MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 38427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009566	CAT	2	6	22422	22427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825150
502	NC_009566	TGA	2	6	22490	22495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825150
503	NC_009566	ATT	2	6	22525	22530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825150
504	NC_009566	CTG	2	6	22537	22542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825150
505	NC_009566	TGG	2	6	22597	22602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825150
506	NC_009566	TGAA	2	8	22645	22652	50 %	25 %	25 %	0 %	148825150
507	NC_009566	AT	3	6	22673	22678	50 %	50 %	0 %	0 %	148825150
508	NC_009566	AAT	2	6	22810	22815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825150
509	NC_009566	TCG	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825151
510	NC_009566	GCA	2	6	22868	22873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825151
511	NC_009566	A	6	6	22893	22898	100 %	0 %	0 %	0 %	148825151
512	NC_009566	GC	3	6	22928	22933	0 %	0 %	50 %	50 %	148825151
513	NC_009566	TGG	2	6	23001	23006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825151
514	NC_009566	GCGG	2	8	23063	23070	0 %	0 %	75 %	25 %	148825151
515	NC_009566	TTTCTG	2	12	23079	23090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148825151
516	NC_009566	T	6	6	23099	23104	0 %	100 %	0 %	0 %	148825151
517	NC_009566	TTA	2	6	23109	23114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825151
518	NC_009566	TTA	2	6	23141	23146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825151
519	NC_009566	GCA	2	6	23186	23191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825151
520	NC_009566	TGA	2	6	23212	23217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825151
521	NC_009566	AT	3	6	23227	23232	50 %	50 %	0 %	0 %	148825151
522	NC_009566	TTC	2	6	23491	23496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009566	TA	3	6	23525	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	148825152
524	NC_009566	TAA	2	6	23536	23541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825152
525	NC_009566	TCG	2	6	23568	23573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825152
526	NC_009566	TCA	2	6	23646	23651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825152
527	NC_009566	CGA	2	6	23656	23661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825152
528	NC_009566	CTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825152
529	NC_009566	CCAC	2	8	23701	23708	25 %	0 %	0 %	75 %	148825152
530	NC_009566	GAA	2	6	23714	23719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825152
531	NC_009566	A	6	6	23781	23786	100 %	0 %	0 %	0 %	148825152
532	NC_009566	ACG	2	6	23813	23818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825152
533	NC_009566	AT	3	6	23829	23834	50 %	50 %	0 %	0 %	148825152
534	NC_009566	TTC	2	6	23900	23905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825152
535	NC_009566	AGCC	2	8	23940	23947	25 %	0 %	25 %	50 %	148825152
536	NC_009566	ATA	2	6	23976	23981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825152
537	NC_009566	T	6	6	23996	24001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009566	AGCC	2	8	24014	24021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009566	T	7	7	24047	24053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009566	ATA	2	6	24054	24059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009566	AAG	2	6	24060	24065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009566	CAA	2	6	24082	24087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825153
543	NC_009566	ATT	2	6	24097	24102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
544	NC_009566	CAA	2	6	24127	24132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825153
545	NC_009566	TGC	2	6	24138	24143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825153
546	NC_009566	ATT	2	6	24150	24155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
547	NC_009566	GAT	2	6	24157	24162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825153
548	NC_009566	CCATT	2	10	24170	24179	20 %	40 %	0 %	40 %	148825153
549	NC_009566	AAG	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
550	NC_009566	ATTT	2	8	24253	24260	25 %	75 %	0 %	0 %	148825153
551	NC_009566	AGA	2	6	24270	24275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
552	NC_009566	CGT	2	6	24277	24282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825153
553	NC_009566	AGA	2	6	24372	24377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
554	NC_009566	A	6	6	24474	24479	100 %	0 %	0 %	0 %	148825153
555	NC_009566	GACA	2	8	24528	24535	50 %	0 %	25 %	25 %	148825153
556	NC_009566	TTA	2	6	24598	24603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
557	NC_009566	ATT	2	6	24617	24622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
558	NC_009566	A	6	6	24627	24632	100 %	0 %	0 %	0 %	148825153
559	NC_009566	ATT	2	6	24692	24697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
560	NC_009566	ATC	2	6	24701	24706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825153
561	NC_009566	ATT	2	6	24711	24716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
562	NC_009566	GAA	2	6	24808	24813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
563	NC_009566	ATT	2	6	24841	24846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
564	NC_009566	ATT	2	6	24851	24856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
565	NC_009566	CAGC	2	8	24877	24884	25 %	0 %	25 %	50 %	148825153
566	NC_009566	CGTGGA	2	12	24911	24922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148825153
567	NC_009566	GAA	3	9	24982	24990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
568	NC_009566	GGC	2	6	25032	25037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825153
569	NC_009566	GGT	2	6	25101	25106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825153
570	NC_009566	ATT	2	6	25122	25127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825153
571	NC_009566	ACC	3	9	25132	25140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825153
572	NC_009566	CA	3	6	25148	25153	50 %	0 %	0 %	50 %	148825153
573	NC_009566	TGAAGC	2	12	25161	25172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825153
574	NC_009566	AATT	2	8	25214	25221	50 %	50 %	0 %	0 %	148825153
575	NC_009566	AAG	2	6	25268	25273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
576	NC_009566	GTG	2	6	25394	25399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825153
577	NC_009566	CGT	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825153
578	NC_009566	GGT	2	6	25527	25532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825153
579	NC_009566	TTGC	2	8	25585	25592	0 %	50 %	25 %	25 %	148825153
580	NC_009566	TGA	2	6	25644	25649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825153
581	NC_009566	A	6	6	25681	25686	100 %	0 %	0 %	0 %	148825153
582	NC_009566	A	6	6	25802	25807	100 %	0 %	0 %	0 %	148825153
583	NC_009566	TGA	2	6	25890	25895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825153
584	NC_009566	CTG	2	6	25976	25981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825153
585	NC_009566	GAA	2	6	25999	26004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825153
586	NC_009566	TCA	2	6	26088	26093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825153
587	NC_009566	TCA	2	6	26113	26118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825153
588	NC_009566	GCATT	2	10	26213	26222	20 %	40 %	20 %	20 %	148825153
589	NC_009566	TAA	2	6	26331	26336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825153
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591	NC_009566	A	6	6	26377	26382	100 %	0 %	0 %	0 %	148825153
592	NC_009566	ATT	2	6	26402	26407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009566	T	7	7	26413	26419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009566	CTTTC	2	10	26424	26433	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
595	NC_009566	T	6	6	26459	26464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009566	TTTA	2	8	26484	26491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009566	GTAT	2	8	26593	26600	25 %	50 %	25 %	0 %	148825154
598	NC_009566	GTG	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825154
599	NC_009566	TGA	2	6	26666	26671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825154
600	NC_009566	GAT	2	6	26739	26744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825154
601	NC_009566	GAA	2	6	26775	26780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825154
602	NC_009566	GCA	2	6	26790	26795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825154
603	NC_009566	TCG	2	6	26924	26929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825154
604	NC_009566	ACA	2	6	27006	27011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825154
605	NC_009566	ACA	2	6	27015	27020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825154
606	NC_009566	CTTT	2	8	27099	27106	0 %	75 %	0 %	25 %	148825154
607	NC_009566	TCG	2	6	27193	27198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825154
608	NC_009566	ATTTT	2	10	27239	27248	20 %	80 %	0 %	0 %	148825154
609	NC_009566	TTGCA	2	10	27280	27289	20 %	40 %	20 %	20 %	148825154
610	NC_009566	ATG	2	6	27295	27300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825154
611	NC_009566	TAA	2	6	27329	27334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825154
612	NC_009566	TGG	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825154
613	NC_009566	A	6	6	27429	27434	100 %	0 %	0 %	0 %	148825154
614	NC_009566	GAT	2	6	27456	27461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825154
615	NC_009566	ATT	2	6	27483	27488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825154
616	NC_009566	ATGA	2	8	27576	27583	50 %	25 %	25 %	0 %	148825154
617	NC_009566	A	6	6	27583	27588	100 %	0 %	0 %	0 %	148825154
618	NC_009566	ATT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825154
619	NC_009566	GCT	2	6	27651	27656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825154
620	NC_009566	GC	3	6	27660	27665	0 %	0 %	50 %	50 %	148825154
621	NC_009566	AGC	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825154
622	NC_009566	CT	3	6	27768	27773	0 %	50 %	0 %	50 %	148825154
623	NC_009566	TGG	2	6	27784	27789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825154
624	NC_009566	GGT	2	6	27804	27809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825154
625	NC_009566	TGT	2	6	27901	27906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825154
626	NC_009566	TGA	2	6	27959	27964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825154
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628	NC_009566	GCC	2	6	28112	28117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148825154
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630	NC_009566	AATG	2	8	28241	28248	50 %	25 %	25 %	0 %	148825154
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