MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 126959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009972	TTC	2	6	153673	153678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896651
3002	NC_009972	GAC	2	6	153708	153713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896651
3003	NC_009972	ACA	2	6	153770	153775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896651
3004	NC_009972	CAG	2	6	153965	153970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_009972	ATT	2	6	154001	154006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009972	AAAG	2	8	154048	154055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009972	TGA	2	6	154152	154157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896652
3008	NC_009972	AGT	2	6	154203	154208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896652
3009	NC_009972	GCA	2	6	154246	154251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_009972	TCA	2	6	154260	154265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_009972	TGG	2	6	154274	154279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896653
3012	NC_009972	AGA	2	6	154290	154295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896653
3013	NC_009972	AGA	2	6	154299	154304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896653
3014	NC_009972	GTT	2	6	154422	154427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896653
3015	NC_009972	AAT	2	6	154487	154492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896653
3016	NC_009972	CCG	2	6	154496	154501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_009972	GAA	3	9	154529	154537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896654
3018	NC_009972	ACT	2	6	154544	154549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896654
3019	NC_009972	GAA	2	6	154679	154684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896654
3020	NC_009972	A	7	7	154722	154728	100 %	0 %	0 %	0 %	159896654
3021	NC_009972	CGA	2	6	154768	154773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896654
3022	NC_009972	GAA	2	6	154853	154858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896654
3023	NC_009972	GAA	3	9	154883	154891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896654
3024	NC_009972	GAA	2	6	154988	154993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896654
3025	NC_009972	GCGCGT	2	12	154999	155010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159896654
3026	NC_009972	AAAG	2	8	155124	155131	75 %	0 %	25 %	0 %	159896655
3027	NC_009972	CTG	2	6	155159	155164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896655
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3029	NC_009972	A	6	6	155249	155254	100 %	0 %	0 %	0 %	159896655
3030	NC_009972	ATT	2	6	155275	155280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896655
3031	NC_009972	CTG	2	6	155339	155344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896655
3032	NC_009972	TTG	2	6	155350	155355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896655
3033	NC_009972	GCT	2	6	155362	155367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896655
3034	NC_009972	GCC	2	6	155485	155490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896655
3035	NC_009972	A	6	6	155492	155497	100 %	0 %	0 %	0 %	159896655
3036	NC_009972	CGCT	2	8	155511	155518	0 %	25 %	25 %	50 %	159896655
3037	NC_009972	TTAAA	2	10	155641	155650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009972	TGT	2	6	155698	155703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009972	A	6	6	155767	155772	100 %	0 %	0 %	0 %	159896656
3040	NC_009972	GCT	2	6	155779	155784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896656
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3042	NC_009972	TCGC	2	8	156008	156015	0 %	25 %	25 %	50 %	159896656
3043	NC_009972	TCG	2	6	156032	156037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896656
3044	NC_009972	GCG	2	6	156038	156043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896656
3045	NC_009972	ATG	2	6	156112	156117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896656
3046	NC_009972	GGTC	2	8	156123	156130	0 %	25 %	50 %	25 %	159896656
3047	NC_009972	CCT	2	6	156193	156198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159896656
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3050	NC_009972	GCT	2	6	156352	156357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896656
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3052	NC_009972	AATT	2	8	156596	156603	50 %	50 %	0 %	0 %	159896657
3053	NC_009972	CAG	2	6	156628	156633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896657
3054	NC_009972	CAC	2	6	156680	156685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896657
3055	NC_009972	CGC	2	6	156689	156694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896657
3056	NC_009972	TTC	2	6	156698	156703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896657
3057	NC_009972	CAG	2	6	156799	156804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896657
3058	NC_009972	CTGC	2	8	156868	156875	0 %	25 %	25 %	50 %	159896657
3059	NC_009972	TGC	2	6	156898	156903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896657
3060	NC_009972	ACT	2	6	156939	156944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896657
3061	NC_009972	CGC	2	6	156949	156954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896657
3062	NC_009972	CGG	2	6	157009	157014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896657
3063	NC_009972	GCG	2	6	157034	157039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896657
3064	NC_009972	TCT	2	6	157095	157100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896657
3065	NC_009972	GCC	2	6	157161	157166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896657
3066	NC_009972	GTG	2	6	157170	157175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896657
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3068	NC_009972	TAA	2	6	157371	157376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009972	CAT	2	6	157401	157406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_009972	CAA	2	6	157483	157488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896658
3071	NC_009972	CAA	2	6	157561	157566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896658
3072	NC_009972	CAA	2	6	157573	157578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896658
3073	NC_009972	GAG	2	6	157585	157590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159896658
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3081	NC_009972	CGAT	2	8	157922	157929	25 %	25 %	25 %	25 %	159896658
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3085	NC_009972	GAA	2	6	158038	158043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896658
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3088	NC_009972	ATC	2	6	158393	158398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896658
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3090	NC_009972	TTGA	2	8	158482	158489	25 %	50 %	25 %	0 %	159896658
3091	NC_009972	AAG	2	6	158495	158500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896658
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3093	NC_009972	TTC	2	6	158650	158655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896658
3094	NC_009972	TGC	2	6	158681	158686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896658
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3096	NC_009972	GGCGC	2	10	158766	158775	0 %	0 %	60 %	40 %	159896658
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3099	NC_009972	CGG	2	6	158894	158899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896659
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3102	NC_009972	GCGT	2	8	159040	159047	0 %	25 %	50 %	25 %	159896659
3103	NC_009972	TTA	2	6	159070	159075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896659
3104	NC_009972	ATGGA	2	10	159133	159142	40 %	20 %	40 %	0 %	159896659
3105	NC_009972	CTT	2	6	159147	159152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896660
3106	NC_009972	GCTTGG	2	12	159188	159199	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159896660
3107	NC_009972	TGC	2	6	159272	159277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896660
3108	NC_009972	CTG	2	6	159310	159315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896660
3109	NC_009972	GCG	2	6	159387	159392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896660
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3114	NC_009972	ACG	2	6	159755	159760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896661
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3119	NC_009972	CGG	2	6	159931	159936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896661
3120	NC_009972	AAC	2	6	160052	160057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896661
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3122	NC_009972	ATT	3	9	160104	160112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896661
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3242	NC_009972	T	7	7	165607	165613	0 %	100 %	0 %	0 %	159896667
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3248	NC_009972	AC	3	6	165981	165986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3493	NC_009972	CAT	2	6	178586	178591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_009972	AAT	2	6	178713	178718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_009972	A	6	6	178802	178807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_009972	ACA	2	6	178875	178880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896680
3497	NC_009972	AGC	2	6	178943	178948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896680
3498	NC_009972	GGC	2	6	178955	178960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896680
3499	NC_009972	GTC	2	6	179020	179025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896680
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