MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009567	GTT	2	6	350	355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009567	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826758
4	NC_009567	CAG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826758
5	NC_009567	GTT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
6	NC_009567	GTT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
7	NC_009567	TGG	3	9	841	849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
8	NC_009567	GGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
9	NC_009567	GTA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826759
10	NC_009567	GGT	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
11	NC_009567	GCA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
12	NC_009567	GAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826759
13	NC_009567	GTT	3	9	1019	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
14	NC_009567	CAG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
15	NC_009567	TTG	2	6	1071	1076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
16	NC_009567	GGC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826759
17	NC_009567	AAT	2	6	1359	1364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009567	GAT	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009567	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009567	TTA	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009567	TTA	2	6	1527	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009567	TGA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826760
23	NC_009567	AAC	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
24	NC_009567	CTA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
25	NC_009567	TCT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
26	NC_009567	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826760
27	NC_009567	GTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826760
28	NC_009567	AAT	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
29	NC_009567	ATC	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
30	NC_009567	AAC	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
31	NC_009567	TCT	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
32	NC_009567	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
33	NC_009567	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
34	NC_009567	CTT	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009567	TAC	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826761
36	NC_009567	AAT	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826761
37	NC_009567	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826761
38	NC_009567	CAC	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826762
39	NC_009567	GCT	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009567	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009567	ATT	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009567	AAT	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
43	NC_009567	TTG	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
44	NC_009567	GAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
45	NC_009567	GTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
46	NC_009567	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826763
47	NC_009567	CAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826763
48	NC_009567	CTT	3	9	3245	3253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
49	NC_009567	AAG	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
50	NC_009567	TGA	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
51	NC_009567	GTG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
52	NC_009567	TGA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
53	NC_009567	TGT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
54	NC_009567	TTG	2	6	3513	3518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
55	NC_009567	AGT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
56	NC_009567	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
57	NC_009567	TGC	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
58	NC_009567	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
59	NC_009567	CCA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826763
60	NC_009567	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
61	NC_009567	CAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826763
62	NC_009567	GCA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826763
63	NC_009567	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
64	NC_009567	GTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
65	NC_009567	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
66	NC_009567	AAT	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
67	NC_009567	TGG	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
68	NC_009567	AAT	2	6	4585	4590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009567	TTA	2	6	4620	4625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009567	CAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
71	NC_009567	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
72	NC_009567	ATG	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826764
73	NC_009567	TCA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
74	NC_009567	ATA	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
75	NC_009567	GCC	2	6	5148	5153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
76	NC_009567	AAT	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
77	NC_009567	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
78	NC_009567	CAC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826764
79	NC_009567	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
80	NC_009567	TAA	2	6	5505	5510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
81	NC_009567	CAA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
82	NC_009567	AAT	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
83	NC_009567	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
84	NC_009567	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
85	NC_009567	TAA	2	6	5755	5760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009567	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009567	ATA	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009567	GTT	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009567	ACT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009567	CCA	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009567	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009567	GAA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009567	TCA	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009567	ATT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009567	CAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009567	CTG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009567	AGT	2	6	6463	6468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009567	TCA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009567	TAT	2	6	6845	6850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009567	CTT	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009567	ATG	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009567	TGG	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009567	TTG	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009567	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
105	NC_009567	CAA	2	6	7307	7312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826765
106	NC_009567	ACC	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
107	NC_009567	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
108	NC_009567	TTC	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
109	NC_009567	TAA	2	6	7557	7562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
110	NC_009567	TGC	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
111	NC_009567	TGC	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
112	NC_009567	CTG	3	9	7769	7777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
113	NC_009567	CAT	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
114	NC_009567	ACG	2	6	7923	7928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826765
115	NC_009567	CAC	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
116	NC_009567	ATA	2	6	8020	8025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
117	NC_009567	TCA	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
118	NC_009567	TTG	2	6	8100	8105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826765
119	NC_009567	TAA	2	6	8189	8194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
120	NC_009567	TTA	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
121	NC_009567	TAT	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
122	NC_009567	ACC	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
123	NC_009567	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
124	NC_009567	CAT	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
125	NC_009567	TAA	2	6	8352	8357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
126	NC_009567	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
127	NC_009567	TTC	2	6	8717	8722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
128	NC_009567	TCT	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
129	NC_009567	ATT	2	6	8737	8742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
130	NC_009567	AAT	2	6	8752	8757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009567	ACT	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009567	CAC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009567	TGG	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009567	CTT	2	6	9141	9146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009567	GTA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_009567	ATT	2	6	19510	19515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826781
268	NC_009567	AAG	2	6	19624	19629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826781
269	NC_009567	GAT	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826781
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345	NC_009567	GCA	2	6	25075	25080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826787
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348	NC_009567	TCA	2	6	25300	25305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_009567	AAT	2	6	25581	25586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826788
353	NC_009567	AGA	2	6	25604	25609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826788
354	NC_009567	TGA	2	6	25925	25930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826788
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360	NC_009567	AAT	2	6	26299	26304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826788
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372	NC_009567	TGG	3	9	27156	27164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826789
373	NC_009567	TGG	2	6	27249	27254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826789
374	NC_009567	TTG	2	6	27258	27263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826789
375	NC_009567	GCA	2	6	27460	27465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_009567	ACA	2	6	27530	27535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826790
377	NC_009567	TTC	2	6	27551	27556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826790
378	NC_009567	TCT	2	6	27561	27566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826790
379	NC_009567	TGA	2	6	27604	27609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826790
380	NC_009567	GTC	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826790
381	NC_009567	TGG	2	6	27654	27659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826790
382	NC_009567	GCG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826790
383	NC_009567	ATC	2	6	27679	27684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826790
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