MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 66269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010337	CT	3	6	246030	246035	0 %	50 %	0 %	50 %	167628670
5003	NC_010337	CAGC	2	8	246036	246043	25 %	0 %	25 %	50 %	167628670
5004	NC_010337	CCA	2	6	246077	246082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628670
5005	NC_010337	GAT	2	6	246135	246140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628670
5006	NC_010337	CAC	2	6	246153	246158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628670
5007	NC_010337	CGG	2	6	246159	246164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628670
5008	NC_010337	GCC	2	6	246176	246181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628670
5009	NC_010337	AAC	2	6	246209	246214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167628670
5010	NC_010337	TCT	2	6	246227	246232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628670
5011	NC_010337	GC	3	6	246319	246324	0 %	0 %	50 %	50 %	167628670
5012	NC_010337	GCC	2	6	246344	246349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628670
5013	NC_010337	CCG	2	6	246416	246421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628670
5014	NC_010337	CGA	2	6	246446	246451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628670
5015	NC_010337	A	6	6	246471	246476	100 %	0 %	0 %	0 %	167628670
5016	NC_010337	CTG	2	6	246519	246524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628670
5017	NC_010337	CGC	2	6	246529	246534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628670
5018	NC_010337	CCT	2	6	246572	246577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628670
5019	NC_010337	GCGCC	2	10	246663	246672	0 %	0 %	40 %	60 %	167628670
5020	NC_010337	GTC	2	6	246693	246698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628670
5021	NC_010337	TCC	2	6	246790	246795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628670
5022	NC_010337	A	7	7	246814	246820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010337	GCG	2	6	246990	246995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628669
5024	NC_010337	ATC	2	6	247066	247071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628669
5025	NC_010337	GCGCCT	2	12	247076	247087	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167628669
5026	NC_010337	CG	3	6	247160	247165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_010337	GCG	2	6	247217	247222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628668
5028	NC_010337	GTTTTC	2	12	247228	247239	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167628668
5029	NC_010337	TGG	2	6	247243	247248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628668
5030	NC_010337	GTC	2	6	247273	247278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628668
5031	NC_010337	GCG	2	6	247280	247285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628668
5032	NC_010337	GAA	2	6	247604	247609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628667
5033	NC_010337	TCC	2	6	247650	247655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628667
5034	NC_010337	CCG	2	6	247663	247668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628667
5035	NC_010337	GCC	2	6	247686	247691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628667
5036	NC_010337	CAG	2	6	247700	247705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628667
5037	NC_010337	GCC	2	6	247728	247733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628667
5038	NC_010337	GACT	2	8	247734	247741	25 %	25 %	25 %	25 %	167628667
5039	NC_010337	CAG	2	6	247750	247755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628667
5040	NC_010337	TTC	2	6	247781	247786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628667
5041	NC_010337	GTC	2	6	247824	247829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628667
5042	NC_010337	TCCT	2	8	247841	247848	0 %	50 %	0 %	50 %	167628667
5043	NC_010337	TTG	2	6	247884	247889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628667
5044	NC_010337	TCG	2	6	247945	247950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628667
5045	NC_010337	T	6	6	248076	248081	0 %	100 %	0 %	0 %	167628667
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5048	NC_010337	GCG	2	6	248313	248318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_010337	CAT	2	6	248324	248329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_010337	CAC	2	6	248347	248352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_010337	T	6	6	248356	248361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010337	CAA	2	6	248491	248496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_010337	GT	3	6	248499	248504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010337	CAG	2	6	248528	248533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628666
5055	NC_010337	A	6	6	248613	248618	100 %	0 %	0 %	0 %	167628666
5056	NC_010337	CTT	2	6	248635	248640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628666
5057	NC_010337	TTC	2	6	248653	248658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628666
5058	NC_010337	ATG	2	6	248699	248704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628666
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5060	NC_010337	CTC	2	6	248781	248786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_010337	T	7	7	248876	248882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_010337	A	7	7	248912	248918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010337	AAAG	2	8	248950	248957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_010337	ATG	2	6	248962	248967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_010337	CAC	2	6	249014	249019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628665
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5067	NC_010337	CCTTT	2	10	249146	249155	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5068	NC_010337	GC	3	6	249330	249335	0 %	0 %	50 %	50 %	167628664
5069	NC_010337	AAG	2	6	249360	249365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628664
5070	NC_010337	GTC	2	6	249390	249395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628664
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5072	NC_010337	TCA	2	6	249448	249453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628664
5073	NC_010337	CCA	2	6	249490	249495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_010337	TCA	2	6	249527	249532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628663
5075	NC_010337	CCCA	2	8	249533	249540	25 %	0 %	0 %	75 %	167628663
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5082	NC_010337	ACGGG	2	10	249773	249782	20 %	0 %	60 %	20 %	167628663
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5089	NC_010337	CG	3	6	250047	250052	0 %	0 %	50 %	50 %	167628663
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5093	NC_010337	GCC	2	6	250113	250118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628663
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5095	NC_010337	CGGCG	2	10	250149	250158	0 %	0 %	60 %	40 %	167628663
5096	NC_010337	GCAG	2	8	250260	250267	25 %	0 %	50 %	25 %	167628663
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5099	NC_010337	GCCCC	2	10	250396	250405	0 %	0 %	20 %	80 %	167628663
5100	NC_010337	CGG	2	6	250637	250642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628663
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5103	NC_010337	GCCG	2	8	250921	250928	0 %	0 %	50 %	50 %	167628663
5104	NC_010337	TTGG	2	8	251040	251047	0 %	50 %	50 %	0 %	167628662
5105	NC_010337	TGG	2	6	251096	251101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628662
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5109	NC_010337	T	7	7	251486	251492	0 %	100 %	0 %	0 %	167628662
5110	NC_010337	GCG	2	6	251509	251514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628662
5111	NC_010337	CGT	2	6	251588	251593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628662
5112	NC_010337	GA	3	6	251667	251672	50 %	0 %	50 %	0 %	167628662
5113	NC_010337	GCT	2	6	251747	251752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628662
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5116	NC_010337	GAT	2	6	251906	251911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628662
5117	NC_010337	T	7	7	251936	251942	0 %	100 %	0 %	0 %	167628662
5118	NC_010337	CCT	2	6	251964	251969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_010337	A	8	8	251971	251978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010337	GGA	2	6	251993	251998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010337	GTCA	2	8	252000	252007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_010337	GGC	2	6	252061	252066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628661
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5124	NC_010337	CTT	2	6	252155	252160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628660
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5136	NC_010337	GTC	2	6	252567	252572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628659
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5230	NC_010337	TCG	2	6	256732	256737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628656
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5241	NC_010337	ATC	2	6	257348	257353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_010337	TCC	2	6	257375	257380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5243	NC_010337	CAT	2	6	257458	257463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_010337	AT	4	8	257502	257509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_010337	CAT	2	6	257568	257573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628654
5247	NC_010337	CGA	2	6	257576	257581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628654
5248	NC_010337	CAT	2	6	257621	257626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628654
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5289	NC_010337	A	6	6	260248	260253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5305	NC_010337	CTGG	2	8	261008	261015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5378	NC_010337	TGG	2	6	265386	265391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628648
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5386	NC_010337	AG	3	6	265918	265923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_010337	TGG	2	6	265955	265960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5412	NC_010337	ATT	2	6	267839	267844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5416	NC_010337	AG	3	6	268053	268058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5442	NC_010337	GAA	2	6	269976	269981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5482	NC_010337	CAA	2	6	272375	272380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5483	NC_010337	CA	3	6	272398	272403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5484	NC_010337	AGGC	2	8	272433	272440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5485	NC_010337	CCG	2	6	272458	272463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5486	NC_010337	CGC	2	6	272498	272503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5491	NC_010337	CGC	2	6	272800	272805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628644
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5494	NC_010337	GCG	2	6	272877	272882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628644
5495	NC_010337	TC	3	6	272912	272917	0 %	50 %	0 %	50 %	167628644
5496	NC_010337	GGC	2	6	273018	273023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628644
5497	NC_010337	CGT	2	6	273196	273201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628643
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5499	NC_010337	TCA	2	6	273229	273234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628643
5500	NC_010337	A	7	7	273272	273278	100 %	0 %	0 %	0 %	167628643

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