MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 126959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009972	GCC	2	6	252070	252075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5002	NC_009972	CGC	3	9	252179	252187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5003	NC_009972	TTGG	2	8	252192	252199	0 %	50 %	50 %	0 %	159896751
5004	NC_009972	CAAA	2	8	252269	252276	75 %	0 %	0 %	25 %	159896751
5005	NC_009972	CGC	2	6	252533	252538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5006	NC_009972	TGG	2	6	252548	252553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896751
5007	NC_009972	GTT	2	6	252566	252571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896751
5008	NC_009972	ATCA	2	8	252588	252595	50 %	25 %	0 %	25 %	159896751
5009	NC_009972	GCC	3	9	252613	252621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5010	NC_009972	GATC	2	8	252728	252735	25 %	25 %	25 %	25 %	159896751
5011	NC_009972	GCC	2	6	252744	252749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5012	NC_009972	GCC	2	6	252763	252768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896751
5013	NC_009972	CGT	2	6	252826	252831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896751
5014	NC_009972	TTG	2	6	252849	252854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896751
5015	NC_009972	CTT	2	6	252887	252892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896751
5016	NC_009972	CTT	2	6	252929	252934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896751
5017	NC_009972	AGCCA	2	10	253011	253020	40 %	0 %	20 %	40 %	159896751
5018	NC_009972	AAT	2	6	253041	253046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896751
5019	NC_009972	GAT	2	6	253125	253130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896751
5020	NC_009972	TAA	2	6	253178	253183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896751
5021	NC_009972	TCA	2	6	253201	253206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896751
5022	NC_009972	A	6	6	253206	253211	100 %	0 %	0 %	0 %	159896751
5023	NC_009972	GA	3	6	253213	253218	50 %	0 %	50 %	0 %	159896751
5024	NC_009972	CAT	2	6	253244	253249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896751
5025	NC_009972	GCA	2	6	253322	253327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896751
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5028	NC_009972	GCAA	2	8	253351	253358	50 %	0 %	25 %	25 %	159896751
5029	NC_009972	CAAGCC	2	12	253440	253451	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159896751
5030	NC_009972	GTTTT	2	10	253672	253681	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009972	T	6	6	253678	253683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009972	TGC	2	6	253732	253737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896752
5033	NC_009972	CGTG	2	8	253748	253755	0 %	25 %	50 %	25 %	159896752
5034	NC_009972	GAT	2	6	253788	253793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896752
5035	NC_009972	GTG	2	6	253840	253845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896752
5036	NC_009972	TTG	2	6	253872	253877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896752
5037	NC_009972	ATC	2	6	253917	253922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896752
5038	NC_009972	AAG	2	6	253948	253953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896752
5039	NC_009972	GGCGTT	2	12	253970	253981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159896752
5040	NC_009972	GAT	2	6	254013	254018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896752
5041	NC_009972	GGC	2	6	254073	254078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896752
5042	NC_009972	GAT	2	6	254166	254171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896752
5043	NC_009972	GCT	2	6	254191	254196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896752
5044	NC_009972	ATCA	2	8	254223	254230	50 %	25 %	0 %	25 %	159896752
5045	NC_009972	GTT	2	6	254281	254286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896752
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5053	NC_009972	AAT	2	6	254870	254875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896752
5054	NC_009972	CAA	2	6	254883	254888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896752
5055	NC_009972	CAAC	2	8	254918	254925	50 %	0 %	0 %	50 %	159896752
5056	NC_009972	GGCGA	2	10	254938	254947	20 %	0 %	60 %	20 %	159896752
5057	NC_009972	CAT	2	6	255026	255031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896752
5058	NC_009972	TGG	2	6	255032	255037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896752
5059	NC_009972	CATCA	2	10	255045	255054	40 %	20 %	0 %	40 %	159896752
5060	NC_009972	GTTG	2	8	255058	255065	0 %	50 %	50 %	0 %	159896752
5061	NC_009972	GAG	2	6	255154	255159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159896752
5062	NC_009972	CAA	2	6	255203	255208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896752
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5068	NC_009972	AAT	2	6	255333	255338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896752
5069	NC_009972	CCA	2	6	255339	255344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896752
5070	NC_009972	CTG	2	6	255469	255474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_009972	AGAT	2	8	255535	255542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_009972	GTT	2	6	255554	255559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_009972	CAA	2	6	255630	255635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_009972	TTC	2	6	255697	255702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_009972	CGG	2	6	255717	255722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_009972	GAATA	2	10	255744	255753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_009972	CAA	2	6	255756	255761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_009972	AAC	2	6	255767	255772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_009972	AG	3	6	255809	255814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009972	GTA	2	6	255897	255902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_009972	GA	3	6	256017	256022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_009972	TTAG	2	8	256033	256040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_009972	TGA	2	6	256430	256435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896753
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5095	NC_009972	GAGCAA	2	12	256644	256655	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	159896753
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5099	NC_009972	CGA	2	6	256755	256760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896753
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5102	NC_009972	CAA	2	6	257023	257028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896753
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5104	NC_009972	CTG	2	6	257203	257208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_009972	GCG	2	6	257279	257284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896754
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5107	NC_009972	TGG	2	6	257404	257409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896754
5108	NC_009972	CAG	2	6	257446	257451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896754
5109	NC_009972	T	6	6	257529	257534	0 %	100 %	0 %	0 %	159896754
5110	NC_009972	CAAA	2	8	257569	257576	75 %	0 %	0 %	25 %	159896754
5111	NC_009972	TCG	2	6	257609	257614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896754
5112	NC_009972	GAT	2	6	257617	257622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896754
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5117	NC_009972	GGT	2	6	257791	257796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896754
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5119	NC_009972	TTA	2	6	257813	257818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896754
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5123	NC_009972	CTGA	2	8	258095	258102	25 %	25 %	25 %	25 %	159896754
5124	NC_009972	ATC	2	6	258139	258144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896754
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5127	NC_009972	GTTG	2	8	258230	258237	0 %	50 %	50 %	0 %	159896754
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5242	NC_009972	TTA	2	6	263722	263727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896761
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5244	NC_009972	GTTG	3	12	263748	263759	0 %	50 %	50 %	0 %	159896761
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