MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010368	GAG	2	6	63422	63427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237414
1502	NC_010368	CGCC	2	8	63450	63457	0 %	0 %	25 %	75 %	169237414
1503	NC_010368	GAT	2	6	63464	63469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237414
1504	NC_010368	GT	3	6	63496	63501	0 %	50 %	50 %	0 %	169237415
1505	NC_010368	CCG	2	6	63509	63514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237415
1506	NC_010368	GTG	2	6	63523	63528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237415
1507	NC_010368	TCG	3	9	63532	63540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1508	NC_010368	CGG	2	6	63542	63547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237415
1509	NC_010368	GTA	2	6	63570	63575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1510	NC_010368	ACG	2	6	63655	63660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1511	NC_010368	ACA	2	6	63662	63667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237415
1512	NC_010368	GGC	2	6	63694	63699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237415
1513	NC_010368	TGA	2	6	63758	63763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1514	NC_010368	GAT	2	6	63777	63782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1515	NC_010368	CAG	2	6	63789	63794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1516	NC_010368	GAA	2	6	63795	63800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237415
1517	NC_010368	CGAC	2	8	63839	63846	25 %	0 %	25 %	50 %	169237415
1518	NC_010368	CAC	2	6	63855	63860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237415
1519	NC_010368	GAT	2	6	63870	63875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1520	NC_010368	CGA	2	6	63878	63883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1521	NC_010368	GGT	2	6	63899	63904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237415
1522	NC_010368	ACG	2	6	63917	63922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1523	NC_010368	GCC	2	6	64032	64037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237415
1524	NC_010368	GAT	2	6	64044	64049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1525	NC_010368	ACG	2	6	64070	64075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1526	NC_010368	GCCG	2	8	64101	64108	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
1527	NC_010368	CGACGG	2	12	64136	64147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	169237415
1528	NC_010368	GAC	2	6	64149	64154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1529	NC_010368	TCC	2	6	64231	64236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237415
1530	NC_010368	GGT	2	6	64242	64247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237415
1531	NC_010368	CGC	2	6	64302	64307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237415
1532	NC_010368	GCC	2	6	64311	64316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237415
1533	NC_010368	ACC	2	6	64387	64392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237415
1534	NC_010368	TGA	2	6	64406	64411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1535	NC_010368	CCA	2	6	64466	64471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237415
1536	NC_010368	CGG	2	6	64505	64510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237415
1537	NC_010368	AGC	2	6	64525	64530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1538	NC_010368	CCA	2	6	64565	64570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237415
1539	NC_010368	GCA	2	6	64583	64588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1540	NC_010368	GC	3	6	64625	64630	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
1541	NC_010368	ATG	2	6	64666	64671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237415
1542	NC_010368	GAG	2	6	64675	64680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237415
1543	NC_010368	GCC	3	9	64713	64721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237415
1544	NC_010368	GAC	2	6	64776	64781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1545	NC_010368	CGGC	2	8	64808	64815	0 %	0 %	50 %	50 %	169237415
1546	NC_010368	ATC	2	6	64864	64869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237415
1547	NC_010368	ATC	2	6	64882	64887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237415
1548	NC_010368	GCT	3	9	64932	64940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237415
1549	NC_010368	TAC	2	6	64948	64953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010368	GTGTA	2	10	64961	64970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010368	AC	3	6	65000	65005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_010368	ACG	2	6	65083	65088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_010368	TCC	2	6	65094	65099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_010368	CCGAC	2	10	65160	65169	20 %	0 %	20 %	60 %	169237416
1555	NC_010368	CGCC	2	8	65256	65263	0 %	0 %	25 %	75 %	169237416
1556	NC_010368	CCG	2	6	65316	65321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237416
1557	NC_010368	CTC	2	6	65356	65361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237416
1558	NC_010368	TCG	2	6	65378	65383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237416
1559	NC_010368	GCG	2	6	65702	65707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237416
1560	NC_010368	GGC	2	6	65721	65726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237416
1561	NC_010368	TGA	2	6	65775	65780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237416
1562	NC_010368	CGT	4	12	65865	65876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237416
1563	NC_010368	CGT	2	6	65883	65888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237416
1564	NC_010368	TTC	2	6	65896	65901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237416
1565	NC_010368	TCACCG	2	12	65978	65989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169237416
1566	NC_010368	CTT	2	6	66006	66011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237416
1567	NC_010368	CACC	2	8	66067	66074	25 %	0 %	0 %	75 %	169237416
1568	NC_010368	CGG	2	6	66114	66119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237416
1569	NC_010368	TTGG	2	8	66121	66128	0 %	50 %	50 %	0 %	169237416
1570	NC_010368	GTC	3	9	66145	66153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237416
1571	NC_010368	CGT	2	6	66165	66170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237416
1572	NC_010368	CAC	2	6	66241	66246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237416
1573	NC_010368	TGG	2	6	66252	66257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237416
1574	NC_010368	GGTA	2	8	66306	66313	25 %	25 %	50 %	0 %	169237416
1575	NC_010368	CA	3	6	66324	66329	50 %	0 %	0 %	50 %	169237416
1576	NC_010368	TCGTGG	2	12	66381	66392	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	169237416
1577	NC_010368	GTG	2	6	66453	66458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010368	TGA	2	6	66556	66561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010368	TGG	3	9	66574	66582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010368	TG	3	6	66761	66766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_010368	CGCC	2	8	66899	66906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1582	NC_010368	CGG	2	6	66913	66918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010368	TC	3	6	66922	66927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_010368	AT	3	6	66970	66975	50 %	50 %	0 %	0 %	169237417
1585	NC_010368	CGG	3	9	67003	67011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237417
1586	NC_010368	AGC	2	6	67027	67032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1587	NC_010368	TCG	2	6	67043	67048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1588	NC_010368	GTG	2	6	67061	67066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237417
1589	NC_010368	AGC	2	6	67083	67088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1590	NC_010368	GCGAC	2	10	67134	67143	20 %	0 %	40 %	40 %	169237417
1591	NC_010368	CGA	2	6	67174	67179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1592	NC_010368	CGC	2	6	67192	67197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237417
1593	NC_010368	CGA	2	6	67204	67209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1594	NC_010368	CG	3	6	67277	67282	0 %	0 %	50 %	50 %	169237417
1595	NC_010368	GAG	2	6	67298	67303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237417
1596	NC_010368	GAG	2	6	67307	67312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237417
1597	NC_010368	GTC	2	6	67313	67318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237417
1598	NC_010368	CCT	2	6	67327	67332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237417
1599	NC_010368	CGG	2	6	67359	67364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237417
1600	NC_010368	CAT	2	6	67420	67425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237417
1601	NC_010368	GCCG	2	8	67457	67464	0 %	0 %	50 %	50 %	169237417
1602	NC_010368	CCT	2	6	67498	67503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237417
1603	NC_010368	CCG	2	6	67512	67517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237417
1604	NC_010368	CTGG	2	8	67529	67536	0 %	25 %	50 %	25 %	169237417
1605	NC_010368	CGT	2	6	67631	67636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010368	GGC	2	6	67638	67643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010368	GAC	2	6	67652	67657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_010368	AGT	2	6	67686	67691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237418
1609	NC_010368	CCA	2	6	67735	67740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237418
1610	NC_010368	ACAG	2	8	67783	67790	50 %	0 %	25 %	25 %	169237418
1611	NC_010368	AAC	2	6	67821	67826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237418
1612	NC_010368	GACA	2	8	67834	67841	50 %	0 %	25 %	25 %	169237418
1613	NC_010368	GTC	2	6	67847	67852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237418
1614	NC_010368	TGC	2	6	67889	67894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237418
1615	NC_010368	AT	3	6	68024	68029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010368	AC	3	6	68050	68055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_010368	CGG	2	6	68063	68068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237419
1618	NC_010368	GGA	2	6	68086	68091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237419
1619	NC_010368	AGA	2	6	68366	68371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237419
1620	NC_010368	GAG	2	6	68407	68412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237419
1621	NC_010368	GCT	2	6	68427	68432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237419
1622	NC_010368	GCT	2	6	68439	68444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237419
1623	NC_010368	ACG	2	6	68474	68479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237419
1624	NC_010368	ACGC	2	8	68498	68505	25 %	0 %	25 %	50 %	169237419
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1626	NC_010368	TCG	2	6	68549	68554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237419
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