MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 4114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009972	GT	3	6	252	257	0 %	50 %	50 %	0 %	159896534
2	NC_009972	CG	3	6	4333	4338	0 %	0 %	50 %	50 %	159896536
3	NC_009972	CT	3	6	5934	5939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009972	AG	3	6	6007	6012	50 %	0 %	50 %	0 %	159896538
5	NC_009972	CA	3	6	8794	8799	50 %	0 %	0 %	50 %	159896540
6	NC_009972	AC	3	6	11288	11293	50 %	0 %	0 %	50 %	159896543
7	NC_009972	CT	3	6	12486	12491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009972	CT	3	6	12576	12581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009972	AT	3	6	16887	16892	50 %	50 %	0 %	0 %	159896547
10	NC_009972	CG	3	6	18769	18774	0 %	0 %	50 %	50 %	159896548
11	NC_009972	GT	3	6	20125	20130	0 %	50 %	50 %	0 %	159896549
12	NC_009972	GT	3	6	20671	20676	0 %	50 %	50 %	0 %	159896549
13	NC_009972	AC	3	6	21002	21007	50 %	0 %	0 %	50 %	159896550
14	NC_009972	AC	3	6	21386	21391	50 %	0 %	0 %	50 %	159896550
15	NC_009972	GT	3	6	22038	22043	0 %	50 %	50 %	0 %	159896551
16	NC_009972	TA	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	159896555
17	NC_009972	AT	3	6	29222	29227	50 %	50 %	0 %	0 %	159896556
18	NC_009972	TC	3	6	29240	29245	0 %	50 %	0 %	50 %	159896556
19	NC_009972	AC	3	6	33514	33519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009972	GT	3	6	36091	36096	0 %	50 %	50 %	0 %	159896561
21	NC_009972	TC	3	6	37839	37844	0 %	50 %	0 %	50 %	159896562
22	NC_009972	GT	3	6	39743	39748	0 %	50 %	50 %	0 %	159896564
23	NC_009972	TA	4	8	39838	39845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009972	GA	3	6	44197	44202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009972	TC	3	6	45382	45387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009972	TG	3	6	46647	46652	0 %	50 %	50 %	0 %	159896570
27	NC_009972	TC	3	6	47207	47212	0 %	50 %	0 %	50 %	159896570
28	NC_009972	TG	3	6	48150	48155	0 %	50 %	50 %	0 %	159896571
29	NC_009972	CA	3	6	50070	50075	50 %	0 %	0 %	50 %	159896573
30	NC_009972	TC	3	6	51380	51385	0 %	50 %	0 %	50 %	159896574
31	NC_009972	AG	3	6	51608	51613	50 %	0 %	50 %	0 %	159896574
32	NC_009972	GA	3	6	60890	60895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009972	TG	3	6	61133	61138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009972	TA	3	6	61467	61472	50 %	50 %	0 %	0 %	159896579
35	NC_009972	GT	3	6	62319	62324	0 %	50 %	50 %	0 %	159896580
36	NC_009972	GA	3	6	65723	65728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009972	AT	3	6	67972	67977	50 %	50 %	0 %	0 %	159896585
38	NC_009972	TG	3	6	69087	69092	0 %	50 %	50 %	0 %	159896586
39	NC_009972	GT	3	6	78305	78310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009972	CT	3	6	78568	78573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009972	TC	3	6	78614	78619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009972	GT	3	6	79603	79608	0 %	50 %	50 %	0 %	159896595
43	NC_009972	CG	3	6	80982	80987	0 %	0 %	50 %	50 %	159896596
44	NC_009972	CT	3	6	87108	87113	0 %	50 %	0 %	50 %	159896600
45	NC_009972	TC	3	6	87250	87255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009972	TG	3	6	87469	87474	0 %	50 %	50 %	0 %	159896601
47	NC_009972	TG	3	6	88134	88139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009972	CG	3	6	88959	88964	0 %	0 %	50 %	50 %	159896602
49	NC_009972	GT	3	6	92286	92291	0 %	50 %	50 %	0 %	159896603
50	NC_009972	GT	3	6	92393	92398	0 %	50 %	50 %	0 %	159896603
51	NC_009972	CG	3	6	98299	98304	0 %	0 %	50 %	50 %	159896608
52	NC_009972	TG	4	8	98432	98439	0 %	50 %	50 %	0 %	159896608
53	NC_009972	TG	3	6	102022	102027	0 %	50 %	50 %	0 %	159896611
54	NC_009972	AG	3	6	102384	102389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009972	TA	3	6	104446	104451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009972	TG	3	6	104556	104561	0 %	50 %	50 %	0 %	159896613
57	NC_009972	GA	3	6	107131	107136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009972	AT	3	6	108917	108922	50 %	50 %	0 %	0 %	159896616
59	NC_009972	AT	3	6	111540	111545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009972	AC	3	6	111678	111683	50 %	0 %	0 %	50 %	159896619
61	NC_009972	AG	3	6	113028	113033	50 %	0 %	50 %	0 %	159896620
62	NC_009972	AC	3	6	113072	113077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009972	AT	3	6	115127	115132	50 %	50 %	0 %	0 %	159896623
64	NC_009972	CG	3	6	115554	115559	0 %	0 %	50 %	50 %	159896623
65	NC_009972	CT	3	6	115752	115757	0 %	50 %	0 %	50 %	159896623
66	NC_009972	CG	3	6	119214	119219	0 %	0 %	50 %	50 %	159896625
67	NC_009972	TC	3	6	120190	120195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009972	AT	3	6	121661	121666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009972	CG	3	6	123038	123043	0 %	0 %	50 %	50 %	159896629
70	NC_009972	GT	3	6	123360	123365	0 %	50 %	50 %	0 %	159896629
71	NC_009972	TG	3	6	125159	125164	0 %	50 %	50 %	0 %	159896629
72	NC_009972	AT	3	6	129935	129940	50 %	50 %	0 %	0 %	159896633
73	NC_009972	CA	3	6	131423	131428	50 %	0 %	0 %	50 %	159896634
74	NC_009972	CA	3	6	131844	131849	50 %	0 %	0 %	50 %	159896635
75	NC_009972	AC	3	6	134163	134168	50 %	0 %	0 %	50 %	159896636
76	NC_009972	AC	3	6	135216	135221	50 %	0 %	0 %	50 %	159896636
77	NC_009972	GA	3	6	136345	136350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_009972	CG	3	6	143793	143798	0 %	0 %	50 %	50 %	159896643
82	NC_009972	CG	3	6	146166	146171	0 %	0 %	50 %	50 %	159896646
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84	NC_009972	AT	3	6	147041	147046	50 %	50 %	0 %	0 %	159896647
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90	NC_009972	CG	3	6	165180	165185	0 %	0 %	50 %	50 %	159896666
91	NC_009972	AC	3	6	165981	165986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009972	TC	3	6	166316	166321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009972	TA	3	6	169541	169546	50 %	50 %	0 %	0 %	159896669
94	NC_009972	AT	3	6	170028	170033	50 %	50 %	0 %	0 %	159896669
95	NC_009972	TG	3	6	171122	171127	0 %	50 %	50 %	0 %	159896670
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102	NC_009972	AT	3	6	181403	181408	50 %	50 %	0 %	0 %	159896683
103	NC_009972	AT	3	6	181550	181555	50 %	50 %	0 %	0 %	159896683
104	NC_009972	GT	3	6	183549	183554	0 %	50 %	50 %	0 %	159896686
105	NC_009972	CG	3	6	184270	184275	0 %	0 %	50 %	50 %	159896686
106	NC_009972	TG	3	6	186567	186572	0 %	50 %	50 %	0 %	159896688
107	NC_009972	TG	3	6	187146	187151	0 %	50 %	50 %	0 %	159896689
108	NC_009972	TA	3	6	196185	196190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009972	GT	3	6	197077	197082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009972	AC	3	6	198462	198467	50 %	0 %	0 %	50 %	159896699
111	NC_009972	GT	3	6	199454	199459	0 %	50 %	50 %	0 %	159896701
112	NC_009972	TC	3	6	201832	201837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009972	GT	3	6	205389	205394	0 %	50 %	50 %	0 %	159896708
114	NC_009972	GT	3	6	205678	205683	0 %	50 %	50 %	0 %	159896708
115	NC_009972	CA	3	6	206905	206910	50 %	0 %	0 %	50 %	159896709
116	NC_009972	TG	3	6	209472	209477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009972	AT	3	6	212126	212131	50 %	50 %	0 %	0 %	159896716
118	NC_009972	CA	4	8	212754	212761	50 %	0 %	0 %	50 %	159896716
119	NC_009972	TA	3	6	213638	213643	50 %	50 %	0 %	0 %	159896717
120	NC_009972	AT	3	6	222259	222264	50 %	50 %	0 %	0 %	159896723
121	NC_009972	TG	3	6	224460	224465	0 %	50 %	50 %	0 %	159896725
122	NC_009972	TA	3	6	226598	226603	50 %	50 %	0 %	0 %	159896727
123	NC_009972	AC	3	6	228443	228448	50 %	0 %	0 %	50 %	159896728
124	NC_009972	AG	3	6	231544	231549	50 %	0 %	50 %	0 %	159896729
125	NC_009972	CG	3	6	232319	232324	0 %	0 %	50 %	50 %	159896729
126	NC_009972	AT	3	6	233425	233430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009972	CG	3	6	235360	235365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009972	AT	3	6	235759	235764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009972	AT	3	6	235801	235806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_009972	GT	3	6	236864	236869	0 %	50 %	50 %	0 %	159896734
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133	NC_009972	CG	3	6	240260	240265	0 %	0 %	50 %	50 %	159896738
134	NC_009972	AT	3	6	243525	243530	50 %	50 %	0 %	0 %	159896741
135	NC_009972	CT	3	6	246826	246831	0 %	50 %	0 %	50 %	159896744
136	NC_009972	CG	3	6	248921	248926	0 %	0 %	50 %	50 %	159896747
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139	NC_009972	GA	3	6	253213	253218	50 %	0 %	50 %	0 %	159896751
140	NC_009972	AG	3	6	255809	255814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009972	TC	3	6	255994	255999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009972	GA	3	6	256017	256022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009972	AC	3	6	258836	258841	50 %	0 %	0 %	50 %	159896754
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