MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010368	GAT	2	6	278918	278923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237596
6502	NC_010368	GTCG	2	8	278975	278982	0 %	25 %	50 %	25 %	169237596
6503	NC_010368	TTC	2	6	279027	279032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237596
6504	NC_010368	GC	4	8	279041	279048	0 %	0 %	50 %	50 %	169237596
6505	NC_010368	GAG	2	6	279066	279071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237596
6506	NC_010368	GAT	2	6	279095	279100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237596
6507	NC_010368	AGG	2	6	279118	279123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237596
6508	NC_010368	CGA	2	6	279137	279142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237596
6509	NC_010368	GAC	2	6	279192	279197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237596
6510	NC_010368	GAG	2	6	279201	279206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237596
6511	NC_010368	GAC	2	6	279238	279243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237597
6512	NC_010368	TCG	2	6	279270	279275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237597
6513	NC_010368	ACGC	2	8	279315	279322	25 %	0 %	25 %	50 %	169237597
6514	NC_010368	GAG	2	6	279500	279505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237597
6515	NC_010368	ACGA	2	8	279518	279525	50 %	0 %	25 %	25 %	169237597
6516	NC_010368	CGT	2	6	279526	279531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237597
6517	NC_010368	AGCG	2	8	279533	279540	25 %	0 %	50 %	25 %	169237597
6518	NC_010368	GGTG	2	8	279572	279579	0 %	25 %	75 %	0 %	169237597
6519	NC_010368	GAC	2	6	279664	279669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_010368	CTG	2	6	279756	279761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_010368	CTTT	2	8	279825	279832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_010368	GGT	2	6	279843	279848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010368	GAG	2	6	279871	279876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_010368	GGA	2	6	279891	279896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_010368	CTG	2	6	279999	280004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237598
6526	NC_010368	CTC	2	6	280090	280095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237598
6527	NC_010368	CGA	2	6	280113	280118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237598
6528	NC_010368	GCGTCT	2	12	280121	280132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237598
6529	NC_010368	GTCA	2	8	280171	280178	25 %	25 %	25 %	25 %	169237598
6530	NC_010368	AAGG	2	8	280222	280229	50 %	0 %	50 %	0 %	169237598
6531	NC_010368	CTA	2	6	280239	280244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237598
6532	NC_010368	ACCG	2	8	280248	280255	25 %	0 %	25 %	50 %	169237598
6533	NC_010368	GAC	2	6	280257	280262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237598
6534	NC_010368	CGA	2	6	280284	280289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237598
6535	NC_010368	GAG	2	6	280346	280351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237599
6536	NC_010368	CGA	2	6	280389	280394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6537	NC_010368	CTG	2	6	280405	280410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6538	NC_010368	GGT	2	6	280442	280447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237599
6539	NC_010368	CGA	2	6	280456	280461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6540	NC_010368	ACG	2	6	280494	280499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6541	NC_010368	CGA	2	6	280501	280506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6542	NC_010368	GTCG	2	8	280513	280520	0 %	25 %	50 %	25 %	169237599
6543	NC_010368	CGC	2	6	280633	280638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237599
6544	NC_010368	CGGAC	2	10	280648	280657	20 %	0 %	40 %	40 %	169237599
6545	NC_010368	GAT	2	6	280690	280695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237599
6546	NC_010368	GA	3	6	280707	280712	50 %	0 %	50 %	0 %	169237599
6547	NC_010368	GAA	2	6	280720	280725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237599
6548	NC_010368	CGA	2	6	280780	280785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6549	NC_010368	CGT	2	6	280795	280800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6550	NC_010368	AAC	2	6	280836	280841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237599
6551	NC_010368	CGA	2	6	280849	280854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6552	NC_010368	TGC	2	6	280866	280871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6553	NC_010368	CGA	2	6	280984	280989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6554	NC_010368	TGA	2	6	281005	281010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237599
6555	NC_010368	TCA	2	6	281061	281066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237599
6556	NC_010368	CGA	2	6	281140	281145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237599
6557	NC_010368	CCGC	2	8	281177	281184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6558	NC_010368	TGT	2	6	281191	281196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_010368	ACG	2	6	281220	281225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_010368	AT	4	8	281271	281278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_010368	CTC	2	6	281463	281468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237600
6562	NC_010368	TCG	2	6	281485	281490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6563	NC_010368	TCG	2	6	281557	281562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6564	NC_010368	TCG	2	6	281644	281649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6565	NC_010368	GA	3	6	281663	281668	50 %	0 %	50 %	0 %	169237600
6566	NC_010368	TCG	2	6	281695	281700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6567	NC_010368	GCT	2	6	281703	281708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6568	NC_010368	CG	3	6	281740	281745	0 %	0 %	50 %	50 %	169237600
6569	NC_010368	CTT	2	6	281772	281777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237600
6570	NC_010368	TC	3	6	281834	281839	0 %	50 %	0 %	50 %	169237600
6571	NC_010368	CGAT	2	8	281905	281912	25 %	25 %	25 %	25 %	169237600
6572	NC_010368	CGT	2	6	282011	282016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6573	NC_010368	CGC	2	6	282018	282023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237600
6574	NC_010368	CGT	2	6	282074	282079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6575	NC_010368	GGA	2	6	282104	282109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237600
6576	NC_010368	TCGT	2	8	282205	282212	0 %	50 %	25 %	25 %	169237600
6577	NC_010368	TCG	2	6	282232	282237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6578	NC_010368	TCT	2	6	282247	282252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237600
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6580	NC_010368	CTT	2	6	282267	282272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237600
6581	NC_010368	ACCG	2	8	282315	282322	25 %	0 %	25 %	50 %	169237600
6582	NC_010368	TTG	2	6	282334	282339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237600
6583	NC_010368	CCG	2	6	282380	282385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237600
6584	NC_010368	TCC	2	6	282394	282399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237600
6585	NC_010368	CGC	3	9	282420	282428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237600
6586	NC_010368	GA	5	10	282441	282450	50 %	0 %	50 %	0 %	169237600
6587	NC_010368	CTG	2	6	282552	282557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6588	NC_010368	GAGC	2	8	282558	282565	25 %	0 %	50 %	25 %	169237600
6589	NC_010368	TGAG	2	8	282584	282591	25 %	25 %	50 %	0 %	169237600
6590	NC_010368	TTG	2	6	282598	282603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237600
6591	NC_010368	CA	3	6	282678	282683	50 %	0 %	0 %	50 %	169237600
6592	NC_010368	TCG	2	6	282724	282729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6593	NC_010368	CTC	2	6	282738	282743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237600
6594	NC_010368	GGC	2	6	282744	282749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237600
6595	NC_010368	GCC	2	6	282775	282780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237600
6596	NC_010368	CGA	2	6	282833	282838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6597	NC_010368	TCG	3	9	282928	282936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237600
6598	NC_010368	ACC	2	6	282976	282981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_010368	TAC	2	6	283018	283023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_010368	CCG	2	6	283052	283057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_010368	TGAC	2	8	283138	283145	25 %	25 %	25 %	25 %	169237601
6602	NC_010368	GGC	2	6	283190	283195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237601
6603	NC_010368	CGT	2	6	283202	283207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237601
6604	NC_010368	CGTC	2	8	283246	283253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_010368	ACG	2	6	283270	283275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_010368	CAT	2	6	283352	283357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_010368	AGA	2	6	283366	283371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_010368	ACG	2	6	283444	283449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_010368	CGA	2	6	283505	283510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_010368	TGGG	2	8	283550	283557	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010368	GAC	2	6	283559	283564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_010368	CGT	2	6	283584	283589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_010368	GAACG	2	10	283649	283658	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6614	NC_010368	CTG	2	6	283720	283725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_010368	TCG	2	6	283876	283881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_010368	CCA	2	6	283967	283972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_010368	CCG	2	6	283982	283987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_010368	TCG	2	6	284073	284078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_010368	CTG	2	6	284123	284128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_010368	GAA	2	6	284171	284176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_010368	AGG	2	6	284216	284221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.