MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 72832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009138	CGC	2	6	23511	23516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093316
502	NC_009138	TCA	2	6	23520	23525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093316
503	NC_009138	GAT	2	6	23563	23568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093316
504	NC_009138	ACG	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093316
505	NC_009138	CG	4	8	23643	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	134093316
506	NC_009138	ATC	2	6	23662	23667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093316
507	NC_009138	TGA	2	6	23711	23716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093316
508	NC_009138	TTC	2	6	23835	23840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093316
509	NC_009138	TCG	2	6	23846	23851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093316
510	NC_009138	GCAT	2	8	23868	23875	25 %	25 %	25 %	25 %	134093316
511	NC_009138	TG	3	6	23948	23953	0 %	50 %	50 %	0 %	134093316
512	NC_009138	T	6	6	23996	24001	0 %	100 %	0 %	0 %	134093316
513	NC_009138	GCG	2	6	24122	24127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093317
514	NC_009138	GAC	2	6	24153	24158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093317
515	NC_009138	AG	3	6	24189	24194	50 %	0 %	50 %	0 %	134093317
516	NC_009138	GC	3	6	24281	24286	0 %	0 %	50 %	50 %	134093317
517	NC_009138	GCC	2	6	24289	24294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093317
518	NC_009138	T	6	6	24298	24303	0 %	100 %	0 %	0 %	134093317
519	NC_009138	ATC	2	6	24331	24336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009138	TGA	2	6	24339	24344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009138	A	7	7	24350	24356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009138	T	6	6	24373	24378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009138	ACT	2	6	24425	24430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093318
524	NC_009138	GCT	2	6	24479	24484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
525	NC_009138	CTT	2	6	24693	24698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093318
526	NC_009138	TGC	2	6	24795	24800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
527	NC_009138	CGA	2	6	24867	24872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093318
528	NC_009138	GATC	2	8	24882	24889	25 %	25 %	25 %	25 %	134093318
529	NC_009138	GCT	2	6	24890	24895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
530	NC_009138	GCC	3	9	24910	24918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
531	NC_009138	TTG	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134093318
532	NC_009138	GCC	2	6	25069	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
533	NC_009138	CTG	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
534	NC_009138	ATG	2	6	25136	25141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093318
535	NC_009138	CCG	2	6	25250	25255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
536	NC_009138	TGCG	2	8	25290	25297	0 %	25 %	50 %	25 %	134093318
537	NC_009138	GGC	2	6	25306	25311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093318
538	NC_009138	TGC	2	6	25312	25317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
539	NC_009138	CGA	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093318
540	NC_009138	CGT	2	6	25347	25352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
541	NC_009138	TTC	2	6	25372	25377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093318
542	NC_009138	TTG	2	6	25388	25393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134093318
543	NC_009138	CCG	2	6	25394	25399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
544	NC_009138	GTC	2	6	25469	25474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
545	NC_009138	ATG	2	6	25484	25489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093318
546	NC_009138	GCC	2	6	25519	25524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
547	NC_009138	ATGG	2	8	25686	25693	25 %	25 %	50 %	0 %	134093318
548	NC_009138	CCG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093318
549	NC_009138	GCA	2	6	25704	25709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093318
550	NC_009138	AGTGA	2	10	25721	25730	40 %	20 %	40 %	0 %	134093318
551	NC_009138	TGA	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093318
552	NC_009138	AAG	2	6	25797	25802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093318
553	NC_009138	TCG	2	6	25811	25816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093318
554	NC_009138	GCA	2	6	25869	25874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093318
555	NC_009138	CGA	2	6	25917	25922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093318
556	NC_009138	ATG	2	6	25988	25993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093318
557	NC_009138	CTTT	2	8	26002	26009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_009138	TAAA	2	8	26018	26025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009138	TGC	2	6	26066	26071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009138	ACT	2	6	26137	26142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009138	CTT	2	6	26148	26153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093319
562	NC_009138	T	6	6	26190	26195	0 %	100 %	0 %	0 %	134093319
563	NC_009138	CTT	2	6	26199	26204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093319
564	NC_009138	TGC	2	6	26251	26256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093319
565	NC_009138	TGA	2	6	26322	26327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093319
566	NC_009138	TGGGT	2	10	26411	26420	0 %	40 %	60 %	0 %	134093319
567	NC_009138	TTTGC	2	10	26438	26447	0 %	60 %	20 %	20 %	134093319
568	NC_009138	GGT	2	6	26497	26502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093319
569	NC_009138	GCTC	2	8	26765	26772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_009138	ATT	2	6	26773	26778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009138	TTC	2	6	26796	26801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009138	CTT	2	6	26840	26845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009138	TAT	2	6	26861	26866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009138	TGC	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009138	A	7	7	26999	27005	100 %	0 %	0 %	0 %	134093320
576	NC_009138	TGGG	2	8	27038	27045	0 %	25 %	75 %	0 %	134093320
577	NC_009138	AGC	2	6	27093	27098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093320
578	NC_009138	CGCATC	2	12	27174	27185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	134093320
579	NC_009138	GCG	2	6	27252	27257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093320
580	NC_009138	GCCGGC	2	12	27290	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	134093320
581	NC_009138	GAA	2	6	27311	27316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093320
582	NC_009138	CGG	2	6	27343	27348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093320
583	NC_009138	GC	3	6	27386	27391	0 %	0 %	50 %	50 %	134093320
584	NC_009138	CGC	2	6	27402	27407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093320
585	NC_009138	CAG	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093320
586	NC_009138	GCG	2	6	27512	27517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093320
587	NC_009138	ATG	2	6	27639	27644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093320
588	NC_009138	CG	4	8	27652	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	134093320
589	NC_009138	TGC	2	6	27672	27677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093320
590	NC_009138	AGC	2	6	27683	27688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093320
591	NC_009138	GTG	2	6	27725	27730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093320
592	NC_009138	GCG	2	6	27741	27746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093320
593	NC_009138	TGA	2	6	27786	27791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093320
594	NC_009138	CGC	2	6	27917	27922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009138	CGGC	2	8	27927	27934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_009138	CAC	2	6	27960	27965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_009138	TCC	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_009138	TTTC	2	8	28028	28035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_009138	TTCAA	2	10	28040	28049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_009138	TCT	2	6	28064	28069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093321
601	NC_009138	CGC	2	6	28126	28131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093321
602	NC_009138	TG	3	6	28143	28148	0 %	50 %	50 %	0 %	134093321
603	NC_009138	GAC	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093321
604	NC_009138	GAA	2	6	28205	28210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093321
605	NC_009138	CGA	2	6	28246	28251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093321
606	NC_009138	ATC	2	6	28295	28300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093321
607	NC_009138	GC	3	6	28313	28318	0 %	0 %	50 %	50 %	134093321
608	NC_009138	GCA	2	6	28423	28428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093321
609	NC_009138	TGC	2	6	28437	28442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093321
610	NC_009138	CAG	2	6	28472	28477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093321
611	NC_009138	CGC	2	6	28512	28517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093321
612	NC_009138	GGC	2	6	28673	28678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093321
613	NC_009138	CCG	2	6	28694	28699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093321
614	NC_009138	GT	3	6	28706	28711	0 %	50 %	50 %	0 %	134093321
615	NC_009138	GC	3	6	28743	28748	0 %	0 %	50 %	50 %	134093321
616	NC_009138	TGC	2	6	28776	28781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093321
617	NC_009138	CGG	2	6	28820	28825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009138	CAA	2	6	28839	28844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009138	GGAA	2	8	28871	28878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009138	ATT	2	6	28904	28909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093322
621	NC_009138	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	134093322
622	NC_009138	ATC	2	6	29004	29009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093322
623	NC_009138	CGG	2	6	29042	29047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093322
624	NC_009138	GC	3	6	29135	29140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_009138	CGA	2	6	29179	29184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093323
626	NC_009138	CG	3	6	29210	29215	0 %	0 %	50 %	50 %	134093323
627	NC_009138	CGGG	2	8	29223	29230	0 %	0 %	75 %	25 %	134093323
628	NC_009138	ATC	2	6	29298	29303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093323
629	NC_009138	TGC	3	9	29316	29324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093323
630	NC_009138	GCA	2	6	29371	29376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093323
631	NC_009138	TCG	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093323
632	NC_009138	GCGCG	2	10	29459	29468	0 %	0 %	60 %	40 %	134093323
633	NC_009138	CCA	2	6	29469	29474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093323
634	NC_009138	CGCAA	2	10	29490	29499	40 %	0 %	20 %	40 %	134093323
635	NC_009138	GC	3	6	29519	29524	0 %	0 %	50 %	50 %	134093323
636	NC_009138	CGCA	2	8	29572	29579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_009138	TCGACA	2	12	29662	29673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_009138	TGA	2	6	29810	29815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093324
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640	NC_009138	GAA	2	6	29842	29847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093324
641	NC_009138	GCG	2	6	30023	30028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093324
642	NC_009138	TCG	2	6	30047	30052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093324
643	NC_009138	CTG	2	6	30115	30120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093324
644	NC_009138	CCG	2	6	30158	30163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093324
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647	NC_009138	TTC	2	6	30336	30341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093325
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649	NC_009138	CCGC	2	8	30358	30365	0 %	0 %	25 %	75 %	134093325
650	NC_009138	GAA	2	6	30397	30402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093325
651	NC_009138	GCT	2	6	30507	30512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093325
652	NC_009138	ATC	2	6	30617	30622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093325
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654	NC_009138	GAA	2	6	30640	30645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093325
655	NC_009138	GCT	2	6	30734	30739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_009138	ACCTG	2	10	30937	30946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
657	NC_009138	CG	3	6	31006	31011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
658	NC_009138	CATT	2	8	31012	31019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
659	NC_009138	CCG	2	6	31062	31067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093326
660	NC_009138	TTTGCA	2	12	31099	31110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134093326
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662	NC_009138	GC	3	6	31189	31194	0 %	0 %	50 %	50 %	134093326
663	NC_009138	CATC	2	8	31244	31251	25 %	25 %	0 %	50 %	134093326
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671	NC_009138	TGA	2	6	31635	31640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093326
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