MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010368	TG	3	6	1308	1313	0 %	50 %	50 %	0 %	169237355
2	NC_010368	TC	3	6	1358	1363	0 %	50 %	0 %	50 %	169237355
3	NC_010368	CA	3	6	3084	3089	50 %	0 %	0 %	50 %	169237355
4	NC_010368	GA	3	6	3146	3151	50 %	0 %	50 %	0 %	169237355
5	NC_010368	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	169237356
6	NC_010368	GC	3	6	6387	6392	0 %	0 %	50 %	50 %	169237356
7	NC_010368	GA	3	6	6549	6554	50 %	0 %	50 %	0 %	169237356
8	NC_010368	TG	3	6	6670	6675	0 %	50 %	50 %	0 %	169237356
9	NC_010368	GC	3	6	7600	7605	0 %	0 %	50 %	50 %	169237357
10	NC_010368	GC	3	6	10295	10300	0 %	0 %	50 %	50 %	169237359
11	NC_010368	GA	3	6	10344	10349	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
12	NC_010368	AG	3	6	10840	10845	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
13	NC_010368	TC	3	6	10948	10953	0 %	50 %	0 %	50 %	169237359
14	NC_010368	GA	3	6	10975	10980	50 %	0 %	50 %	0 %	169237359
15	NC_010368	GC	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	169237359
16	NC_010368	GA	3	6	11351	11356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010368	TC	3	6	11459	11464	0 %	50 %	0 %	50 %	169237360
18	NC_010368	GA	3	6	11570	11575	50 %	0 %	50 %	0 %	169237360
19	NC_010368	AG	3	6	12985	12990	50 %	0 %	50 %	0 %	169237360
20	NC_010368	CG	3	6	13069	13074	0 %	0 %	50 %	50 %	169237360
21	NC_010368	TC	3	6	14648	14653	0 %	50 %	0 %	50 %	169237361
22	NC_010368	GC	3	6	14855	14860	0 %	0 %	50 %	50 %	169237361
23	NC_010368	AC	4	8	15452	15459	50 %	0 %	0 %	50 %	169237362
24	NC_010368	TG	3	6	15819	15824	0 %	50 %	50 %	0 %	169237363
25	NC_010368	CT	3	6	17606	17611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010368	GA	3	6	18001	18006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010368	CG	3	6	19144	19149	0 %	0 %	50 %	50 %	169237365
28	NC_010368	GA	3	6	19497	19502	50 %	0 %	50 %	0 %	169237365
29	NC_010368	AC	3	6	19583	19588	50 %	0 %	0 %	50 %	169237365
30	NC_010368	TG	3	6	19649	19654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010368	CT	3	6	19849	19854	0 %	50 %	0 %	50 %	169237366
32	NC_010368	TC	3	6	20359	20364	0 %	50 %	0 %	50 %	169237367
33	NC_010368	AC	3	6	20663	20668	50 %	0 %	0 %	50 %	169237367
34	NC_010368	CG	3	6	21169	21174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010368	CG	3	6	21652	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	169237370
36	NC_010368	GA	3	6	22187	22192	50 %	0 %	50 %	0 %	169237370
37	NC_010368	CG	3	6	22251	22256	0 %	0 %	50 %	50 %	169237370
38	NC_010368	CT	3	6	22257	22262	0 %	50 %	0 %	50 %	169237370
39	NC_010368	AT	3	6	22441	22446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010368	GC	3	6	23460	23465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010368	GA	3	6	23759	23764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010368	CA	3	6	24191	24196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010368	GA	3	6	24686	24691	50 %	0 %	50 %	0 %	169237371
44	NC_010368	CT	3	6	24883	24888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010368	CT	3	6	24908	24913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010368	GC	3	6	25657	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	169237372
47	NC_010368	GT	3	6	25953	25958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010368	GA	3	6	26087	26092	50 %	0 %	50 %	0 %	169237374
49	NC_010368	TC	3	6	27029	27034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010368	TC	3	6	27251	27256	0 %	50 %	0 %	50 %	169237375
51	NC_010368	TC	3	6	27261	27266	0 %	50 %	0 %	50 %	169237375
52	NC_010368	AC	3	6	28465	28470	50 %	0 %	0 %	50 %	169237376
53	NC_010368	CT	3	6	28614	28619	0 %	50 %	0 %	50 %	169237376
54	NC_010368	CT	3	6	29004	29009	0 %	50 %	0 %	50 %	169237376
55	NC_010368	TG	3	6	29889	29894	0 %	50 %	50 %	0 %	169237377
56	NC_010368	GT	3	6	31083	31088	0 %	50 %	50 %	0 %	169237379
57	NC_010368	GC	3	6	32065	32070	0 %	0 %	50 %	50 %	169237379
58	NC_010368	TC	3	6	32439	32444	0 %	50 %	0 %	50 %	169237379
59	NC_010368	GC	3	6	32500	32505	0 %	0 %	50 %	50 %	169237379
60	NC_010368	CG	3	6	32747	32752	0 %	0 %	50 %	50 %	169237380
61	NC_010368	AC	3	6	35584	35589	50 %	0 %	0 %	50 %	169237382
62	NC_010368	CA	3	6	36567	36572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010368	GT	3	6	37151	37156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010368	TC	3	6	37392	37397	0 %	50 %	0 %	50 %	169237384
65	NC_010368	GA	3	6	37618	37623	50 %	0 %	50 %	0 %	169237384
66	NC_010368	GT	3	6	37816	37821	0 %	50 %	50 %	0 %	169237385
67	NC_010368	CT	3	6	37834	37839	0 %	50 %	0 %	50 %	169237385
68	NC_010368	CG	3	6	38261	38266	0 %	0 %	50 %	50 %	169237385
69	NC_010368	AC	3	6	38376	38381	50 %	0 %	0 %	50 %	169237385
70	NC_010368	GT	3	6	39416	39421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010368	GC	3	6	39680	39685	0 %	0 %	50 %	50 %	169237387
72	NC_010368	GA	3	6	39990	39995	50 %	0 %	50 %	0 %	169237387
73	NC_010368	CA	3	6	40122	40127	50 %	0 %	0 %	50 %	169237387
74	NC_010368	AG	3	6	40419	40424	50 %	0 %	50 %	0 %	169237387
75	NC_010368	GC	3	6	40930	40935	0 %	0 %	50 %	50 %	169237388
76	NC_010368	GA	3	6	41031	41036	50 %	0 %	50 %	0 %	169237388
77	NC_010368	GT	3	6	41442	41447	0 %	50 %	50 %	0 %	169237388
78	NC_010368	AG	3	6	43476	43481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010368	CT	3	6	43595	43600	0 %	50 %	0 %	50 %	169237391
80	NC_010368	CT	4	8	43901	43908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010368	CT	3	6	43926	43931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010368	AC	3	6	44261	44266	50 %	0 %	0 %	50 %	169237392
83	NC_010368	CT	3	6	45151	45156	0 %	50 %	0 %	50 %	169237394
84	NC_010368	CT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	0 %	50 %	169237400
85	NC_010368	CG	3	6	48623	48628	0 %	0 %	50 %	50 %	169237400
86	NC_010368	AT	3	6	50346	50351	50 %	50 %	0 %	0 %	169237402
87	NC_010368	CT	3	6	50811	50816	0 %	50 %	0 %	50 %	169237403
88	NC_010368	CA	3	6	51164	51169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010368	GC	3	6	53050	53055	0 %	0 %	50 %	50 %	169237406
90	NC_010368	GA	3	6	53935	53940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010368	GT	3	6	53941	53946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010368	CA	3	6	53950	53955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010368	AC	3	6	54200	54205	50 %	0 %	0 %	50 %	169237408
94	NC_010368	GC	3	6	54558	54563	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
95	NC_010368	GC	3	6	55140	55145	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
96	NC_010368	CG	3	6	55342	55347	0 %	0 %	50 %	50 %	169237408
97	NC_010368	CG	4	8	55989	55996	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
98	NC_010368	CG	3	6	56404	56409	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
99	NC_010368	CG	3	6	56856	56861	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
100	NC_010368	CG	3	6	56878	56883	0 %	0 %	50 %	50 %	169237409
101	NC_010368	GC	3	6	57363	57368	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
102	NC_010368	GC	3	6	57831	57836	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
103	NC_010368	GC	3	6	57990	57995	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
104	NC_010368	GC	3	6	58505	58510	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
105	NC_010368	GC	3	6	58622	58627	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
106	NC_010368	AC	3	6	58837	58842	50 %	0 %	0 %	50 %	169237410
107	NC_010368	GC	3	6	59236	59241	0 %	0 %	50 %	50 %	169237411
108	NC_010368	CA	3	6	60021	60026	50 %	0 %	0 %	50 %	169237412
109	NC_010368	GT	3	6	60151	60156	0 %	50 %	50 %	0 %	169237412
110	NC_010368	GC	3	6	60776	60781	0 %	0 %	50 %	50 %	169237412
111	NC_010368	AC	3	6	61026	61031	50 %	0 %	0 %	50 %	169237413
112	NC_010368	CG	3	6	61271	61276	0 %	0 %	50 %	50 %	169237413
113	NC_010368	GC	3	6	61431	61436	0 %	0 %	50 %	50 %	169237413
114	NC_010368	AC	3	6	61728	61733	50 %	0 %	0 %	50 %	169237413
115	NC_010368	GC	3	6	63013	63018	0 %	0 %	50 %	50 %	169237414
116	NC_010368	GC	3	6	63185	63190	0 %	0 %	50 %	50 %	169237414
117	NC_010368	GT	3	6	63496	63501	0 %	50 %	50 %	0 %	169237415
118	NC_010368	GC	3	6	64625	64630	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
119	NC_010368	AC	3	6	65000	65005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010368	CA	3	6	66324	66329	50 %	0 %	0 %	50 %	169237416
121	NC_010368	TG	3	6	66761	66766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010368	TC	3	6	66922	66927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010368	AT	3	6	66970	66975	50 %	50 %	0 %	0 %	169237417
124	NC_010368	CG	3	6	67277	67282	0 %	0 %	50 %	50 %	169237417
125	NC_010368	AT	3	6	68024	68029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010368	AC	3	6	68050	68055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010368	GT	3	6	68655	68660	0 %	50 %	50 %	0 %	169237419
128	NC_010368	GA	3	6	68759	68764	50 %	0 %	50 %	0 %	169237419
129	NC_010368	AC	3	6	69200	69205	50 %	0 %	0 %	50 %	169237420
130	NC_010368	CG	3	6	69812	69817	0 %	0 %	50 %	50 %	169237422
131	NC_010368	GC	3	6	70018	70023	0 %	0 %	50 %	50 %	169237422
132	NC_010368	TG	3	6	70570	70575	0 %	50 %	50 %	0 %	169237423
133	NC_010368	GC	3	6	71355	71360	0 %	0 %	50 %	50 %	169237425
134	NC_010368	CG	3	6	71404	71409	0 %	0 %	50 %	50 %	169237425
135	NC_010368	GT	3	6	71464	71469	0 %	50 %	50 %	0 %	169237425
136	NC_010368	CG	3	6	71717	71722	0 %	0 %	50 %	50 %	169237426
137	NC_010368	GC	3	6	72612	72617	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
138	NC_010368	GC	3	6	72655	72660	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
139	NC_010368	CG	3	6	72789	72794	0 %	0 %	50 %	50 %	169237428
140	NC_010368	CG	3	6	74734	74739	0 %	0 %	50 %	50 %	169237430
141	NC_010368	TG	3	6	74948	74953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010368	AC	3	6	76130	76135	50 %	0 %	0 %	50 %	169237432
143	NC_010368	CG	3	6	76498	76503	0 %	0 %	50 %	50 %	169237433
144	NC_010368	GT	3	6	77312	77317	0 %	50 %	50 %	0 %	169237433
145	NC_010368	CG	3	6	77970	77975	0 %	0 %	50 %	50 %	169237435
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