MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010368	GAC	2	6	100713	100718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237457
2502	NC_010368	AACC	2	8	100864	100871	50 %	0 %	0 %	50 %	169237457
2503	NC_010368	CACC	2	8	100890	100897	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2504	NC_010368	GTT	2	6	100920	100925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010368	TTC	2	6	101111	101116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237458
2506	NC_010368	TCT	2	6	101205	101210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237458
2507	NC_010368	CAC	3	9	101246	101254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237458
2508	NC_010368	GTC	2	6	101266	101271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2509	NC_010368	CCA	2	6	101292	101297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237458
2510	NC_010368	AGT	2	6	101349	101354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237458
2511	NC_010368	CCA	2	6	101370	101375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237458
2512	NC_010368	GCCGTA	2	12	101401	101412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2513	NC_010368	GCC	2	6	101422	101427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237458
2514	NC_010368	TCG	2	6	101511	101516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2515	NC_010368	CTG	2	6	101518	101523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2516	NC_010368	GCC	2	6	101581	101586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237458
2517	NC_010368	CAG	2	6	101635	101640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2518	NC_010368	GGA	2	6	101664	101669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237458
2519	NC_010368	GTC	2	6	101674	101679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237458
2520	NC_010368	GT	3	6	101735	101740	0 %	50 %	50 %	0 %	169237458
2521	NC_010368	GTA	2	6	101860	101865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237458
2522	NC_010368	TCCA	2	8	101882	101889	25 %	25 %	0 %	50 %	169237458
2523	NC_010368	TCGG	2	8	101922	101929	0 %	25 %	50 %	25 %	169237458
2524	NC_010368	CCG	2	6	101985	101990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237459
2525	NC_010368	CGGC	2	8	102084	102091	0 %	0 %	50 %	50 %	169237459
2526	NC_010368	TCG	2	6	102127	102132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237459
2527	NC_010368	GAC	2	6	102177	102182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237459
2528	NC_010368	CGCC	2	8	102185	102192	0 %	0 %	25 %	75 %	169237459
2529	NC_010368	GCC	2	6	102253	102258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237459
2530	NC_010368	GAG	2	6	102261	102266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237459
2531	NC_010368	GCCA	2	8	102334	102341	25 %	0 %	25 %	50 %	169237459
2532	NC_010368	CTCGAT	2	12	102390	102401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_010368	CTG	2	6	102502	102507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2534	NC_010368	GCC	2	6	102521	102526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237460
2535	NC_010368	CCGT	2	8	102533	102540	0 %	25 %	25 %	50 %	169237460
2536	NC_010368	CTC	2	6	102580	102585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237460
2537	NC_010368	CGT	2	6	102591	102596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2538	NC_010368	CGT	2	6	102699	102704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2539	NC_010368	GTT	2	6	102727	102732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237460
2540	NC_010368	TCG	2	6	102779	102784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2541	NC_010368	CGA	2	6	102801	102806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2542	NC_010368	GGT	2	6	102817	102822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237460
2543	NC_010368	GCC	2	6	102833	102838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237460
2544	NC_010368	GCC	2	6	102848	102853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237460
2545	NC_010368	TGC	2	6	102871	102876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2546	NC_010368	GAC	2	6	102894	102899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237460
2547	NC_010368	CCT	2	6	103046	103051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237461
2548	NC_010368	TTCG	2	8	103068	103075	0 %	50 %	25 %	25 %	169237461
2549	NC_010368	CGG	2	6	103097	103102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237461
2550	NC_010368	CAA	2	6	103201	103206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_010368	ACTA	2	8	103275	103282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_010368	GCAA	2	8	103317	103324	50 %	0 %	25 %	25 %	169237462
2553	NC_010368	TGA	2	6	103371	103376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237462
2554	NC_010368	CTG	2	6	103400	103405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237462
2555	NC_010368	GCT	2	6	103468	103473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237462
2556	NC_010368	GAC	2	6	103531	103536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237462
2557	NC_010368	ACC	2	6	103557	103562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_010368	GAG	2	6	103608	103613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237463
2559	NC_010368	TGA	2	6	103667	103672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237463
2560	NC_010368	GGA	2	6	103679	103684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237463
2561	NC_010368	TGC	2	6	103723	103728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237463
2562	NC_010368	CGA	2	6	103847	103852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237463
2563	NC_010368	ATC	2	6	103942	103947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_010368	GGA	2	6	103956	103961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_010368	GAA	2	6	103998	104003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_010368	GGACAA	2	12	104055	104066	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2567	NC_010368	GAA	2	6	104100	104105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010368	G	6	6	104166	104171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_010368	AGA	2	6	104246	104251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_010368	ATC	2	6	104364	104369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_010368	CCG	2	6	104370	104375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_010368	AATCA	2	10	104387	104396	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2573	NC_010368	ACG	2	6	104440	104445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2574	NC_010368	TAC	2	6	104505	104510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2575	NC_010368	TGGA	2	8	104548	104555	25 %	25 %	50 %	0 %	169237464
2576	NC_010368	GACGC	2	10	104559	104568	20 %	0 %	40 %	40 %	169237464
2577	NC_010368	ACT	2	6	104572	104577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2578	NC_010368	CGAG	2	8	104581	104588	25 %	0 %	50 %	25 %	169237464
2579	NC_010368	CCG	2	6	104685	104690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237464
2580	NC_010368	CGA	2	6	104750	104755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2581	NC_010368	CGC	3	9	104798	104806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237464
2582	NC_010368	GAACGG	2	12	104807	104818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	169237464
2583	NC_010368	ACG	2	6	104827	104832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2584	NC_010368	GAA	2	6	104837	104842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237464
2585	NC_010368	ACG	3	9	104863	104871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2586	NC_010368	CAC	2	6	104901	104906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237464
2587	NC_010368	AGTC	2	8	104926	104933	25 %	25 %	25 %	25 %	169237464
2588	NC_010368	CGC	2	6	104975	104980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237464
2589	NC_010368	ACT	2	6	104989	104994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2590	NC_010368	AG	3	6	105053	105058	50 %	0 %	50 %	0 %	169237464
2591	NC_010368	GCCGG	2	10	105083	105092	0 %	0 %	60 %	40 %	169237464
2592	NC_010368	ACT	2	6	105094	105099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2593	NC_010368	CGCT	2	8	105121	105128	0 %	25 %	25 %	50 %	169237464
2594	NC_010368	GTC	2	6	105129	105134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2595	NC_010368	CGC	2	6	105145	105150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237464
2596	NC_010368	GTC	2	6	105341	105346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2597	NC_010368	TAC	2	6	105348	105353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2598	NC_010368	CGA	2	6	105374	105379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2599	NC_010368	CTA	2	6	105386	105391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237464
2600	NC_010368	GAC	2	6	105456	105461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237464
2601	NC_010368	GGA	2	6	105491	105496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237464
2602	NC_010368	AGA	2	6	105506	105511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237464
2603	NC_010368	CCG	2	6	105527	105532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237464
2604	NC_010368	CTT	2	6	105575	105580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237464
2605	NC_010368	GAA	2	6	105596	105601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237464
2606	NC_010368	TCC	2	6	105670	105675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237464
2607	NC_010368	CG	3	6	105757	105762	0 %	0 %	50 %	50 %	169237464
2608	NC_010368	CCGA	2	8	105774	105781	25 %	0 %	25 %	50 %	169237464
2609	NC_010368	AT	3	6	105811	105816	50 %	50 %	0 %	0 %	169237464
2610	NC_010368	TCA	2	6	105879	105884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237465
2611	NC_010368	TCG	2	6	105948	105953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237465
2612	NC_010368	CTC	2	6	105995	106000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237465
2613	NC_010368	AGT	2	6	106001	106006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237465
2614	NC_010368	CGA	2	6	106074	106079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237465
2615	NC_010368	TCA	2	6	106128	106133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_010368	AGT	2	6	106153	106158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_010368	CTT	2	6	106174	106179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_010368	CGTT	2	8	106218	106225	0 %	50 %	25 %	25 %	169237466
2619	NC_010368	GTA	2	6	106257	106262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237466
2620	NC_010368	GA	3	6	106462	106467	50 %	0 %	50 %	0 %	169237466
2621	NC_010368	GAA	2	6	106490	106495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237466
2622	NC_010368	TCT	2	6	106839	106844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_010368	ACT	2	6	106919	106924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2744	NC_010368	GCA	2	6	111637	111642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237469
2745	NC_010368	GTT	2	6	111713	111718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237469
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2987	NC_010368	TCG	2	6	121494	121499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
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2989	NC_010368	TCG	2	6	121550	121555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
2990	NC_010368	GTT	2	6	121558	121563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237478
2991	NC_010368	GCT	2	6	121585	121590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
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