MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 66757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008789	CAGGTG	2	12	46724	46735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121996854
1003	NC_008789	C	6	6	46759	46764	0 %	0 %	0 %	100 %	121996854
1004	NC_008789	CTCGC	2	10	46886	46895	0 %	20 %	20 %	60 %	121996854
1005	NC_008789	GGTGG	2	10	46934	46943	0 %	20 %	80 %	0 %	121996854
1006	NC_008789	CCG	2	6	47055	47060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996854
1007	NC_008789	TGG	2	6	47076	47081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996854
1008	NC_008789	CAC	2	6	47123	47128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996854
1009	NC_008789	CAT	2	6	47150	47155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996854
1010	NC_008789	CTG	2	6	47207	47212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996854
1011	NC_008789	CGGTC	2	10	47239	47248	0 %	20 %	40 %	40 %	121996854
1012	NC_008789	AGC	2	6	47249	47254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996854
1013	NC_008789	TCCCC	2	10	47275	47284	0 %	20 %	0 %	80 %	121996854
1014	NC_008789	GTGG	2	8	47288	47295	0 %	25 %	75 %	0 %	121996854
1015	NC_008789	GCC	2	6	47300	47305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996854
1016	NC_008789	CGA	2	6	47371	47376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996854
1017	NC_008789	GTC	2	6	47471	47476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996854
1018	NC_008789	ACC	2	6	47507	47512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996854
1019	NC_008789	ACA	2	6	47625	47630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121996854
1020	NC_008789	C	6	6	47686	47691	0 %	0 %	0 %	100 %	121996855
1021	NC_008789	CCA	2	6	47729	47734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996855
1022	NC_008789	ACC	2	6	47806	47811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996855
1023	NC_008789	AGA	2	6	47834	47839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121996855
1024	NC_008789	ATG	3	9	47842	47850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996855
1025	NC_008789	AGC	2	6	47860	47865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996855
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1027	NC_008789	CAT	2	6	47949	47954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996855
1028	NC_008789	ACCAGC	2	12	47962	47973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121996855
1029	NC_008789	CCA	2	6	47991	47996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996855
1030	NC_008789	GTG	2	6	47997	48002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996855
1031	NC_008789	CGG	2	6	48044	48049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996855
1032	NC_008789	GCC	2	6	48140	48145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996856
1033	NC_008789	GGT	2	6	48214	48219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996856
1034	NC_008789	CAG	2	6	48242	48247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996856
1035	NC_008789	GTA	2	6	48293	48298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996856
1036	NC_008789	CGG	2	6	48307	48312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996856
1037	NC_008789	CGA	2	6	48331	48336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996856
1038	NC_008789	CCG	2	6	48343	48348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996856
1039	NC_008789	GCA	2	6	48379	48384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996856
1040	NC_008789	AGC	2	6	48390	48395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996856
1041	NC_008789	GA	3	6	48430	48435	50 %	0 %	50 %	0 %	121996856
1042	NC_008789	GCG	2	6	48492	48497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008789	GAA	2	6	48510	48515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008789	GAT	2	6	48520	48525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008789	AAG	2	6	48563	48568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008789	CAG	2	6	48581	48586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008789	GAG	2	6	48707	48712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008789	CGT	2	6	48804	48809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1049	NC_008789	CGA	2	6	48822	48827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996857
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1051	NC_008789	GCC	2	6	48877	48882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996857
1052	NC_008789	CTG	2	6	48925	48930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1053	NC_008789	GAC	2	6	48955	48960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1054	NC_008789	CGA	2	6	48981	48986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1055	NC_008789	TGC	2	6	49025	49030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996857
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1057	NC_008789	GCC	2	6	49081	49086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996857
1058	NC_008789	GGCG	2	8	49292	49299	0 %	0 %	75 %	25 %	121996857
1059	NC_008789	CGG	2	6	49383	49388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996857
1060	NC_008789	CG	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	121996857
1061	NC_008789	AGC	2	6	49460	49465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1062	NC_008789	GCC	2	6	49477	49482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996857
1063	NC_008789	CGG	2	6	49499	49504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996857
1064	NC_008789	GGCC	2	8	49539	49546	0 %	0 %	50 %	50 %	121996857
1065	NC_008789	GCG	2	6	49558	49563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996857
1066	NC_008789	TCG	2	6	49580	49585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996857
1067	NC_008789	CTCGC	2	10	49588	49597	0 %	20 %	20 %	60 %	121996857
1068	NC_008789	CGGCTC	2	12	49645	49656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121996857
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1071	NC_008789	CGG	2	6	49785	49790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1072	NC_008789	CGG	2	6	49792	49797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
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1075	NC_008789	CCG	2	6	49869	49874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996858
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1077	NC_008789	CGT	2	6	49908	49913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
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1083	NC_008789	CG	3	6	50130	50135	0 %	0 %	50 %	50 %	121996858
1084	NC_008789	GCC	2	6	50141	50146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996858
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1087	NC_008789	ACC	2	6	50459	50464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996858
1088	NC_008789	TGG	2	6	50525	50530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996858
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1090	NC_008789	CAT	2	6	50572	50577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996858
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1092	NC_008789	GCG	2	6	50617	50622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
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1094	NC_008789	CTT	2	6	50806	50811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996858
1095	NC_008789	CGA	2	6	50838	50843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996858
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1098	NC_008789	CAT	2	6	50977	50982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996858
1099	NC_008789	CCT	2	6	51009	51014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996858
1100	NC_008789	CGG	2	6	51060	51065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1101	NC_008789	CGG	2	6	51077	51082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1102	NC_008789	GCG	2	6	51133	51138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996858
1103	NC_008789	TCG	2	6	51158	51163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996858
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1105	NC_008789	GGCC	2	8	51215	51222	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
1106	NC_008789	CGG	2	6	51397	51402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
1107	NC_008789	GC	3	6	51430	51435	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
1108	NC_008789	TGC	2	6	51466	51471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
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1110	NC_008789	GGT	2	6	51537	51542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996859
1111	NC_008789	TGC	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1112	NC_008789	C	6	6	51555	51560	0 %	0 %	0 %	100 %	121996859
1113	NC_008789	GATC	2	8	51602	51609	25 %	25 %	25 %	25 %	121996859
1114	NC_008789	TCG	2	6	51628	51633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
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1116	NC_008789	C	6	6	51678	51683	0 %	0 %	0 %	100 %	121996859
1117	NC_008789	CAGC	2	8	51735	51742	25 %	0 %	25 %	50 %	121996859
1118	NC_008789	CGG	2	6	51800	51805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
1119	NC_008789	CG	3	6	51833	51838	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
1120	NC_008789	CAG	2	6	51864	51869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996859
1121	NC_008789	CGG	2	6	51961	51966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996859
1122	NC_008789	CTC	2	6	52041	52046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996859
1123	NC_008789	TCG	2	6	52066	52071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996859
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1125	NC_008789	CTT	2	6	52202	52207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_008789	CGG	2	6	58006	58011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996863
1254	NC_008789	CGG	2	6	58030	58035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996863
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1259	NC_008789	CGA	2	6	58150	58155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996863
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1281	NC_008789	ATC	2	6	59096	59101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996863
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1349	NC_008789	ATACCG	2	12	62133	62144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121996866
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1351	NC_008789	C	7	7	62177	62183	0 %	0 %	0 %	100 %	121996866
1352	NC_008789	CAG	3	9	62213	62221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996866
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1355	NC_008789	CCGC	2	8	62379	62386	0 %	0 %	25 %	75 %	121996866
1356	NC_008789	CCG	2	6	62398	62403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996866
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1359	NC_008789	GC	3	6	62508	62513	0 %	0 %	50 %	50 %	121996866
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1369	NC_008789	TCC	2	6	62769	62774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996866
1370	NC_008789	GCA	2	6	62836	62841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996866
1371	NC_008789	GCT	2	6	62848	62853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996866
1372	NC_008789	TCGGC	2	10	62890	62899	0 %	20 %	40 %	40 %	121996866
1373	NC_008789	CGG	2	6	62971	62976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996866
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