MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 66757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008789	CGT	2	6	195825	195830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996975
4502	NC_008789	GCG	2	6	195866	195871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996975
4503	NC_008789	AGC	2	6	195936	195941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_008789	G	6	6	195947	195952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008789	TGC	2	6	196009	196014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008789	CAC	2	6	196089	196094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_008789	GGA	2	6	196171	196176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_008789	CT	3	6	196266	196271	0 %	50 %	0 %	50 %	121996976
4509	NC_008789	AAC	2	6	196531	196536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121996976
4510	NC_008789	TCG	2	6	196570	196575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4511	NC_008789	CGA	2	6	196598	196603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4512	NC_008789	CGG	2	6	196641	196646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996976
4513	NC_008789	CGCCA	2	10	196701	196710	20 %	0 %	20 %	60 %	121996976
4514	NC_008789	GGC	3	9	196715	196723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996976
4515	NC_008789	GCA	2	6	196724	196729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4516	NC_008789	GGC	2	6	196736	196741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996976
4517	NC_008789	GGC	2	6	196793	196798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996976
4518	NC_008789	TCACC	2	10	196811	196820	20 %	20 %	0 %	60 %	121996976
4519	NC_008789	GGA	2	6	196850	196855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996976
4520	NC_008789	CGC	2	6	196859	196864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996976
4521	NC_008789	CGA	2	6	196907	196912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4522	NC_008789	TCG	2	6	196945	196950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4523	NC_008789	CGT	2	6	196973	196978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996976
4524	NC_008789	GCAGC	2	10	197021	197030	20 %	0 %	40 %	40 %	121996976
4525	NC_008789	GAG	2	6	197034	197039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996976
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4530	NC_008789	CGCA	2	8	197285	197292	25 %	0 %	25 %	50 %	121996976
4531	NC_008789	GACCA	2	10	197328	197337	40 %	0 %	20 %	40 %	121996976
4532	NC_008789	GGC	2	6	197366	197371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996976
4533	NC_008789	GAG	2	6	197412	197417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996976
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4535	NC_008789	GCA	2	6	197455	197460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
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4537	NC_008789	CAG	2	6	197529	197534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
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4539	NC_008789	CG	3	6	197590	197595	0 %	0 %	50 %	50 %	121996976
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4541	NC_008789	CAG	2	6	197646	197651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996976
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4543	NC_008789	GGCC	2	8	197876	197883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_008789	CGT	2	6	197945	197950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996977
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4550	NC_008789	C	6	6	198459	198464	0 %	0 %	0 %	100 %	121996978
4551	NC_008789	CGT	2	6	198483	198488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996978
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4553	NC_008789	GGT	2	6	198604	198609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996978
4554	NC_008789	CAC	2	6	198636	198641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996978
4555	NC_008789	CCA	2	6	198660	198665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996978
4556	NC_008789	GCA	2	6	198789	198794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996978
4557	NC_008789	GGTGA	2	10	198808	198817	20 %	20 %	60 %	0 %	121996978
4558	NC_008789	TCGACA	2	12	198839	198850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121996978
4559	NC_008789	CGGG	2	8	198893	198900	0 %	0 %	75 %	25 %	121996978
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4562	NC_008789	GC	3	6	198959	198964	0 %	0 %	50 %	50 %	121996978
4563	NC_008789	TCT	2	6	198992	198997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996978
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4567	NC_008789	CCCG	2	8	199234	199241	0 %	0 %	25 %	75 %	121996978
4568	NC_008789	C	7	7	199348	199354	0 %	0 %	0 %	100 %	121996978
4569	NC_008789	CCGG	2	8	199447	199454	0 %	0 %	50 %	50 %	121996978
4570	NC_008789	AGGT	2	8	199475	199482	25 %	25 %	50 %	0 %	121996978
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4573	NC_008789	CAG	2	6	199555	199560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996978
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4584	NC_008789	TCG	2	6	199990	199995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996979
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4591	NC_008789	GCC	2	6	200202	200207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_008789	GGC	2	6	200231	200236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996980
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4595	NC_008789	TCC	2	6	200396	200401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996980
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4601	NC_008789	TCAA	2	8	200855	200862	50 %	25 %	0 %	25 %	121996980
4602	NC_008789	CGT	2	6	200887	200892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996980
4603	NC_008789	GC	3	6	200989	200994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_008789	GC	3	6	200996	201001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_008789	ATGGA	2	10	201045	201054	40 %	20 %	40 %	0 %	121996981
4606	NC_008789	CAC	2	6	201078	201083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996981
4607	NC_008789	CCA	2	6	201101	201106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996981
4608	NC_008789	CAGC	2	8	201137	201144	25 %	0 %	25 %	50 %	121996981
4609	NC_008789	CGC	2	6	201194	201199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996981
4610	NC_008789	GCA	2	6	201200	201205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996981
4611	NC_008789	CGGC	2	8	201226	201233	0 %	0 %	50 %	50 %	121996981
4612	NC_008789	GGT	2	6	201308	201313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996981
4613	NC_008789	CCG	2	6	201357	201362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996981
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4617	NC_008789	CGA	2	6	201587	201592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996981
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4619	NC_008789	TGG	2	6	201649	201654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996981
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4621	NC_008789	GC	3	6	201822	201827	0 %	0 %	50 %	50 %	121996981
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4991	NC_008789	CGG	2	6	217705	217710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996995
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4995	NC_008789	CGC	2	6	217795	217800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996995
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