MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010368	GGA	2	6	234684	234689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237556
5502	NC_010368	CAT	2	6	234702	234707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237556
5503	NC_010368	CTC	2	6	234715	234720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237556
5504	NC_010368	TCG	2	6	234735	234740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237556
5505	NC_010368	GAT	2	6	234888	234893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5506	NC_010368	CGA	2	6	234935	234940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5507	NC_010368	CTC	2	6	235038	235043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5508	NC_010368	GAG	2	6	235104	235109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5509	NC_010368	CG	3	6	235119	235124	0 %	0 %	50 %	50 %	169237557
5510	NC_010368	GTC	2	6	235131	235136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5511	NC_010368	CCG	2	6	235156	235161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237557
5512	NC_010368	CTCG	2	8	235266	235273	0 %	25 %	25 %	50 %	169237557
5513	NC_010368	TCG	2	6	235303	235308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5514	NC_010368	CGT	2	6	235364	235369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5515	NC_010368	CGT	2	6	235394	235399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5516	NC_010368	GT	3	6	235419	235424	0 %	50 %	50 %	0 %	169237557
5517	NC_010368	CCA	2	6	235425	235430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237557
5518	NC_010368	CTGG	2	8	235467	235474	0 %	25 %	50 %	25 %	169237557
5519	NC_010368	CTC	2	6	235485	235490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5520	NC_010368	CTG	2	6	235509	235514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5521	NC_010368	CGT	3	9	235580	235588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5522	NC_010368	GTTG	2	8	235605	235612	0 %	50 %	50 %	0 %	169237557
5523	NC_010368	CGA	2	6	235616	235621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5524	NC_010368	TCG	2	6	235659	235664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5525	NC_010368	CTG	2	6	235677	235682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5526	NC_010368	CTC	2	6	235695	235700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5527	NC_010368	ACGA	2	8	235702	235709	50 %	0 %	25 %	25 %	169237557
5528	NC_010368	GAG	2	6	235713	235718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5529	NC_010368	TCCG	2	8	235830	235837	0 %	25 %	25 %	50 %	169237557
5530	NC_010368	GTCGA	2	10	235849	235858	20 %	20 %	40 %	20 %	169237557
5531	NC_010368	TCC	2	6	235863	235868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5532	NC_010368	CCT	2	6	235897	235902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5533	NC_010368	CGT	3	9	235917	235925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5534	NC_010368	CTT	3	9	236058	236066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237557
5535	NC_010368	TCG	2	6	236084	236089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5536	NC_010368	GC	3	6	236137	236142	0 %	0 %	50 %	50 %	169237557
5537	NC_010368	ACC	2	6	236160	236165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237557
5538	NC_010368	GT	3	6	236166	236171	0 %	50 %	50 %	0 %	169237557
5539	NC_010368	TCT	2	6	236179	236184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237557
5540	NC_010368	CTG	2	6	236199	236204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5541	NC_010368	TCG	2	6	236260	236265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5542	NC_010368	GCA	2	6	236273	236278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5543	NC_010368	CTC	2	6	236319	236324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5544	NC_010368	CGC	2	6	236354	236359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237557
5545	NC_010368	CGA	2	6	236396	236401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5546	NC_010368	ACC	2	6	236489	236494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237557
5547	NC_010368	TCG	2	6	236518	236523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5548	NC_010368	GTCC	2	8	236525	236532	0 %	25 %	25 %	50 %	169237557
5549	NC_010368	GA	3	6	236731	236736	50 %	0 %	50 %	0 %	169237557
5550	NC_010368	ACGA	2	8	236739	236746	50 %	0 %	25 %	25 %	169237557
5551	NC_010368	GAT	2	6	236778	236783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5552	NC_010368	GAT	2	6	236826	236831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5553	NC_010368	CGGCC	2	10	236865	236874	0 %	0 %	40 %	60 %	169237557
5554	NC_010368	TCG	2	6	236875	236880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5555	NC_010368	GGAG	2	8	236912	236919	25 %	0 %	75 %	0 %	169237557
5556	NC_010368	ATG	2	6	237007	237012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5557	NC_010368	GGA	2	6	237026	237031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5558	NC_010368	GCA	2	6	237032	237037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5559	NC_010368	TCC	2	6	237064	237069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5560	NC_010368	GTC	2	6	237132	237137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5561	NC_010368	GGA	2	6	237215	237220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5562	NC_010368	AGA	2	6	237260	237265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237557
5563	NC_010368	CTT	2	6	237287	237292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237557
5564	NC_010368	GA	3	6	237304	237309	50 %	0 %	50 %	0 %	169237557
5565	NC_010368	GGA	2	6	237338	237343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5566	NC_010368	TGA	2	6	237356	237361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5567	NC_010368	GTC	2	6	237378	237383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5568	NC_010368	GCG	2	6	237386	237391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237557
5569	NC_010368	CCA	2	6	237641	237646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237557
5570	NC_010368	GTCGCC	2	12	237654	237665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169237557
5571	NC_010368	TCG	2	6	237670	237675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5572	NC_010368	GTCC	2	8	237717	237724	0 %	25 %	25 %	50 %	169237557
5573	NC_010368	TCG	2	6	237742	237747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5574	NC_010368	AGT	2	6	237751	237756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5575	NC_010368	GGT	2	6	237770	237775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237557
5576	NC_010368	GTC	2	6	237855	237860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5577	NC_010368	GGGT	2	8	237896	237903	0 %	25 %	75 %	0 %	169237557
5578	NC_010368	CTG	2	6	237930	237935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5579	NC_010368	TCC	2	6	237940	237945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5580	NC_010368	GTC	2	6	238008	238013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5581	NC_010368	GTC	2	6	238024	238029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5582	NC_010368	GAA	2	6	238044	238049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237557
5583	NC_010368	CGA	2	6	238065	238070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5584	NC_010368	CCCT	2	8	238074	238081	0 %	25 %	0 %	75 %	169237557
5585	NC_010368	TCT	2	6	238145	238150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237557
5586	NC_010368	AGG	2	6	238165	238170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5587	NC_010368	CGA	2	6	238209	238214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5588	NC_010368	GCT	2	6	238256	238261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5589	NC_010368	CAT	2	6	238268	238273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237557
5590	NC_010368	CAG	2	6	238299	238304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237557
5591	NC_010368	GAG	2	6	238320	238325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237557
5592	NC_010368	GTA	2	6	238344	238349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5593	NC_010368	AGT	2	6	238361	238366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237557
5594	NC_010368	GAA	2	6	238410	238415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237557
5595	NC_010368	CTC	2	6	238437	238442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237557
5596	NC_010368	GGTA	2	8	238451	238458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010368	TCGA	2	8	238459	238466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_010368	CGGA	2	8	238507	238514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_010368	CTC	2	6	238515	238520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_010368	CGG	2	6	238538	238543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_010368	GTCA	2	8	238557	238564	25 %	25 %	25 %	25 %	169237558
5602	NC_010368	CGCT	2	8	238639	238646	0 %	25 %	25 %	50 %	169237558
5603	NC_010368	TCG	2	6	238659	238664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5604	NC_010368	CTGG	2	8	238699	238706	0 %	25 %	50 %	25 %	169237558
5605	NC_010368	AGCC	2	8	238716	238723	25 %	0 %	25 %	50 %	169237558
5606	NC_010368	GT	3	6	238751	238756	0 %	50 %	50 %	0 %	169237558
5607	NC_010368	CGA	2	6	238777	238782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5608	NC_010368	CGT	2	6	238790	238795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5609	NC_010368	CTG	2	6	238826	238831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5610	NC_010368	TG	3	6	238830	238835	0 %	50 %	50 %	0 %	169237558
5611	NC_010368	TC	3	6	238849	238854	0 %	50 %	0 %	50 %	169237558
5612	NC_010368	ACCG	2	8	238860	238867	25 %	0 %	25 %	50 %	169237558
5613	NC_010368	TCG	2	6	238891	238896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5614	NC_010368	CGT	3	9	238921	238929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5615	NC_010368	GTCG	2	8	239002	239009	0 %	25 %	50 %	25 %	169237558
5616	NC_010368	GTC	2	6	239042	239047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5617	NC_010368	CAA	2	6	239051	239056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237558
5618	NC_010368	TCG	2	6	239211	239216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237558
5619	NC_010368	TTC	2	6	239222	239227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237558
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5621	NC_010368	CGAG	2	8	239277	239284	25 %	0 %	50 %	25 %	169237558
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5747	NC_010368	CTG	2	6	244614	244619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237561
5748	NC_010368	ACG	2	6	244659	244664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237561
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5750	NC_010368	GACG	2	8	244690	244697	25 %	0 %	50 %	25 %	169237561
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5865	NC_010368	AGA	2	6	250196	250201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5866	NC_010368	AC	3	6	250257	250262	50 %	0 %	0 %	50 %	169237566
5867	NC_010368	TAG	2	6	250323	250328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237566
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5993	NC_010368	GCC	2	6	257537	257542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5994	NC_010368	CA	3	6	257553	257558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5995	NC_010368	CTGC	2	8	257571	257578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5996	NC_010368	GCCC	2	8	257672	257679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5997	NC_010368	GAT	2	6	257702	257707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_010368	TCA	2	6	257725	257730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5999	NC_010368	GAG	2	6	257786	257791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_010368	AC	3	6	257796	257801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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