MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi470 chromosome

Total Repeats: 4626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010698	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	188526813
2	NC_010698	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	188526813
3	NC_010698	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	188526814
4	NC_010698	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	188526815
5	NC_010698	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	188526815
6	NC_010698	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	188526816
7	NC_010698	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	188526816
8	NC_010698	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	188526816
9	NC_010698	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	188526816
10	NC_010698	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	188526816
11	NC_010698	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	188526817
12	NC_010698	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	188526817
13	NC_010698	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	188526818
14	NC_010698	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	188526818
15	NC_010698	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	188526818
16	NC_010698	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	188526818
17	NC_010698	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010698	TAAA	2	8	4693	4700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010698	CATT	2	8	5285	5292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010698	CATT	2	8	5596	5603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010698	GTGC	2	8	5865	5872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010698	TGGT	2	8	6656	6663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010698	ATCG	2	8	6830	6837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010698	CGTT	2	8	6865	6872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010698	CAAA	2	8	7306	7313	75 %	0 %	0 %	25 %	188526819
26	NC_010698	TTCA	2	8	7602	7609	25 %	50 %	0 %	25 %	188526820
27	NC_010698	TCTT	2	8	7896	7903	0 %	75 %	0 %	25 %	188526820
28	NC_010698	AAGC	2	8	8711	8718	50 %	0 %	25 %	25 %	188526820
29	NC_010698	CAAA	2	8	8948	8955	75 %	0 %	0 %	25 %	188526820
30	NC_010698	ATAA	2	8	9398	9405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010698	TATT	2	8	9597	9604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010698	ATTC	2	8	9612	9619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010698	GATA	2	8	9701	9708	50 %	25 %	25 %	0 %	188526822
34	NC_010698	TCAA	2	8	9808	9815	50 %	25 %	0 %	25 %	188526822
35	NC_010698	GCTC	2	8	11251	11258	0 %	25 %	25 %	50 %	188526822
36	NC_010698	AGTG	2	8	11425	11432	25 %	25 %	50 %	0 %	188526823
37	NC_010698	ATTG	2	8	11603	11610	25 %	50 %	25 %	0 %	188526823
38	NC_010698	GCAA	2	8	11794	11801	50 %	0 %	25 %	25 %	188526823
39	NC_010698	AAGC	2	8	11935	11942	50 %	0 %	25 %	25 %	188526823
40	NC_010698	TGCT	2	8	11999	12006	0 %	50 %	25 %	25 %	188526823
41	NC_010698	GGCC	2	8	12262	12269	0 %	0 %	50 %	50 %	188526823
42	NC_010698	TGCA	2	8	12480	12487	25 %	25 %	25 %	25 %	188526824
43	NC_010698	TCTT	2	8	13280	13287	0 %	75 %	0 %	25 %	188526825
44	NC_010698	TTAA	2	8	13428	13435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010698	AGCG	2	8	13751	13758	25 %	0 %	50 %	25 %	188526827
46	NC_010698	GATT	2	8	13859	13866	25 %	50 %	25 %	0 %	188526827
47	NC_010698	CAAA	2	8	14028	14035	75 %	0 %	0 %	25 %	188526828
48	NC_010698	ATGC	2	8	14443	14450	25 %	25 %	25 %	25 %	188526828
49	NC_010698	GAGC	2	8	14748	14755	25 %	0 %	50 %	25 %	188526828
50	NC_010698	TTTA	2	8	15030	15037	25 %	75 %	0 %	0 %	188526828
51	NC_010698	TGAT	2	8	16232	16239	25 %	50 %	25 %	0 %	188526828
52	NC_010698	AGTT	2	8	16374	16381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010698	AACG	2	8	17055	17062	50 %	0 %	25 %	25 %	188526829
54	NC_010698	GCTT	2	8	17227	17234	0 %	50 %	25 %	25 %	188526829
55	NC_010698	CTAT	2	8	17452	17459	25 %	50 %	0 %	25 %	188526829
56	NC_010698	CGAT	2	8	17461	17468	25 %	25 %	25 %	25 %	188526829
57	NC_010698	ATCT	2	8	17784	17791	25 %	50 %	0 %	25 %	188526829
58	NC_010698	GTTT	2	8	18002	18009	0 %	75 %	25 %	0 %	188526829
59	NC_010698	TTGA	2	8	18343	18350	25 %	50 %	25 %	0 %	188526830
60	NC_010698	TGCT	2	8	18719	18726	0 %	50 %	25 %	25 %	188526830
61	NC_010698	AGCG	2	8	18891	18898	25 %	0 %	50 %	25 %	188526830
62	NC_010698	TAAA	2	8	20397	20404	75 %	25 %	0 %	0 %	188526832
63	NC_010698	GCGA	2	8	20406	20413	25 %	0 %	50 %	25 %	188526832
64	NC_010698	AGGC	2	8	20838	20845	25 %	0 %	50 %	25 %	188526832
65	NC_010698	TGAT	2	8	20996	21003	25 %	50 %	25 %	0 %	188526833
66	NC_010698	CTTT	2	8	21263	21270	0 %	75 %	0 %	25 %	188526833
67	NC_010698	AAGT	2	8	21575	21582	50 %	25 %	25 %	0 %	188526833
68	NC_010698	GCTT	2	8	21708	21715	0 %	50 %	25 %	25 %	188526833
69	NC_010698	CTTT	2	8	22340	22347	0 %	75 %	0 %	25 %	188526833
70	NC_010698	AATC	3	12	22478	22489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010698	TTAG	2	8	22679	22686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010698	CTTT	2	8	22694	22701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010698	GTTT	2	8	23271	23278	0 %	75 %	25 %	0 %	188526834
74	NC_010698	ACTG	2	8	23568	23575	25 %	25 %	25 %	25 %	188526834
75	NC_010698	ATTG	2	8	24235	24242	25 %	50 %	25 %	0 %	188526834
76	NC_010698	TAGT	2	8	24383	24390	25 %	50 %	25 %	0 %	188526834
77	NC_010698	TCCC	2	8	24411	24418	0 %	25 %	0 %	75 %	188526834
78	NC_010698	GATT	2	8	24894	24901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010698	ATTA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010698	TCGC	2	8	25267	25274	0 %	25 %	25 %	50 %	188526835
81	NC_010698	ATAA	2	8	26099	26106	75 %	25 %	0 %	0 %	188526836
82	NC_010698	AAGG	2	8	27490	27497	50 %	0 %	50 %	0 %	188526837
83	NC_010698	ATGG	2	8	28072	28079	25 %	25 %	50 %	0 %	188526837
84	NC_010698	ATGA	2	8	28335	28342	50 %	25 %	25 %	0 %	188526838
85	NC_010698	TTTA	2	8	28709	28716	25 %	75 %	0 %	0 %	188526838
86	NC_010698	CGTT	2	8	28777	28784	0 %	50 %	25 %	25 %	188526839
87	NC_010698	TGGT	2	8	29227	29234	0 %	50 %	50 %	0 %	188526839
88	NC_010698	AGTC	2	8	29508	29515	25 %	25 %	25 %	25 %	188526840
89	NC_010698	GGTT	2	8	29858	29865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010698	TTTA	2	8	29992	29999	25 %	75 %	0 %	0 %	188526841
91	NC_010698	CAGA	2	8	30028	30035	50 %	0 %	25 %	25 %	188526841
92	NC_010698	TGAT	2	8	30137	30144	25 %	50 %	25 %	0 %	188526841
93	NC_010698	GCGA	2	8	30190	30197	25 %	0 %	50 %	25 %	188526841
94	NC_010698	ACCC	2	8	30307	30314	25 %	0 %	0 %	75 %	188526842
95	NC_010698	CATC	2	8	30433	30440	25 %	25 %	0 %	50 %	188526842
96	NC_010698	TCAA	2	8	30575	30582	50 %	25 %	0 %	25 %	188526843
97	NC_010698	CATG	2	8	31695	31702	25 %	25 %	25 %	25 %	188526843
98	NC_010698	TTGC	2	8	32199	32206	0 %	50 %	25 %	25 %	188526843
99	NC_010698	GCTT	2	8	32710	32717	0 %	50 %	25 %	25 %	188526843
100	NC_010698	GAAA	2	8	32742	32749	75 %	0 %	25 %	0 %	188526843
101	NC_010698	GAAA	2	8	32769	32776	75 %	0 %	25 %	0 %	188526843
102	NC_010698	GATC	2	8	32847	32854	25 %	25 %	25 %	25 %	188526844
103	NC_010698	ATGA	2	8	33050	33057	50 %	25 %	25 %	0 %	188526844
104	NC_010698	TTGT	2	8	34648	34655	0 %	75 %	25 %	0 %	188526847
105	NC_010698	CTTT	2	8	34795	34802	0 %	75 %	0 %	25 %	188526847
106	NC_010698	AATA	2	8	35472	35479	75 %	25 %	0 %	0 %	188526847
107	NC_010698	TAAA	2	8	35494	35501	75 %	25 %	0 %	0 %	188526847
108	NC_010698	GAAA	2	8	35624	35631	75 %	0 %	25 %	0 %	188526848
109	NC_010698	GTGA	2	8	35721	35728	25 %	25 %	50 %	0 %	188526849
110	NC_010698	ATGA	2	8	36201	36208	50 %	25 %	25 %	0 %	188526849
111	NC_010698	TTTG	2	8	36254	36261	0 %	75 %	25 %	0 %	188526849
112	NC_010698	TGAT	2	8	36744	36751	25 %	50 %	25 %	0 %	188526850
113	NC_010698	AAAC	2	8	37639	37646	75 %	0 %	0 %	25 %	188526851
114	NC_010698	CAAA	2	8	37715	37722	75 %	0 %	0 %	25 %	188526851
115	NC_010698	ATTG	2	8	38129	38136	25 %	50 %	25 %	0 %	188526851
116	NC_010698	ATCA	2	8	38304	38311	50 %	25 %	0 %	25 %	188526851
117	NC_010698	TCAA	2	8	38317	38324	50 %	25 %	0 %	25 %	188526851
118	NC_010698	GATT	2	8	38910	38917	25 %	50 %	25 %	0 %	188526852
119	NC_010698	TGTT	2	8	39092	39099	0 %	75 %	25 %	0 %	188526852
120	NC_010698	TCGT	2	8	39212	39219	0 %	50 %	25 %	25 %	188526852
121	NC_010698	CTTT	2	8	39685	39692	0 %	75 %	0 %	25 %	188526852
122	NC_010698	GAAA	2	8	39972	39979	75 %	0 %	25 %	0 %	188526853
123	NC_010698	GATC	2	8	40101	40108	25 %	25 %	25 %	25 %	188526853
124	NC_010698	ATGA	2	8	41108	41115	50 %	25 %	25 %	0 %	188526853
125	NC_010698	CAAA	2	8	41947	41954	75 %	0 %	0 %	25 %	188526854
126	NC_010698	GATT	2	8	42264	42271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010698	TGAT	2	8	42500	42507	25 %	50 %	25 %	0 %	188526856
128	NC_010698	AAAC	2	8	42513	42520	75 %	0 %	0 %	25 %	188526856
129	NC_010698	CATT	2	8	42641	42648	25 %	50 %	0 %	25 %	188526856
130	NC_010698	CGCT	2	8	42654	42661	0 %	25 %	25 %	50 %	188526856
131	NC_010698	GTTT	2	8	43276	43283	0 %	75 %	25 %	0 %	188526856
132	NC_010698	CAAA	2	8	43772	43779	75 %	0 %	0 %	25 %	188526857
133	NC_010698	TCGC	2	8	44587	44594	0 %	25 %	25 %	50 %	188526857
134	NC_010698	AGGG	2	8	44598	44605	25 %	0 %	75 %	0 %	188526857
135	NC_010698	GCAA	2	8	45251	45258	50 %	0 %	25 %	25 %	188526857
136	NC_010698	CAAC	2	8	45383	45390	50 %	0 %	0 %	50 %	188526857
137	NC_010698	TAAA	2	8	45520	45527	75 %	25 %	0 %	0 %	188526857
138	NC_010698	AGCG	2	8	45943	45950	25 %	0 %	50 %	25 %	188526858
139	NC_010698	TTCA	2	8	46563	46570	25 %	50 %	0 %	25 %	188526858
140	NC_010698	CTTT	2	8	46916	46923	0 %	75 %	0 %	25 %	188526859
141	NC_010698	TGGT	2	8	47676	47683	0 %	50 %	50 %	0 %	188526860
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143	NC_010698	TCAA	2	8	48491	48498	50 %	25 %	0 %	25 %	188526861
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