MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 42572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008309	CTGT	2	8	22354	22361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_008309	GAC	2	6	22377	22382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008309	AAG	2	6	22460	22465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460170
504	NC_008309	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	113460170
505	NC_008309	AG	3	6	22525	22530	50 %	0 %	50 %	0 %	113460170
506	NC_008309	TTG	2	6	22614	22619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460170
507	NC_008309	A	6	6	22651	22656	100 %	0 %	0 %	0 %	113460170
508	NC_008309	TTA	2	6	22818	22823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460170
509	NC_008309	ATC	2	6	22928	22933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460170
510	NC_008309	GATTA	2	10	23019	23028	40 %	40 %	20 %	0 %	113460170
511	NC_008309	GAA	2	6	23109	23114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460170
512	NC_008309	GTT	2	6	23123	23128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460170
513	NC_008309	CTT	2	6	23178	23183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460170
514	NC_008309	AAACG	2	10	23218	23227	60 %	0 %	20 %	20 %	113460170
515	NC_008309	TAATT	2	10	23239	23248	40 %	60 %	0 %	0 %	113460170
516	NC_008309	CAAG	2	8	23283	23290	50 %	0 %	25 %	25 %	113460170
517	NC_008309	GAA	2	6	23300	23305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460170
518	NC_008309	GAA	2	6	23341	23346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460170
519	NC_008309	TAT	2	6	23347	23352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460170
520	NC_008309	TGA	2	6	23371	23376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460170
521	NC_008309	TGA	2	6	23413	23418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460170
522	NC_008309	TAAC	2	8	23451	23458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_008309	TAA	2	6	23467	23472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008309	A	6	6	23484	23489	100 %	0 %	0 %	0 %	113460171
525	NC_008309	GTT	2	6	23505	23510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460171
526	NC_008309	TAG	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460171
527	NC_008309	GAA	2	6	23628	23633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460171
528	NC_008309	A	6	6	23632	23637	100 %	0 %	0 %	0 %	113460171
529	NC_008309	AAT	2	6	23670	23675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460171
530	NC_008309	GCG	2	6	23683	23688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460171
531	NC_008309	TTA	3	9	23745	23753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460171
532	NC_008309	GT	3	6	23776	23781	0 %	50 %	50 %	0 %	113460171
533	NC_008309	TATT	2	8	23793	23800	25 %	75 %	0 %	0 %	113460171
534	NC_008309	ATT	2	6	23885	23890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460171
535	NC_008309	A	6	6	23931	23936	100 %	0 %	0 %	0 %	113460171
536	NC_008309	GAT	2	6	23949	23954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460171
537	NC_008309	TTGT	2	8	23991	23998	0 %	75 %	25 %	0 %	113460171
538	NC_008309	TGAT	2	8	24076	24083	25 %	50 %	25 %	0 %	113460171
539	NC_008309	AT	3	6	24098	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	113460171
540	NC_008309	ATT	2	6	24176	24181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460171
541	NC_008309	AGA	2	6	24218	24223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460171
542	NC_008309	AGAA	2	8	24262	24269	75 %	0 %	25 %	0 %	113460171
543	NC_008309	CTT	2	6	24308	24313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460171
544	NC_008309	ATT	2	6	24336	24341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460171
545	NC_008309	A	6	6	24436	24441	100 %	0 %	0 %	0 %	113460171
546	NC_008309	AAT	2	6	24454	24459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460171
547	NC_008309	TGTT	2	8	24473	24480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008309	T	6	6	24601	24606	0 %	100 %	0 %	0 %	113460172
549	NC_008309	T	6	6	24624	24629	0 %	100 %	0 %	0 %	113460172
550	NC_008309	GAA	2	6	24652	24657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460172
551	NC_008309	T	7	7	24686	24692	0 %	100 %	0 %	0 %	113460172
552	NC_008309	AAAG	2	8	24712	24719	75 %	0 %	25 %	0 %	113460172
553	NC_008309	T	6	6	24784	24789	0 %	100 %	0 %	0 %	113460172
554	NC_008309	AT	3	6	24794	24799	50 %	50 %	0 %	0 %	113460172
555	NC_008309	TTGC	2	8	24805	24812	0 %	50 %	25 %	25 %	113460172
556	NC_008309	TTA	2	6	24821	24826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460172
557	NC_008309	A	6	6	24866	24871	100 %	0 %	0 %	0 %	113460172
558	NC_008309	AGC	2	6	24909	24914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460172
559	NC_008309	CTTAT	2	10	24927	24936	20 %	60 %	0 %	20 %	113460172
560	NC_008309	AGG	2	6	24987	24992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460172
561	NC_008309	ATG	2	6	24999	25004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460172
562	NC_008309	ATT	2	6	25010	25015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
563	NC_008309	TTATG	2	10	25087	25096	20 %	60 %	20 %	0 %	113460173
564	NC_008309	AATT	2	8	25120	25127	50 %	50 %	0 %	0 %	113460173
565	NC_008309	TAA	2	6	25151	25156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460173
566	NC_008309	T	6	6	25179	25184	0 %	100 %	0 %	0 %	113460173
567	NC_008309	CGG	2	6	25211	25216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460173
568	NC_008309	AGG	2	6	25268	25273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460173
569	NC_008309	ATT	2	6	25290	25295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
570	NC_008309	CTG	2	6	25327	25332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460173
571	NC_008309	ATG	2	6	25371	25376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460173
572	NC_008309	A	6	6	25383	25388	100 %	0 %	0 %	0 %	113460173
573	NC_008309	ATG	2	6	25390	25395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460173
574	NC_008309	ATT	2	6	25431	25436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
575	NC_008309	GGT	2	6	25439	25444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460173
576	NC_008309	TCC	2	6	25448	25453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460173
577	NC_008309	ATT	2	6	25505	25510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
578	NC_008309	ATT	2	6	25532	25537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
579	NC_008309	GAA	2	6	25587	25592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460173
580	NC_008309	A	6	6	25638	25643	100 %	0 %	0 %	0 %	113460173
581	NC_008309	T	6	6	25646	25651	0 %	100 %	0 %	0 %	113460173
582	NC_008309	ATT	2	6	25655	25660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
583	NC_008309	TTG	2	6	25678	25683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460173
584	NC_008309	GCG	2	6	25728	25733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460173
585	NC_008309	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	113460173
586	NC_008309	ACT	2	6	25815	25820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460173
587	NC_008309	TGTT	2	8	25831	25838	0 %	75 %	25 %	0 %	113460173
588	NC_008309	TTA	2	6	25948	25953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
589	NC_008309	TTA	2	6	25962	25967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
590	NC_008309	GTTG	2	8	25971	25978	0 %	50 %	50 %	0 %	113460173
591	NC_008309	TAT	2	6	26020	26025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460173
592	NC_008309	ATG	2	6	26073	26078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460173
593	NC_008309	TGT	2	6	26240	26245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460173
594	NC_008309	GTG	2	6	26273	26278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460173
595	NC_008309	TTA	2	6	26280	26285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008309	TAA	2	6	26355	26360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008309	T	6	6	26426	26431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008309	TCA	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460174
599	NC_008309	CTC	2	6	26509	26514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460174
600	NC_008309	CTG	2	6	26515	26520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460174
601	NC_008309	AAG	2	6	26584	26589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460174
602	NC_008309	TGGT	2	8	26593	26600	0 %	50 %	50 %	0 %	113460174
603	NC_008309	AAT	2	6	26604	26609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460174
604	NC_008309	ATTT	2	8	26626	26633	25 %	75 %	0 %	0 %	113460174
605	NC_008309	TGG	2	6	26735	26740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460174
606	NC_008309	ATTT	2	8	26755	26762	25 %	75 %	0 %	0 %	113460174
607	NC_008309	ATT	2	6	26799	26804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460174
608	NC_008309	TGGC	2	8	26990	26997	0 %	25 %	50 %	25 %	113460174
609	NC_008309	CAA	2	6	27036	27041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460174
610	NC_008309	CCA	2	6	27045	27050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460174
611	NC_008309	AG	3	6	27089	27094	50 %	0 %	50 %	0 %	113460174
612	NC_008309	TC	3	6	27170	27175	0 %	50 %	0 %	50 %	113460175
613	NC_008309	A	6	6	27235	27240	100 %	0 %	0 %	0 %	113460175
614	NC_008309	TGG	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460175
615	NC_008309	TAG	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460175
616	NC_008309	TAT	2	6	27415	27420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460175
617	NC_008309	CGG	2	6	27451	27456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460175
618	NC_008309	G	6	6	27512	27517	0 %	0 %	100 %	0 %	113460175
619	NC_008309	GAC	2	6	27625	27630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460175
620	NC_008309	TAC	2	6	27655	27660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460175
621	NC_008309	TTC	2	6	27677	27682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460175
622	NC_008309	CAG	2	6	27709	27714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460175
623	NC_008309	CTG	2	6	27789	27794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460175
624	NC_008309	AGG	2	6	27856	27861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460175
625	NC_008309	TG	3	6	27878	27883	0 %	50 %	50 %	0 %	113460175
626	NC_008309	ATT	2	6	27943	27948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460175
627	NC_008309	GATT	2	8	28028	28035	25 %	50 %	25 %	0 %	113460175
628	NC_008309	GAT	2	6	28245	28250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460176
629	NC_008309	TTTAT	2	10	28265	28274	20 %	80 %	0 %	0 %	113460176
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