MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008358	TCA	2	6	223779	223784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797106
5002	NC_008358	TG	3	6	223880	223885	0 %	50 %	50 %	0 %	114797106
5003	NC_008358	TGA	2	6	223966	223971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797106
5004	NC_008358	CTG	2	6	223988	223993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797106
5005	NC_008358	TCC	2	6	224018	224023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797106
5006	NC_008358	ATGA	2	8	224045	224052	50 %	25 %	25 %	0 %	114797106
5007	NC_008358	CAGA	2	8	224075	224082	50 %	0 %	25 %	25 %	114797106
5008	NC_008358	GGC	2	6	224104	224109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797106
5009	NC_008358	TCGCT	2	10	224115	224124	0 %	40 %	20 %	40 %	114797106
5010	NC_008358	CACCT	2	10	224127	224136	20 %	20 %	0 %	60 %	114797106
5011	NC_008358	GCC	2	6	224173	224178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_008358	AAT	2	6	224239	224244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008358	TTG	2	6	224272	224277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008358	GCT	2	6	224287	224292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_008358	GGGC	2	8	224400	224407	0 %	0 %	75 %	25 %	114800539
5016	NC_008358	GCG	2	6	224444	224449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800539
5017	NC_008358	GCT	2	6	224466	224471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5018	NC_008358	ATG	2	6	224546	224551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800539
5019	NC_008358	TGA	2	6	224628	224633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800539
5020	NC_008358	CGA	2	6	224675	224680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5021	NC_008358	GC	3	6	224685	224690	0 %	0 %	50 %	50 %	114800539
5022	NC_008358	GGC	2	6	224880	224885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800539
5023	NC_008358	AAC	2	6	224999	225004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114800539
5024	NC_008358	CTG	2	6	225010	225015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5025	NC_008358	ACA	2	6	225059	225064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114800539
5026	NC_008358	GAC	2	6	225114	225119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5027	NC_008358	GAA	2	6	225252	225257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114800539
5028	NC_008358	AGG	2	6	225308	225313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800539
5029	NC_008358	CCG	2	6	225314	225319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800539
5030	NC_008358	TGG	2	6	225368	225373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114800539
5031	NC_008358	GTC	2	6	225379	225384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5032	NC_008358	ATC	2	6	225409	225414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800539
5033	NC_008358	GCC	2	6	225482	225487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800539
5034	NC_008358	GAG	2	6	225502	225507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800539
5035	NC_008358	GCT	2	6	225522	225527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800539
5036	NC_008358	GC	3	6	225550	225555	0 %	0 %	50 %	50 %	114799545
5037	NC_008358	CAA	2	6	225572	225577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799545
5038	NC_008358	CGA	2	6	225581	225586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799545
5039	NC_008358	TCC	2	6	225589	225594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114799545
5040	NC_008358	TCG	2	6	225607	225612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799545
5041	NC_008358	AGC	2	6	225631	225636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799545
5042	NC_008358	GC	3	6	225661	225666	0 %	0 %	50 %	50 %	114799545
5043	NC_008358	GCT	2	6	225677	225682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799545
5044	NC_008358	GCG	2	6	225705	225710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799545
5045	NC_008358	GAAG	2	8	225740	225747	50 %	0 %	50 %	0 %	114799545
5046	NC_008358	GAA	2	6	225762	225767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799545
5047	NC_008358	TA	3	6	225825	225830	50 %	50 %	0 %	0 %	114799545
5048	NC_008358	GATG	2	8	225841	225848	25 %	25 %	50 %	0 %	114799545
5049	NC_008358	GATC	2	8	225880	225887	25 %	25 %	25 %	25 %	114799545
5050	NC_008358	CGAACG	2	12	225920	225931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799545
5051	NC_008358	GCCGCA	2	12	225933	225944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114799545
5052	NC_008358	GCAG	2	8	226034	226041	25 %	0 %	50 %	25 %	114799545
5053	NC_008358	CGG	2	6	226141	226146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799545
5054	NC_008358	GGCG	2	8	226221	226228	0 %	0 %	75 %	25 %	114799545
5055	NC_008358	TAT	2	6	226233	226238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114799545
5056	NC_008358	TGG	2	6	226273	226278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799545
5057	NC_008358	CGGA	2	8	226412	226419	25 %	0 %	50 %	25 %	114799545
5058	NC_008358	GCG	2	6	226465	226470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799545
5059	NC_008358	GTG	2	6	226481	226486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799545
5060	NC_008358	GCTG	2	8	226521	226528	0 %	25 %	50 %	25 %	114797779
5061	NC_008358	GC	3	6	226600	226605	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5062	NC_008358	TGC	2	6	226641	226646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797779
5063	NC_008358	GGC	2	6	226686	226691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5064	NC_008358	AGG	3	9	226805	226813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114797779
5065	NC_008358	CG	3	6	226814	226819	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5066	NC_008358	GCTG	2	8	226824	226831	0 %	25 %	50 %	25 %	114797779
5067	NC_008358	ATG	2	6	226838	226843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797779
5068	NC_008358	GC	3	6	226864	226869	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5069	NC_008358	CGGAAG	2	12	226874	226885	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114797779
5070	NC_008358	GCC	2	6	226927	226932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797779
5071	NC_008358	GAA	2	6	226933	226938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797779
5072	NC_008358	GC	3	6	226956	226961	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5073	NC_008358	GCC	2	6	227079	227084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797779
5074	NC_008358	GCC	2	6	227191	227196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797779
5075	NC_008358	TCG	2	6	227234	227239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797779
5076	NC_008358	GC	4	8	227248	227255	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5077	NC_008358	TCGGA	2	10	227293	227302	20 %	20 %	40 %	20 %	114797779
5078	NC_008358	GGC	2	6	227307	227312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
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5080	NC_008358	AAG	2	6	227396	227401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797779
5081	NC_008358	CGG	2	6	227408	227413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5082	NC_008358	GCG	2	6	227421	227426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5083	NC_008358	CTG	2	6	227473	227478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797779
5084	NC_008358	GAC	2	6	227503	227508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797779
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5086	NC_008358	GCCG	2	8	227566	227573	0 %	0 %	50 %	50 %	114797779
5087	NC_008358	CGA	2	6	227601	227606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797779
5088	NC_008358	GGGC	2	8	227611	227618	0 %	0 %	75 %	25 %	114797779
5089	NC_008358	GCAG	2	8	227630	227637	25 %	0 %	50 %	25 %	114797779
5090	NC_008358	GTT	2	6	227671	227676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114797779
5091	NC_008358	TGA	2	6	227691	227696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797779
5092	NC_008358	GCGCG	2	10	227733	227742	0 %	0 %	60 %	40 %	114797779
5093	NC_008358	CGGT	2	8	227758	227765	0 %	25 %	50 %	25 %	114797779
5094	NC_008358	GCG	2	6	227766	227771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5095	NC_008358	G	6	6	227850	227855	0 %	0 %	100 %	0 %	114797779
5096	NC_008358	CGG	2	6	227862	227867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5097	NC_008358	CGGGG	2	10	227911	227920	0 %	0 %	80 %	20 %	114797779
5098	NC_008358	GCC	2	6	227952	227957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797779
5099	NC_008358	GCG	2	6	227984	227989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797779
5100	NC_008358	CCTTC	2	10	227996	228005	0 %	40 %	0 %	60 %	114797779
5101	NC_008358	GAAG	2	8	228014	228021	50 %	0 %	50 %	0 %	114797779
5102	NC_008358	CGGG	2	8	228041	228048	0 %	0 %	75 %	25 %	114797779
5103	NC_008358	GATC	2	8	228124	228131	25 %	25 %	25 %	25 %	114800356
5104	NC_008358	CAC	2	6	228184	228189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114800356
5105	NC_008358	CCG	2	6	228236	228241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800356
5106	NC_008358	TGC	2	6	228251	228256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800356
5107	NC_008358	GCTG	2	8	228312	228319	0 %	25 %	50 %	25 %	114800356
5108	NC_008358	TCA	2	6	228339	228344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800356
5109	NC_008358	GCC	2	6	228367	228372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800356
5110	NC_008358	CTG	2	6	228402	228407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800356
5111	NC_008358	CAG	2	6	228466	228471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800356
5112	NC_008358	CGG	2	6	228480	228485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800356
5113	NC_008358	GC	3	6	228500	228505	0 %	0 %	50 %	50 %	114800356
5114	NC_008358	GAA	2	6	228631	228636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114800356
5115	NC_008358	ATG	2	6	228668	228673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800356
5116	NC_008358	CAT	2	6	228772	228777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800356
5117	NC_008358	GTGG	2	8	228793	228800	0 %	25 %	75 %	0 %	114800356
5118	NC_008358	CAT	2	6	228837	228842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800356
5119	NC_008358	GCG	2	6	228863	228868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800356
5120	NC_008358	GA	3	6	228923	228928	50 %	0 %	50 %	0 %	114800356
5121	NC_008358	GTA	2	6	228940	228945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800356
5122	NC_008358	GCG	2	6	229014	229019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800356
5123	NC_008358	CG	3	6	229027	229032	0 %	0 %	50 %	50 %	114800356
5124	NC_008358	GCC	2	6	229081	229086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800356
5125	NC_008358	AGG	2	6	229101	229106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800356
5126	NC_008358	TGC	2	6	229136	229141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800356
5127	NC_008358	GC	3	6	229196	229201	0 %	0 %	50 %	50 %	114800356
5128	NC_008358	GTC	2	6	229204	229209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800356
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5142	NC_008358	AGG	2	6	229648	229653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800069
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5147	NC_008358	CATG	2	8	229892	229899	25 %	25 %	25 %	25 %	114800069
5148	NC_008358	CGG	2	6	229921	229926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800069
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5152	NC_008358	CTC	2	6	230208	230213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5153	NC_008358	GC	3	6	230289	230294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5154	NC_008358	AGGC	2	8	230325	230332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5155	NC_008358	GCG	2	6	230333	230338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_008358	TCAT	2	8	230383	230390	25 %	50 %	0 %	25 %	114799076
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5180	NC_008358	CGTC	2	8	231437	231444	0 %	25 %	25 %	50 %	114798928
5181	NC_008358	TGA	2	6	231458	231463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798928
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5198	NC_008358	TTCG	2	8	231973	231980	0 %	50 %	25 %	25 %	114797942
5199	NC_008358	CCTG	2	8	232154	232161	0 %	25 %	25 %	50 %	114800445
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5233	NC_008358	GAT	2	6	233794	233799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797896
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5241	NC_008358	GAT	2	6	234135	234140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797896
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5243	NC_008358	CG	3	6	234205	234210	0 %	0 %	50 %	50 %	114797896
5244	NC_008358	GCCT	2	8	234265	234272	0 %	25 %	25 %	50 %	114797896
5245	NC_008358	ATG	2	6	234315	234320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797896
5246	NC_008358	CCG	2	6	234362	234367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798836
5247	NC_008358	CCG	2	6	234392	234397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798836
5248	NC_008358	TGA	2	6	234536	234541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798836
5249	NC_008358	GGC	2	6	234643	234648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798811
5250	NC_008358	GCT	2	6	234674	234679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798811
5251	NC_008358	GCC	2	6	234683	234688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798811
5252	NC_008358	AGG	2	6	234714	234719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114798811
5253	NC_008358	CGCTG	2	10	234724	234733	0 %	20 %	40 %	40 %	114798811
5254	NC_008358	GAT	2	6	234832	234837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798811
5255	NC_008358	CAG	2	6	234899	234904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798811
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5258	NC_008358	AGC	2	6	235026	235031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798811
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5264	NC_008358	ATG	3	9	235280	235288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798811
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5270	NC_008358	GCGG	2	8	235476	235483	0 %	0 %	75 %	25 %	114800000
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5275	NC_008358	GC	3	6	235555	235560	0 %	0 %	50 %	50 %	114800000
5276	NC_008358	GTC	2	6	235615	235620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800000
5277	NC_008358	GC	3	6	235655	235660	0 %	0 %	50 %	50 %	114800000
5278	NC_008358	GCGGG	2	10	235662	235671	0 %	0 %	80 %	20 %	114800000
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5283	NC_008358	CAT	2	6	235902	235907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800000
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5290	NC_008358	ATG	2	6	236294	236299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800000
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5294	NC_008358	A	6	6	236505	236510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_008358	GAT	2	6	236607	236612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797455
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5302	NC_008358	TTCAC	2	10	237124	237133	20 %	40 %	0 %	40 %	114797455
5303	NC_008358	GAT	2	6	237225	237230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797455
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5323	NC_008358	TCG	2	6	238124	238129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798459
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5330	NC_008358	GC	6	12	238574	238585	0 %	0 %	50 %	50 %	114798459
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5333	NC_008358	ATG	2	6	238637	238642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798459
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5338	NC_008358	CGGG	2	8	238979	238986	0 %	0 %	75 %	25 %	114798876
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5350	NC_008358	TGC	2	6	239697	239702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798876
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5354	NC_008358	CAC	2	6	239976	239981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798876
5355	NC_008358	AGCG	2	8	239983	239990	25 %	0 %	50 %	25 %	114798876
5356	NC_008358	CGA	2	6	240032	240037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798876
5357	NC_008358	CTGG	2	8	240048	240055	0 %	25 %	50 %	25 %	114798876
5358	NC_008358	TGC	2	6	240075	240080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798876
5359	NC_008358	GGC	2	6	240087	240092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798876
5360	NC_008358	TCG	2	6	240165	240170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799551
5361	NC_008358	CG	3	6	240203	240208	0 %	0 %	50 %	50 %	114799551
5362	NC_008358	CCAC	2	8	240282	240289	25 %	0 %	0 %	75 %	114799551
5363	NC_008358	CTGC	2	8	240297	240304	0 %	25 %	25 %	50 %	114799551
5364	NC_008358	AGAGGT	2	12	240310	240321	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114799551
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5366	NC_008358	CCG	2	6	240416	240421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799551
5367	NC_008358	GGA	2	6	240445	240450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799551
5368	NC_008358	TCG	2	6	240459	240464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799551
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5372	NC_008358	CGGC	2	8	240563	240570	0 %	0 %	50 %	50 %	114799551
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5488	NC_008358	CGA	2	6	245920	245925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798160
5489	NC_008358	GCCA	2	8	245952	245959	25 %	0 %	25 %	50 %	114798160
5490	NC_008358	CAGC	2	8	246061	246068	25 %	0 %	25 %	50 %	114798160
5491	NC_008358	TGA	2	6	246118	246123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798160
5492	NC_008358	TC	3	6	246144	246149	0 %	50 %	0 %	50 %	114798160
5493	NC_008358	GAGG	2	8	246150	246157	25 %	0 %	75 %	0 %	114798160
5494	NC_008358	CGCC	2	8	246193	246200	0 %	0 %	25 %	75 %	114799934
5495	NC_008358	GTC	2	6	246227	246232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799934
5496	NC_008358	GGGC	2	8	246349	246356	0 %	0 %	75 %	25 %	114799934
5497	NC_008358	TGG	2	6	246438	246443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799934
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5499	NC_008358	GCGG	2	8	246539	246546	0 %	0 %	75 %	25 %	114799934
5500	NC_008358	CGA	2	6	246565	246570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799934

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