MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 5873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010364	CAAC	2	8	717	724	50 %	0 %	0 %	50 %	169235050
2	NC_010364	GACA	2	8	730	737	50 %	0 %	25 %	25 %	169235050
3	NC_010364	GCAC	2	8	939	946	25 %	0 %	25 %	50 %	169235050
4	NC_010364	ACCA	2	8	969	976	50 %	0 %	0 %	50 %	169235050
5	NC_010364	GCTT	2	8	1610	1617	0 %	50 %	25 %	25 %	169235051
6	NC_010364	TCAC	2	8	2042	2049	25 %	25 %	0 %	50 %	169235051
7	NC_010364	GCTC	2	8	2120	2127	0 %	25 %	25 %	50 %	169235052
8	NC_010364	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	169235052
9	NC_010364	CGAA	2	8	2354	2361	50 %	0 %	25 %	25 %	169235052
10	NC_010364	ACCA	2	8	2538	2545	50 %	0 %	0 %	50 %	169235052
11	NC_010364	GCTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010364	CCGT	2	8	4103	4110	0 %	25 %	25 %	50 %	169235053
13	NC_010364	GTTC	2	8	4236	4243	0 %	50 %	25 %	25 %	169235053
14	NC_010364	CGGC	2	8	4445	4452	0 %	0 %	50 %	50 %	169235053
15	NC_010364	CACG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	169235053
16	NC_010364	TCGA	2	8	5202	5209	25 %	25 %	25 %	25 %	169235053
17	NC_010364	TCGC	2	8	5818	5825	0 %	25 %	25 %	50 %	169235054
18	NC_010364	CGGC	2	8	6037	6044	0 %	0 %	50 %	50 %	169235054
19	NC_010364	CGTC	2	8	6632	6639	0 %	25 %	25 %	50 %	169235054
20	NC_010364	CTGC	2	8	7816	7823	0 %	25 %	25 %	50 %	169235055
21	NC_010364	CGCC	2	8	8506	8513	0 %	0 %	25 %	75 %	169235055
22	NC_010364	CGTC	2	8	9290	9297	0 %	25 %	25 %	50 %	169235056
23	NC_010364	CGCC	2	8	9770	9777	0 %	0 %	25 %	75 %	169235056
24	NC_010364	CTGC	2	8	10024	10031	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
25	NC_010364	GCCT	2	8	10181	10188	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
26	NC_010364	CGCT	2	8	10269	10276	0 %	25 %	25 %	50 %	169235057
27	NC_010364	ACCG	2	8	10664	10671	25 %	0 %	25 %	50 %	169235057
28	NC_010364	CGGC	2	8	10857	10864	0 %	0 %	50 %	50 %	169235057
29	NC_010364	CCCG	2	8	12101	12108	0 %	0 %	25 %	75 %	169235058
30	NC_010364	TCGG	2	8	12209	12216	0 %	25 %	50 %	25 %	169235058
31	NC_010364	CCCT	2	8	12803	12810	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010364	ACTC	2	8	12811	12818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010364	TCGC	2	8	13166	13173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010364	CGAT	2	8	13551	13558	25 %	25 %	25 %	25 %	169235059
35	NC_010364	TCCA	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	169235059
36	NC_010364	ACGG	2	8	13692	13699	25 %	0 %	50 %	25 %	169235059
37	NC_010364	TCGC	2	8	13907	13914	0 %	25 %	25 %	50 %	169235060
38	NC_010364	TCGT	2	8	14143	14150	0 %	50 %	25 %	25 %	169235060
39	NC_010364	GGCG	2	8	14446	14453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010364	TAGA	2	8	15286	15293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010364	TTTA	2	8	15977	15984	25 %	75 %	0 %	0 %	169235064
42	NC_010364	ACGA	2	8	16388	16395	50 %	0 %	25 %	25 %	169235065
43	NC_010364	GCAG	2	8	17238	17245	25 %	0 %	50 %	25 %	169235065
44	NC_010364	ACAA	2	8	17479	17486	75 %	0 %	0 %	25 %	169235065
45	NC_010364	GTTC	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	169235065
46	NC_010364	CTAA	2	8	18132	18139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010364	ACTG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	25 %	25 %	169235066
48	NC_010364	CCAG	2	8	18622	18629	25 %	0 %	25 %	50 %	169235066
49	NC_010364	AGTC	2	8	18780	18787	25 %	25 %	25 %	25 %	169235066
50	NC_010364	CAAG	2	8	18860	18867	50 %	0 %	25 %	25 %	169235066
51	NC_010364	TGAG	2	8	18896	18903	25 %	25 %	50 %	0 %	169235066
52	NC_010364	CCGG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	169235067
53	NC_010364	TGCC	2	8	19322	19329	0 %	25 %	25 %	50 %	169235067
54	NC_010364	GACC	2	8	19365	19372	25 %	0 %	25 %	50 %	169235067
55	NC_010364	TCGC	2	8	19441	19448	0 %	25 %	25 %	50 %	169235067
56	NC_010364	CGAT	2	8	19469	19476	25 %	25 %	25 %	25 %	169235067
57	NC_010364	CTCC	2	8	20092	20099	0 %	25 %	0 %	75 %	169235068
58	NC_010364	AGCT	2	8	21148	21155	25 %	25 %	25 %	25 %	169235070
59	NC_010364	CGGT	2	8	21477	21484	0 %	25 %	50 %	25 %	169235070
60	NC_010364	GGTG	2	8	21561	21568	0 %	25 %	75 %	0 %	169235070
61	NC_010364	CCCT	2	8	21855	21862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_010364	TTGG	2	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	169235071
63	NC_010364	CTGG	2	8	22341	22348	0 %	25 %	50 %	25 %	169235071
64	NC_010364	CACT	2	8	22566	22573	25 %	25 %	0 %	50 %	169235071
65	NC_010364	TGGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	50 %	25 %	169235071
66	NC_010364	ATGG	2	8	22879	22886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010364	ATAC	2	8	23081	23088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010364	CTTC	2	8	23555	23562	0 %	50 %	0 %	50 %	169235073
69	NC_010364	CGGC	2	8	23744	23751	0 %	0 %	50 %	50 %	169235073
70	NC_010364	GGGC	2	8	23846	23853	0 %	0 %	75 %	25 %	169235073
71	NC_010364	GCTG	2	8	23867	23874	0 %	25 %	50 %	25 %	169235073
72	NC_010364	CGAC	2	8	24171	24178	25 %	0 %	25 %	50 %	169235074
73	NC_010364	ACCC	2	8	24206	24213	25 %	0 %	0 %	75 %	169235074
74	NC_010364	CACC	2	8	24407	24414	25 %	0 %	0 %	75 %	169235074
75	NC_010364	CAAG	2	8	24458	24465	50 %	0 %	25 %	25 %	169235074
76	NC_010364	CCCT	2	8	24735	24742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_010364	CAGT	2	8	24997	25004	25 %	25 %	25 %	25 %	169235075
78	NC_010364	TTCG	2	8	25163	25170	0 %	50 %	25 %	25 %	169235075
79	NC_010364	CCTC	2	8	25229	25236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_010364	GCCA	2	8	25522	25529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010364	AACC	2	8	25536	25543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010364	CCCA	2	8	26091	26098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_010364	ACCA	2	8	26211	26218	50 %	0 %	0 %	50 %	169235076
84	NC_010364	ATCA	2	8	26249	26256	50 %	25 %	0 %	25 %	169235076
85	NC_010364	TGCC	2	8	26793	26800	0 %	25 %	25 %	50 %	169235077
86	NC_010364	GTCA	2	8	27252	27259	25 %	25 %	25 %	25 %	169235077
87	NC_010364	GAGT	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	169235077
88	NC_010364	TTCA	2	8	27520	27527	25 %	50 %	0 %	25 %	169235077
89	NC_010364	GGCA	2	8	28029	28036	25 %	0 %	50 %	25 %	169235077
90	NC_010364	CCGT	2	8	28672	28679	0 %	25 %	25 %	50 %	169235077
91	NC_010364	AACT	2	8	29017	29024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010364	CACT	2	8	29995	30002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010364	TCAC	2	8	30241	30248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010364	TACG	2	8	30323	30330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010364	CTTC	2	8	30454	30461	0 %	50 %	0 %	50 %	169235080
96	NC_010364	GTTG	2	8	30493	30500	0 %	50 %	50 %	0 %	169235080
97	NC_010364	CCCG	2	8	31073	31080	0 %	0 %	25 %	75 %	169235080
98	NC_010364	CAAG	2	8	31146	31153	50 %	0 %	25 %	25 %	169235080
99	NC_010364	CGGC	2	8	31346	31353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010364	GTCT	2	8	31647	31654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010364	CGAA	2	8	31940	31947	50 %	0 %	25 %	25 %	169235081
102	NC_010364	CCGG	2	8	32123	32130	0 %	0 %	50 %	50 %	169235082
103	NC_010364	CGAA	2	8	32176	32183	50 %	0 %	25 %	25 %	169235082
104	NC_010364	ACGG	2	8	32449	32456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010364	TTGA	2	8	32687	32694	25 %	50 %	25 %	0 %	169235083
106	NC_010364	TCGT	2	8	32853	32860	0 %	50 %	25 %	25 %	169235083
107	NC_010364	TTGT	2	8	33344	33351	0 %	75 %	25 %	0 %	169235084
108	NC_010364	AGCG	2	8	34112	34119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010364	TATC	2	8	34363	34370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010364	GTGG	2	8	35592	35599	0 %	25 %	75 %	0 %	169235086
111	NC_010364	TGTT	2	8	36545	36552	0 %	75 %	25 %	0 %	169235087
112	NC_010364	CCGA	2	8	36632	36639	25 %	0 %	25 %	50 %	169235087
113	NC_010364	AGAC	2	8	36834	36841	50 %	0 %	25 %	25 %	169235087
114	NC_010364	GTGA	2	8	37175	37182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010364	ACTC	2	8	37574	37581	25 %	25 %	0 %	50 %	169235088
116	NC_010364	ACCA	2	8	38000	38007	50 %	0 %	0 %	50 %	169235089
117	NC_010364	CCGA	2	8	38246	38253	25 %	0 %	25 %	50 %	169235089
118	NC_010364	GCAA	2	8	38497	38504	50 %	0 %	25 %	25 %	169235089
119	NC_010364	TCGC	2	8	38619	38626	0 %	25 %	25 %	50 %	169235089
120	NC_010364	CCAG	2	8	39334	39341	25 %	0 %	25 %	50 %	169235090
121	NC_010364	ATCT	2	8	39476	39483	25 %	50 %	0 %	25 %	169235090
122	NC_010364	CGGA	2	8	39872	39879	25 %	0 %	50 %	25 %	169235090
123	NC_010364	CAGT	2	8	40744	40751	25 %	25 %	25 %	25 %	169235091
124	NC_010364	GTGC	2	8	40821	40828	0 %	25 %	50 %	25 %	169235091
125	NC_010364	CGCT	2	8	40966	40973	0 %	25 %	25 %	50 %	169235091
126	NC_010364	CTGG	2	8	41015	41022	0 %	25 %	50 %	25 %	169235091
127	NC_010364	CGTC	2	8	41690	41697	0 %	25 %	25 %	50 %	169235091
128	NC_010364	ACTC	2	8	41907	41914	25 %	25 %	0 %	50 %	169235091
129	NC_010364	GGCT	2	8	42703	42710	0 %	25 %	50 %	25 %	169235092
130	NC_010364	GGGA	2	8	43222	43229	25 %	0 %	75 %	0 %	169235093
131	NC_010364	ACGA	2	8	43441	43448	50 %	0 %	25 %	25 %	169235093
132	NC_010364	TTCT	2	8	43461	43468	0 %	75 %	0 %	25 %	169235093
133	NC_010364	CATG	2	8	43901	43908	25 %	25 %	25 %	25 %	169235094
134	NC_010364	GCCA	2	8	43941	43948	25 %	0 %	25 %	50 %	169235094
135	NC_010364	AATC	2	8	44039	44046	50 %	25 %	0 %	25 %	169235094
136	NC_010364	CCTC	2	8	44101	44108	0 %	25 %	0 %	75 %	169235094
137	NC_010364	TGTT	2	8	44293	44300	0 %	75 %	25 %	0 %	169235094
138	NC_010364	AGTT	2	8	44465	44472	25 %	50 %	25 %	0 %	169235094
139	NC_010364	CTTC	2	8	44591	44598	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
140	NC_010364	ATGA	2	8	45542	45549	50 %	25 %	25 %	0 %	169235095
141	NC_010364	ATCG	2	8	45957	45964	25 %	25 %	25 %	25 %	169235095
142	NC_010364	AGTT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010364	CTTC	2	8	46609	46616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010364	AATA	2	8	46621	46628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010364	GGTG	2	8	46861	46868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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