MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010368	CGG	2	6	189280	189285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237532
4502	NC_010368	ATC	2	6	189317	189322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237532
4503	NC_010368	CGTC	2	8	189394	189401	0 %	25 %	25 %	50 %	169237532
4504	NC_010368	CGT	2	6	189412	189417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237532
4505	NC_010368	CGA	2	6	189418	189423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237532
4506	NC_010368	TCGT	2	8	189446	189453	0 %	50 %	25 %	25 %	169237532
4507	NC_010368	CCG	2	6	189483	189488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237532
4508	NC_010368	GGATCG	2	12	189513	189524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169237532
4509	NC_010368	CTT	2	6	189619	189624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237532
4510	NC_010368	CTC	2	6	189742	189747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_010368	CTGA	2	8	189859	189866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_010368	CGA	2	6	189876	189881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_010368	CGGT	2	8	189902	189909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_010368	GCA	2	6	189981	189986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_010368	ACG	2	6	190077	190082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_010368	CAGC	2	8	190112	190119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_010368	GTA	2	6	190132	190137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_010368	GT	3	6	190165	190170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010368	A	6	6	190226	190231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_010368	AGA	2	6	190251	190256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_010368	GAC	2	6	190284	190289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_010368	CTGA	2	8	190292	190299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_010368	TGC	2	6	190334	190339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_010368	CT	3	6	190381	190386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_010368	CT	3	6	190399	190404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_010368	GCT	2	6	190431	190436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_010368	CAG	2	6	190497	190502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_010368	GGC	2	6	190506	190511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_010368	ACC	3	9	190524	190532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_010368	GAC	2	6	190566	190571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_010368	GGT	2	6	190584	190589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_010368	GAC	2	6	190603	190608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_010368	GTCG	2	8	190631	190638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_010368	ACG	2	6	190646	190651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_010368	CAA	2	6	190674	190679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_010368	CCG	2	6	190687	190692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_010368	AG	3	6	190766	190771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_010368	CTAT	2	8	190784	190791	25 %	50 %	0 %	25 %	169237533
4539	NC_010368	TCG	2	6	190838	190843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237533
4540	NC_010368	TCT	2	6	190908	190913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237533
4541	NC_010368	GTGC	2	8	190940	190947	0 %	25 %	50 %	25 %	169237533
4542	NC_010368	GGA	2	6	190980	190985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237533
4543	NC_010368	GAG	2	6	191021	191026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237533
4544	NC_010368	TTCG	2	8	191037	191044	0 %	50 %	25 %	25 %	169237533
4545	NC_010368	CGTA	2	8	191052	191059	25 %	25 %	25 %	25 %	169237533
4546	NC_010368	TGGG	2	8	191159	191166	0 %	25 %	75 %	0 %	169237533
4547	NC_010368	GAT	2	6	191185	191190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237533
4548	NC_010368	ACA	2	6	191211	191216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237533
4549	NC_010368	TGC	2	6	191226	191231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237533
4550	NC_010368	ACG	2	6	191423	191428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_010368	TCG	2	6	191459	191464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_010368	CGA	2	6	191490	191495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_010368	CAG	2	6	191511	191516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_010368	C	6	6	191550	191555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4555	NC_010368	GA	3	6	191610	191615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010368	CAC	2	6	191623	191628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_010368	TTC	2	6	191636	191641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_010368	CGC	2	6	191658	191663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_010368	CGA	2	6	191665	191670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_010368	TTG	2	6	191930	191935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237534
4561	NC_010368	GCT	2	6	192015	192020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237534
4562	NC_010368	CAG	2	6	192073	192078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237534
4563	NC_010368	GAG	2	6	192196	192201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237534
4564	NC_010368	CGCCGA	2	12	192234	192245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	169237534
4565	NC_010368	GAC	2	6	192286	192291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237534
4566	NC_010368	ACCG	2	8	192390	192397	25 %	0 %	25 %	50 %	169237534
4567	NC_010368	GGA	2	6	192411	192416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237534
4568	NC_010368	TCG	2	6	192464	192469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237534
4569	NC_010368	GGC	2	6	192504	192509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237534
4570	NC_010368	CTC	2	6	192523	192528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237534
4571	NC_010368	CGG	2	6	192531	192536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237534
4572	NC_010368	GCC	2	6	192562	192567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237534
4573	NC_010368	AGG	2	6	192701	192706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237534
4574	NC_010368	AACG	2	8	192765	192772	50 %	0 %	25 %	25 %	169237534
4575	NC_010368	GTC	2	6	192855	192860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4576	NC_010368	CTG	2	6	192867	192872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4577	NC_010368	TCG	2	6	192910	192915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4578	NC_010368	GAG	2	6	192921	192926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237535
4579	NC_010368	GCC	2	6	192945	192950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237535
4580	NC_010368	TGC	2	6	192985	192990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4581	NC_010368	TCT	2	6	192991	192996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237535
4582	NC_010368	GTG	2	6	193018	193023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237535
4583	NC_010368	GCTA	2	8	193086	193093	25 %	25 %	25 %	25 %	169237535
4584	NC_010368	GGCT	2	8	193187	193194	0 %	25 %	50 %	25 %	169237535
4585	NC_010368	GTT	2	6	193211	193216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237535
4586	NC_010368	CGA	2	6	193243	193248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4587	NC_010368	GTC	2	6	193254	193259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4588	NC_010368	CGG	2	6	193307	193312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237535
4589	NC_010368	TCA	2	6	193345	193350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237535
4590	NC_010368	GCT	2	6	193373	193378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237535
4591	NC_010368	GCC	2	6	193419	193424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237535
4592	NC_010368	CTT	2	6	193462	193467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237535
4593	NC_010368	CCG	2	6	193524	193529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_010368	CGC	2	6	193561	193566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_010368	GGC	2	6	193568	193573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_010368	CTG	2	6	193574	193579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_010368	TCT	2	6	193727	193732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237536
4598	NC_010368	GT	3	6	193785	193790	0 %	50 %	50 %	0 %	169237536
4599	NC_010368	CCGC	2	8	193822	193829	0 %	0 %	25 %	75 %	169237536
4600	NC_010368	GGT	3	9	193830	193838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237536
4601	NC_010368	GTC	2	6	193864	193869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237536
4602	NC_010368	TCC	2	6	193905	193910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237536
4603	NC_010368	GGA	2	6	193978	193983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237536
4604	NC_010368	CGGG	2	8	193998	194005	0 %	0 %	75 %	25 %	169237536
4605	NC_010368	CGC	2	6	194020	194025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237536
4606	NC_010368	TC	3	6	194032	194037	0 %	50 %	0 %	50 %	169237536
4607	NC_010368	CCA	2	6	194040	194045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237536
4608	NC_010368	CAT	2	6	194077	194082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237536
4609	NC_010368	GCT	2	6	194131	194136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237536
4610	NC_010368	GGA	2	6	194266	194271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237536
4611	NC_010368	TCGC	2	8	194343	194350	0 %	25 %	25 %	50 %	169237536
4612	NC_010368	TCGT	2	8	194400	194407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_010368	GTG	2	6	194447	194452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_010368	CGC	2	6	194455	194460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_010368	TCGATA	2	12	194492	194503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169237537
4616	NC_010368	ACCG	2	8	194557	194564	25 %	0 %	25 %	50 %	169237537
4617	NC_010368	CGT	2	6	194601	194606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237537
4618	NC_010368	GAGTTC	2	12	194677	194688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237537
4619	NC_010368	CCT	2	6	194697	194702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237537
4620	NC_010368	GTT	2	6	194710	194715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237537
4621	NC_010368	TCG	4	12	194729	194740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237537
4622	NC_010368	AAT	2	6	194846	194851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237537
4623	NC_010368	CCTA	2	8	194886	194893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_010368	TCC	2	6	194998	195003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_010368	CTG	2	6	195050	195055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4861	NC_010368	GGAC	2	8	206783	206790	25 %	0 %	50 %	25 %	169237545
4862	NC_010368	CATCGT	2	12	206873	206884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169237545
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4872	NC_010368	TCA	2	6	207351	207356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237546
4873	NC_010368	TCG	3	9	207371	207379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237546
4874	NC_010368	CGT	2	6	207405	207410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237546
4875	NC_010368	TCG	2	6	207422	207427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237546
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4878	NC_010368	CGT	2	6	207514	207519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237546
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4881	NC_010368	CGA	2	6	207590	207595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237546
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4884	NC_010368	GTA	2	6	207667	207672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237546
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4892	NC_010368	AAC	2	6	208013	208018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237546
4893	NC_010368	CGT	2	6	208032	208037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237546
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4974	NC_010368	GTC	2	6	211824	211829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4979	NC_010368	GTT	2	6	212064	212069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4980	NC_010368	GAC	2	6	212075	212080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4981	NC_010368	TACG	2	8	212099	212106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4982	NC_010368	GGC	2	6	212120	212125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4987	NC_010368	GTTG	2	8	212269	212276	0 %	50 %	50 %	0 %	169237547
4988	NC_010368	CTC	2	6	212366	212371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237547
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4993	NC_010368	TCG	2	6	212527	212532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237547
4994	NC_010368	CG	3	6	212558	212563	0 %	0 %	50 %	50 %	169237547
4995	NC_010368	CCG	2	6	212644	212649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237547
4996	NC_010368	GGC	2	6	212662	212667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237547
4997	NC_010368	GTG	2	6	212719	212724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237547
4998	NC_010368	CCCG	2	8	212849	212856	0 %	0 %	25 %	75 %	169237547
4999	NC_010368	CGGCG	2	10	212864	212873	0 %	0 %	60 %	40 %	169237547
5000	NC_010368	CAAG	2	8	212922	212929	50 %	0 %	25 %	25 %	169237547

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