MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 1509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	TGCAT	2	10	443	452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009566	CTTTC	2	10	513	522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009566	TAAAA	2	10	1158	1167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	CAAAA	2	10	2492	2501	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
5	NC_009566	ATTTG	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	148825134
6	NC_009566	AAACA	2	10	3511	3520	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
7	NC_009566	TACAT	2	10	3720	3729	40 %	40 %	0 %	20 %	148825134
8	NC_009566	TCAGT	2	10	4393	4402	20 %	40 %	20 %	20 %	148825134
9	NC_009566	AAAAT	2	10	4423	4432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009566	AAATG	2	10	5479	5488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009566	AACCA	2	10	9861	9870	60 %	0 %	0 %	40 %	148825136
12	NC_009566	AAAAT	2	10	10311	10320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009566	CTTTT	2	10	10726	10735	0 %	80 %	0 %	20 %	148825137
14	NC_009566	ATTCT	2	10	13531	13540	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009566	TCTGG	2	10	14867	14876	0 %	40 %	40 %	20 %	148825141
16	NC_009566	TTGAT	2	10	15203	15212	20 %	60 %	20 %	0 %	148825141
17	NC_009566	TCGTA	2	10	15732	15741	20 %	40 %	20 %	20 %	148825141
18	NC_009566	CACAC	2	10	17719	17728	40 %	0 %	0 %	60 %	148825142
19	NC_009566	AAAAG	2	10	18053	18062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	AGTTA	2	10	18894	18903	40 %	40 %	20 %	0 %	148825145
21	NC_009566	TTTGA	2	10	19184	19193	20 %	60 %	20 %	0 %	148825146
22	NC_009566	GCAAA	2	10	19490	19499	60 %	0 %	20 %	20 %	148825146
23	NC_009566	TTGAT	2	10	20202	20211	20 %	60 %	20 %	0 %	148825147
24	NC_009566	TGAAA	2	10	20788	20797	60 %	20 %	20 %	0 %	148825148
25	NC_009566	CCATT	2	10	24170	24179	20 %	40 %	0 %	40 %	148825153
26	NC_009566	GCATT	2	10	26213	26222	20 %	40 %	20 %	20 %	148825153
27	NC_009566	CTTTC	2	10	26424	26433	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009566	ATTTT	2	10	27239	27248	20 %	80 %	0 %	0 %	148825154
29	NC_009566	TTGCA	2	10	27280	27289	20 %	40 %	20 %	20 %	148825154
30	NC_009566	ATTTC	2	10	28997	29006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009566	CTTAT	2	10	29085	29094	20 %	60 %	0 %	20 %	148825155
32	NC_009566	AATGG	2	10	29763	29772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009566	AATCC	2	10	30417	30426	40 %	20 %	0 %	40 %	148825156
34	NC_009566	AACCA	2	10	30531	30540	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009566	TATTT	2	10	32478	32487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009566	TCATT	2	10	35939	35948	20 %	60 %	0 %	20 %	148825164
37	NC_009566	TTGAA	2	10	36225	36234	40 %	40 %	20 %	0 %	148825165
38	NC_009566	TATCG	2	10	37538	37547	20 %	40 %	20 %	20 %	148825166
39	NC_009566	CTAAT	2	10	38498	38507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009566	AAAGC	2	10	39147	39156	60 %	0 %	20 %	20 %	148825167
41	NC_009566	ACTGG	2	10	42092	42101	20 %	20 %	40 %	20 %	148825170
42	NC_009566	GCATC	2	10	45377	45386	20 %	20 %	20 %	40 %	148825174
43	NC_009566	GATAT	2	10	46331	46340	40 %	40 %	20 %	0 %	148825175
44	NC_009566	ATTTT	2	10	47685	47694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009566	ATAAA	2	10	49621	49630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009566	TTTCA	2	10	50259	50268	20 %	60 %	0 %	20 %	148825183
47	NC_009566	ATTAC	2	10	51313	51322	40 %	40 %	0 %	20 %	148825183
48	NC_009566	TTAAA	2	10	51989	51998	60 %	40 %	0 %	0 %	148825185
49	NC_009566	GTGAA	2	10	52506	52515	40 %	20 %	40 %	0 %	148825186
50	NC_009566	GAAGA	2	10	54418	54427	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009566	AAAGC	2	10	55121	55130	60 %	0 %	20 %	20 %	148825189
52	NC_009566	CAAAT	2	10	55736	55745	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009566	TGGTA	2	10	57665	57674	20 %	40 %	40 %	0 %	148825192
54	NC_009566	AAGAT	2	10	61146	61155	60 %	20 %	20 %	0 %	148825193
55	NC_009566	AATGA	2	10	61584	61593	60 %	20 %	20 %	0 %	148825194
56	NC_009566	CAGTA	2	10	62456	62465	40 %	20 %	20 %	20 %	148825194
57	NC_009566	GTTTG	2	10	62617	62626	0 %	60 %	40 %	0 %	148825194
58	NC_009566	GCGTT	2	10	63133	63142	0 %	40 %	40 %	20 %	148825195
59	NC_009566	TTTAA	2	10	63335	63344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009566	ATTTT	2	10	63357	63366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009566	GATTA	2	10	64066	64075	40 %	40 %	20 %	0 %	148825196
62	NC_009566	TTTTG	2	10	65038	65047	0 %	80 %	20 %	0 %	148825197
63	NC_009566	TTGGC	2	10	66264	66273	0 %	40 %	40 %	20 %	148825198
64	NC_009566	GGGAA	2	10	66541	66550	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009566	GGTTG	2	10	67291	67300	0 %	40 %	60 %	0 %	148825200
66	NC_009566	GAAAA	2	10	68124	68133	80 %	0 %	20 %	0 %	148825201
67	NC_009566	TACAA	2	10	72034	72043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009566	CTTCA	2	10	72073	72082	20 %	40 %	0 %	40 %	148825203
69	NC_009566	ACGCA	2	10	73220	73229	40 %	0 %	20 %	40 %	148825203
70	NC_009566	TTAAC	2	10	74479	74488	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009566	ATGAT	2	10	76497	76506	40 %	40 %	20 %	0 %	148825206
72	NC_009566	ATTCC	2	10	80226	80235	20 %	40 %	0 %	40 %	148825209
73	NC_009566	ATCAA	2	10	81601	81610	60 %	20 %	0 %	20 %	148825209
74	NC_009566	GTGAA	2	10	82500	82509	40 %	20 %	40 %	0 %	148825210
75	NC_009566	TTGGA	2	10	87162	87171	20 %	40 %	40 %	0 %	148825211
76	NC_009566	GTTTA	2	10	89500	89509	20 %	60 %	20 %	0 %	148825213
77	NC_009566	TTCAG	2	10	91728	91737	20 %	40 %	20 %	20 %	148825216
78	NC_009566	TTTTC	2	10	97639	97648	0 %	80 %	0 %	20 %	148825222
79	NC_009566	TTTGA	2	10	97834	97843	20 %	60 %	20 %	0 %	148825222
80	NC_009566	CCAGC	2	10	98735	98744	20 %	0 %	20 %	60 %	148825223
81	NC_009566	ATCAA	2	10	103266	103275	60 %	20 %	0 %	20 %	148825228
82	NC_009566	TTTCC	2	10	104067	104076	0 %	60 %	0 %	40 %	148825229
83	NC_009566	TTTTA	2	10	106567	106576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009566	AGTAG	2	10	107504	107513	40 %	20 %	40 %	0 %	148825234
85	NC_009566	TGAAT	2	10	107662	107671	40 %	40 %	20 %	0 %	148825234
86	NC_009566	AATGC	2	10	108449	108458	40 %	20 %	20 %	20 %	148825236
87	NC_009566	ACGTA	2	10	108518	108527	40 %	20 %	20 %	20 %	148825236
88	NC_009566	AACTT	2	10	109092	109101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009566	GCTTA	2	10	109895	109904	20 %	40 %	20 %	20 %	148825239
90	NC_009566	AAATT	2	10	110315	110324	60 %	40 %	0 %	0 %	148825239
91	NC_009566	GTGAA	2	10	112218	112227	40 %	20 %	40 %	0 %	148825241
92	NC_009566	TAATT	2	10	112777	112786	40 %	60 %	0 %	0 %	148825241
93	NC_009566	TGAAT	2	10	112837	112846	40 %	40 %	20 %	0 %	148825241
94	NC_009566	ATGAA	2	10	113458	113467	60 %	20 %	20 %	0 %	148825242
95	NC_009566	ATTTA	2	10	114304	114313	40 %	60 %	0 %	0 %	148825243
96	NC_009566	GCAGA	2	10	114326	114335	40 %	0 %	40 %	20 %	148825243
97	NC_009566	ATGGA	2	10	114951	114960	40 %	20 %	40 %	0 %	148825244
98	NC_009566	TAAAA	2	10	115120	115129	80 %	20 %	0 %	0 %	148825244
99	NC_009566	TGGAA	2	10	115525	115534	40 %	20 %	40 %	0 %	148825244
100	NC_009566	TAAAG	2	10	116005	116014	60 %	20 %	20 %	0 %	148825244
101	NC_009566	ATTGT	2	10	116150	116159	20 %	60 %	20 %	0 %	148825245
102	NC_009566	AATCC	2	10	116401	116410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009566	TCTTT	2	10	116644	116653	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009566	GATTT	2	10	119067	119076	20 %	60 %	20 %	0 %	148825248
105	NC_009566	CATTT	2	10	119272	119281	20 %	60 %	0 %	20 %	148825249
106	NC_009566	GGATA	2	10	120780	120789	40 %	20 %	40 %	0 %	148825250
107	NC_009566	TCAAT	2	10	121245	121254	40 %	40 %	0 %	20 %	148825250
108	NC_009566	CTAGA	2	10	121775	121784	40 %	20 %	20 %	20 %	148825251
109	NC_009566	TGGAC	2	10	122836	122845	20 %	20 %	40 %	20 %	148825251
110	NC_009566	TTTTC	2	10	124273	124282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009566	GAATT	2	10	124584	124593	40 %	40 %	20 %	0 %	148825253
112	NC_009566	AATTT	2	10	127307	127316	40 %	60 %	0 %	0 %	148825255
113	NC_009566	TACAA	2	10	127686	127695	60 %	20 %	0 %	20 %	148825256
114	NC_009566	ATTTT	2	10	127900	127909	20 %	80 %	0 %	0 %	148825256
115	NC_009566	GGTTT	2	10	128453	128462	0 %	60 %	40 %	0 %	148825257
116	NC_009566	GGGGA	2	10	128742	128751	20 %	0 %	80 %	0 %	148825257
117	NC_009566	ACATC	2	10	130450	130459	40 %	20 %	0 %	40 %	148825258
118	NC_009566	ATTTT	2	10	132060	132069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009566	TTTCA	2	10	133401	133410	20 %	60 %	0 %	20 %	148825260
120	NC_009566	AAAGT	2	10	133516	133525	60 %	20 %	20 %	0 %	148825260
121	NC_009566	GATGA	2	10	134495	134504	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009566	ACTTG	2	10	135955	135964	20 %	40 %	20 %	20 %	148825263
123	NC_009566	TATGG	2	10	136277	136286	20 %	40 %	40 %	0 %	148825263
124	NC_009566	TCATC	2	10	136724	136733	20 %	40 %	0 %	40 %	148825264
125	NC_009566	GCAGA	2	10	137127	137136	40 %	0 %	40 %	20 %	148825264
126	NC_009566	TGGAT	2	10	137931	137940	20 %	40 %	40 %	0 %	148825265
127	NC_009566	GATTA	2	10	138527	138536	40 %	40 %	20 %	0 %	148825266
128	NC_009566	GAAAA	2	10	138887	138896	80 %	0 %	20 %	0 %	148825266
129	NC_009566	TTATT	2	10	139970	139979	20 %	80 %	0 %	0 %	148825268
130	NC_009566	CTGTG	2	10	143490	143499	0 %	40 %	40 %	20 %	148825272
131	NC_009566	ATTAC	2	10	145995	146004	40 %	40 %	0 %	20 %	148825274
132	NC_009566	GTTTT	2	10	147180	147189	0 %	80 %	20 %	0 %	148825276
133	NC_009566	GCATT	2	10	152624	152633	20 %	40 %	20 %	20 %	148825280
134	NC_009566	CCTTT	2	10	154041	154050	0 %	60 %	0 %	40 %	148825281
135	NC_009566	TAATT	2	10	154774	154783	40 %	60 %	0 %	0 %	148825282
136	NC_009566	AGTGC	2	10	154880	154889	20 %	20 %	40 %	20 %	148825282
137	NC_009566	ATTAT	2	10	155700	155709	40 %	60 %	0 %	0 %	148825284
138	NC_009566	GCGGA	2	10	155839	155848	20 %	0 %	60 %	20 %	148825284
139	NC_009566	TGAAA	2	10	158393	158402	60 %	20 %	20 %	0 %	148825287
140	NC_009566	AATGA	2	10	160721	160730	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009566	ATGGT	2	10	161291	161300	20 %	40 %	40 %	0 %	148825291
142	NC_009566	GCAAT	2	10	162133	162142	40 %	20 %	20 %	20 %	148825291
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145	NC_009566	AATTA	2	10	164272	164281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009566	AAAAG	2	10	167485	167494	80 %	0 %	20 %	0 %	148825295
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152	NC_009566	GTGAA	2	10	170225	170234	40 %	20 %	40 %	0 %	148825298
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155	NC_009566	ATAAA	2	10	175557	175566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009566	TATGA	2	10	179447	179456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009566	AAATT	2	10	184122	184131	60 %	40 %	0 %	0 %	148825311
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178	NC_009566	AAACT	2	10	199236	199245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_009566	TAACC	2	10	310628	310637	40 %	20 %	0 %	40 %	148825441
263	NC_009566	AAATA	2	10	310853	310862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009566	AAAAT	2	10	311013	311022	80 %	20 %	0 %	0 %	148825442
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404	NC_009566	CTTAT	2	10	491032	491041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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