MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010368	TCG	2	6	43578	43583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237391
1002	NC_010368	CT	3	6	43595	43600	0 %	50 %	0 %	50 %	169237391
1003	NC_010368	AGT	3	9	43639	43647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237391
1004	NC_010368	TGATCG	2	12	43669	43680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237391
1005	NC_010368	CGT	2	6	43696	43701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237391
1006	NC_010368	TCC	2	6	43746	43751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237391
1007	NC_010368	GGT	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237391
1008	NC_010368	GGA	2	6	43889	43894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237391
1009	NC_010368	CT	4	8	43901	43908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_010368	CT	3	6	43926	43931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_010368	TTG	2	6	43942	43947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010368	CTT	2	6	44002	44007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010368	CAC	2	6	44066	44071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237392
1014	NC_010368	ACC	2	6	44084	44089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237392
1015	NC_010368	TCC	2	6	44108	44113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237392
1016	NC_010368	CCA	2	6	44150	44155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237392
1017	NC_010368	CGAC	2	8	44211	44218	25 %	0 %	25 %	50 %	169237392
1018	NC_010368	TCG	2	6	44223	44228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237392
1019	NC_010368	GAC	3	9	44248	44256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237392
1020	NC_010368	AC	3	6	44261	44266	50 %	0 %	0 %	50 %	169237392
1021	NC_010368	GAC	2	6	44303	44308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237392
1022	NC_010368	GCG	2	6	44351	44356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237392
1023	NC_010368	ATC	2	6	44397	44402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237392
1024	NC_010368	GCCA	2	8	44425	44432	25 %	0 %	25 %	50 %	169237392
1025	NC_010368	CGGA	2	8	44558	44565	25 %	0 %	50 %	25 %	169237392
1026	NC_010368	GTC	2	6	44570	44575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237392
1027	NC_010368	ATG	2	6	44652	44657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237392
1028	NC_010368	TTC	2	6	44801	44806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237392
1029	NC_010368	GGA	2	6	44876	44881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237393
1030	NC_010368	GTC	2	6	44907	44912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237393
1031	NC_010368	GTA	2	6	44939	44944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237393
1032	NC_010368	TCG	2	6	44994	44999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237393
1033	NC_010368	CGT	2	6	45107	45112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237394
1034	NC_010368	CT	3	6	45151	45156	0 %	50 %	0 %	50 %	169237394
1035	NC_010368	G	6	6	45192	45197	0 %	0 %	100 %	0 %	169237394
1036	NC_010368	TCG	2	6	45268	45273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237394
1037	NC_010368	CAG	2	6	45282	45287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237394
1038	NC_010368	TCT	2	6	45311	45316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237394
1039	NC_010368	CCG	2	6	45334	45339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237394
1040	NC_010368	GTAG	2	8	45380	45387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010368	CTT	2	6	45422	45427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010368	AAC	2	6	45455	45460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010368	GAG	2	6	45500	45505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237395
1044	NC_010368	CGA	3	9	45535	45543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237395
1045	NC_010368	TCA	2	6	45570	45575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237395
1046	NC_010368	AGA	2	6	45589	45594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237395
1047	NC_010368	CGAC	2	8	45645	45652	25 %	0 %	25 %	50 %	169237396
1048	NC_010368	CGTT	2	8	45729	45736	0 %	50 %	25 %	25 %	169237396
1049	NC_010368	CTT	2	6	45763	45768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237396
1050	NC_010368	T	6	6	45782	45787	0 %	100 %	0 %	0 %	169237396
1051	NC_010368	CAGC	2	8	45850	45857	25 %	0 %	25 %	50 %	169237396
1052	NC_010368	CGA	2	6	45871	45876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237396
1053	NC_010368	ACG	2	6	45879	45884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237396
1054	NC_010368	TCG	2	6	45954	45959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010368	GGT	2	6	46021	46026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237397
1056	NC_010368	TCG	3	9	46029	46037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1057	NC_010368	AGC	2	6	46042	46047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1058	NC_010368	TCG	2	6	46056	46061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1059	NC_010368	TGC	2	6	46164	46169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1060	NC_010368	GTC	2	6	46196	46201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1061	NC_010368	TCC	2	6	46263	46268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237397
1062	NC_010368	ACCAGC	2	12	46316	46327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169237397
1063	NC_010368	CGG	2	6	46332	46337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237397
1064	NC_010368	GTC	2	6	46346	46351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1065	NC_010368	GCG	2	6	46361	46366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237397
1066	NC_010368	GTC	2	6	46397	46402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1067	NC_010368	TGG	2	6	46409	46414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237397
1068	NC_010368	CGA	2	6	46422	46427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1069	NC_010368	TTG	2	6	46452	46457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237397
1070	NC_010368	ACG	2	6	46470	46475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1071	NC_010368	CGA	2	6	46504	46509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1072	NC_010368	TCG	2	6	46530	46535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237397
1073	NC_010368	GATCGG	2	12	46537	46548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169237397
1074	NC_010368	CGG	2	6	46648	46653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237397
1075	NC_010368	CTGAG	2	10	46785	46794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_010368	CGT	2	6	46817	46822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010368	CTG	2	6	46911	46916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010368	CGA	2	6	46965	46970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010368	GAC	2	6	46981	46986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010368	AAC	2	6	47164	47169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_010368	AGAC	2	8	47207	47214	50 %	0 %	25 %	25 %	169237398
1082	NC_010368	GCTTT	2	10	47259	47268	0 %	60 %	20 %	20 %	169237398
1083	NC_010368	AGG	2	6	47308	47313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237398
1084	NC_010368	AAC	2	6	47460	47465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237399
1085	NC_010368	GAA	2	6	47468	47473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237399
1086	NC_010368	CGA	2	6	47500	47505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237399
1087	NC_010368	TCG	2	6	47638	47643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1088	NC_010368	CGA	2	6	47756	47761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1089	NC_010368	TCG	2	6	47764	47769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1090	NC_010368	TCG	2	6	47836	47841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1091	NC_010368	TCG	2	6	47845	47850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1092	NC_010368	TCG	2	6	47893	47898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1093	NC_010368	TCG	2	6	47915	47920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1094	NC_010368	TTC	2	6	47946	47951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237400
1095	NC_010368	CAG	2	6	47970	47975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1096	NC_010368	TCG	2	6	48049	48054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1097	NC_010368	ACC	2	6	48061	48066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237400
1098	NC_010368	TTG	2	6	48133	48138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237400
1099	NC_010368	AGTTCG	2	12	48167	48178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237400
1100	NC_010368	AGC	2	6	48202	48207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1101	NC_010368	GGC	2	6	48223	48228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237400
1102	NC_010368	CAT	2	6	48329	48334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237400
1103	NC_010368	ACC	2	6	48339	48344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237400
1104	NC_010368	CGA	2	6	48374	48379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1105	NC_010368	TCGAG	2	10	48449	48458	20 %	20 %	40 %	20 %	169237400
1106	NC_010368	CGG	2	6	48464	48469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237400
1107	NC_010368	TCT	2	6	48475	48480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237400
1108	NC_010368	TCG	2	6	48481	48486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1109	NC_010368	CT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	0 %	50 %	169237400
1110	NC_010368	CGA	2	6	48560	48565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1111	NC_010368	CG	3	6	48623	48628	0 %	0 %	50 %	50 %	169237400
1112	NC_010368	ACCG	2	8	48695	48702	25 %	0 %	25 %	50 %	169237400
1113	NC_010368	CGG	2	6	48706	48711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237400
1114	NC_010368	CGA	2	6	48806	48811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1115	NC_010368	CCT	2	6	48905	48910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237400
1116	NC_010368	GCT	2	6	48926	48931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1117	NC_010368	GTA	2	6	48945	48950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237400
1118	NC_010368	GGA	2	6	49042	49047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237400
1119	NC_010368	GGA	2	6	49052	49057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237400
1120	NC_010368	CGG	2	6	49068	49073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237400
1121	NC_010368	ATC	2	6	49123	49128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237400
1122	NC_010368	TCG	3	9	49147	49155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1123	NC_010368	GCC	2	6	49158	49163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237400
1124	NC_010368	CCT	2	6	49226	49231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237400
1125	NC_010368	CGATCT	2	12	49247	49258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169237400
1126	NC_010368	ACG	2	6	49273	49278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1127	NC_010368	ACC	2	6	49303	49308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237400
1128	NC_010368	GACC	2	8	49330	49337	25 %	0 %	25 %	50 %	169237400
1129	NC_010368	CGA	2	6	49397	49402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1130	NC_010368	CCG	2	6	49475	49480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237400
1131	NC_010368	GTC	2	6	49512	49517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1132	NC_010368	GAT	2	6	49560	49565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237400
1133	NC_010368	CCG	2	6	49618	49623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237400
1134	NC_010368	CGA	2	6	49640	49645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1135	NC_010368	CTG	2	6	49654	49659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237400
1136	NC_010368	GTT	2	6	49727	49732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237400
1137	NC_010368	GAA	2	6	49772	49777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_010368	GTG	2	6	49845	49850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237401
1139	NC_010368	TCG	2	6	49911	49916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237401
1140	NC_010368	GAAGCG	2	12	49934	49945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	169237401
1141	NC_010368	GGT	2	6	49948	49953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237401
1142	NC_010368	CGG	2	6	49990	49995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237401
1143	NC_010368	TCG	2	6	50076	50081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237401
1144	NC_010368	TCC	2	6	50082	50087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237401
1145	NC_010368	A	6	6	50230	50235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_010368	ATGT	2	8	50256	50263	25 %	50 %	25 %	0 %	169237402
1147	NC_010368	ATT	2	6	50264	50269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237402
1148	NC_010368	GTGGC	2	10	50278	50287	0 %	20 %	60 %	20 %	169237402
1149	NC_010368	TGT	2	6	50303	50308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237402
1150	NC_010368	AGC	2	6	50335	50340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237402
1151	NC_010368	AT	3	6	50346	50351	50 %	50 %	0 %	0 %	169237402
1152	NC_010368	AAC	2	6	50357	50362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237402
1153	NC_010368	TTC	2	6	50397	50402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237402
1154	NC_010368	CGA	2	6	50405	50410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237402
1155	NC_010368	AGT	2	6	50418	50423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237402
1156	NC_010368	CCA	2	6	50478	50483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237402
1157	NC_010368	AGG	2	6	50517	50522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237402
1158	NC_010368	CAC	2	6	50566	50571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237402
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1160	NC_010368	CTCG	2	8	50701	50708	0 %	25 %	25 %	50 %	169237402
1161	NC_010368	CTG	2	6	50719	50724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237402
1162	NC_010368	CTCCG	2	10	50760	50769	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1163	NC_010368	GAC	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1164	NC_010368	CT	3	6	50811	50816	0 %	50 %	0 %	50 %	169237403
1165	NC_010368	CGC	2	6	50828	50833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237403
1166	NC_010368	GCTG	2	8	50854	50861	0 %	25 %	50 %	25 %	169237403
1167	NC_010368	GCCA	2	8	50895	50902	25 %	0 %	25 %	50 %	169237403
1168	NC_010368	CTG	2	6	50912	50917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237403
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1176	NC_010368	CA	3	6	51164	51169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1177	NC_010368	ACG	2	6	51227	51232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237404
1178	NC_010368	ACG	2	6	51248	51253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237404
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1182	NC_010368	GAG	2	6	51406	51411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237404
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1192	NC_010368	CCA	2	6	51685	51690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1193	NC_010368	CGG	2	6	51702	51707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237405
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1214	NC_010368	GTG	2	6	52667	52672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1215	NC_010368	TCCAG	2	10	52881	52890	20 %	20 %	20 %	40 %	169237406
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1221	NC_010368	ACGA	2	8	53077	53084	50 %	0 %	25 %	25 %	169237406
1222	NC_010368	TGACG	2	10	53103	53112	20 %	20 %	40 %	20 %	169237406
1223	NC_010368	ACG	2	6	53153	53158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237406
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1228	NC_010368	ATC	2	6	53335	53340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237406
1229	NC_010368	GAA	2	6	53397	53402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237406
1230	NC_010368	TCCA	2	8	53440	53447	25 %	25 %	0 %	50 %	169237406
1231	NC_010368	TCA	2	6	53546	53551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237406
1232	NC_010368	ACA	2	6	53582	53587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237406
1233	NC_010368	CGA	2	6	53643	53648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237406
1234	NC_010368	GTT	2	6	53690	53695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237407
1235	NC_010368	AGCG	2	8	53745	53752	25 %	0 %	50 %	25 %	169237407
1236	NC_010368	GAG	2	6	53769	53774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237407
1237	NC_010368	ACG	3	9	53794	53802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237407
1238	NC_010368	CGT	2	6	53823	53828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1239	NC_010368	GAGC	2	8	53830	53837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1240	NC_010368	GTC	2	6	53843	53848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1241	NC_010368	CCG	2	6	53890	53895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1242	NC_010368	CGA	2	6	53928	53933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1243	NC_010368	GA	3	6	53935	53940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_010368	GT	3	6	53941	53946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_010368	CA	3	6	53950	53955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1246	NC_010368	CGA	2	6	53963	53968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_010368	TATT	2	8	54019	54026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_010368	AGA	2	6	54056	54061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_010368	TGAC	2	8	54099	54106	25 %	25 %	25 %	25 %	169237408
1250	NC_010368	ACG	2	6	54108	54113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237408
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1371	NC_010368	TAC	2	6	58446	58451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237410
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1373	NC_010368	CGA	2	6	58478	58483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237410
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1380	NC_010368	GC	3	6	58622	58627	0 %	0 %	50 %	50 %	169237410
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1499	NC_010368	GAT	2	6	63392	63397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237414
1500	NC_010368	CGT	2	6	63403	63408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237414

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