MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 42572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008309	TAT	2	6	70005	70010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460218
1502	NC_008309	CAA	2	6	70027	70032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460218
1503	NC_008309	AAAG	2	8	70061	70068	75 %	0 %	25 %	0 %	113460218
1504	NC_008309	AAT	2	6	70077	70082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460218
1505	NC_008309	TTA	2	6	70136	70141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460218
1506	NC_008309	TTAT	2	8	70194	70201	25 %	75 %	0 %	0 %	113460218
1507	NC_008309	A	6	6	70326	70331	100 %	0 %	0 %	0 %	113460218
1508	NC_008309	GATA	2	8	70385	70392	50 %	25 %	25 %	0 %	113460218
1509	NC_008309	GAA	2	6	70413	70418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460218
1510	NC_008309	G	6	6	70420	70425	0 %	0 %	100 %	0 %	113460218
1511	NC_008309	TC	3	6	70731	70736	0 %	50 %	0 %	50 %	113460218
1512	NC_008309	ATT	2	6	70738	70743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460218
1513	NC_008309	AAT	2	6	70788	70793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460218
1514	NC_008309	TTG	2	6	70794	70799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460218
1515	NC_008309	A	6	6	70804	70809	100 %	0 %	0 %	0 %	113460218
1516	NC_008309	ATTTT	2	10	70858	70867	20 %	80 %	0 %	0 %	113460218
1517	NC_008309	GTT	2	6	70889	70894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460218
1518	NC_008309	GTT	2	6	70915	70920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008309	T	6	6	70919	70924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008309	CAG	2	6	70934	70939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_008309	TGT	2	6	71000	71005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008309	T	6	6	71061	71066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008309	CGT	2	6	71173	71178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460219
1524	NC_008309	TGC	2	6	71181	71186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460219
1525	NC_008309	ATC	2	6	71197	71202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460219
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1527	NC_008309	GTT	2	6	71266	71271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460219
1528	NC_008309	AAG	2	6	71281	71286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460219
1529	NC_008309	TCG	2	6	71292	71297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460219
1530	NC_008309	ATA	2	6	71348	71353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460219
1531	NC_008309	ATC	2	6	71428	71433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460219
1532	NC_008309	TC	3	6	71432	71437	0 %	50 %	0 %	50 %	113460219
1533	NC_008309	GCT	2	6	71473	71478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460220
1534	NC_008309	GGTAA	2	10	71536	71545	40 %	20 %	40 %	0 %	113460220
1535	NC_008309	TTG	2	6	71573	71578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460220
1536	NC_008309	TGG	2	6	71634	71639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460220
1537	NC_008309	CAA	3	9	71693	71701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460220
1538	NC_008309	CTT	2	6	71751	71756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460220
1539	NC_008309	TAA	2	6	71763	71768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460220
1540	NC_008309	ATT	2	6	71773	71778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460220
1541	NC_008309	TAC	2	6	71817	71822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460221
1542	NC_008309	ACT	2	6	71860	71865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460221
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1545	NC_008309	GATT	2	8	72103	72110	25 %	50 %	25 %	0 %	113460221
1546	NC_008309	TGA	2	6	72284	72289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460221
1547	NC_008309	TTA	2	6	72303	72308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460221
1548	NC_008309	AGGT	2	8	72338	72345	25 %	25 %	50 %	0 %	113460221
1549	NC_008309	CAAT	2	8	72359	72366	50 %	25 %	0 %	25 %	113460222
1550	NC_008309	GAA	2	6	72422	72427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460222
1551	NC_008309	AAAG	2	8	72430	72437	75 %	0 %	25 %	0 %	113460222
1552	NC_008309	TGA	2	6	72460	72465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460222
1553	NC_008309	GTC	2	6	72552	72557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460222
1554	NC_008309	TTC	2	6	72567	72572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460222
1555	NC_008309	GCT	2	6	72608	72613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460222
1556	NC_008309	GAA	2	6	72815	72820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460223
1557	NC_008309	TGT	2	6	72997	73002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460223
1558	NC_008309	TAT	2	6	73018	73023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460223
1559	NC_008309	AAG	2	6	73083	73088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460223
1560	NC_008309	AG	3	6	73087	73092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008309	CTA	2	6	73167	73172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460224
1562	NC_008309	ATA	2	6	73237	73242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460224
1563	NC_008309	TC	3	6	73255	73260	0 %	50 %	0 %	50 %	113460224
1564	NC_008309	TGG	2	6	73366	73371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460224
1565	NC_008309	CTG	2	6	73465	73470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460224
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1569	NC_008309	AAT	2	6	73630	73635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460224
1570	NC_008309	CGT	2	6	73672	73677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460225
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1573	NC_008309	TGCT	2	8	73787	73794	0 %	50 %	25 %	25 %	113460225
1574	NC_008309	TGGT	2	8	73865	73872	0 %	50 %	50 %	0 %	113460225
1575	NC_008309	TTG	2	6	73877	73882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460225
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1582	NC_008309	ATC	2	6	74329	74334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460226
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1585	NC_008309	CAAC	2	8	74405	74412	50 %	0 %	0 %	50 %	113460226
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1589	NC_008309	TGA	2	6	74519	74524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460227
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1595	NC_008309	GGT	2	6	74861	74866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460228
1596	NC_008309	TCG	2	6	74881	74886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460228
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1598	NC_008309	ATT	2	6	74972	74977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460228
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1604	NC_008309	TGG	2	6	75353	75358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460229
1605	NC_008309	ATT	3	9	75417	75425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460229
1606	NC_008309	ATT	2	6	75428	75433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460229
1607	NC_008309	GAA	2	6	75464	75469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460229
1608	NC_008309	AGTA	2	8	75498	75505	50 %	25 %	25 %	0 %	113460229
1609	NC_008309	TTTAC	2	10	75610	75619	20 %	60 %	0 %	20 %	113460229
1610	NC_008309	ATT	2	6	75711	75716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460229
1611	NC_008309	TTG	2	6	75727	75732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460229
1612	NC_008309	TGT	2	6	75842	75847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460229
1613	NC_008309	AGA	2	6	75867	75872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460229
1614	NC_008309	CAA	2	6	75897	75902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460229
1615	NC_008309	GTC	2	6	75904	75909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460229
1616	NC_008309	TAG	2	6	75913	75918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460229
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1619	NC_008309	TAT	2	6	76115	76120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460229
1620	NC_008309	T	6	6	76122	76127	0 %	100 %	0 %	0 %	113460229
1621	NC_008309	GCAAT	2	10	76143	76152	40 %	20 %	20 %	20 %	113460229
1622	NC_008309	CAG	2	6	76168	76173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460229
1623	NC_008309	AACA	2	8	76222	76229	75 %	0 %	0 %	25 %	113460229
1624	NC_008309	TA	3	6	76279	76284	50 %	50 %	0 %	0 %	113460229
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