MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 58651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010364	GAG	2	6	183477	183482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235237
5002	NC_010364	CGC	2	6	183525	183530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_010364	TTC	2	6	183690	183695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235238
5004	NC_010364	ACG	2	6	183729	183734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5005	NC_010364	CGG	2	6	183752	183757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5006	NC_010364	CTC	2	6	183776	183781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235238
5007	NC_010364	GCT	2	6	183782	183787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5008	NC_010364	TCG	3	9	183805	183813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5009	NC_010364	CGC	2	6	183827	183832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5010	NC_010364	CGC	2	6	183839	183844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5011	NC_010364	GCGCTC	2	12	183897	183908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169235238
5012	NC_010364	GTC	2	6	183930	183935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5013	NC_010364	TGC	2	6	183970	183975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5014	NC_010364	ACCGCC	2	12	183990	184001	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	169235238
5015	NC_010364	GTT	3	9	184007	184015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235238
5016	NC_010364	CGG	2	6	184022	184027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5017	NC_010364	ACGTC	2	10	184039	184048	20 %	20 %	20 %	40 %	169235238
5018	NC_010364	CGG	3	9	184049	184057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5019	NC_010364	GCT	2	6	184061	184066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5020	NC_010364	CG	3	6	184079	184084	0 %	0 %	50 %	50 %	169235238
5021	NC_010364	C	6	6	184098	184103	0 %	0 %	0 %	100 %	169235238
5022	NC_010364	C	6	6	184123	184128	0 %	0 %	0 %	100 %	169235238
5023	NC_010364	TGT	2	6	184138	184143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235238
5024	NC_010364	TCG	3	9	184186	184194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5025	NC_010364	GCAGC	2	10	184211	184220	20 %	0 %	40 %	40 %	169235238
5026	NC_010364	CGG	2	6	184247	184252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5027	NC_010364	CTT	2	6	184295	184300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235238
5028	NC_010364	GAG	2	6	184314	184319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235238
5029	NC_010364	CGT	2	6	184322	184327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5030	NC_010364	CCG	2	6	184349	184354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5031	NC_010364	CGA	2	6	184361	184366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5032	NC_010364	GAT	2	6	184394	184399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235238
5033	NC_010364	CGG	3	9	184424	184432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5034	NC_010364	ACGG	2	8	184461	184468	25 %	0 %	50 %	25 %	169235238
5035	NC_010364	CCG	2	6	184492	184497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5036	NC_010364	TCG	2	6	184540	184545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5037	NC_010364	CGC	3	9	184547	184555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5038	NC_010364	ACACCG	2	12	184579	184590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169235238
5039	NC_010364	CGA	3	9	184646	184654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5040	NC_010364	CGA	2	6	184691	184696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5041	NC_010364	CGG	2	6	184720	184725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5042	NC_010364	CCG	2	6	184726	184731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5043	NC_010364	CAA	2	6	184784	184789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235238
5044	NC_010364	CGA	2	6	184802	184807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5045	NC_010364	AGCG	2	8	184830	184837	25 %	0 %	50 %	25 %	169235238
5046	NC_010364	GCC	2	6	184857	184862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5047	NC_010364	GCC	2	6	184869	184874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5048	NC_010364	CGT	2	6	184982	184987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5049	NC_010364	CAC	2	6	184997	185002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235238
5050	NC_010364	AAC	2	6	185031	185036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235238
5051	NC_010364	CCT	2	6	185060	185065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235238
5052	NC_010364	CGG	2	6	185075	185080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235238
5053	NC_010364	GCC	2	6	185160	185165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5054	NC_010364	GTC	2	6	185193	185198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5055	NC_010364	GCC	2	6	185211	185216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235238
5056	NC_010364	GAC	2	6	185220	185225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235238
5057	NC_010364	GC	3	6	185258	185263	0 %	0 %	50 %	50 %	169235238
5058	NC_010364	GCCA	2	8	185304	185311	25 %	0 %	25 %	50 %	169235238
5059	NC_010364	TCT	2	6	185389	185394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235238
5060	NC_010364	CCG	2	6	185407	185412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_010364	AC	3	6	185475	185480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_010364	CGT	3	9	185516	185524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5063	NC_010364	CGA	2	6	185525	185530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5064	NC_010364	GAC	2	6	185537	185542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5065	NC_010364	ACG	2	6	185647	185652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5066	NC_010364	CG	3	6	185672	185677	0 %	0 %	50 %	50 %	169235239
5067	NC_010364	CGAC	2	8	185741	185748	25 %	0 %	25 %	50 %	169235239
5068	NC_010364	GCC	2	6	185750	185755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235239
5069	NC_010364	CTA	2	6	185795	185800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235239
5070	NC_010364	CGT	2	6	185837	185842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5071	NC_010364	GAT	2	6	185850	185855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169235239
5072	NC_010364	CGG	2	6	185858	185863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235239
5073	NC_010364	CTGG	2	8	185983	185990	0 %	25 %	50 %	25 %	169235239
5074	NC_010364	CGC	3	9	186005	186013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235239
5075	NC_010364	GTC	2	6	186040	186045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235239
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5077	NC_010364	CGA	2	6	186101	186106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235239
5078	NC_010364	CGC	3	9	186144	186152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_010364	TGGCG	2	10	186157	186166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5080	NC_010364	TCG	2	6	186193	186198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235240
5081	NC_010364	GTC	2	6	186207	186212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235240
5082	NC_010364	GCT	2	6	186217	186222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235240
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5085	NC_010364	CGT	2	6	186239	186244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235240
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5088	NC_010364	CGG	2	6	186392	186397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235240
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5091	NC_010364	CGC	2	6	186461	186466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235241
5092	NC_010364	CCG	2	6	186472	186477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235241
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5094	NC_010364	TCC	2	6	186529	186534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235241
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5101	NC_010364	GGT	2	6	186793	186798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235241
5102	NC_010364	GC	3	6	186825	186830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_010364	GCC	2	6	186890	186895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_010364	CGGA	2	8	186950	186957	25 %	0 %	50 %	25 %	169235242
5105	NC_010364	CGA	2	6	186980	186985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235242
5106	NC_010364	CGA	2	6	187037	187042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235242
5107	NC_010364	CGCC	2	8	187103	187110	0 %	0 %	25 %	75 %	169235242
5108	NC_010364	GCT	2	6	187122	187127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235242
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5111	NC_010364	CTTC	2	8	187213	187220	0 %	50 %	0 %	50 %	169235243
5112	NC_010364	CGC	2	6	187276	187281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235243
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5116	NC_010364	GC	3	6	187582	187587	0 %	0 %	50 %	50 %	169235244
5117	NC_010364	CCGG	2	8	187594	187601	0 %	0 %	50 %	50 %	169235244
5118	NC_010364	CCG	2	6	187644	187649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_010364	TG	3	6	187673	187678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010364	CAC	2	6	187693	187698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_010364	CGT	2	6	187757	187762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_010364	TTCG	2	8	187789	187796	0 %	50 %	25 %	25 %	169235245
5123	NC_010364	CTCC	2	8	187806	187813	0 %	25 %	0 %	75 %	169235245
5124	NC_010364	TTC	2	6	187843	187848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235245
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5199	NC_010364	CGGC	2	8	190452	190459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5200	NC_010364	GCA	2	6	190512	190517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5225	NC_010364	ATCC	2	8	191328	191335	25 %	25 %	0 %	50 %	169235250
5226	NC_010364	CGT	2	6	191375	191380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235250
5227	NC_010364	CGA	2	6	191390	191395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235250
5228	NC_010364	TCC	2	6	191401	191406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235250
5229	NC_010364	CAC	2	6	191429	191434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235250
5230	NC_010364	GCC	2	6	191497	191502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235250
5231	NC_010364	GTG	2	6	191508	191513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235250
5232	NC_010364	CCACG	2	10	191516	191525	20 %	0 %	20 %	60 %	169235250
5233	NC_010364	CGGG	2	8	191552	191559	0 %	0 %	75 %	25 %	169235250
5234	NC_010364	CAGC	2	8	191621	191628	25 %	0 %	25 %	50 %	169235250
5235	NC_010364	CCG	2	6	191653	191658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235250
5236	NC_010364	CGA	2	6	191672	191677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235250
5237	NC_010364	ACCAGG	2	12	191692	191703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235250
5238	NC_010364	G	6	6	191728	191733	0 %	0 %	100 %	0 %	169235250
5239	NC_010364	G	6	6	191745	191750	0 %	0 %	100 %	0 %	169235250
5240	NC_010364	GAG	2	6	191768	191773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235251
5241	NC_010364	GTC	3	9	191774	191782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235251
5242	NC_010364	GAG	2	6	191783	191788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235251
5243	NC_010364	GCT	2	6	191809	191814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235251
5244	NC_010364	GGC	2	6	191815	191820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235251
5245	NC_010364	ACC	2	6	191915	191920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235251
5246	NC_010364	GAC	2	6	191921	191926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235251
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5248	NC_010364	GAC	2	6	191939	191944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235251
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5264	NC_010364	CGA	2	6	192510	192515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235251
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5348	NC_010364	GGTC	2	8	194829	194836	0 %	25 %	50 %	25 %	169235253
5349	NC_010364	GGC	2	6	194854	194859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
5350	NC_010364	GC	4	8	194948	194955	0 %	0 %	50 %	50 %	169235253
5351	NC_010364	CGG	2	6	194973	194978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
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5354	NC_010364	CG	3	6	195034	195039	0 %	0 %	50 %	50 %	169235253
5355	NC_010364	GGT	2	6	195076	195081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235253
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5358	NC_010364	CGT	2	6	195144	195149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235253
5359	NC_010364	GGGC	2	8	195243	195250	0 %	0 %	75 %	25 %	169235253
5360	NC_010364	GGC	2	6	195280	195285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
5361	NC_010364	CGG	2	6	195291	195296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
5362	NC_010364	CGG	3	9	195309	195317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
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5364	NC_010364	CGA	2	6	195387	195392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235253
5365	NC_010364	CGG	3	9	195420	195428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235253
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5367	NC_010364	CGC	2	6	195558	195563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235253
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5481	NC_010364	GATC	2	8	199221	199228	25 %	25 %	25 %	25 %	169235257
5482	NC_010364	CTT	2	6	199233	199238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235257
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5485	NC_010364	CTC	2	6	199333	199338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235257
5486	NC_010364	TCC	5	15	199343	199357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235257
5487	NC_010364	GCC	2	6	199364	199369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235257
5488	NC_010364	CGC	2	6	199535	199540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5489	NC_010364	GTC	2	6	199592	199597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235258
5490	NC_010364	CCGC	2	8	199614	199621	0 %	0 %	25 %	75 %	169235258
5491	NC_010364	GCG	2	6	199622	199627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235258
5492	NC_010364	TCG	2	6	199728	199733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235258
5493	NC_010364	G	7	7	199738	199744	0 %	0 %	100 %	0 %	169235258
5494	NC_010364	CGT	2	6	199765	199770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235258
5495	NC_010364	CGG	2	6	199783	199788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235258
5496	NC_010364	CGC	2	6	199837	199842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235258
5497	NC_010364	CGG	2	6	199870	199875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235258
5498	NC_010364	TCG	2	6	199878	199883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235258
5499	NC_010364	GCG	2	6	199890	199895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235258
5500	NC_010364	CCA	2	6	199911	199916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235258

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