MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010368	ACA	2	6	143688	143693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3502	NC_010368	CAG	2	6	143702	143707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3503	NC_010368	CAA	2	6	143716	143721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3504	NC_010368	ACC	2	6	143748	143753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3505	NC_010368	GTC	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3506	NC_010368	CAGA	2	8	143902	143909	50 %	0 %	25 %	25 %	169237494
3507	NC_010368	GCG	2	6	143949	143954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3508	NC_010368	CGA	2	6	144292	144297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3509	NC_010368	ACC	2	6	144298	144303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3510	NC_010368	ACT	2	6	144312	144317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237494
3511	NC_010368	GCG	2	6	144433	144438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3512	NC_010368	ACA	2	6	144474	144479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237494
3513	NC_010368	GCG	2	6	144489	144494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237494
3514	NC_010368	GGA	2	6	144589	144594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237494
3515	NC_010368	GC	3	6	144652	144657	0 %	0 %	50 %	50 %	169237494
3516	NC_010368	CGT	2	6	144662	144667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3517	NC_010368	GAAA	2	8	144726	144733	75 %	0 %	25 %	0 %	169237494
3518	NC_010368	TGA	2	6	144736	144741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237494
3519	NC_010368	CTG	2	6	144751	144756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3520	NC_010368	GCC	2	6	144830	144835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237494
3521	NC_010368	AG	3	6	144842	144847	50 %	0 %	50 %	0 %	169237494
3522	NC_010368	GC	3	6	144926	144931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_010368	GAAC	2	8	144957	144964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_010368	A	6	6	145002	145007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_010368	AGA	2	6	145031	145036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010368	ACG	2	6	145081	145086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_010368	CTC	2	6	145089	145094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_010368	GTTC	2	8	145140	145147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_010368	GAG	3	9	145164	145172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_010368	TAC	2	6	145225	145230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237495
3531	NC_010368	GAG	2	6	145351	145356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_010368	CGT	2	6	145429	145434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010368	CGA	2	6	145450	145455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_010368	TAG	2	6	145570	145575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3535	NC_010368	TGA	2	6	145586	145591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3536	NC_010368	CCG	2	6	145594	145599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237496
3537	NC_010368	CGA	2	6	145643	145648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237496
3538	NC_010368	GAT	2	6	145669	145674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237496
3539	NC_010368	AAT	2	6	145683	145688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237496
3540	NC_010368	GCT	2	6	145693	145698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237496
3541	NC_010368	AAT	2	6	145794	145799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_010368	CA	4	8	145820	145827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_010368	GTC	2	6	145863	145868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_010368	CTG	2	6	145957	145962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_010368	GCT	2	6	146004	146009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3546	NC_010368	ACC	2	6	146021	146026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237497
3547	NC_010368	TGA	2	6	146069	146074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3548	NC_010368	GC	3	6	146084	146089	0 %	0 %	50 %	50 %	169237497
3549	NC_010368	GTT	2	6	146138	146143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3550	NC_010368	GCT	2	6	146166	146171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3551	NC_010368	CGTT	2	8	146272	146279	0 %	50 %	25 %	25 %	169237497
3552	NC_010368	GA	3	6	146290	146295	50 %	0 %	50 %	0 %	169237497
3553	NC_010368	GAT	2	6	146301	146306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3554	NC_010368	TTG	2	6	146377	146382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3555	NC_010368	GTT	2	6	146606	146611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3556	NC_010368	ACG	2	6	146629	146634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3557	NC_010368	TCG	2	6	146677	146682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3558	NC_010368	CGA	2	6	146747	146752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3559	NC_010368	TCG	2	6	146842	146847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3560	NC_010368	GC	3	6	146943	146948	0 %	0 %	50 %	50 %	169237497
3561	NC_010368	GCT	2	6	146960	146965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3562	NC_010368	TGA	2	6	146996	147001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237497
3563	NC_010368	CAT	2	6	147023	147028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237497
3564	NC_010368	ATC	2	6	147039	147044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237497
3565	NC_010368	GCG	2	6	147048	147053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237497
3566	NC_010368	GCT	2	6	147059	147064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3567	NC_010368	CGA	3	9	147122	147130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3568	NC_010368	CGT	2	6	147139	147144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3569	NC_010368	CGA	2	6	147248	147253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3570	NC_010368	TGT	2	6	147259	147264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237497
3571	NC_010368	GTC	2	6	147266	147271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237497
3572	NC_010368	GTA	2	6	147371	147376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_010368	GAGT	2	8	147409	147416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010368	GCC	2	6	147419	147424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_010368	AG	3	6	147428	147433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010368	TCA	2	6	147445	147450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_010368	AGA	2	6	147459	147464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_010368	TCA	2	6	147492	147497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_010368	CGC	2	6	147553	147558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_010368	CA	3	6	147584	147589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_010368	TCC	2	6	147596	147601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_010368	GAG	2	6	147617	147622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_010368	CA	3	6	147625	147630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_010368	GTA	2	6	147680	147685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010368	TGA	2	6	147799	147804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_010368	TGT	2	6	147836	147841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_010368	GACG	2	8	147884	147891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_010368	GCC	2	6	147894	147899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_010368	CTT	2	6	147938	147943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_010368	AC	3	6	147946	147951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_010368	ACT	2	6	147987	147992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_010368	AAT	2	6	148022	148027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_010368	ACC	2	6	148103	148108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_010368	TTC	2	6	148151	148156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_010368	TCT	2	6	148219	148224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010368	TGC	2	6	148316	148321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_010368	ACG	2	6	148340	148345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_010368	AT	3	6	148422	148427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010368	GAC	2	6	148455	148460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237498
3600	NC_010368	TGG	2	6	148524	148529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237498
3601	NC_010368	GGT	2	6	148563	148568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237498
3602	NC_010368	CTC	2	6	148627	148632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237498
3603	NC_010368	AAG	2	6	148664	148669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237498
3604	NC_010368	GAG	2	6	148688	148693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_010368	CTG	2	6	148695	148700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_010368	ATA	2	6	148805	148810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010368	ATA	2	6	148853	148858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010368	CTCAG	2	10	148980	148989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3609	NC_010368	CGCA	2	8	148994	149001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_010368	CAG	2	6	149110	149115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_010368	A	6	6	149133	149138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_010368	ACA	2	6	149174	149179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_010368	ACC	2	6	149218	149223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_010368	TTC	2	6	149292	149297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_010368	CTT	2	6	149316	149321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_010368	CAGATG	2	12	149351	149362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169237499
3617	NC_010368	GCA	2	6	149401	149406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3618	NC_010368	AG	3	6	149445	149450	50 %	0 %	50 %	0 %	169237499
3619	NC_010368	TGC	2	6	149482	149487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3620	NC_010368	GAA	2	6	149508	149513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237499
3621	NC_010368	CGT	2	6	149585	149590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237499
3622	NC_010368	CAA	2	6	149605	149610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237499
3623	NC_010368	CGA	2	6	149663	149668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237499
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3625	NC_010368	GCG	2	6	149717	149722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237499
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3746	NC_010368	GGC	2	6	155857	155862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3747	NC_010368	GACC	2	8	155906	155913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3994	NC_010368	TGA	2	6	166585	166590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237510
3995	NC_010368	ACC	2	6	166609	166614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237510
3996	NC_010368	CAG	2	6	166640	166645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237510
3997	NC_010368	GTT	2	6	166704	166709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237510
3998	NC_010368	TCC	2	6	166711	166716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237510
3999	NC_010368	GTC	2	6	166737	166742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237510
4000	NC_010368	CTT	2	6	166776	166781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237510

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