MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009973	GAA	3	9	25960	25968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901531
502	NC_009973	GAC	3	9	25975	25983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901531
503	NC_009973	CCG	2	6	26030	26035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901531
504	NC_009973	CGC	2	6	26104	26109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901531
505	NC_009973	TGC	2	6	26150	26155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901531
506	NC_009973	CAG	2	6	26179	26184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901531
507	NC_009973	ATGC	2	8	26259	26266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_009973	T	6	6	26351	26356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009973	ATGGC	2	10	26378	26387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
510	NC_009973	CCA	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_009973	CCA	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_009973	CAG	2	6	26561	26566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009973	GGT	2	6	26619	26624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009973	ACG	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009973	GAG	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009973	ATT	2	6	26691	26696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009973	GAC	2	6	26819	26824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009973	CAT	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009973	CAG	3	9	26840	26848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009973	CCAT	2	8	26849	26856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_009973	CAG	2	6	26919	26924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009973	TCG	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009973	GAT	2	6	27027	27032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009973	GAC	2	6	27073	27078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901532
525	NC_009973	TGC	2	6	27114	27119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901532
526	NC_009973	ACCC	2	8	27122	27129	25 %	0 %	0 %	75 %	159901532
527	NC_009973	GCG	2	6	27152	27157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901532
528	NC_009973	A	6	6	27185	27190	100 %	0 %	0 %	0 %	159901532
529	NC_009973	CAG	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009973	CGG	2	6	27315	27320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_009973	TTG	2	6	27353	27358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009973	AGGG	2	8	27390	27397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009973	CGG	3	9	27438	27446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009973	ATA	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009973	TTA	2	6	27491	27496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009973	TC	3	6	27576	27581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_009973	CAA	2	6	27617	27622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009973	AG	3	6	27632	27637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009973	GTG	2	6	27699	27704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009973	GT	3	6	27710	27715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009973	GCG	2	6	27725	27730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009973	AGG	2	6	27791	27796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009973	TTC	2	6	27798	27803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009973	GAT	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009973	GGT	2	6	27944	27949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009973	GCTG	2	8	27968	27975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_009973	CT	3	6	27989	27994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_009973	GAG	2	6	28014	28019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009973	GAT	2	6	28030	28035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901533
550	NC_009973	GAT	2	6	28055	28060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901533
551	NC_009973	CTG	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901533
552	NC_009973	GCC	2	6	28127	28132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901533
553	NC_009973	GA	3	6	28201	28206	50 %	0 %	50 %	0 %	159901533
554	NC_009973	CCG	2	6	28246	28251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901533
555	NC_009973	GTG	2	6	28265	28270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901533
556	NC_009973	GCG	2	6	28301	28306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901533
557	NC_009973	GAA	2	6	28313	28318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901533
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559	NC_009973	CAA	2	6	28455	28460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901533
560	NC_009973	TC	3	6	28494	28499	0 %	50 %	0 %	50 %	159901533
561	NC_009973	ACGG	2	8	28552	28559	25 %	0 %	50 %	25 %	159901533
562	NC_009973	CTA	2	6	28561	28566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901533
563	NC_009973	AC	3	6	28572	28577	50 %	0 %	0 %	50 %	159901533
564	NC_009973	CCG	2	6	28588	28593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901533
565	NC_009973	TGC	2	6	28600	28605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901533
566	NC_009973	CAT	2	6	28727	28732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901533
567	NC_009973	GGC	2	6	28746	28751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901533
568	NC_009973	CGC	2	6	28770	28775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901533
569	NC_009973	C	6	6	28793	28798	0 %	0 %	0 %	100 %	159901533
570	NC_009973	GGC	2	6	28804	28809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901533
571	NC_009973	GT	3	6	28813	28818	0 %	50 %	50 %	0 %	159901533
572	NC_009973	TGG	2	6	28824	28829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901533
573	NC_009973	AT	3	6	28885	28890	50 %	50 %	0 %	0 %	159901533
574	NC_009973	AATC	2	8	28900	28907	50 %	25 %	0 %	25 %	159901533
575	NC_009973	CACC	2	8	28987	28994	25 %	0 %	0 %	75 %	159901533
576	NC_009973	GAGG	2	8	29021	29028	25 %	0 %	75 %	0 %	159901533
577	NC_009973	CCT	2	6	29038	29043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901533
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579	NC_009973	GGA	2	6	29082	29087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009973	ATG	2	6	29186	29191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009973	GCT	2	6	29217	29222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009973	CGC	2	6	29264	29269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_009973	GTG	2	6	29323	29328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901534
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589	NC_009973	TGA	2	6	29693	29698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901534
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592	NC_009973	GT	3	6	29822	29827	0 %	50 %	50 %	0 %	159901534
593	NC_009973	CA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	0 %	50 %	159901534
594	NC_009973	ATGGAG	2	12	30178	30189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009973	TATG	2	8	30238	30245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009973	CAAG	2	8	30262	30269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_009973	TGA	2	6	30339	30344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009973	CACG	2	8	30414	30421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_009973	TTGTC	2	10	30452	30461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_009973	GGA	2	6	30514	30519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009973	TGT	2	6	30550	30555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009973	GCTG	2	8	30616	30623	0 %	25 %	50 %	25 %	159901535
603	NC_009973	GCT	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901535
604	NC_009973	CAT	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901535
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610	NC_009973	CGCA	2	8	30894	30901	25 %	0 %	25 %	50 %	159901535
611	NC_009973	TGGC	2	8	30923	30930	0 %	25 %	50 %	25 %	159901535
612	NC_009973	GCA	2	6	30938	30943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901535
613	NC_009973	CGC	2	6	30960	30965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901535
614	NC_009973	TGG	2	6	30997	31002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901535
615	NC_009973	GGT	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901535
616	NC_009973	TTC	2	6	31089	31094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901535
617	NC_009973	CGA	2	6	31118	31123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901535
618	NC_009973	CTT	2	6	31128	31133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901535
619	NC_009973	GCG	2	6	31145	31150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901535
620	NC_009973	CAA	2	6	31229	31234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901535
621	NC_009973	ATCC	2	8	31248	31255	25 %	25 %	0 %	50 %	159901535
622	NC_009973	ACC	2	6	31339	31344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901535
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624	NC_009973	TGG	2	6	31540	31545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009973	T	6	6	31568	31573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009973	TAGGA	2	10	31621	31630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009973	CAA	2	6	31698	31703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901536
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631	NC_009973	GAA	2	6	31911	31916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901536
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633	NC_009973	CGG	2	6	32004	32009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901536
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