MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 47771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010337	GCA	2	6	111	116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010337	GTG	2	6	176	181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010337	AGA	2	6	201	206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010337	CTG	2	6	228	233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010337	GGT	2	6	300	305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010337	AGC	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010337	AAG	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010337	ACG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628138
9	NC_010337	ATC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
10	NC_010337	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628138
11	NC_010337	TCC	2	6	516	521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628138
12	NC_010337	GTT	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628138
13	NC_010337	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
14	NC_010337	ATC	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
15	NC_010337	TCA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
16	NC_010337	CCA	2	6	958	963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628138
17	NC_010337	GAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
18	NC_010337	GCG	2	6	1134	1139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628138
19	NC_010337	CAG	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628138
20	NC_010337	TCC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628138
21	NC_010337	GAT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
22	NC_010337	ATG	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
23	NC_010337	CAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628139
24	NC_010337	TAT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628139
25	NC_010337	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628139
26	NC_010337	AGG	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628140
27	NC_010337	ATT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628140
28	NC_010337	TCC	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628140
29	NC_010337	GGA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628141
30	NC_010337	AGA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628141
31	NC_010337	CGA	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628141
32	NC_010337	AGC	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628141
33	NC_010337	CGG	2	6	2101	2106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628141
34	NC_010337	CAC	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628141
35	NC_010337	TTG	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628141
36	NC_010337	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628141
37	NC_010337	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010337	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010337	CCG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
40	NC_010337	GAT	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628142
41	NC_010337	TCG	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628142
42	NC_010337	GGC	2	6	2419	2424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628142
43	NC_010337	AAG	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628142
44	NC_010337	CAT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628142
45	NC_010337	GAT	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628142
46	NC_010337	CTC	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628142
47	NC_010337	GAC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628142
48	NC_010337	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
49	NC_010337	CAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628142
50	NC_010337	GCC	2	6	2738	2743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
51	NC_010337	AGG	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628142
52	NC_010337	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010337	AGG	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010337	AGA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628143
55	NC_010337	GCT	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
56	NC_010337	CTG	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
57	NC_010337	GCC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
58	NC_010337	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
59	NC_010337	CCG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
60	NC_010337	GCT	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
61	NC_010337	CCG	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
62	NC_010337	CCG	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
63	NC_010337	CCG	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
64	NC_010337	CGC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
65	NC_010337	CGC	2	6	3422	3427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
66	NC_010337	GCT	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
67	NC_010337	CGC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
68	NC_010337	CGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
69	NC_010337	CCG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
70	NC_010337	GCT	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
71	NC_010337	GTC	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
72	NC_010337	GCC	2	6	3555	3560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
73	NC_010337	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
74	NC_010337	CGC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
75	NC_010337	GAA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628143
76	NC_010337	TGC	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
77	NC_010337	GCC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
78	NC_010337	ATC	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628143
79	NC_010337	TCA	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628143
80	NC_010337	GCC	2	6	3964	3969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
81	NC_010337	TCA	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628144
82	NC_010337	ACG	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628144
83	NC_010337	CGA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010337	AAT	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010337	CGC	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010337	CCG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628145
87	NC_010337	CGA	2	6	4605	4610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628145
88	NC_010337	TGG	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628145
89	NC_010337	GCC	2	6	4721	4726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628145
90	NC_010337	TCG	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
91	NC_010337	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628145
92	NC_010337	GTT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628145
93	NC_010337	CTT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628145
94	NC_010337	TGG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628145
95	NC_010337	TGC	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
96	NC_010337	CTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628145
97	NC_010337	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
98	NC_010337	GAA	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628145
99	NC_010337	GAA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628145
100	NC_010337	TGT	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628145
101	NC_010337	GCA	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628145
102	NC_010337	TGC	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
103	NC_010337	CGG	2	6	5463	5468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
104	NC_010337	GCG	2	6	5474	5479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
105	NC_010337	GCG	2	6	5522	5527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
106	NC_010337	ACC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628145
107	NC_010337	CAG	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628146
108	NC_010337	TCA	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628146
109	NC_010337	ACG	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628146
110	NC_010337	CCG	2	6	6133	6138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628146
111	NC_010337	CGA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010337	TAT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010337	GAC	2	6	6373	6378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628147
114	NC_010337	AGG	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628147
115	NC_010337	CAT	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628148
116	NC_010337	ATC	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628148
117	NC_010337	AGC	2	6	6736	6741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628148
118	NC_010337	GGC	2	6	6752	6757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628148
119	NC_010337	TGC	2	6	6792	6797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628148
120	NC_010337	CGG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628148
121	NC_010337	AGC	2	6	6860	6865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628148
122	NC_010337	GGT	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628148
123	NC_010337	CTG	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628148
124	NC_010337	GGA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628148
125	NC_010337	CGG	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628148
126	NC_010337	TCA	2	6	7303	7308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010337	TAA	2	6	7312	7317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010337	TCG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628149
129	NC_010337	GCT	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010337	GGA	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628150
131	NC_010337	TAC	2	6	8232	8237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628150
132	NC_010337	TTG	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628150
133	NC_010337	CTG	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628150
134	NC_010337	GAA	3	9	8546	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628150
135	NC_010337	TCC	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628150
136	NC_010337	GAT	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628150
137	NC_010337	CGG	2	6	8645	8650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628150
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140	NC_010337	CGA	2	6	8863	8868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628150
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146	NC_010337	GCT	2	6	9506	9511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628151
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152	NC_010337	ATT	2	6	9842	9847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010337	TGT	2	6	9848	9853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010337	CAG	2	6	9877	9882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_010337	TTC	2	6	10004	10009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010337	CGC	2	6	10067	10072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_010337	GCG	2	6	10096	10101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010337	TGT	2	6	10129	10134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628152
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162	NC_010337	GTT	2	6	10310	10315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628152
163	NC_010337	TCT	2	6	10333	10338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628152
164	NC_010337	AGG	2	6	10431	10436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628152
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174	NC_010337	AGG	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628152
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189	NC_010337	GTA	2	6	11855	11860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628152
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192	NC_010337	ACC	2	6	12275	12280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_010337	TAT	2	6	12407	12412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628153
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220	NC_010337	TTA	2	6	14911	14916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_010337	CAG	2	6	16777	16782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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247	NC_010337	CAT	2	6	16880	16885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_010337	CAC	2	6	16944	16949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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256	NC_010337	GAG	2	6	17561	17566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010337	GAC	2	6	17601	17606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628162
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263	NC_010337	CGG	2	6	18067	18072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628162
264	NC_010337	GAT	2	6	18215	18220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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