MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 2094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	AT	3	6	916	921	50 %	50 %	0 %	0 %	113460150
2	NC_008309	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	AT	3	6	2013	2018	50 %	50 %	0 %	0 %	113460151
4	NC_008309	AT	3	6	4283	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
5	NC_008309	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
6	NC_008309	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	113460154
7	NC_008309	TG	3	6	8160	8165	0 %	50 %	50 %	0 %	113460154
8	NC_008309	TG	3	6	9667	9672	0 %	50 %	50 %	0 %	113460156
9	NC_008309	TG	3	6	11902	11907	0 %	50 %	50 %	0 %	113460160
10	NC_008309	CT	3	6	12983	12988	0 %	50 %	0 %	50 %	113460161
11	NC_008309	TG	3	6	14418	14423	0 %	50 %	50 %	0 %	113460162
12	NC_008309	GA	3	6	14863	14868	50 %	0 %	50 %	0 %	113460163
13	NC_008309	TG	3	6	16408	16413	0 %	50 %	50 %	0 %	113460165
14	NC_008309	TA	3	6	18986	18991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008309	AT	3	6	19012	19017	50 %	50 %	0 %	0 %	113460167
16	NC_008309	AT	3	6	19313	19318	50 %	50 %	0 %	0 %	113460167
17	NC_008309	GA	3	6	19482	19487	50 %	0 %	50 %	0 %	113460167
18	NC_008309	AG	3	6	19523	19528	50 %	0 %	50 %	0 %	113460167
19	NC_008309	TA	3	6	19786	19791	50 %	50 %	0 %	0 %	113460167
20	NC_008309	TC	3	6	20352	20357	0 %	50 %	0 %	50 %	113460168
21	NC_008309	CT	3	6	21024	21029	0 %	50 %	0 %	50 %	113460168
22	NC_008309	TA	3	6	21108	21113	50 %	50 %	0 %	0 %	113460168
23	NC_008309	GT	3	6	21352	21357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008309	TC	3	6	22158	22163	0 %	50 %	0 %	50 %	113460169
25	NC_008309	AG	3	6	22525	22530	50 %	0 %	50 %	0 %	113460170
26	NC_008309	GT	3	6	23776	23781	0 %	50 %	50 %	0 %	113460171
27	NC_008309	AT	3	6	24098	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	113460171
28	NC_008309	AT	3	6	24794	24799	50 %	50 %	0 %	0 %	113460172
29	NC_008309	AG	3	6	27089	27094	50 %	0 %	50 %	0 %	113460174
30	NC_008309	TC	3	6	27170	27175	0 %	50 %	0 %	50 %	113460175
31	NC_008309	TG	3	6	27878	27883	0 %	50 %	50 %	0 %	113460175
32	NC_008309	AG	3	6	28719	28724	50 %	0 %	50 %	0 %	113460176
33	NC_008309	CT	3	6	29024	29029	0 %	50 %	0 %	50 %	113460177
34	NC_008309	CT	3	6	30042	30047	0 %	50 %	0 %	50 %	113460177
35	NC_008309	AT	3	6	30177	30182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	GA	3	6	30862	30867	50 %	0 %	50 %	0 %	113460178
37	NC_008309	TC	3	6	30956	30961	0 %	50 %	0 %	50 %	113460178
38	NC_008309	AG	3	6	31167	31172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008309	TC	3	6	32247	32252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008309	CT	3	6	32332	32337	0 %	50 %	0 %	50 %	113460180
41	NC_008309	CT	3	6	32354	32359	0 %	50 %	0 %	50 %	113460180
42	NC_008309	CT	3	6	34456	34461	0 %	50 %	0 %	50 %	113460181
43	NC_008309	AT	3	6	35102	35107	50 %	50 %	0 %	0 %	113460182
44	NC_008309	AT	4	8	35335	35342	50 %	50 %	0 %	0 %	113460182
45	NC_008309	CT	3	6	36143	36148	0 %	50 %	0 %	50 %	113460183
46	NC_008309	AT	3	6	36485	36490	50 %	50 %	0 %	0 %	113460183
47	NC_008309	TG	3	6	36678	36683	0 %	50 %	50 %	0 %	113460183
48	NC_008309	AT	3	6	37413	37418	50 %	50 %	0 %	0 %	113460184
49	NC_008309	TA	3	6	38111	38116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008309	AG	3	6	38364	38369	50 %	0 %	50 %	0 %	113460185
51	NC_008309	GA	3	6	38707	38712	50 %	0 %	50 %	0 %	113460185
52	NC_008309	TC	3	6	38999	39004	0 %	50 %	0 %	50 %	113460185
53	NC_008309	TA	3	6	39147	39152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008309	AT	3	6	39411	39416	50 %	50 %	0 %	0 %	113460186
55	NC_008309	CT	3	6	39916	39921	0 %	50 %	0 %	50 %	113460187
56	NC_008309	GA	3	6	40716	40721	50 %	0 %	50 %	0 %	113460187
57	NC_008309	TA	3	6	42270	42275	50 %	50 %	0 %	0 %	113460188
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59	NC_008309	GA	3	6	44597	44602	50 %	0 %	50 %	0 %	113460191
60	NC_008309	AT	3	6	45480	45485	50 %	50 %	0 %	0 %	113460192
61	NC_008309	GA	3	6	45801	45806	50 %	0 %	50 %	0 %	113460192
62	NC_008309	TA	3	6	46696	46701	50 %	50 %	0 %	0 %	113460192
63	NC_008309	AT	3	6	46914	46919	50 %	50 %	0 %	0 %	113460192
64	NC_008309	GA	3	6	47927	47932	50 %	0 %	50 %	0 %	113460193
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66	NC_008309	TA	3	6	50420	50425	50 %	50 %	0 %	0 %	113460195
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68	NC_008309	AT	3	6	52038	52043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008309	CA	3	6	52707	52712	50 %	0 %	0 %	50 %	113460197
70	NC_008309	AG	3	6	54580	54585	50 %	0 %	50 %	0 %	113460198
71	NC_008309	AG	3	6	55698	55703	50 %	0 %	50 %	0 %	113460199
72	NC_008309	AC	3	6	55793	55798	50 %	0 %	0 %	50 %	113460199
73	NC_008309	GA	3	6	56741	56746	50 %	0 %	50 %	0 %	113460200
74	NC_008309	TA	3	6	58164	58169	50 %	50 %	0 %	0 %	113460201
75	NC_008309	CT	3	6	58814	58819	0 %	50 %	0 %	50 %	113460202
76	NC_008309	TG	3	6	59081	59086	0 %	50 %	50 %	0 %	113460202
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78	NC_008309	CT	3	6	60698	60703	0 %	50 %	0 %	50 %	113460203
79	NC_008309	TA	3	6	60903	60908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008309	CA	3	6	63335	63340	50 %	0 %	0 %	50 %	113460207
81	NC_008309	GT	3	6	63917	63922	0 %	50 %	50 %	0 %	113460208
82	NC_008309	TA	3	6	64589	64594	50 %	50 %	0 %	0 %	113460209
83	NC_008309	AT	3	6	65821	65826	50 %	50 %	0 %	0 %	113460211
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86	NC_008309	TA	3	6	68096	68101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008309	TA	3	6	68290	68295	50 %	50 %	0 %	0 %	113460218
88	NC_008309	GA	3	6	68800	68805	50 %	0 %	50 %	0 %	113460218
89	NC_008309	TC	3	6	70731	70736	0 %	50 %	0 %	50 %	113460218
90	NC_008309	TC	3	6	71432	71437	0 %	50 %	0 %	50 %	113460219
91	NC_008309	AG	3	6	73087	73092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008309	TC	3	6	73255	73260	0 %	50 %	0 %	50 %	113460224
93	NC_008309	AG	3	6	73702	73707	50 %	0 %	50 %	0 %	113460225
94	NC_008309	GC	3	6	74173	74178	0 %	0 %	50 %	50 %	113460226
95	NC_008309	AT	3	6	74679	74684	50 %	50 %	0 %	0 %	113460227
96	NC_008309	TA	3	6	76279	76284	50 %	50 %	0 %	0 %	113460229
97	NC_008309	TA	4	8	76648	76655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008309	AG	3	6	78041	78046	50 %	0 %	50 %	0 %	113460232
99	NC_008309	GT	3	6	78089	78094	0 %	50 %	50 %	0 %	113460232
100	NC_008309	AG	3	6	78192	78197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_008309	GT	3	6	82759	82764	0 %	50 %	50 %	0 %	113460238
103	NC_008309	TG	3	6	85824	85829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008309	AT	3	6	88610	88615	50 %	50 %	0 %	0 %	113460244
105	NC_008309	AC	3	6	89871	89876	50 %	0 %	0 %	50 %	113460244
106	NC_008309	GT	3	6	90019	90024	0 %	50 %	50 %	0 %	113460244
107	NC_008309	AC	3	6	90666	90671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008309	AT	3	6	93120	93125	50 %	50 %	0 %	0 %	113460247
109	NC_008309	GA	4	8	93898	93905	50 %	0 %	50 %	0 %	113460247
110	NC_008309	AT	3	6	93939	93944	50 %	50 %	0 %	0 %	113460247
111	NC_008309	GT	3	6	94823	94828	0 %	50 %	50 %	0 %	113460248
112	NC_008309	TG	3	6	96732	96737	0 %	50 %	50 %	0 %	113460251
113	NC_008309	TG	3	6	98257	98262	0 %	50 %	50 %	0 %	113460253
114	NC_008309	TG	3	6	98390	98395	0 %	50 %	50 %	0 %	113460253
115	NC_008309	AG	3	6	99688	99693	50 %	0 %	50 %	0 %	113460254
116	NC_008309	TC	3	6	100360	100365	0 %	50 %	0 %	50 %	113460255
117	NC_008309	TG	3	6	102478	102483	0 %	50 %	50 %	0 %	113460259
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119	NC_008309	TC	3	6	104957	104962	0 %	50 %	0 %	50 %	113460262
120	NC_008309	AG	3	6	106949	106954	50 %	0 %	50 %	0 %	113460265
121	NC_008309	TC	3	6	107533	107538	0 %	50 %	0 %	50 %	113460266
122	NC_008309	TG	3	6	109562	109567	0 %	50 %	50 %	0 %	113460267
123	NC_008309	AT	3	6	109859	109864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008309	TG	3	6	110341	110346	0 %	50 %	50 %	0 %	113460268
125	NC_008309	AT	3	6	111010	111015	50 %	50 %	0 %	0 %	113460268
126	NC_008309	AT	3	6	111232	111237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008309	TA	3	6	111386	111391	50 %	50 %	0 %	0 %	113460269
128	NC_008309	AC	3	6	113100	113105	50 %	0 %	0 %	50 %	113460270
129	NC_008309	TA	4	8	113117	113124	50 %	50 %	0 %	0 %	113460270
130	NC_008309	TC	3	6	113466	113471	0 %	50 %	0 %	50 %	113460271
131	NC_008309	TG	3	6	114891	114896	0 %	50 %	50 %	0 %	113460273
132	NC_008309	CA	3	6	115731	115736	50 %	0 %	0 %	50 %	113460275
133	NC_008309	CT	3	6	115890	115895	0 %	50 %	0 %	50 %	113460275
134	NC_008309	GT	3	6	118723	118728	0 %	50 %	50 %	0 %	113460278
135	NC_008309	AT	3	6	120799	120804	50 %	50 %	0 %	0 %	113460279
136	NC_008309	GT	3	6	121821	121826	0 %	50 %	50 %	0 %	113461931
137	NC_008309	AT	3	6	122920	122925	50 %	50 %	0 %	0 %	113460282
138	NC_008309	AT	3	6	124505	124510	50 %	50 %	0 %	0 %	113460283
139	NC_008309	TG	3	6	125517	125522	0 %	50 %	50 %	0 %	113460284
140	NC_008309	TC	3	6	126891	126896	0 %	50 %	0 %	50 %	113460287
141	NC_008309	TC	3	6	127062	127067	0 %	50 %	0 %	50 %	113460287
142	NC_008309	GA	3	6	129273	129278	50 %	0 %	50 %	0 %	113460290
143	NC_008309	AC	3	6	130231	130236	50 %	0 %	0 %	50 %	113460291
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