MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 40117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009567	AATA	2	8	21053	21060	75 %	25 %	0 %	0 %	148826782
502	NC_009567	ATTTT	2	10	21145	21154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009567	ATG	2	6	21168	21173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826783
504	NC_009567	ATT	2	6	21183	21188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826783
505	NC_009567	GAA	2	6	21306	21311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826783
506	NC_009567	GTG	2	6	21312	21317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826783
507	NC_009567	GAA	2	6	21357	21362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826783
508	NC_009567	CGA	2	6	21377	21382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826783
509	NC_009567	TGAAA	2	10	21386	21395	60 %	20 %	20 %	0 %	148826783
510	NC_009567	GAA	2	6	21417	21422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826783
511	NC_009567	GAA	2	6	21438	21443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826783
512	NC_009567	AAC	3	9	21448	21456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826783
513	NC_009567	ATG	2	6	21487	21492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826783
514	NC_009567	TGA	2	6	21533	21538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826783
515	NC_009567	AAG	2	6	21649	21654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826783
516	NC_009567	AAGT	2	8	21664	21671	50 %	25 %	25 %	0 %	148826783
517	NC_009567	GT	3	6	21679	21684	0 %	50 %	50 %	0 %	148826783
518	NC_009567	TCA	2	6	21855	21860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826783
519	NC_009567	GGT	2	6	21867	21872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826783
520	NC_009567	TTG	2	6	21928	21933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826783
521	NC_009567	AACA	2	8	22036	22043	75 %	0 %	0 %	25 %	148826783
522	NC_009567	TTA	2	6	22059	22064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826783
523	NC_009567	TGA	2	6	22165	22170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826783
524	NC_009567	TGA	2	6	22181	22186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826783
525	NC_009567	ATT	2	6	22200	22205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826783
526	NC_009567	TCT	2	6	22339	22344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826784
527	NC_009567	AGCC	2	8	22371	22378	25 %	0 %	25 %	50 %	148826784
528	NC_009567	GAT	2	6	22476	22481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826784
529	NC_009567	ATT	2	6	22615	22620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826784
530	NC_009567	ATT	2	6	22654	22659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826784
531	NC_009567	TTG	2	6	22667	22672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826784
532	NC_009567	GAT	2	6	22684	22689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826784
533	NC_009567	CGT	2	6	22690	22695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826784
534	NC_009567	TGGC	2	8	22712	22719	0 %	25 %	50 %	25 %	148826784
535	NC_009567	AAT	2	6	22742	22747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826784
536	NC_009567	TGGC	2	8	22761	22768	0 %	25 %	50 %	25 %	148826785
537	NC_009567	A	7	7	22792	22798	100 %	0 %	0 %	0 %	148826785
538	NC_009567	CTT	2	6	22833	22838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826785
539	NC_009567	TGA	2	6	22880	22885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826785
540	NC_009567	TGA	2	6	22895	22900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826785
541	NC_009567	TCG	2	6	22934	22939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826785
542	NC_009567	GAA	2	6	23085	23090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826785
543	NC_009567	TGT	2	6	23228	23233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826785
544	NC_009567	AGAA	2	8	23255	23262	75 %	0 %	25 %	0 %	148826785
545	NC_009567	ATA	2	6	23302	23307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826785
546	NC_009567	ATG	2	6	23419	23424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826785
547	NC_009567	ATT	2	6	23448	23453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826785
548	NC_009567	TAT	2	6	23488	23493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826785
549	NC_009567	CAA	2	6	23511	23516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826785
550	NC_009567	ATT	2	6	23548	23553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826785
551	NC_009567	CGTG	2	8	23570	23577	0 %	25 %	50 %	25 %	148826785
552	NC_009567	GAA	2	6	23615	23620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826785
553	NC_009567	TGA	2	6	23683	23688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826786
554	NC_009567	TGGG	2	8	23721	23728	0 %	25 %	75 %	0 %	148826786
555	NC_009567	A	7	7	23747	23753	100 %	0 %	0 %	0 %	148826786
556	NC_009567	GAAA	2	8	23770	23777	75 %	0 %	25 %	0 %	148826786
557	NC_009567	TCA	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826786
558	NC_009567	TAC	2	6	23793	23798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826786
559	NC_009567	AGA	2	6	23836	23841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826786
560	NC_009567	TTTA	2	8	23925	23932	25 %	75 %	0 %	0 %	148826786
561	NC_009567	GCA	2	6	24061	24066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826786
562	NC_009567	GAA	2	6	24110	24115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826786
563	NC_009567	TCTT	2	8	24130	24137	0 %	75 %	0 %	25 %	148826786
564	NC_009567	T	6	6	24323	24328	0 %	100 %	0 %	0 %	148826786
565	NC_009567	CGG	2	6	24354	24359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826786
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568	NC_009567	AAAAT	2	10	24446	24455	80 %	20 %	0 %	0 %	148826787
569	NC_009567	ATTC	2	8	24637	24644	25 %	50 %	0 %	25 %	148826787
570	NC_009567	GAA	2	6	24664	24669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826787
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572	NC_009567	TGT	2	6	24762	24767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826787
573	NC_009567	ATT	2	6	24772	24777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826787
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577	NC_009567	TAATT	2	10	24966	24975	40 %	60 %	0 %	0 %	148826787
578	NC_009567	A	6	6	25003	25008	100 %	0 %	0 %	0 %	148826787
579	NC_009567	GCA	2	6	25075	25080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826787
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581	NC_009567	ATCCAA	2	12	25163	25174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148826787
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583	NC_009567	TCA	2	6	25300	25305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009567	TA	3	6	25335	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009567	A	6	6	25340	25345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_009567	TTA	2	6	25495	25500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826788
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590	NC_009567	AAT	2	6	25581	25586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826788
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592	NC_009567	T	6	6	25681	25686	0 %	100 %	0 %	0 %	148826788
593	NC_009567	GGTT	2	8	25707	25714	0 %	50 %	50 %	0 %	148826788
594	NC_009567	TGA	2	6	25925	25930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826788
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596	NC_009567	TAAT	2	8	25993	26000	50 %	50 %	0 %	0 %	148826788
597	NC_009567	A	6	6	26022	26027	100 %	0 %	0 %	0 %	148826788
598	NC_009567	TGAT	2	8	26062	26069	25 %	50 %	25 %	0 %	148826788
599	NC_009567	CCA	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826788
600	NC_009567	TAATT	2	10	26189	26198	40 %	60 %	0 %	0 %	148826788
601	NC_009567	GCGA	2	8	26220	26227	25 %	0 %	50 %	25 %	148826788
602	NC_009567	ACA	2	6	26238	26243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826788
603	NC_009567	GAA	2	6	26271	26276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826788
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611	NC_009567	A	6	6	26532	26537	100 %	0 %	0 %	0 %	148826789
612	NC_009567	ACA	2	6	26585	26590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826789
613	NC_009567	TGA	2	6	26656	26661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826789
614	NC_009567	TGA	2	6	26787	26792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826789
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626	NC_009567	T	6	6	27345	27350	0 %	100 %	0 %	0 %	148826789
627	NC_009567	GCA	2	6	27460	27465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009567	TAAA	2	8	27488	27495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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