MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 1953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	TA	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009566	TC	3	6	2450	2455	0 %	50 %	0 %	50 %	148825134
3	NC_009566	AG	3	6	2729	2734	50 %	0 %	50 %	0 %	148825134
4	NC_009566	CA	3	6	3183	3188	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
5	NC_009566	TA	3	6	3797	3802	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
6	NC_009566	TA	3	6	4253	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
7	NC_009566	AC	3	6	4929	4934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009566	TG	3	6	7231	7236	0 %	50 %	50 %	0 %	148825135
9	NC_009566	TG	3	6	7294	7299	0 %	50 %	50 %	0 %	148825135
10	NC_009566	CA	3	6	7559	7564	50 %	0 %	0 %	50 %	148825135
11	NC_009566	CA	3	6	9101	9106	50 %	0 %	0 %	50 %	148825136
12	NC_009566	TA	3	6	11106	11111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009566	AC	3	6	11233	11238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009566	TA	3	6	11362	11367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009566	TA	3	6	13504	13509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009566	TA	3	6	13679	13684	50 %	50 %	0 %	0 %	148825139
17	NC_009566	CA	3	6	13855	13860	50 %	0 %	0 %	50 %	148825139
18	NC_009566	TA	3	6	14620	14625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009566	CA	3	6	15991	15996	50 %	0 %	0 %	50 %	148825141
20	NC_009566	AC	3	6	18319	18324	50 %	0 %	0 %	50 %	148825143
21	NC_009566	AT	3	6	18360	18365	50 %	50 %	0 %	0 %	148825143
22	NC_009566	CG	3	6	19902	19907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009566	AT	3	6	22673	22678	50 %	50 %	0 %	0 %	148825150
24	NC_009566	GC	3	6	22928	22933	0 %	0 %	50 %	50 %	148825151
25	NC_009566	AT	3	6	23227	23232	50 %	50 %	0 %	0 %	148825151
26	NC_009566	TA	3	6	23525	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	148825152
27	NC_009566	AT	3	6	23829	23834	50 %	50 %	0 %	0 %	148825152
28	NC_009566	CA	3	6	25148	25153	50 %	0 %	0 %	50 %	148825153
29	NC_009566	GC	3	6	27660	27665	0 %	0 %	50 %	50 %	148825154
30	NC_009566	CT	3	6	27768	27773	0 %	50 %	0 %	50 %	148825154
31	NC_009566	GC	3	6	29949	29954	0 %	0 %	50 %	50 %	148825156
32	NC_009566	AG	3	6	31236	31241	50 %	0 %	50 %	0 %	148825159
33	NC_009566	CA	3	6	32894	32899	50 %	0 %	0 %	50 %	148825161
34	NC_009566	TC	3	6	33076	33081	0 %	50 %	0 %	50 %	148825162
35	NC_009566	CG	3	6	33315	33320	0 %	0 %	50 %	50 %	148825162
36	NC_009566	AC	3	6	35897	35902	50 %	0 %	0 %	50 %	148825164
37	NC_009566	CA	3	6	36406	36411	50 %	0 %	0 %	50 %	148825165
38	NC_009566	TC	3	6	39005	39010	0 %	50 %	0 %	50 %	148825167
39	NC_009566	CG	3	6	39491	39496	0 %	0 %	50 %	50 %	148825168
40	NC_009566	GA	3	6	40085	40090	50 %	0 %	50 %	0 %	148825169
41	NC_009566	AT	3	6	40285	40290	50 %	50 %	0 %	0 %	148825169
42	NC_009566	GC	3	6	40914	40919	0 %	0 %	50 %	50 %	148825170
43	NC_009566	GT	3	6	41069	41074	0 %	50 %	50 %	0 %	148825170
44	NC_009566	GT	4	8	42310	42317	0 %	50 %	50 %	0 %	148825171
45	NC_009566	AC	3	6	42576	42581	50 %	0 %	0 %	50 %	148825171
46	NC_009566	CA	4	8	42982	42989	50 %	0 %	0 %	50 %	148825172
47	NC_009566	GT	3	6	44145	44150	0 %	50 %	50 %	0 %	148825173
48	NC_009566	AC	3	6	45311	45316	50 %	0 %	0 %	50 %	148825174
49	NC_009566	CT	3	6	46253	46258	0 %	50 %	0 %	50 %	148825175
50	NC_009566	TG	3	6	46275	46280	0 %	50 %	50 %	0 %	148825175
51	NC_009566	AT	3	6	47059	47064	50 %	50 %	0 %	0 %	148825176
52	NC_009566	GA	3	6	47551	47556	50 %	0 %	50 %	0 %	148825176
53	NC_009566	AT	3	6	49666	49671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009566	AC	3	6	51266	51271	50 %	0 %	0 %	50 %	148825183
55	NC_009566	GC	3	6	51290	51295	0 %	0 %	50 %	50 %	148825183
56	NC_009566	CG	3	6	51628	51633	0 %	0 %	50 %	50 %	148825184
57	NC_009566	TA	3	6	51780	51785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009566	GC	3	6	52451	52456	0 %	0 %	50 %	50 %	148825186
59	NC_009566	CA	3	6	53359	53364	50 %	0 %	0 %	50 %	148825187
60	NC_009566	CA	3	6	54532	54537	50 %	0 %	0 %	50 %	148825188
61	NC_009566	AC	3	6	55460	55465	50 %	0 %	0 %	50 %	148825189
62	NC_009566	AT	3	6	55766	55771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009566	CA	3	6	56053	56058	50 %	0 %	0 %	50 %	148825190
64	NC_009566	TG	3	6	58665	58670	0 %	50 %	50 %	0 %	148825192
65	NC_009566	TC	3	6	59239	59244	0 %	50 %	0 %	50 %	148825193
66	NC_009566	GC	3	6	62001	62006	0 %	0 %	50 %	50 %	148825194
67	NC_009566	CG	3	6	62887	62892	0 %	0 %	50 %	50 %	148825194
68	NC_009566	GC	3	6	63117	63122	0 %	0 %	50 %	50 %	148825195
69	NC_009566	TG	3	6	64829	64834	0 %	50 %	50 %	0 %	148825197
70	NC_009566	TG	3	6	66234	66239	0 %	50 %	50 %	0 %	148825198
71	NC_009566	CG	3	6	68208	68213	0 %	0 %	50 %	50 %	148825201
72	NC_009566	TG	3	6	69155	69160	0 %	50 %	50 %	0 %	148825202
73	NC_009566	TA	3	6	69633	69638	50 %	50 %	0 %	0 %	148825202
74	NC_009566	TG	3	6	71818	71823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009566	GT	3	6	74510	74515	0 %	50 %	50 %	0 %	148825205
76	NC_009566	TG	3	6	76641	76646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009566	TA	3	6	77907	77912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009566	AT	3	6	79091	79096	50 %	50 %	0 %	0 %	148825209
79	NC_009566	AT	3	6	79256	79261	50 %	50 %	0 %	0 %	148825209
80	NC_009566	AC	3	6	79794	79799	50 %	0 %	0 %	50 %	148825209
81	NC_009566	TA	3	6	80155	80160	50 %	50 %	0 %	0 %	148825209
82	NC_009566	TG	3	6	80532	80537	0 %	50 %	50 %	0 %	148825209
83	NC_009566	TG	4	8	87462	87469	0 %	50 %	50 %	0 %	148825211
84	NC_009566	AT	3	6	87824	87829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009566	GT	3	6	88512	88517	0 %	50 %	50 %	0 %	148825212
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87	NC_009566	AT	3	6	90151	90156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009566	AC	3	6	90536	90541	50 %	0 %	0 %	50 %	148825215
89	NC_009566	CT	3	6	90881	90886	0 %	50 %	0 %	50 %	148825216
90	NC_009566	AC	3	6	90889	90894	50 %	0 %	0 %	50 %	148825216
91	NC_009566	GA	3	6	91017	91022	50 %	0 %	50 %	0 %	148825216
92	NC_009566	GT	4	8	94199	94206	0 %	50 %	50 %	0 %	148825219
93	NC_009566	AT	3	6	95272	95277	50 %	50 %	0 %	0 %	148825220
94	NC_009566	GA	3	6	95672	95677	50 %	0 %	50 %	0 %	148825220
95	NC_009566	TG	3	6	96637	96642	0 %	50 %	50 %	0 %	148825221
96	NC_009566	AT	3	6	96698	96703	50 %	50 %	0 %	0 %	148825221
97	NC_009566	GA	3	6	97207	97212	50 %	0 %	50 %	0 %	148825222
98	NC_009566	AT	3	6	97275	97280	50 %	50 %	0 %	0 %	148825222
99	NC_009566	TG	3	6	98040	98045	0 %	50 %	50 %	0 %	148825222
100	NC_009566	TC	3	6	98309	98314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009566	AC	3	6	98780	98785	50 %	0 %	0 %	50 %	148825223
102	NC_009566	CA	3	6	99654	99659	50 %	0 %	0 %	50 %	148825223
103	NC_009566	CA	3	6	101209	101214	50 %	0 %	0 %	50 %	148825226
104	NC_009566	GC	3	6	102157	102162	0 %	0 %	50 %	50 %	148825226
105	NC_009566	TA	3	6	102781	102786	50 %	50 %	0 %	0 %	148825227
106	NC_009566	TC	3	6	104101	104106	0 %	50 %	0 %	50 %	148825229
107	NC_009566	TG	3	6	105212	105217	0 %	50 %	50 %	0 %	148825230
108	NC_009566	AT	3	6	105734	105739	50 %	50 %	0 %	0 %	148825231
109	NC_009566	GA	3	6	111997	112002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009566	TG	3	6	112266	112271	0 %	50 %	50 %	0 %	148825241
111	NC_009566	GT	3	6	113713	113718	0 %	50 %	50 %	0 %	148825242
112	NC_009566	TG	3	6	115709	115714	0 %	50 %	50 %	0 %	148825244
113	NC_009566	TG	3	6	116756	116761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009566	GA	3	6	116887	116892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009566	AC	3	6	117878	117883	50 %	0 %	0 %	50 %	148825247
116	NC_009566	CT	3	6	119333	119338	0 %	50 %	0 %	50 %	148825249
117	NC_009566	GT	3	6	119683	119688	0 %	50 %	50 %	0 %	148825249
118	NC_009566	TC	3	6	119946	119951	0 %	50 %	0 %	50 %	148825249
119	NC_009566	TG	3	6	120707	120712	0 %	50 %	50 %	0 %	148825250
120	NC_009566	AG	3	6	120877	120882	50 %	0 %	50 %	0 %	148825250
121	NC_009566	GA	3	6	122144	122149	50 %	0 %	50 %	0 %	148825251
122	NC_009566	TA	3	6	129291	129296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009566	CG	3	6	131564	131569	0 %	0 %	50 %	50 %	148825258
124	NC_009566	TC	3	6	131858	131863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009566	GC	3	6	132725	132730	0 %	0 %	50 %	50 %	148825259
126	NC_009566	AC	3	6	135333	135338	50 %	0 %	0 %	50 %	148825262
127	NC_009566	GA	3	6	136199	136204	50 %	0 %	50 %	0 %	148825263
128	NC_009566	AG	3	6	137314	137319	50 %	0 %	50 %	0 %	148825265
129	NC_009566	TG	3	6	137349	137354	0 %	50 %	50 %	0 %	148825265
130	NC_009566	AT	3	6	138192	138197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009566	CG	4	8	138325	138332	0 %	0 %	50 %	50 %	148825266
132	NC_009566	GA	3	6	138912	138917	50 %	0 %	50 %	0 %	148825266
133	NC_009566	AC	3	6	139464	139469	50 %	0 %	0 %	50 %	148825267
134	NC_009566	GC	3	6	139758	139763	0 %	0 %	50 %	50 %	148825268
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142	NC_009566	GT	3	6	145135	145140	0 %	50 %	50 %	0 %	148825274
143	NC_009566	TG	3	6	146239	146244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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