MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

< Previous1234567891011121314Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009973	ATT	2	6	99007	99012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901590
2002	NC_009973	CAG	2	6	99028	99033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901590
2003	NC_009973	GAT	2	6	99053	99058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901590
2004	NC_009973	CGC	2	6	99060	99065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901590
2005	NC_009973	ATG	2	6	99072	99077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901590
2006	NC_009973	TCCG	2	8	99096	99103	0 %	25 %	25 %	50 %	159901590
2007	NC_009973	TCA	2	6	99109	99114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901590
2008	NC_009973	ATG	2	6	99212	99217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901590
2009	NC_009973	GCGG	2	8	99264	99271	0 %	0 %	75 %	25 %	159901590
2010	NC_009973	ATT	2	6	99452	99457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901590
2011	NC_009973	ATT	2	6	99497	99502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901590
2012	NC_009973	ATG	2	6	99522	99527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901590
2013	NC_009973	TGG	2	6	99544	99549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901590
2014	NC_009973	CCTT	2	8	99579	99586	0 %	50 %	0 %	50 %	159901590
2015	NC_009973	CGC	2	6	99589	99594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901590
2016	NC_009973	TTGG	2	8	99686	99693	0 %	50 %	50 %	0 %	159901590
2017	NC_009973	ATG	2	6	99824	99829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901591
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2041	NC_009973	GAT	2	6	101111	101116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901592
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2044	NC_009973	GTCG	2	8	101298	101305	0 %	25 %	50 %	25 %	159901593
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2053	NC_009973	GAT	2	6	101645	101650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901593
2054	NC_009973	ATG	2	6	101725	101730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901593
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2056	NC_009973	TTA	2	6	101809	101814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_009973	AG	3	6	101892	101897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_009973	TGG	2	6	101951	101956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_009973	CGC	2	6	102087	102092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2063	NC_009973	CGC	2	6	102172	102177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2064	NC_009973	CGATC	2	10	102222	102231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2097	NC_009973	T	6	6	106211	106216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_009973	GAC	2	6	106288	106293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_009973	AAC	2	6	106302	106307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2107	NC_009973	AC	3	6	106786	106791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2108	NC_009973	AGGC	2	8	106873	106880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2109	NC_009973	GCG	2	6	106881	106886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_009973	AC	3	6	106930	106935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2111	NC_009973	ATC	2	6	107008	107013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2256	NC_009973	ACC	2	6	115224	115229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901599
2257	NC_009973	TGC	2	6	115308	115313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901599
2258	NC_009973	AAC	2	6	115397	115402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901599
2259	NC_009973	ACC	2	6	115436	115441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901599
2260	NC_009973	CAGGAT	2	12	115457	115468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159901599
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2262	NC_009973	GTT	2	6	115519	115524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901599
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2266	NC_009973	TGAGG	2	10	115621	115630	20 %	20 %	60 %	0 %	159901599
2267	NC_009973	TGA	2	6	115690	115695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901599
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2269	NC_009973	TGA	2	6	115804	115809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901599
2270	NC_009973	CAT	2	6	115828	115833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901599
2271	NC_009973	CAT	2	6	115856	115861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901599
2272	NC_009973	A	7	7	115864	115870	100 %	0 %	0 %	0 %	159901599
2273	NC_009973	AACG	2	8	115925	115932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2274	NC_009973	TGAT	2	8	115968	115975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_009973	GGGC	3	12	116061	116072	0 %	0 %	75 %	25 %	159901600
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2281	NC_009973	A	6	6	116415	116420	100 %	0 %	0 %	0 %	159901600
2282	NC_009973	TGA	2	6	116467	116472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901600
2283	NC_009973	ATC	2	6	116500	116505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901600
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2287	NC_009973	AGGA	2	8	116748	116755	50 %	0 %	50 %	0 %	159901601
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2322	NC_009973	CAG	2	6	118413	118418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901601
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2329	NC_009973	CGTT	2	8	118992	118999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2330	NC_009973	ACCAA	2	10	119007	119016	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2340	NC_009973	AGA	2	6	119384	119389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2352	NC_009973	GTC	2	6	119943	119948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901602
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2369	NC_009973	GGC	2	6	120798	120803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901603
2370	NC_009973	TCAA	2	8	120814	120821	50 %	25 %	0 %	25 %	159901603
2371	NC_009973	GGTTTG	2	12	120834	120845	0 %	50 %	50 %	0 %	159901603
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2377	NC_009973	TGC	2	6	121107	121112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901603
2378	NC_009973	GCA	2	6	121138	121143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901603
2379	NC_009973	ACA	2	6	121175	121180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901603
2380	NC_009973	TGC	2	6	121242	121247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901603
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