MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 58651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010364	TGA	2	6	42505	42510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235092
1002	NC_010364	AGA	2	6	42677	42682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235092
1003	NC_010364	GGA	2	6	42686	42691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235092
1004	NC_010364	GGCT	2	8	42703	42710	0 %	25 %	50 %	25 %	169235092
1005	NC_010364	AGA	2	6	42716	42721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235092
1006	NC_010364	GA	3	6	42755	42760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010364	TAC	2	6	42778	42783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010364	ATT	3	9	42861	42869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010364	CTG	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_010364	TAA	2	6	42883	42888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010364	T	6	6	42941	42946	0 %	100 %	0 %	0 %	169235093
1012	NC_010364	CT	4	8	42996	43003	0 %	50 %	0 %	50 %	169235093
1013	NC_010364	GGGA	2	8	43222	43229	25 %	0 %	75 %	0 %	169235093
1014	NC_010364	ATC	2	6	43263	43268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235093
1015	NC_010364	CGAGGT	2	12	43404	43415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169235093
1016	NC_010364	CTAGT	2	10	43424	43433	20 %	40 %	20 %	20 %	169235093
1017	NC_010364	ACGA	2	8	43441	43448	50 %	0 %	25 %	25 %	169235093
1018	NC_010364	TTCT	2	8	43461	43468	0 %	75 %	0 %	25 %	169235093
1019	NC_010364	GAA	2	6	43564	43569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235093
1020	NC_010364	AGA	2	6	43635	43640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235093
1021	NC_010364	TGA	2	6	43672	43677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235093
1022	NC_010364	TCG	2	6	43685	43690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010364	TAT	2	6	43777	43782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169235094
1024	NC_010364	CT	3	6	43790	43795	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1025	NC_010364	CATG	2	8	43901	43908	25 %	25 %	25 %	25 %	169235094
1026	NC_010364	TTA	2	6	43915	43920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169235094
1027	NC_010364	GCCA	2	8	43941	43948	25 %	0 %	25 %	50 %	169235094
1028	NC_010364	ATG	2	6	43980	43985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1029	NC_010364	TCT	2	6	44005	44010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235094
1030	NC_010364	TC	3	6	44030	44035	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1031	NC_010364	AATC	2	8	44039	44046	50 %	25 %	0 %	25 %	169235094
1032	NC_010364	CAA	2	6	44062	44067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235094
1033	NC_010364	TGA	2	6	44071	44076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1034	NC_010364	TA	3	6	44089	44094	50 %	50 %	0 %	0 %	169235094
1035	NC_010364	CCTC	2	8	44101	44108	0 %	25 %	0 %	75 %	169235094
1036	NC_010364	TC	3	6	44222	44227	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1037	NC_010364	CATAT	2	10	44268	44277	40 %	40 %	0 %	20 %	169235094
1038	NC_010364	TGTT	2	8	44293	44300	0 %	75 %	25 %	0 %	169235094
1039	NC_010364	T	6	6	44299	44304	0 %	100 %	0 %	0 %	169235094
1040	NC_010364	GAT	2	6	44310	44315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1041	NC_010364	ACTCT	2	10	44394	44403	20 %	40 %	0 %	40 %	169235094
1042	NC_010364	CAG	3	9	44446	44454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235094
1043	NC_010364	AGTT	2	8	44465	44472	25 %	50 %	25 %	0 %	169235094
1044	NC_010364	TCC	2	6	44488	44493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235094
1045	NC_010364	CTG	2	6	44539	44544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235094
1046	NC_010364	TGA	2	6	44564	44569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1047	NC_010364	CTTC	2	8	44591	44598	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1048	NC_010364	AGG	2	6	44630	44635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235094
1049	NC_010364	TC	3	6	44756	44761	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1050	NC_010364	GAA	2	6	44781	44786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235094
1051	NC_010364	ACT	2	6	44787	44792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235094
1052	NC_010364	TGC	2	6	44876	44881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235094
1053	NC_010364	CT	3	6	44931	44936	0 %	50 %	0 %	50 %	169235094
1054	NC_010364	AAT	2	6	44942	44947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169235094
1055	NC_010364	GCA	2	6	44988	44993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235094
1056	NC_010364	AAT	2	6	44999	45004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169235094
1057	NC_010364	ATG	2	6	45021	45026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1058	NC_010364	TTG	2	6	45048	45053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235094
1059	NC_010364	GAT	2	6	45123	45128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235094
1060	NC_010364	AT	3	6	45146	45151	50 %	50 %	0 %	0 %	169235094
1061	NC_010364	ATT	2	6	45202	45207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010364	TGA	2	6	45373	45378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235095
1063	NC_010364	AAT	2	6	45440	45445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169235095
1064	NC_010364	TGC	2	6	45454	45459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235095
1065	NC_010364	CTC	2	6	45524	45529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235095
1066	NC_010364	ATGA	2	8	45542	45549	50 %	25 %	25 %	0 %	169235095
1067	NC_010364	CGT	2	6	45553	45558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235095
1068	NC_010364	TCC	2	6	45645	45650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235095
1069	NC_010364	ACT	2	6	45678	45683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235095
1070	NC_010364	CGT	2	6	45694	45699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235095
1071	NC_010364	ATG	2	6	45723	45728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235095
1072	NC_010364	TCC	2	6	45861	45866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235095
1073	NC_010364	ATCG	2	8	45957	45964	25 %	25 %	25 %	25 %	169235095
1074	NC_010364	GTT	2	6	46010	46015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235095
1075	NC_010364	AGA	2	6	46092	46097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169235095
1076	NC_010364	T	6	6	46101	46106	0 %	100 %	0 %	0 %	169235095
1077	NC_010364	AAC	2	6	46136	46141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235095
1078	NC_010364	GAT	2	6	46300	46305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235095
1079	NC_010364	GAT	2	6	46320	46325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235095
1080	NC_010364	TTG	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235095
1081	NC_010364	CTG	2	6	46432	46437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235095
1082	NC_010364	TAACTA	2	12	46472	46483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1083	NC_010364	TCT	2	6	46504	46509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_010364	AGTT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010364	ATG	2	6	46559	46564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010364	CTTC	2	8	46609	46616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_010364	AATA	2	8	46621	46628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010364	CCG	2	6	46639	46644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_010364	CGA	2	6	46684	46689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_010364	TCTGT	2	10	46737	46746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_010364	GTC	2	6	46755	46760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010364	GCTGTC	2	12	46794	46805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010364	GGC	2	6	46806	46811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010364	GCC	2	6	46817	46822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010364	GGTG	2	8	46861	46868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010364	GTC	2	6	46885	46890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1097	NC_010364	TGG	2	6	46891	46896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235096
1098	NC_010364	CGG	2	6	46902	46907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235096
1099	NC_010364	CCA	3	9	46978	46986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235096
1100	NC_010364	CGCC	2	8	46994	47001	0 %	0 %	25 %	75 %	169235096
1101	NC_010364	CGGCG	2	10	47003	47012	0 %	0 %	60 %	40 %	169235096
1102	NC_010364	CAG	2	6	47056	47061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1103	NC_010364	CAC	2	6	47065	47070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235096
1104	NC_010364	CAG	2	6	47077	47082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1105	NC_010364	CGT	2	6	47101	47106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1106	NC_010364	GTC	2	6	47108	47113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1107	NC_010364	CTCGA	2	10	47141	47150	20 %	20 %	20 %	40 %	169235096
1108	NC_010364	AGT	2	6	47166	47171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235096
1109	NC_010364	GCG	2	6	47213	47218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235096
1110	NC_010364	TCG	2	6	47243	47248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1111	NC_010364	CCGT	2	8	47251	47258	0 %	25 %	25 %	50 %	169235096
1112	NC_010364	GTAC	2	8	47263	47270	25 %	25 %	25 %	25 %	169235096
1113	NC_010364	CTG	2	6	47368	47373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1114	NC_010364	GAT	2	6	47392	47397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235096
1115	NC_010364	CTG	2	6	47531	47536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1116	NC_010364	TTC	2	6	47585	47590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235096
1117	NC_010364	CG	3	6	47594	47599	0 %	0 %	50 %	50 %	169235096
1118	NC_010364	GGT	2	6	47626	47631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235096
1119	NC_010364	GTC	2	6	47668	47673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1120	NC_010364	TCA	2	6	47675	47680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235096
1121	NC_010364	GTA	2	6	47683	47688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235096
1122	NC_010364	CGA	2	6	47739	47744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235096
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1124	NC_010364	GAT	2	6	47808	47813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235096
1125	NC_010364	CGG	2	6	47880	47885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235096
1126	NC_010364	CGA	2	6	47892	47897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235096
1127	NC_010364	GTT	2	6	47932	47937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235096
1128	NC_010364	GA	3	6	47947	47952	50 %	0 %	50 %	0 %	169235096
1129	NC_010364	TGCT	2	8	48016	48023	0 %	50 %	25 %	25 %	169235096
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1132	NC_010364	CTAA	2	8	48057	48064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_010364	TCG	2	6	48098	48103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1248	NC_010364	ACG	2	6	53052	53057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_010364	CAG	2	6	53059	53064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_010364	GACT	2	8	53113	53120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1251	NC_010364	CTG	2	6	53123	53128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_010364	CCA	2	6	53152	53157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_010364	CGG	2	6	53203	53208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_010364	GGAA	2	8	53281	53288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_010364	GCG	2	6	53292	53297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_010364	CCG	2	6	53337	53342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_010364	TAA	2	6	53485	53490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_010364	CGG	2	6	54136	54141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1373	NC_010364	TG	3	6	59815	59820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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