227453	0 %	100 %	0 %	0 %	195952636
5016	NC_011126	TTCT	2	8	227492	227499	0 %	75 %	0 %	25 %	195952636
5017	NC_011126	GAA	2	6	227521	227526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5018	NC_011126	AGAA	2	8	227581	227588	75 %	0 %	25 %	0 %	195952636
5019	NC_011126	ATG	2	6	227647	227652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5020	NC_011126	TATTC	2	10	227726	227735	20 %	60 %	0 %	20 %	195952636
5021	NC_011126	AAG	2	6	227756	227761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5022	NC_011126	CTA	2	6	227834	227839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952636
5023	NC_011126	ATA	2	6	227848	227853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952636
5024	NC_011126	TTTGG	2	10	227905	227914	0 %	60 %	40 %	0 %	195952636
5025	NC_011126	AT	3	6	227927	227932	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5026	NC_011126	TA	3	6	228008	228013	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5027	NC_011126	GGA	2	6	228018	228023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952636
5028	NC_011126	AGA	2	6	228087	228092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5029	NC_011126	AGA	2	6	228102	228107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5030	NC_011126	TAA	2	6	228143	228148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952636
5031	NC_011126	ACC	2	6	228199	228204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952636
5032	NC_011126	AT	4	8	228329	228336	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5033	NC_011126	GTAG	2	8	228451	228458	25 %	25 %	50 %	0 %	195952636
5034	NC_011126	TA	3	6	228481	228486	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5035	NC_011126	AG	3	6	228493	228498	50 %	0 %	50 %	0 %	195952636
5036	NC_011126	TGA	2	6	228525	228530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5037	NC_011126	AAG	2	6	228572	228577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5038	NC_011126	AAGGT	2	10	228712	228721	40 %	20 %	40 %	0 %	195952636
5039	NC_011126	GAT	2	6	228739	228744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5040	NC_011126	AGA	2	6	228763	228768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5041	NC_011126	GCATAG	2	12	228806	228817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195952636
5042	NC_011126	AGA	2	6	228864	228869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5043	NC_011126	TCT	2	6	228916	228921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952636
5044	NC_011126	GGT	2	6	228940	228945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5045	NC_011126	AGA	3	9	228997	229005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5046	NC_011126	TGG	2	6	229023	229028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5047	NC_011126	AG	4	8	229036	229043	50 %	0 %	50 %	0 %	195952636
5048	NC_011126	GCT	2	6	229237	229242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952636
5049	NC_011126	GAA	3	9	229246	229254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5050	NC_011126	TA	3	6	229369	229374	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5051	NC_011126	ATA	2	6	229393	229398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952636
5052	NC_011126	GGAAT	2	10	229522	229531	40 %	20 %	40 %	0 %	195952636
5053	NC_011126	GTG	2	6	229550	229555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5054	NC_011126	GGT	2	6	229576	229581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5055	NC_011126	AGA	2	6	229587	229592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5056	NC_011126	AAAC	2	8	229697	229704	75 %	0 %	0 %	25 %	195952636
5057	NC_011126	TA	3	6	229736	229741	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5058	NC_011126	AAG	2	6	229756	229761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5059	NC_011126	TTGT	2	8	229826	229833	0 %	75 %	25 %	0 %	195952636
5060	NC_011126	CGTGG	2	10	229841	229850	0 %	20 %	60 %	20 %	195952636
5061	NC_011126	AGA	2	6	229896	229901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5062	NC_011126	AGA	2	6	229923	229928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5063	NC_011126	TGA	2	6	229962	229967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5064	NC_011126	TGA	2	6	230019	230024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5065	NC_011126	AT	3	6	230066	230071	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5066	NC_011126	TGG	2	6	230072	230077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5067	NC_011126	CTC	2	6	230169	230174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952636
5068	NC_011126	TAG	2	6	230261	230266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5069	NC_011126	AAG	2	6	230279	230284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5070	NC_011126	AAAG	2	8	230298	230305	75 %	0 %	25 %	0 %	195952636
5071	NC_011126	AAAC	2	8	230382	230389	75 %	0 %	0 %	25 %	195952636
5072	NC_011126	ACA	2	6	230450	230455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952636
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5074	NC_011126	AGA	2	6	230513	230518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5075	NC_011126	AGA	2	6	230520	230525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
5076	NC_011126	AGCTCA	2	12	230538	230549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	195952636
5077	NC_011126	AGATA	2	10	230562	230571	60 %	20 %	20 %	0 %	195952636
5078	NC_011126	GAA	2	6	230575	230580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952636
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5080	NC_011126	TA	3	6	230917	230922	50 %	50 %	0 %	0 %	195952636
5081	NC_011126	AAC	2	6	230950	230955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952636
5082	NC_011126	TCA	2	6	230969	230974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952636
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5088	NC_011126	GCA	2	6	231270	231275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952636
5089	NC_011126	TGG	2	6	231300	231305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952636
5090	NC_011126	GAT	2	6	231391	231396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
5091	NC_011126	TG	4	8	231516	231523	0 %	50 %	50 %	0 %	195952636
5092	NC_011126	AAGA	2	8	231565	231572	75 %	0 %	25 %	0 %	195952636
5093	NC_011126	GGA	2	6	231573	231578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952636
5094	NC_011126	TGA	2	6	231583	231588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952636
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5096	NC_011126	TAA	2	6	231608	231613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952637
5097	NC_011126	TTGC	2	8	231624	231631	0 %	50 %	25 %	25 %	195952637
5098	NC_011126	AAGG	2	8	231714	231721	50 %	0 %	50 %	0 %	195952637
5099	NC_011126	TG	3	6	231769	231774	0 %	50 %	50 %	0 %	195952637
5100	NC_011126	AGA	2	6	231849	231854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952637
5101	NC_011126	AT	3	6	231895	231900	50 %	50 %	0 %	0 %	195952637
5102	NC_011126	TCT	2	6	231912	231917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952637
5103	NC_011126	TA	3	6	231971	231976	50 %	50 %	0 %	0 %	195952637
5104	NC_011126	CTTA	2	8	231985	231992	25 %	50 %	0 %	25 %	195952637
5105	NC_011126	TCA	2	6	232076	232081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952637
5106	NC_011126	GTT	2	6	232095	232100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952637
5107	NC_011126	GAA	2	6	232104	232109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952637
5108	NC_011126	ACA	2	6	232141	232146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952637
5109	NC_011126	TGGGA	2	10	232157	232166	20 %	20 %	60 %	0 %	195952637
5110	NC_011126	ATA	2	6	232311	232316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952637
5111	NC_011126	AT	3	6	232425	232430	50 %	50 %	0 %	0 %	195952637
5112	NC_011126	CAAAAT	2	12	232530	232541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	195952637
5113	NC_011126	AAG	2	6	232564	232569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952637
5114	NC_011126	GAT	2	6	232679	232684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952637
5115	NC_011126	AG	3	6	232903	232908	50 %	0 %	50 %	0 %	195952637
5116	NC_011126	GTA	2	6	232914	232919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952637
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5118	NC_011126	GTT	2	6	233093	233098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952637
5119	NC_011126	AGA	2	6	233115	233120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952637
5120	NC_011126	A	6	6	233150	233155	100 %	0 %	0 %	0 %	195952637
5121	NC_011126	TGG	2	6	233290	233295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952637
5122	NC_011126	AAGGC	2	10	233296	233305	40 %	0 %	40 %	20 %	195952637
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5124	NC_011126	TTC	2	6	233547	233552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952637
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5242	NC_011126	ACT	2	6	238306	238311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952640
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5244	NC_011126	AGA	2	6	238333	238338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952640
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5393	NC_011126	TGT	2	6	245699	245704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952652
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5399	NC_011126	A	6	6	245892	245897	100 %	0 %	0 %	0 %	195952653
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5493	NC_011126	TGT	2	6	250337	250342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952663
5494	NC_011126	TGG	2	6	250349	250354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952663
5495	NC_011126	GTT	2	6	250368	250373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952663
5496	NC_011126	TGATA	2	10	250421	250430	40 %	40 %	20 %	0 %	195952663
5497	NC_011126	ATT	2	6	250575	250580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952663
5498	NC_011126	AAG	2	6	250609	250614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952663
5499	NC_011126	AG	3	6	250616	250621	50 %	0 %	50 %	0 %	195952663
5500	NC_011126	AAG	2	6	250643	250648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952663

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