MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009973	CCT	2	6	193576	193581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901652
4002	NC_009973	AGG	2	6	193589	193594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901652
4003	NC_009973	TAC	2	6	193609	193614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4004	NC_009973	CAC	2	6	193660	193665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901652
4005	NC_009973	TTG	2	6	193715	193720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901652
4006	NC_009973	GGC	2	6	193754	193759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901652
4007	NC_009973	CAT	2	6	193774	193779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4008	NC_009973	ACT	3	9	193802	193810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4009	NC_009973	GCTT	2	8	193811	193818	0 %	50 %	25 %	25 %	159901652
4010	NC_009973	CAG	2	6	193835	193840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4011	NC_009973	TGCT	2	8	193970	193977	0 %	50 %	25 %	25 %	159901652
4012	NC_009973	TGC	2	6	194041	194046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4013	NC_009973	CTG	2	6	194111	194116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4014	NC_009973	TGC	2	6	194168	194173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4015	NC_009973	TTG	2	6	194187	194192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901652
4016	NC_009973	TTG	2	6	194309	194314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901652
4017	NC_009973	CCT	2	6	194368	194373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901652
4018	NC_009973	CAT	2	6	194470	194475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4019	NC_009973	TTG	2	6	194507	194512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901652
4020	NC_009973	CCT	2	6	194566	194571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901652
4021	NC_009973	TAC	2	6	194599	194604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4022	NC_009973	TTG	2	6	194705	194710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901652
4023	NC_009973	CCT	2	6	194764	194769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901652
4024	NC_009973	TAC	2	6	194797	194802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4025	NC_009973	TCT	2	6	194805	194810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901652
4026	NC_009973	GAC	2	6	194825	194830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4027	NC_009973	ATC	2	6	194834	194839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4028	NC_009973	A	7	7	194861	194867	100 %	0 %	0 %	0 %	159901652
4029	NC_009973	A	6	6	194894	194899	100 %	0 %	0 %	0 %	159901652
4030	NC_009973	TGCT	2	8	194900	194907	0 %	50 %	25 %	25 %	159901652
4031	NC_009973	GGT	2	6	194948	194953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901652
4032	NC_009973	GCA	2	6	194970	194975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901652
4033	NC_009973	CAT	2	6	194993	194998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901652
4034	NC_009973	CAA	2	6	195002	195007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901652
4035	NC_009973	CAA	2	6	195028	195033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901652
4036	NC_009973	T	6	6	195050	195055	0 %	100 %	0 %	0 %	159901652
4037	NC_009973	GA	4	8	195132	195139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009973	GCCC	2	8	195296	195303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4039	NC_009973	GAT	2	6	195503	195508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901653
4040	NC_009973	GCA	2	6	195609	195614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901653
4041	NC_009973	TGG	2	6	195624	195629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901653
4042	NC_009973	GTGG	2	8	195700	195707	0 %	25 %	75 %	0 %	159901653
4043	NC_009973	GCG	2	6	195886	195891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901653
4044	NC_009973	CGGGG	2	10	196047	196056	0 %	0 %	80 %	20 %	159901653
4045	NC_009973	GGAT	2	8	196111	196118	25 %	25 %	50 %	0 %	159901653
4046	NC_009973	G	7	7	196125	196131	0 %	0 %	100 %	0 %	159901653
4047	NC_009973	AT	3	6	196178	196183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_009973	ATA	2	6	196188	196193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009973	TACAG	2	10	196257	196266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_009973	A	6	6	196356	196361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009973	T	6	6	196418	196423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009973	AT	4	8	196445	196452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009973	TCC	2	6	196489	196494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_009973	TTA	2	6	196521	196526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009973	ATA	2	6	196559	196564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_009973	TAA	2	6	196596	196601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_009973	TAT	2	6	196615	196620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_009973	AAT	2	6	196625	196630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009973	AAT	2	6	196640	196645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_009973	ACTT	2	8	196646	196653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_009973	AAT	2	6	196654	196659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009973	ACA	2	6	196685	196690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_009973	ATTT	2	8	196742	196749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_009973	A	7	7	196760	196766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009973	AAT	2	6	196780	196785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009973	AATAGA	2	12	196831	196842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159901654
4067	NC_009973	ATT	2	6	196850	196855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901654
4068	NC_009973	ATA	2	6	196863	196868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901654
4069	NC_009973	ATT	2	6	196874	196879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901654
4070	NC_009973	AT	3	6	196917	196922	50 %	50 %	0 %	0 %	159901654
4071	NC_009973	CAT	2	6	196926	196931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901654
4072	NC_009973	TAA	2	6	196932	196937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901654
4073	NC_009973	CAT	2	6	196968	196973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901654
4074	NC_009973	AAG	2	6	196987	196992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901654
4075	NC_009973	CTT	2	6	197011	197016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901654
4076	NC_009973	TTAG	2	8	197047	197054	25 %	50 %	25 %	0 %	159901654
4077	NC_009973	T	6	6	197135	197140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_009973	T	6	6	197161	197166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009973	TAG	2	6	197169	197174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009973	TCT	2	6	197175	197180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_009973	C	7	7	197241	197247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4082	NC_009973	GAG	2	6	197279	197284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_009973	CATC	2	8	197428	197435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_009973	CAT	2	6	197467	197472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_009973	ATT	2	6	197531	197536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_009973	CAT	2	6	197753	197758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009973	TTGCT	2	10	197928	197937	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4088	NC_009973	ACC	2	6	197951	197956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_009973	CA	3	6	197960	197965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_009973	CAG	2	6	197970	197975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_009973	C	6	6	198033	198038	0 %	0 %	0 %	100 %	159901655
4093	NC_009973	CCGC	2	8	198060	198067	0 %	0 %	25 %	75 %	159901655
4094	NC_009973	CAGG	2	8	198071	198078	25 %	0 %	50 %	25 %	159901655
4095	NC_009973	CTG	3	9	198098	198106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4096	NC_009973	TGA	2	6	198112	198117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901655
4097	NC_009973	CA	3	6	198155	198160	50 %	0 %	0 %	50 %	159901655
4098	NC_009973	CGT	2	6	198175	198180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4099	NC_009973	CAA	2	6	198266	198271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901655
4100	NC_009973	GATACC	2	12	198302	198313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159901655
4101	NC_009973	TCGCC	2	10	198457	198466	0 %	20 %	20 %	60 %	159901655
4102	NC_009973	ACC	2	6	198498	198503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901655
4103	NC_009973	GCG	2	6	198509	198514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901655
4104	NC_009973	CAT	2	6	198529	198534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901655
4105	NC_009973	TGC	2	6	198538	198543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4106	NC_009973	ACCA	2	8	198620	198627	50 %	0 %	0 %	50 %	159901655
4107	NC_009973	CAT	2	6	198644	198649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901655
4108	NC_009973	GTC	2	6	198773	198778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4109	NC_009973	TGCC	2	8	198784	198791	0 %	25 %	25 %	50 %	159901655
4110	NC_009973	CAG	2	6	198796	198801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4111	NC_009973	TCA	2	6	198840	198845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901655
4112	NC_009973	CCG	2	6	198858	198863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901655
4113	NC_009973	TGG	2	6	199048	199053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901655
4114	NC_009973	GCA	2	6	199066	199071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4115	NC_009973	CCA	2	6	199097	199102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901655
4116	NC_009973	A	6	6	199245	199250	100 %	0 %	0 %	0 %	159901655
4117	NC_009973	GCA	2	6	199271	199276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901655
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4119	NC_009973	TCG	2	6	199323	199328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901655
4120	NC_009973	GGC	2	6	199345	199350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901655
4121	NC_009973	GCA	2	6	199367	199372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901655
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4123	NC_009973	AGT	2	6	199430	199435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901655
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4125	NC_009973	CAC	2	6	199478	199483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901655
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4248	NC_009973	AGC	2	6	205808	205813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901656
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4373	NC_009973	GGAT	2	8	211162	211169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_009973	GAT	2	6	211228	211233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_009973	CCT	2	6	211259	211264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4495	NC_009973	GAT	2	6	218245	218250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901660
4496	NC_009973	ACC	2	6	218277	218282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901660
4497	NC_009973	CGT	2	6	218296	218301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4498	NC_009973	GTC	2	6	218405	218410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4499	NC_009973	AAG	2	6	218414	218419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901660
4500	NC_009973	GATT	2	8	218462	218469	25 %	50 %	25 %	0 %	159901660

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