MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 58651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010364	GAG	2	6	65997	66002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235112
1502	NC_010364	CGG	2	6	66024	66029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235112
1503	NC_010364	TCGC	2	8	66045	66052	0 %	25 %	25 %	50 %	169235112
1504	NC_010364	GAC	2	6	66192	66197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235112
1505	NC_010364	ACA	2	6	66243	66248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235113
1506	NC_010364	GCTC	2	8	66258	66265	0 %	25 %	25 %	50 %	169235113
1507	NC_010364	CTT	2	6	66287	66292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235113
1508	NC_010364	GTC	2	6	66329	66334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235113
1509	NC_010364	ACA	2	6	66402	66407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235113
1510	NC_010364	GGCT	2	8	66410	66417	0 %	25 %	50 %	25 %	169235113
1511	NC_010364	GACG	2	8	66486	66493	25 %	0 %	50 %	25 %	169235113
1512	NC_010364	GAC	2	6	66541	66546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010364	AGC	2	6	66612	66617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010364	TGA	2	6	66627	66632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010364	CGA	2	6	66702	66707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235114
1516	NC_010364	TCC	2	6	66753	66758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235114
1517	NC_010364	GTC	2	6	66912	66917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010364	GCG	2	6	66978	66983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010364	AC	3	6	66994	66999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_010364	AGAC	2	8	67001	67008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_010364	AGA	2	6	67101	67106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235115
1522	NC_010364	GAA	2	6	67114	67119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235115
1523	NC_010364	TC	3	6	67273	67278	0 %	50 %	0 %	50 %	169235116
1524	NC_010364	TAC	2	6	67295	67300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235116
1525	NC_010364	CAA	2	6	67301	67306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235116
1526	NC_010364	CGA	2	6	67309	67314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235116
1527	NC_010364	CCGGCG	2	12	67383	67394	0 %	0 %	50 %	50 %	169235116
1528	NC_010364	CGA	2	6	67519	67524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235116
1529	NC_010364	CCA	2	6	67676	67681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_010364	TCG	2	6	67726	67731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010364	ACG	2	6	67762	67767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_010364	GCC	2	6	67968	67973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_010364	TCC	2	6	68046	68051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010364	GGA	2	6	68064	68069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010364	GTCGA	2	10	68090	68099	20 %	20 %	40 %	20 %	169235117
1536	NC_010364	CCA	2	6	68101	68106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235117
1537	NC_010364	GTC	3	9	68117	68125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1538	NC_010364	CGT	2	6	68146	68151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1539	NC_010364	CGC	2	6	68154	68159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235117
1540	NC_010364	GTC	2	6	68172	68177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1541	NC_010364	GTC	2	6	68201	68206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1542	NC_010364	CAT	2	6	68230	68235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235117
1543	NC_010364	CTG	2	6	68334	68339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1544	NC_010364	TCG	2	6	68364	68369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1545	NC_010364	CGT	2	6	68407	68412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1546	NC_010364	CTG	2	6	68431	68436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235117
1547	NC_010364	TCC	2	6	68510	68515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235118
1548	NC_010364	GTC	2	6	68533	68538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235118
1549	NC_010364	TCC	2	6	68543	68548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235118
1550	NC_010364	CCA	2	6	68583	68588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235118
1551	NC_010364	CGA	2	6	68623	68628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235118
1552	NC_010364	TCG	2	6	68669	68674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235118
1553	NC_010364	CAG	2	6	68686	68691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235118
1554	NC_010364	CTG	2	6	68695	68700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235118
1555	NC_010364	TCC	2	6	68744	68749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235118
1556	NC_010364	CCA	2	6	68828	68833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_010364	TCG	2	6	68952	68957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235119
1558	NC_010364	CGC	2	6	68982	68987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235119
1559	NC_010364	CGG	2	6	69027	69032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235119
1560	NC_010364	TCG	2	6	69053	69058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235119
1561	NC_010364	CCT	2	6	69150	69155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235119
1562	NC_010364	CA	3	6	69231	69236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_010364	AG	3	6	69238	69243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010364	ATT	2	6	69251	69256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010364	AAT	2	6	69269	69274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010364	CGGG	2	8	69346	69353	0 %	0 %	75 %	25 %	169235120
1567	NC_010364	CAA	2	6	69432	69437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235120
1568	NC_010364	CGA	2	6	69445	69450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235120
1569	NC_010364	TCG	2	6	69492	69497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235120
1570	NC_010364	TTC	2	6	69724	69729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_010364	CTG	2	6	69736	69741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010364	TCAC	2	8	69837	69844	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_010364	CGA	2	6	69884	69889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_010364	ATG	2	6	69973	69978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010364	TC	3	6	70136	70141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_010364	CTG	2	6	70318	70323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_010364	GAC	2	6	70339	70344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_010364	GAC	2	6	70501	70506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_010364	AAG	2	6	70535	70540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010364	CCTT	2	8	70557	70564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_010364	ACA	2	6	70643	70648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010364	TGG	2	6	70653	70658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235121
1583	NC_010364	GCT	2	6	70669	70674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1584	NC_010364	TCA	2	6	70701	70706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235121
1585	NC_010364	GTC	2	6	70709	70714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1586	NC_010364	TCG	2	6	70722	70727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1587	NC_010364	CGT	2	6	70744	70749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1588	NC_010364	GCG	2	6	70760	70765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235121
1589	NC_010364	GAG	2	6	70793	70798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235121
1590	NC_010364	CTC	2	6	70807	70812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235121
1591	NC_010364	TCGGCG	2	12	70866	70877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169235121
1592	NC_010364	AC	4	8	70878	70885	50 %	0 %	0 %	50 %	169235121
1593	NC_010364	GAT	2	6	70991	70996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235121
1594	NC_010364	CGC	2	6	71016	71021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235121
1595	NC_010364	GCG	2	6	71070	71075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235121
1596	NC_010364	CGG	2	6	71148	71153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235121
1597	NC_010364	CGA	2	6	71161	71166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1598	NC_010364	ACGCG	2	10	71235	71244	20 %	0 %	40 %	40 %	169235121
1599	NC_010364	AC	3	6	71343	71348	50 %	0 %	0 %	50 %	169235121
1600	NC_010364	CGAC	2	8	71358	71365	25 %	0 %	25 %	50 %	169235121
1601	NC_010364	GC	3	6	71503	71508	0 %	0 %	50 %	50 %	169235121
1602	NC_010364	CGA	3	9	71509	71517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1603	NC_010364	ACGTCG	2	12	71538	71549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1604	NC_010364	TCA	2	6	71562	71567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235121
1605	NC_010364	CGA	2	6	71575	71580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1606	NC_010364	GTT	2	6	71594	71599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235121
1607	NC_010364	CAC	2	6	71629	71634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235121
1608	NC_010364	CAA	2	6	71655	71660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235121
1609	NC_010364	GAC	2	6	71722	71727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1610	NC_010364	CGT	2	6	71743	71748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235121
1611	NC_010364	ACCA	2	8	71805	71812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_010364	TGA	2	6	71834	71839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010364	CAC	2	6	71886	71891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235122
1614	NC_010364	GTC	3	9	72010	72018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235122
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1616	NC_010364	TCG	2	6	72182	72187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235122
1617	NC_010364	CCA	2	6	72208	72213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235122
1618	NC_010364	GAC	2	6	72220	72225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235122
1619	NC_010364	ACG	2	6	72230	72235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235122
1620	NC_010364	TGCT	2	8	72420	72427	0 %	50 %	25 %	25 %	169235123
1621	NC_010364	GCTCGC	2	12	72505	72516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169235123
1622	NC_010364	CCG	2	6	72558	72563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235123
1623	NC_010364	TCGTGC	2	12	72564	72575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235123
1624	NC_010364	CTC	2	6	72593	72598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235123
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1873	NC_010364	GTG	2	6	80139	80144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235130
1874	NC_010364	CGT	2	6	80150	80155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235130
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1999	NC_010364	CG	3	6	84041	84046	0 %	0 %	50 %	50 %	169235135
2000	NC_010364	ACC	2	6	84059	84064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235135

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